6GHO_B
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6GHO_B.pdb ! residue not defined for rnum = 20
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6GHO_B.pdb ! residue not defined for rnum = 21
 295
 (295, 295)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.155270
6G70_B
running..
 Extract distance maps..
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{79: 'D', 80: 'F', 81: 'P', 82: 'P', 83: 'E', 84: 'F', 85: 'E', 86: 'K', 87: 'F', 88: 'W', 89: 'K', 90: 'T', 91: 'V', 92: 'E', 93: 'M', 94: 'N', 95: 'P', 96: 'Q', 97: 'D', 98: 'F', 99: 'T', 100: 'G', 101: 'W', 102: 'V', 103: 'Y', 104: 'L', 105: 'L', 106: 'Q', 107: 'Y', 108: 'V', 109: 'E', 110: 'Q', 111: 'E', 112: 'N', 113: 'H', 114: 'L', 115: 'M', 116: 'A', 117: 'A', 118: 'R', 119: 'K', 120: 'A', 121: 'F', 122: 'D', 123: 'K', 124: 'F', 125: 'F', 126: 'V', 127: 'H', 128: 'Y', 129: 'P', 130: 'Y', 131: 'C', 132: 'Y', 133: 'G', 134: 'Y', 135: 'W', 136: 'K', 137: 'K', 138: 'Y', 139: 'A', 140: 'D', 141: 'L', 142: 'E', 143: 'K', 144: 'R', 145: 'H', 146: 'D', 147: 'N', 148: 'I', 149: 'K', 150: 'Q', 151: 'S', 152: 'D', 153: 'E', 154: 'V', 155: 'Y', 156: 'R', 157: 'R', 158: 'G', 159: 'L', 160: 'Q', 161: 'A', 162: 'I', 163: 'P', 164: 'L', 165: 'S', 166: 'V', 167: 'D', 168: 'L', 169: 'W', 170: 'I', 171: 'H', 172: 'Y', 173: 'I', 174: 'N', 175: 'F', 176: 'L', 177: 'K', 178: 'E', 179: 'T', 180: 'L', 181: 'D', 182: 'P', 183: 'G', 184: 'D', 185: 'Q', 186: 'E', 187: 'T', 188: 'N', 189: 'T', 190: 'T', 191: 'I', 192: 'R', 193: 'G', 194: 'T', 195: 'F', 196: 'E', 197: 'H', 198: 'A', 199: 'V', 200: 'L', 201: 'A', 202: 'A', 203: 'G', 204: 'T', 205: 'D', 206: 'F', 207: 'R', 208: 'S', 209: 'D', 210: 'K', 211: 'L', 212: 'W', 213: 'E', 214: 'M', 215: 'Y', 216: 'I', 217: 'N', 218: 'W', 219: 'E', 220: 'N', 221: 'E', 222: 'Q', 223: 'G', 224: 'N', 225: 'L', 226: 'R', 227: 'E', 228: 'V', 229: 'T', 230: 'A', 231: 'V', 232: 'Y', 233: 'D', 234: 'R', 235: 'I', 236: 'L', 237: 'G', 238: 'I', 239: 'P', 240: 'T', 241: 'Q', 242: 'L', 243: 'Y', 244: 'S', 245: 'H', 246: 'H', 247: 'F', 248: 'Q', 249: 'R', 250: 'F', 251: 'K', 252: 'E', 253: 'H', 254: 'V', 255: 'Q', 256: 'N', 257: 'N', 258: 'L', 259: 'P', 260: 'R', 261: 'D', 262: 'L', 263: 'L', 264: 'T', 265: 'G', 266: 'E', 267: 'Q', 268: 'F', 269: 'I', 270: 'Q', 271: 'L', 272: 'R', 273: 'R', 274: 'E', 275: 'L', 276: 'A', 277: 'S', 278: 'V', 279: 'N', 280: 'G', 300: 'T', 301: 'D', 302: 'P', 303: 'A', 304: 'K', 305: 'L', 306: 'I', 307: 'T', 308: 'E', 309: 'I', 310: 'E', 311: 'N', 312: 'M', 313: 'R', 314: 'H', 315: 'R', 316: 'I', 317: 'I', 318: 'E', 319: 'I', 320: 'H', 321: 'Q', 322: 'E', 323: 'M', 324: 'F', 325: 'N', 326: 'Y', 327: 'N', 328: 'E', 329: 'H', 330: 'E', 331: 'V', 332: 'S', 333: 'K', 334: 'R', 335: 'W', 336: 'T', 337: 'F', 338: 'E', 339: 'E', 340: 'G', 341: 'I', 342: 'K', 343: 'R', 344: 'P', 345: 'Y', 346: 'F', 347: 'H', 348: 'V', 349: 'K', 350: 'P', 351: 'L', 352: 'E', 353: 'K', 354: 'A', 355: 'Q', 356: 'L', 357: 'K', 358: 'N', 359: 'W', 360: 'K', 361: 'E', 362: 'Y', 363: 'L', 364: 'E', 365: 'F', 366: 'E', 367: 'I', 368: 'E', 369: 'N', 370: 'G', 371: 'T', 372: 'H', 373: 'E', 374: 'R', 375: 'V', 376: 'V', 377: 'V', 378: 'L', 379: 'F', 380: 'E', 381: 'R', 382: 'C', 383: 'V', 384: 'I', 385: 'S', 386: 'C', 387: 'A', 388: 'L', 389: 'Y', 390: 'E', 391: 'E', 392: 'F', 393: 'W', 394: 'I', 395: 'K', 396: 'Y', 397: 'A', 398: 'K', 399: 'Y', 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500: 'K', 501: 'L', 502: 'A', 503: 'R', 504: 'H', 505: 'L', 506: 'F', 507: 'K', 508: 'I', 509: 'Q', 510: 'K', 511: 'N', 512: 'L', 513: 'P', 514: 'K', 515: 'S', 516: 'R', 517: 'K', 518: 'V', 519: 'L', 520: 'L', 521: 'E', 522: 'A', 523: 'I', 524: 'E', 525: 'K', 526: 'D', 527: 'K', 528: 'E', 529: 'N', 530: 'T', 531: 'K', 532: 'L', 533: 'Y', 534: 'L', 535: 'N', 536: 'L', 537: 'L', 538: 'E', 539: 'M', 540: 'E', 541: 'Y', 542: 'S', 543: 'C', 544: 'D', 545: 'L', 546: 'K', 547: 'Q', 548: 'N', 549: 'E', 550: 'E', 551: 'N', 552: 'I', 553: 'L', 554: 'N', 555: 'C', 556: 'F', 557: 'D', 558: 'K', 559: 'A', 560: 'I', 561: 'H', 562: 'G', 563: 'S', 564: 'L', 565: 'P', 566: 'I', 567: 'K', 568: 'M', 569: 'R', 570: 'I', 571: 'T', 572: 'F', 573: 'S', 574: 'Q', 575: 'R', 576: 'K', 577: 'V', 578: 'E', 579: 'F', 580: 'L', 581: 'E', 582: 'D', 583: 'F', 584: 'G', 585: 'S', 586: 'D', 587: 'V', 588: 'N', 589: 'K', 590: 'L', 591: 'L', 592: 'N', 593: 'A', 594: 'Y', 595: 'D', 596: 'E', 597: 'H', 598: 'Q', 599: 'T', 600: 'L', 601: 'L', 602: 'K', 603: 'E', 604: 'Q', 605: 'D', 606: 'T', 607: 'L'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6G70_B.pdb ! residue not defined for rnum = 299
 607
 (607, 607)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.508079
6I1R_B
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6I1R_B.pdb ! residue not defined for rnum = 28
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6I1R_B.pdb ! residue not defined for rnum = 30
 313
 (313, 313)
 Verify the symmetricity in distance maps..
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6FXD_B
running..
 Extract distance maps..
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{21: 'N', 22: 'R', 23: 'T', 24: 'C', 25: 'M', 26: 'A', 27: 'M', 28: 'P', 29: 'Y', 30: 'F', 31: 'E', 32: 'I', 33: 'P', 34: 'E', 35: 'R', 36: 'H', 37: 'L', 38: 'E', 39: 'A', 40: 'F', 41: 'K', 42: 'A', 43: 'Y', 44: 'C', 45: 'A', 46: 'V', 47: 'F', 48: 'I', 49: 'E', 50: 'K', 51: 'T', 52: 'S', 53: 'K', 54: 'E', 55: 'P', 56: 'G', 57: 'C', 58: 'L', 59: 'Y', 60: 'Y', 61: 'G', 62: 'F', 63: 'S', 64: 'F', 65: 'N', 66: 'G', 67: 'T', 68: 'Q', 69: 'G', 70: 'H', 71: 'C', 72: 'R', 73: 'E', 74: 'V', 75: 'Y', 76: 'S', 77: 'D', 78: 'A', 79: 'Q', 80: 'G', 81: 'L', 82: 'L', 83: 'N', 84: 'H', 85: 'L', 86: 'V', 87: 'N', 88: 'I', 89: 'A', 90: 'E', 91: 'L', 92: 'N', 93: 'S', 94: 'E', 95: 'A', 96: 'F', 97: 'H', 98: 'L', 99: 'A', 100: 'S', 101: 'I', 102: 'V', 103: 'R', 104: 'Y', 105: 'E', 106: 'V', 107: 'H', 108: 'G', 109: 'P', 110: 'R', 111: 'E', 112: 'E', 113: 'L', 114: 'D', 115: 'K', 116: 'L', 117: 'R', 118: 'G', 119: 'P', 120: 'L', 121: 'A', 122: 'F', 123: 'M', 124: 'K', 125: 'P', 126: 'Q', 127: 'F', 128: 'F', 129: 'E', 130: 'L', 131: 'E', 132: 'Q', 133: 'C', 134: 'F', 135: 'S', 136: 'R', 137: 'P', 138: 'S', 139: 'V', 140: 'V', 141: 'A'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6FXD_B.pdb ! residue not defined for rnum = 16
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6FXD_B.pdb ! residue not defined for rnum = 17
{21: 'N', 22: 'R', 23: 'T', 24: 'C', 25: 'M', 26: 'A', 27: 'M', 28: 'P', 29: 'Y', 30: 'F', 31: 'E', 32: 'I', 33: 'P', 34: 'E', 35: 'R', 36: 'H', 37: 'L', 38: 'E', 39: 'A', 40: 'F', 41: 'K', 42: 'A', 43: 'Y', 44: 'C', 45: 'A', 46: 'V', 47: 'F', 48: 'I', 49: 'E', 50: 'K', 51: 'T', 52: 'S', 53: 'K', 54: 'E', 55: 'P', 56: 'G', 57: 'C', 58: 'L', 59: 'Y', 60: 'Y', 61: 'G', 62: 'F', 63: 'S', 64: 'F', 65: 'N', 66: 'G', 67: 'T', 68: 'Q', 69: 'G', 70: 'H', 71: 'C', 72: 'R', 73: 'E', 74: 'V', 75: 'Y', 76: 'S', 77: 'D', 78: 'A', 79: 'Q', 80: 'G', 81: 'L', 82: 'L', 83: 'N', 84: 'H', 85: 'L', 86: 'V', 87: 'N', 88: 'I', 89: 'A', 90: 'E', 91: 'L', 92: 'N', 93: 'S', 94: 'E', 95: 'A', 96: 'F', 97: 'H', 98: 'L', 99: 'A', 100: 'S', 101: 'I', 102: 'V', 103: 'R', 104: 'Y', 105: 'E', 106: 'V', 107: 'H', 108: 'G', 109: 'P', 110: 'R', 111: 'E', 112: 'E', 113: 'L', 114: 'D', 115: 'K', 116: 'L', 117: 'R', 118: 'G', 119: 'P', 120: 'L', 121: 'A', 122: 'F', 123: 'M', 124: 'K', 125: 'P', 126: 'Q', 127: 'F', 128: 'F', 129: 'E', 130: 'L', 131: 'E', 132: 'Q', 133: 'C', 134: 'F', 135: 'S', 136: 'R', 137: 'P', 138: 'S', 139: 'V', 140: 'V', 141: 'A'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6FXD_B.pdb ! residue not defined for rnum = 18
{21: 'N', 22: 'R', 23: 'T', 24: 'C', 25: 'M', 26: 'A', 27: 'M', 28: 'P', 29: 'Y', 30: 'F', 31: 'E', 32: 'I', 33: 'P', 34: 'E', 35: 'R', 36: 'H', 37: 'L', 38: 'E', 39: 'A', 40: 'F', 41: 'K', 42: 'A', 43: 'Y', 44: 'C', 45: 'A', 46: 'V', 47: 'F', 48: 'I', 49: 'E', 50: 'K', 51: 'T', 52: 'S', 53: 'K', 54: 'E', 55: 'P', 56: 'G', 57: 'C', 58: 'L', 59: 'Y', 60: 'Y', 61: 'G', 62: 'F', 63: 'S', 64: 'F', 65: 'N', 66: 'G', 67: 'T', 68: 'Q', 69: 'G', 70: 'H', 71: 'C', 72: 'R', 73: 'E', 74: 'V', 75: 'Y', 76: 'S', 77: 'D', 78: 'A', 79: 'Q', 80: 'G', 81: 'L', 82: 'L', 83: 'N', 84: 'H', 85: 'L', 86: 'V', 87: 'N', 88: 'I', 89: 'A', 90: 'E', 91: 'L', 92: 'N', 93: 'S', 94: 'E', 95: 'A', 96: 'F', 97: 'H', 98: 'L', 99: 'A', 100: 'S', 101: 'I', 102: 'V', 103: 'R', 104: 'Y', 105: 'E', 106: 'V', 107: 'H', 108: 'G', 109: 'P', 110: 'R', 111: 'E', 112: 'E', 113: 'L', 114: 'D', 115: 'K', 116: 'L', 117: 'R', 118: 'G', 119: 'P', 120: 'L', 121: 'A', 122: 'F', 123: 'M', 124: 'K', 125: 'P', 126: 'Q', 127: 'F', 128: 'F', 129: 'E', 130: 'L', 131: 'E', 132: 'Q', 133: 'C', 134: 'F', 135: 'S', 136: 'R', 137: 'P', 138: 'S', 139: 'V', 140: 'V', 141: 'A'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6FXD_B.pdb ! residue not defined for rnum = 19
{21: 'N', 22: 'R', 23: 'T', 24: 'C', 25: 'M', 26: 'A', 27: 'M', 28: 'P', 29: 'Y', 30: 'F', 31: 'E', 32: 'I', 33: 'P', 34: 'E', 35: 'R', 36: 'H', 37: 'L', 38: 'E', 39: 'A', 40: 'F', 41: 'K', 42: 'A', 43: 'Y', 44: 'C', 45: 'A', 46: 'V', 47: 'F', 48: 'I', 49: 'E', 50: 'K', 51: 'T', 52: 'S', 53: 'K', 54: 'E', 55: 'P', 56: 'G', 57: 'C', 58: 'L', 59: 'Y', 60: 'Y', 61: 'G', 62: 'F', 63: 'S', 64: 'F', 65: 'N', 66: 'G', 67: 'T', 68: 'Q', 69: 'G', 70: 'H', 71: 'C', 72: 'R', 73: 'E', 74: 'V', 75: 'Y', 76: 'S', 77: 'D', 78: 'A', 79: 'Q', 80: 'G', 81: 'L', 82: 'L', 83: 'N', 84: 'H', 85: 'L', 86: 'V', 87: 'N', 88: 'I', 89: 'A', 90: 'E', 91: 'L', 92: 'N', 93: 'S', 94: 'E', 95: 'A', 96: 'F', 97: 'H', 98: 'L', 99: 'A', 100: 'S', 101: 'I', 102: 'V', 103: 'R', 104: 'Y', 105: 'E', 106: 'V', 107: 'H', 108: 'G', 109: 'P', 110: 'R', 111: 'E', 112: 'E', 113: 'L', 114: 'D', 115: 'K', 116: 'L', 117: 'R', 118: 'G', 119: 'P', 120: 'L', 121: 'A', 122: 'F', 123: 'M', 124: 'K', 125: 'P', 126: 'Q', 127: 'F', 128: 'F', 129: 'E', 130: 'L', 131: 'E', 132: 'Q', 133: 'C', 134: 'F', 135: 'S', 136: 'R', 137: 'P', 138: 'S', 139: 'V', 140: 'V', 141: 'A'}
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 141
 (141, 141)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.037898
5XJO_E
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5XJO_E.pdb ! residue not defined for rnum = 26
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5XJO_E.pdb ! residue not defined for rnum = 29
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5XJO_E.pdb ! residue not defined for rnum = 31
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5XJO_E.pdb ! residue not defined for rnum = 32
{1: 'A', 2: 'G', 3: 'S', 4: 'R', 5: 'L', 6: 'P', 7: 'D', 8: 'C', 9: 'S', 10: 'H', 11: 'A', 12: 'C', 13: 'G', 14: 'S', 15: 'C', 16: 'S', 17: 'P', 18: 'C', 19: 'R', 20: 'L', 21: 'V', 22: 'M', 23: 'V', 24: 'S', 25: 'F', 36: 'C', 37: 'P', 38: 'M', 39: 'A', 40: 'Y', 41: 'K', 42: 'C', 43: 'M', 44: 'C', 45: 'N', 46: 'N', 47: 'K', 48: 'S', 49: 'Y', 50: 'P', 51: 'V', 52: 'P'}
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{1: 'A', 2: 'G', 3: 'S', 4: 'R', 5: 'L', 6: 'P', 7: 'D', 8: 'C', 9: 'S', 10: 'H', 11: 'A', 12: 'C', 13: 'G', 14: 'S', 15: 'C', 16: 'S', 17: 'P', 18: 'C', 19: 'R', 20: 'L', 21: 'V', 22: 'M', 23: 'V', 24: 'S', 25: 'F', 36: 'C', 37: 'P', 38: 'M', 39: 'A', 40: 'Y', 41: 'K', 42: 'C', 43: 'M', 44: 'C', 45: 'N', 46: 'N', 47: 'K', 48: 'S', 49: 'Y', 50: 'P', 51: 'V', 52: 'P'}
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5XJO_E.pdb ! residue not defined for rnum = 35
 52
 (52, 52)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.013148
6CZ6_D
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CZ6_D.pdb ! residue not defined for rnum = 1
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CZ6_D.pdb ! residue not defined for rnum = 410
 423
 (423, 423)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.214425
5ZYO_D
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZYO_D.pdb ! residue not defined for rnum = 6
 158
 (158, 158)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.052502
6AAY_A
running..
 Extract distance maps..
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 1225
 (1225, 1225)
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6CP8_B
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CP8_B.pdb ! residue not defined for rnum = 1
 163
 (163, 163)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.057756
5Z7C_A
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5Z7C_A.pdb ! residue not defined for rnum = 395
 463
 (463, 463)
 Verify the symmetricity in distance maps..
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Runtime = 0:00:00.328035
6G1H_A
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6G1H_A.pdb ! residue not defined for rnum = 299
 343
 (343, 343)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.217932
6EAZ_B
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6EAZ_B.pdb ! residue not defined for rnum = 1
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 374
 (374, 374)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.207417
5ZT0_J
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 Extract distance maps..
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{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
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{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
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{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT0_J.pdb ! residue not defined for rnum = 4
{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
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{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
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{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
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{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
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{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
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{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
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{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
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{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT0_J.pdb ! residue not defined for rnum = 12
{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT0_J.pdb ! residue not defined for rnum = 13
{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT0_J.pdb ! residue not defined for rnum = 14
{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT0_J.pdb ! residue not defined for rnum = 15
{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT0_J.pdb ! residue not defined for rnum = 16
{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT0_J.pdb ! residue not defined for rnum = 17
{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT0_J.pdb ! residue not defined for rnum = 18
{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT0_J.pdb ! residue not defined for rnum = 19
{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT0_J.pdb ! residue not defined for rnum = 20
{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT0_J.pdb ! residue not defined for rnum = 21
{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT0_J.pdb ! residue not defined for rnum = 22
{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT0_J.pdb ! residue not defined for rnum = 23
{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT0_J.pdb ! residue not defined for rnum = 24
{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT0_J.pdb ! residue not defined for rnum = 25
{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT0_J.pdb ! residue not defined for rnum = 26
{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
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{29: 'V', 30: 'K', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'V', 34: 'S', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'G', 41: 'L', 42: 'A', 43: 'L', 44: 'T', 45: 'M', 46: 'V', 47: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT0_J.pdb ! residue not defined for rnum = 28
 47
 (47, 47)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
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6I9H_A
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6I9H_A.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{3: 'G', 4: 'G', 5: 'A', 6: 'E', 7: 'A', 8: 'L', 9: 'E', 10: 'L', 11: 'L', 12: 'E', 13: 'H', 14: 'C', 15: 'G', 16: 'V', 17: 'C', 18: 'R', 19: 'E', 20: 'R', 21: 'L', 22: 'R', 23: 'P', 24: 'E', 25: 'R', 26: 'E', 27: 'P', 28: 'R', 29: 'L', 30: 'L', 31: 'P', 32: 'C', 33: 'L', 34: 'H', 35: 'S', 36: 'A', 37: 'C', 38: 'S', 39: 'A', 40: 'C', 41: 'L', 42: 'G', 43: 'P', 44: 'A', 45: 'A', 46: 'P', 47: 'A', 48: 'A', 49: 'A', 50: 'N', 51: 'S', 52: 'S', 53: 'G', 54: 'D', 55: 'G', 56: 'G', 57: 'A', 58: 'A', 59: 'G', 60: 'D', 61: 'G', 62: 'T', 63: 'V', 64: 'V', 65: 'D', 66: 'C', 67: 'P', 68: 'V', 69: 'C', 70: 'K', 71: 'Q', 72: 'Q', 73: 'C', 74: 'F', 75: 'S', 76: 'K', 77: 'D', 78: 'I', 79: 'V', 80: 'E', 81: 'N', 82: 'Y', 83: 'F', 84: 'M', 85: 'R', 86: 'D', 87: 'S', 88: 'G', 89: 'S', 90: 'K', 91: 'A', 92: 'A', 93: 'T', 94: 'D'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6I9H_A.pdb ! residue not defined for rnum = 2
 94
 (94, 94)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.025289
5ZB2_A
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 Extract distance maps..
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{4: 'S', 5: 'V', 6: 'S', 7: 'S', 8: 'L', 9: 'Q', 10: 'S', 11: 'L', 12: 'C', 13: 'I', 14: 'T', 15: 'K', 16: 'I', 17: 'S', 18: 'E', 19: 'N', 20: 'I', 21: 'S', 22: 'K', 23: 'W', 24: 'Q', 25: 'K', 26: 'E', 27: 'A', 28: 'D', 29: 'E', 30: 'S', 31: 'S', 32: 'K', 33: 'L', 34: 'V', 35: 'F', 36: 'N', 37: 'K', 38: 'L', 39: 'R', 40: 'D', 41: 'V', 42: 'L', 43: 'G', 44: 'G', 45: 'V', 46: 'S', 47: 'T', 48: 'A', 49: 'N', 50: 'L', 51: 'N', 52: 'N', 53: 'L', 54: 'A', 55: 'K', 56: 'A', 57: 'L', 58: 'S', 59: 'K', 60: 'N', 61: 'R', 62: 'A', 63: 'L', 64: 'N', 65: 'D', 66: 'H', 67: 'T', 68: 'L', 69: 'Q', 70: 'L', 71: 'F', 72: 'L', 73: 'K', 74: 'T', 75: 'D', 76: 'L', 77: 'K', 78: 'R', 79: 'L', 80: 'T', 81: 'F', 82: 'S', 83: 'D', 84: 'C', 85: 'S', 86: 'K', 87: 'I', 88: 'S', 89: 'F', 90: 'D', 91: 'G', 92: 'Y', 93: 'K', 94: 'T', 95: 'L', 96: 'A', 97: 'I', 98: 'F', 99: 'S', 100: 'P', 101: 'H', 102: 'L', 103: 'T', 104: 'E', 105: 'L', 106: 'S', 107: 'L', 108: 'Q', 109: 'M', 110: 'C', 111: 'G', 112: 'Q', 113: 'L', 114: 'N', 115: 'H', 116: 'E', 117: 'S', 118: 'L', 119: 'L', 120: 'Y', 121: 'I', 122: 'A', 123: 'E', 124: 'K', 125: 'L', 126: 'P', 127: 'N', 128: 'L', 129: 'K', 130: 'S', 131: 'L', 132: 'N', 133: 'L', 134: 'D', 135: 'G', 136: 'P', 137: 'F', 138: 'L', 139: 'I', 140: 'N', 141: 'E', 142: 'D', 143: 'T', 144: 'W', 145: 'E', 146: 'K', 147: 'F', 148: 'F', 149: 'V', 150: 'I', 151: 'M', 152: 'K', 153: 'G', 154: 'R', 155: 'L', 156: 'E', 157: 'E', 158: 'F', 159: 'H', 160: 'I', 161: 'S', 162: 'N', 163: 'T', 164: 'H', 165: 'R', 166: 'F', 167: 'T', 168: 'D', 169: 'K', 170: 'S', 171: 'L', 172: 'S', 173: 'N', 174: 'L', 175: 'L', 176: 'I', 177: 'N', 178: 'C', 179: 'G', 180: 'S', 181: 'T', 182: 'L', 183: 'V', 184: 'S', 185: 'L', 186: 'G', 187: 'L', 188: 'S', 189: 'R', 190: 'L', 191: 'D', 192: 'S', 193: 'I', 194: 'S', 195: 'N', 196: 'Y', 197: 'A', 198: 'L', 199: 'L', 200: 'P', 201: 'Q', 202: 'Y', 203: 'L', 204: 'V', 205: 'N', 206: 'D', 207: 'E', 208: 'F', 209: 'H', 210: 'S', 211: 'L', 212: 'C', 213: 'I', 214: 'E', 215: 'Y', 216: 'P', 217: 'F', 218: 'N', 219: 'E', 220: 'E', 221: 'D', 222: 'V', 223: 'N', 224: 'D', 225: 'E', 226: 'I', 227: 'I', 228: 'I', 229: 'N', 230: 'L', 231: 'L', 232: 'G', 233: 'Q', 234: 'I', 235: 'G', 236: 'R', 237: 'T', 238: 'L', 239: 'R', 240: 'K', 241: 'L', 242: 'V', 243: 'L', 244: 'N', 245: 'G', 246: 'C', 247: 'I', 248: 'D', 249: 'L', 250: 'T', 251: 'D', 252: 'S', 253: 'M', 254: 'I', 255: 'I', 256: 'N', 257: 'G', 258: 'L', 259: 'T', 260: 'A', 261: 'F', 262: 'I', 263: 'P', 264: 'E', 265: 'K', 266: 'C', 267: 'P', 268: 'L', 269: 'E', 270: 'V', 271: 'L', 272: 'S', 273: 'L', 274: 'E', 275: 'E', 276: 'S', 277: 'D', 278: 'Q', 279: 'I', 280: 'T', 281: 'T', 282: 'D', 283: 'S', 284: 'L', 285: 'S', 286: 'Y', 287: 'F', 288: 'F', 289: 'S', 290: 'K', 291: 'V', 292: 'E', 293: 'L', 294: 'N', 295: 'N', 296: 'L', 297: 'I', 298: 'E', 299: 'C', 300: 'S', 301: 'F', 302: 'R', 303: 'R', 304: 'C', 305: 'L', 306: 'Q', 307: 'L', 308: 'G', 309: 'D', 310: 'M', 311: 'A', 312: 'I', 313: 'I', 314: 'E', 315: 'L', 316: 'L', 317: 'L', 318: 'N', 319: 'G', 320: 'A', 321: 'R', 322: 'D', 323: 'S', 324: 'L', 325: 'R', 326: 'S', 327: 'L', 328: 'N', 329: 'L', 330: 'N', 331: 'S', 332: 'L', 333: 'K', 334: 'E', 335: 'L', 336: 'T', 337: 'K', 338: 'E', 339: 'A', 340: 'F', 341: 'V', 342: 'A', 343: 'L', 344: 'A', 345: 'C', 346: 'P', 347: 'N', 348: 'L', 349: 'T', 350: 'Y', 351: 'L', 352: 'D', 353: 'L', 354: 'G', 355: 'F', 356: 'V', 357: 'R', 358: 'C', 359: 'V', 360: 'D', 361: 'D', 362: 'S', 363: 'V', 364: 'I', 365: 'Q', 366: 'M', 367: 'L', 368: 'G', 369: 'E', 370: 'Q', 371: 'N', 372: 'P', 373: 'N', 374: 'L', 375: 'T', 376: 'V', 377: 'I', 378: 'D', 379: 'V', 380: 'F', 381: 'G', 382: 'D', 383: 'N', 384: 'L', 385: 'V', 386: 'T', 387: 'E', 388: 'K', 389: 'A', 390: 'T', 391: 'M', 392: 'R', 393: 'P', 394: 'G', 395: 'L', 396: 'T', 397: 'L', 398: 'I', 399: 'G', 400: 'R', 401: 'Q', 402: 'S', 403: 'D', 404: 'S', 405: 'I'}
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 405
 (405, 405)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.301332
6BZJ_A
running..
 Extract distance maps..
 57
 (57, 57)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.015222
5YA6_B
running..
 Extract distance maps..
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 211
 (211, 211)
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 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5OD9_B.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{4: 'S', 5: 'P', 6: 'L', 7: 'A', 8: 'Q', 9: 'Q', 10: 'I', 11: 'K', 12: 'N', 13: 'T', 14: 'L', 15: 'T', 16: 'F', 17: 'I', 18: 'G', 19: 'Q', 20: 'A', 21: 'N', 22: 'A', 23: 'A', 24: 'G', 25: 'R', 26: 'M', 27: 'D', 28: 'E', 29: 'V', 30: 'R', 31: 'T', 32: 'L', 33: 'Q', 34: 'E', 35: 'N', 36: 'L', 37: 'H', 38: 'P', 39: 'L', 40: 'W', 41: 'H', 42: 'E', 43: 'Y', 44: 'F', 45: 'Q', 46: 'Q', 47: 'T', 48: 'E', 53: 'S', 54: 'P', 55: 'L', 56: 'A', 57: 'Q', 58: 'Q', 59: 'I', 60: 'E', 61: 'Y', 62: 'G', 63: 'H', 64: 'V', 65: 'L', 66: 'I', 67: 'H', 68: 'Q', 69: 'A', 70: 'R', 71: 'A', 72: 'A', 73: 'G', 74: 'R', 75: 'M', 76: 'D', 77: 'E', 78: 'V', 79: 'R', 80: 'R', 81: 'L', 82: 'S', 83: 'E', 84: 'N', 85: 'T', 86: 'L', 87: 'Q', 88: 'L', 89: 'M', 90: 'K', 91: 'E', 92: 'Y', 93: 'F', 94: 'Q', 95: 'Q'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5OD9_B.pdb ! residue not defined for rnum = 2
{4: 'S', 5: 'P', 6: 'L', 7: 'A', 8: 'Q', 9: 'Q', 10: 'I', 11: 'K', 12: 'N', 13: 'T', 14: 'L', 15: 'T', 16: 'F', 17: 'I', 18: 'G', 19: 'Q', 20: 'A', 21: 'N', 22: 'A', 23: 'A', 24: 'G', 25: 'R', 26: 'M', 27: 'D', 28: 'E', 29: 'V', 30: 'R', 31: 'T', 32: 'L', 33: 'Q', 34: 'E', 35: 'N', 36: 'L', 37: 'H', 38: 'P', 39: 'L', 40: 'W', 41: 'H', 42: 'E', 43: 'Y', 44: 'F', 45: 'Q', 46: 'Q', 47: 'T', 48: 'E', 53: 'S', 54: 'P', 55: 'L', 56: 'A', 57: 'Q', 58: 'Q', 59: 'I', 60: 'E', 61: 'Y', 62: 'G', 63: 'H', 64: 'V', 65: 'L', 66: 'I', 67: 'H', 68: 'Q', 69: 'A', 70: 'R', 71: 'A', 72: 'A', 73: 'G', 74: 'R', 75: 'M', 76: 'D', 77: 'E', 78: 'V', 79: 'R', 80: 'R', 81: 'L', 82: 'S', 83: 'E', 84: 'N', 85: 'T', 86: 'L', 87: 'Q', 88: 'L', 89: 'M', 90: 'K', 91: 'E', 92: 'Y', 93: 'F', 94: 'Q', 95: 'Q'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5OD9_B.pdb ! residue not defined for rnum = 3
{4: 'S', 5: 'P', 6: 'L', 7: 'A', 8: 'Q', 9: 'Q', 10: 'I', 11: 'K', 12: 'N', 13: 'T', 14: 'L', 15: 'T', 16: 'F', 17: 'I', 18: 'G', 19: 'Q', 20: 'A', 21: 'N', 22: 'A', 23: 'A', 24: 'G', 25: 'R', 26: 'M', 27: 'D', 28: 'E', 29: 'V', 30: 'R', 31: 'T', 32: 'L', 33: 'Q', 34: 'E', 35: 'N', 36: 'L', 37: 'H', 38: 'P', 39: 'L', 40: 'W', 41: 'H', 42: 'E', 43: 'Y', 44: 'F', 45: 'Q', 46: 'Q', 47: 'T', 48: 'E', 53: 'S', 54: 'P', 55: 'L', 56: 'A', 57: 'Q', 58: 'Q', 59: 'I', 60: 'E', 61: 'Y', 62: 'G', 63: 'H', 64: 'V', 65: 'L', 66: 'I', 67: 'H', 68: 'Q', 69: 'A', 70: 'R', 71: 'A', 72: 'A', 73: 'G', 74: 'R', 75: 'M', 76: 'D', 77: 'E', 78: 'V', 79: 'R', 80: 'R', 81: 'L', 82: 'S', 83: 'E', 84: 'N', 85: 'T', 86: 'L', 87: 'Q', 88: 'L', 89: 'M', 90: 'K', 91: 'E', 92: 'Y', 93: 'F', 94: 'Q', 95: 'Q'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5OD9_B.pdb ! residue not defined for rnum = 49
{4: 'S', 5: 'P', 6: 'L', 7: 'A', 8: 'Q', 9: 'Q', 10: 'I', 11: 'K', 12: 'N', 13: 'T', 14: 'L', 15: 'T', 16: 'F', 17: 'I', 18: 'G', 19: 'Q', 20: 'A', 21: 'N', 22: 'A', 23: 'A', 24: 'G', 25: 'R', 26: 'M', 27: 'D', 28: 'E', 29: 'V', 30: 'R', 31: 'T', 32: 'L', 33: 'Q', 34: 'E', 35: 'N', 36: 'L', 37: 'H', 38: 'P', 39: 'L', 40: 'W', 41: 'H', 42: 'E', 43: 'Y', 44: 'F', 45: 'Q', 46: 'Q', 47: 'T', 48: 'E', 53: 'S', 54: 'P', 55: 'L', 56: 'A', 57: 'Q', 58: 'Q', 59: 'I', 60: 'E', 61: 'Y', 62: 'G', 63: 'H', 64: 'V', 65: 'L', 66: 'I', 67: 'H', 68: 'Q', 69: 'A', 70: 'R', 71: 'A', 72: 'A', 73: 'G', 74: 'R', 75: 'M', 76: 'D', 77: 'E', 78: 'V', 79: 'R', 80: 'R', 81: 'L', 82: 'S', 83: 'E', 84: 'N', 85: 'T', 86: 'L', 87: 'Q', 88: 'L', 89: 'M', 90: 'K', 91: 'E', 92: 'Y', 93: 'F', 94: 'Q', 95: 'Q'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5OD9_B.pdb ! residue not defined for rnum = 50
{4: 'S', 5: 'P', 6: 'L', 7: 'A', 8: 'Q', 9: 'Q', 10: 'I', 11: 'K', 12: 'N', 13: 'T', 14: 'L', 15: 'T', 16: 'F', 17: 'I', 18: 'G', 19: 'Q', 20: 'A', 21: 'N', 22: 'A', 23: 'A', 24: 'G', 25: 'R', 26: 'M', 27: 'D', 28: 'E', 29: 'V', 30: 'R', 31: 'T', 32: 'L', 33: 'Q', 34: 'E', 35: 'N', 36: 'L', 37: 'H', 38: 'P', 39: 'L', 40: 'W', 41: 'H', 42: 'E', 43: 'Y', 44: 'F', 45: 'Q', 46: 'Q', 47: 'T', 48: 'E', 53: 'S', 54: 'P', 55: 'L', 56: 'A', 57: 'Q', 58: 'Q', 59: 'I', 60: 'E', 61: 'Y', 62: 'G', 63: 'H', 64: 'V', 65: 'L', 66: 'I', 67: 'H', 68: 'Q', 69: 'A', 70: 'R', 71: 'A', 72: 'A', 73: 'G', 74: 'R', 75: 'M', 76: 'D', 77: 'E', 78: 'V', 79: 'R', 80: 'R', 81: 'L', 82: 'S', 83: 'E', 84: 'N', 85: 'T', 86: 'L', 87: 'Q', 88: 'L', 89: 'M', 90: 'K', 91: 'E', 92: 'Y', 93: 'F', 94: 'Q', 95: 'Q'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5OD9_B.pdb ! residue not defined for rnum = 51
{4: 'S', 5: 'P', 6: 'L', 7: 'A', 8: 'Q', 9: 'Q', 10: 'I', 11: 'K', 12: 'N', 13: 'T', 14: 'L', 15: 'T', 16: 'F', 17: 'I', 18: 'G', 19: 'Q', 20: 'A', 21: 'N', 22: 'A', 23: 'A', 24: 'G', 25: 'R', 26: 'M', 27: 'D', 28: 'E', 29: 'V', 30: 'R', 31: 'T', 32: 'L', 33: 'Q', 34: 'E', 35: 'N', 36: 'L', 37: 'H', 38: 'P', 39: 'L', 40: 'W', 41: 'H', 42: 'E', 43: 'Y', 44: 'F', 45: 'Q', 46: 'Q', 47: 'T', 48: 'E', 53: 'S', 54: 'P', 55: 'L', 56: 'A', 57: 'Q', 58: 'Q', 59: 'I', 60: 'E', 61: 'Y', 62: 'G', 63: 'H', 64: 'V', 65: 'L', 66: 'I', 67: 'H', 68: 'Q', 69: 'A', 70: 'R', 71: 'A', 72: 'A', 73: 'G', 74: 'R', 75: 'M', 76: 'D', 77: 'E', 78: 'V', 79: 'R', 80: 'R', 81: 'L', 82: 'S', 83: 'E', 84: 'N', 85: 'T', 86: 'L', 87: 'Q', 88: 'L', 89: 'M', 90: 'K', 91: 'E', 92: 'Y', 93: 'F', 94: 'Q', 95: 'Q'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5OD9_B.pdb ! residue not defined for rnum = 52
 95
 (95, 95)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.024275
5XKJ_F
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5XKJ_F.pdb ! residue not defined for rnum = 26
{1: 'T', 2: 'G', 3: 'S', 4: 'S', 5: 'L', 6: 'P', 7: 'D', 8: 'C', 9: 'S', 10: 'Y', 11: 'A', 12: 'C', 13: 'G', 14: 'A', 15: 'C', 16: 'S', 17: 'P', 18: 'C', 19: 'K', 20: 'R', 21: 'V', 22: 'M', 23: 'I', 24: 'S', 25: 'F', 33: 'C', 34: 'S', 35: 'V', 36: 'I', 37: 'Y', 38: 'R', 39: 'C', 40: 'T', 41: 'C', 42: 'R', 43: 'G', 44: 'R', 45: 'Y', 46: 'Y', 47: 'H', 48: 'V', 49: 'P', 50: 'S', 51: 'R', 52: 'A'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5XKJ_F.pdb ! residue not defined for rnum = 27
{1: 'T', 2: 'G', 3: 'S', 4: 'S', 5: 'L', 6: 'P', 7: 'D', 8: 'C', 9: 'S', 10: 'Y', 11: 'A', 12: 'C', 13: 'G', 14: 'A', 15: 'C', 16: 'S', 17: 'P', 18: 'C', 19: 'K', 20: 'R', 21: 'V', 22: 'M', 23: 'I', 24: 'S', 25: 'F', 33: 'C', 34: 'S', 35: 'V', 36: 'I', 37: 'Y', 38: 'R', 39: 'C', 40: 'T', 41: 'C', 42: 'R', 43: 'G', 44: 'R', 45: 'Y', 46: 'Y', 47: 'H', 48: 'V', 49: 'P', 50: 'S', 51: 'R', 52: 'A'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5XKJ_F.pdb ! residue not defined for rnum = 28
{1: 'T', 2: 'G', 3: 'S', 4: 'S', 5: 'L', 6: 'P', 7: 'D', 8: 'C', 9: 'S', 10: 'Y', 11: 'A', 12: 'C', 13: 'G', 14: 'A', 15: 'C', 16: 'S', 17: 'P', 18: 'C', 19: 'K', 20: 'R', 21: 'V', 22: 'M', 23: 'I', 24: 'S', 25: 'F', 33: 'C', 34: 'S', 35: 'V', 36: 'I', 37: 'Y', 38: 'R', 39: 'C', 40: 'T', 41: 'C', 42: 'R', 43: 'G', 44: 'R', 45: 'Y', 46: 'Y', 47: 'H', 48: 'V', 49: 'P', 50: 'S', 51: 'R', 52: 'A'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5XKJ_F.pdb ! residue not defined for rnum = 29
{1: 'T', 2: 'G', 3: 'S', 4: 'S', 5: 'L', 6: 'P', 7: 'D', 8: 'C', 9: 'S', 10: 'Y', 11: 'A', 12: 'C', 13: 'G', 14: 'A', 15: 'C', 16: 'S', 17: 'P', 18: 'C', 19: 'K', 20: 'R', 21: 'V', 22: 'M', 23: 'I', 24: 'S', 25: 'F', 33: 'C', 34: 'S', 35: 'V', 36: 'I', 37: 'Y', 38: 'R', 39: 'C', 40: 'T', 41: 'C', 42: 'R', 43: 'G', 44: 'R', 45: 'Y', 46: 'Y', 47: 'H', 48: 'V', 49: 'P', 50: 'S', 51: 'R', 52: 'A'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5XKJ_F.pdb ! residue not defined for rnum = 30
{1: 'T', 2: 'G', 3: 'S', 4: 'S', 5: 'L', 6: 'P', 7: 'D', 8: 'C', 9: 'S', 10: 'Y', 11: 'A', 12: 'C', 13: 'G', 14: 'A', 15: 'C', 16: 'S', 17: 'P', 18: 'C', 19: 'K', 20: 'R', 21: 'V', 22: 'M', 23: 'I', 24: 'S', 25: 'F', 33: 'C', 34: 'S', 35: 'V', 36: 'I', 37: 'Y', 38: 'R', 39: 'C', 40: 'T', 41: 'C', 42: 'R', 43: 'G', 44: 'R', 45: 'Y', 46: 'Y', 47: 'H', 48: 'V', 49: 'P', 50: 'S', 51: 'R', 52: 'A'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5XKJ_F.pdb ! residue not defined for rnum = 31
{1: 'T', 2: 'G', 3: 'S', 4: 'S', 5: 'L', 6: 'P', 7: 'D', 8: 'C', 9: 'S', 10: 'Y', 11: 'A', 12: 'C', 13: 'G', 14: 'A', 15: 'C', 16: 'S', 17: 'P', 18: 'C', 19: 'K', 20: 'R', 21: 'V', 22: 'M', 23: 'I', 24: 'S', 25: 'F', 33: 'C', 34: 'S', 35: 'V', 36: 'I', 37: 'Y', 38: 'R', 39: 'C', 40: 'T', 41: 'C', 42: 'R', 43: 'G', 44: 'R', 45: 'Y', 46: 'Y', 47: 'H', 48: 'V', 49: 'P', 50: 'S', 51: 'R', 52: 'A'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5XKJ_F.pdb ! residue not defined for rnum = 32
 52
 (52, 52)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.013620
6GDJ_B
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6GDJ_B.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{3: 'P', 4: 'A', 5: 'P', 6: 'L', 7: 'S', 8: 'T', 9: 'M', 10: 'Q', 11: 'T', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'M', 15: 'R', 16: 'L', 17: 'R', 18: 'T', 19: 'Y', 20: 'H', 21: 'P', 22: 'S', 23: 'P', 24: 'I', 25: 'I', 26: 'L', 27: 'K', 28: 'P', 29: 'V', 30: 'E', 31: 'Q', 32: 'A', 33: 'V', 34: 'N', 35: 'H', 36: 'A', 37: 'I', 38: 'T', 39: 'L', 40: 'V', 41: 'N', 42: 'T', 43: 'S', 44: 'P', 45: 'S', 46: 'S', 47: 'V', 48: 'V', 49: 'D', 50: 'A', 51: 'L', 52: 'C', 53: 'R', 54: 'S', 55: 'L', 56: 'A', 57: 'E', 58: 'L', 59: 'C', 60: 'L', 61: 'G', 62: 'L', 63: 'V', 64: 'Q', 65: 'E', 66: 'A', 67: 'I', 68: 'D', 69: 'A', 70: 'S', 71: 'I'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6GDJ_B.pdb ! residue not defined for rnum = 2
 71
 (71, 71)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.018360
6A9W_A
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6A9W_A.pdb ! residue not defined for rnum = 1
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6A9W_A.pdb ! residue not defined for rnum = 2
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{20: 'H', 21: 'M', 22: 'I', 23: 'M', 24: 'E', 25: 'I', 26: 'P', 27: 'A', 28: 'I', 29: 'K', 30: 'A', 31: 'L', 32: 'S', 33: 'R', 34: 'Y', 35: 'A', 36: 'Q', 37: 'W', 38: 'V', 39: 'I', 40: 'W', 41: 'K', 42: 'K', 43: 'E', 44: 'R', 45: 'D', 46: 'T', 47: 'K', 48: 'I', 49: 'P', 50: 'Y', 51: 'N', 52: 'P', 53: 'N', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'K', 57: 'K', 58: 'A', 59: 'S', 60: 'S', 61: 'T', 62: 'D', 63: 'P', 64: 'L', 65: 'A', 66: 'W', 67: 'G', 68: 'D', 69: 'I', 70: 'D', 71: 'E', 72: 'A', 73: 'Q', 74: 'A', 75: 'G', 76: 'L', 77: 'V', 78: 'R', 79: 'Y', 80: 'G', 81: 'A', 82: 'N', 83: 'G', 84: 'L', 85: 'G', 86: 'F', 87: 'V', 88: 'L', 89: 'T', 90: 'K', 91: 'S', 92: 'D', 93: 'P', 94: 'F', 95: 'V', 96: 'F', 97: 'I', 98: 'D', 99: 'L', 100: 'D', 101: 'H', 102: 'V', 103: 'L', 104: 'D', 105: 'E', 106: 'N', 107: 'K', 108: 'R', 109: 'V', 110: 'K', 111: 'C', 112: 'E', 113: 'W', 114: 'A', 115: 'R', 116: 'Q', 117: 'L', 118: 'L', 119: 'K', 120: 'E', 121: 'I', 122: 'K', 123: 'S', 124: 'Y', 125: 'T', 126: 'E', 127: 'I', 128: 'S', 129: 'P', 130: 'S', 131: 'G', 132: 'D', 133: 'G', 134: 'L', 135: 'H', 136: 'V', 137: 'V', 138: 'V', 139: 'S', 140: 'G', 141: 'K', 142: 'L', 143: 'P', 144: 'D', 145: 'Y', 146: 'I', 147: 'K', 148: 'H', 149: 'K', 150: 'T', 151: 'K', 152: 'F', 153: 'D', 154: 'D', 155: 'G', 156: 'S', 157: 'A', 158: 'L', 159: 'E', 160: 'V', 161: 'Y', 162: 'E', 163: 'S', 164: 'G', 165: 'R', 166: 'Y', 167: 'M', 168: 'T', 169: 'I', 170: 'T', 171: 'G', 172: 'E', 173: 'V', 174: 'F', 175: 'D', 176: 'G', 177: 'R', 178: 'D', 179: 'D', 180: 'I', 181: 'K', 182: 'E', 183: 'L', 184: 'D', 185: 'L', 186: 'S', 187: 'I', 188: 'L', 189: 'G', 190: 'E', 191: 'F', 192: 'A', 193: 'E', 194: 'H', 195: 'K', 196: 'I', 211: 'L', 212: 'D', 213: 'D', 214: 'E', 215: 'A', 216: 'I', 217: 'I', 218: 'D', 219: 'L', 220: 'M', 221: 'K', 222: 'R', 223: 'K', 224: 'G', 225: 'Q', 226: 'W', 227: 'P', 228: 'D', 229: 'A', 230: 'P', 231: 'K', 232: 'D', 233: 'G', 234: 'D', 235: 'D', 236: 'W', 237: 'S', 238: 'S', 239: 'L', 240: 'D', 241: 'M', 242: 'S', 243: 'F', 244: 'A', 245: 'N', 246: 'R', 247: 'L', 248: 'A', 249: 'F', 250: 'W', 251: 'C', 252: 'G', 253: 'K', 254: 'D', 255: 'I', 256: 'E', 257: 'R', 258: 'M', 259: 'D', 260: 'R', 261: 'I', 262: 'F', 263: 'R', 264: 'Q', 265: 'S', 266: 'P', 267: 'L', 268: 'M', 269: 'R', 270: 'Q', 271: 'K', 272: 'W', 273: 'D', 274: 'R', 275: 'P', 276: 'T', 277: 'A', 278: 'G', 279: 'S', 280: 'T', 281: 'Y', 282: 'G', 283: 'R', 284: 'I', 285: 'T', 286: 'L', 287: 'K', 288: 'K', 289: 'A', 290: 'C', 291: 'D', 292: 'F', 293: 'V', 294: 'D', 295: 'S', 296: 'V', 297: 'Y', 298: 'D', 299: 'P', 300: 'A', 301: 'L', 302: 'R', 303: 'N', 304: 'E', 305: 'S', 306: 'D', 307: 'C', 308: 'P', 309: 'F', 310: 'E', 311: 'P', 312: 'Y', 313: 'N', 314: 'E'}
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{20: 'H', 21: 'M', 22: 'I', 23: 'M', 24: 'E', 25: 'I', 26: 'P', 27: 'A', 28: 'I', 29: 'K', 30: 'A', 31: 'L', 32: 'S', 33: 'R', 34: 'Y', 35: 'A', 36: 'Q', 37: 'W', 38: 'V', 39: 'I', 40: 'W', 41: 'K', 42: 'K', 43: 'E', 44: 'R', 45: 'D', 46: 'T', 47: 'K', 48: 'I', 49: 'P', 50: 'Y', 51: 'N', 52: 'P', 53: 'N', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'K', 57: 'K', 58: 'A', 59: 'S', 60: 'S', 61: 'T', 62: 'D', 63: 'P', 64: 'L', 65: 'A', 66: 'W', 67: 'G', 68: 'D', 69: 'I', 70: 'D', 71: 'E', 72: 'A', 73: 'Q', 74: 'A', 75: 'G', 76: 'L', 77: 'V', 78: 'R', 79: 'Y', 80: 'G', 81: 'A', 82: 'N', 83: 'G', 84: 'L', 85: 'G', 86: 'F', 87: 'V', 88: 'L', 89: 'T', 90: 'K', 91: 'S', 92: 'D', 93: 'P', 94: 'F', 95: 'V', 96: 'F', 97: 'I', 98: 'D', 99: 'L', 100: 'D', 101: 'H', 102: 'V', 103: 'L', 104: 'D', 105: 'E', 106: 'N', 107: 'K', 108: 'R', 109: 'V', 110: 'K', 111: 'C', 112: 'E', 113: 'W', 114: 'A', 115: 'R', 116: 'Q', 117: 'L', 118: 'L', 119: 'K', 120: 'E', 121: 'I', 122: 'K', 123: 'S', 124: 'Y', 125: 'T', 126: 'E', 127: 'I', 128: 'S', 129: 'P', 130: 'S', 131: 'G', 132: 'D', 133: 'G', 134: 'L', 135: 'H', 136: 'V', 137: 'V', 138: 'V', 139: 'S', 140: 'G', 141: 'K', 142: 'L', 143: 'P', 144: 'D', 145: 'Y', 146: 'I', 147: 'K', 148: 'H', 149: 'K', 150: 'T', 151: 'K', 152: 'F', 153: 'D', 154: 'D', 155: 'G', 156: 'S', 157: 'A', 158: 'L', 159: 'E', 160: 'V', 161: 'Y', 162: 'E', 163: 'S', 164: 'G', 165: 'R', 166: 'Y', 167: 'M', 168: 'T', 169: 'I', 170: 'T', 171: 'G', 172: 'E', 173: 'V', 174: 'F', 175: 'D', 176: 'G', 177: 'R', 178: 'D', 179: 'D', 180: 'I', 181: 'K', 182: 'E', 183: 'L', 184: 'D', 185: 'L', 186: 'S', 187: 'I', 188: 'L', 189: 'G', 190: 'E', 191: 'F', 192: 'A', 193: 'E', 194: 'H', 195: 'K', 196: 'I', 211: 'L', 212: 'D', 213: 'D', 214: 'E', 215: 'A', 216: 'I', 217: 'I', 218: 'D', 219: 'L', 220: 'M', 221: 'K', 222: 'R', 223: 'K', 224: 'G', 225: 'Q', 226: 'W', 227: 'P', 228: 'D', 229: 'A', 230: 'P', 231: 'K', 232: 'D', 233: 'G', 234: 'D', 235: 'D', 236: 'W', 237: 'S', 238: 'S', 239: 'L', 240: 'D', 241: 'M', 242: 'S', 243: 'F', 244: 'A', 245: 'N', 246: 'R', 247: 'L', 248: 'A', 249: 'F', 250: 'W', 251: 'C', 252: 'G', 253: 'K', 254: 'D', 255: 'I', 256: 'E', 257: 'R', 258: 'M', 259: 'D', 260: 'R', 261: 'I', 262: 'F', 263: 'R', 264: 'Q', 265: 'S', 266: 'P', 267: 'L', 268: 'M', 269: 'R', 270: 'Q', 271: 'K', 272: 'W', 273: 'D', 274: 'R', 275: 'P', 276: 'T', 277: 'A', 278: 'G', 279: 'S', 280: 'T', 281: 'Y', 282: 'G', 283: 'R', 284: 'I', 285: 'T', 286: 'L', 287: 'K', 288: 'K', 289: 'A', 290: 'C', 291: 'D', 292: 'F', 293: 'V', 294: 'D', 295: 'S', 296: 'V', 297: 'Y', 298: 'D', 299: 'P', 300: 'A', 301: 'L', 302: 'R', 303: 'N', 304: 'E', 305: 'S', 306: 'D', 307: 'C', 308: 'P', 309: 'F', 310: 'E', 311: 'P', 312: 'Y', 313: 'N', 314: 'E'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6A9W_A.pdb ! residue not defined for rnum = 210
 314
 (314, 314)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.154637
5OQK_A
running..
 Extract distance maps..
 147
 (147, 147)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.047923
5ZOR_A
running..
 Extract distance maps..
 149
 (149, 149)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.048355
5Z9T_B
running..
 Extract distance maps..
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 536
 (536, 536)
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6AHQ_T
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{23: 'A', 24: 'S', 25: 'P', 26: 'I', 27: 'A', 28: 'Y', 29: 'V', 30: 'N', 31: 'L', 32: 'P', 33: 'Q', 34: 'A', 35: 'F', 36: 'V', 37: 'F', 38: 'N', 39: 'V', 40: 'T', 41: 'G', 42: 'D', 43: 'S', 44: 'R', 45: 'D', 46: 'R', 47: 'L', 48: 'V', 49: 'Q', 50: 'I', 51: 'K', 52: 'A', 53: 'Q', 54: 'L', 55: 'M', 56: 'V', 57: 'R', 58: 'G', 59: 'A', 60: 'E', 61: 'N', 62: 'E', 63: 'E', 64: 'L', 65: 'A', 66: 'R', 67: 'Y', 68: 'H', 69: 'S', 70: 'P', 71: 'L', 72: 'I', 73: 'E', 74: 'S', 75: 'S', 76: 'L', 77: 'L', 78: 'S', 79: 'T', 80: 'F', 81: 'A', 82: 'S', 83: 'A', 84: 'T', 85: 'V', 86: 'D', 87: 'Q', 88: 'L', 89: 'R', 90: 'S', 91: 'P', 92: 'T', 93: 'G', 94: 'R', 95: 'V', 96: 'E', 97: 'L', 98: 'R', 99: 'D', 100: 'R', 101: 'A', 102: 'S', 103: 'E', 104: 'D', 105: 'I', 106: 'K', 107: 'A', 108: 'A', 109: 'L', 110: 'N', 111: 'A', 112: 'A', 113: 'V', 114: 'G', 115: 'K', 116: 'P', 117: 'V', 118: 'I', 119: 'E', 120: 'K', 121: 'V', 122: 'L', 123: 'F', 124: 'T', 125: 'D', 126: 'F', 127: 'V', 128: 'I', 129: 'Q'}
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{23: 'A', 24: 'S', 25: 'P', 26: 'I', 27: 'A', 28: 'Y', 29: 'V', 30: 'N', 31: 'L', 32: 'P', 33: 'Q', 34: 'A', 35: 'F', 36: 'V', 37: 'F', 38: 'N', 39: 'V', 40: 'T', 41: 'G', 42: 'D', 43: 'S', 44: 'R', 45: 'D', 46: 'R', 47: 'L', 48: 'V', 49: 'Q', 50: 'I', 51: 'K', 52: 'A', 53: 'Q', 54: 'L', 55: 'M', 56: 'V', 57: 'R', 58: 'G', 59: 'A', 60: 'E', 61: 'N', 62: 'E', 63: 'E', 64: 'L', 65: 'A', 66: 'R', 67: 'Y', 68: 'H', 69: 'S', 70: 'P', 71: 'L', 72: 'I', 73: 'E', 74: 'S', 75: 'S', 76: 'L', 77: 'L', 78: 'S', 79: 'T', 80: 'F', 81: 'A', 82: 'S', 83: 'A', 84: 'T', 85: 'V', 86: 'D', 87: 'Q', 88: 'L', 89: 'R', 90: 'S', 91: 'P', 92: 'T', 93: 'G', 94: 'R', 95: 'V', 96: 'E', 97: 'L', 98: 'R', 99: 'D', 100: 'R', 101: 'A', 102: 'S', 103: 'E', 104: 'D', 105: 'I', 106: 'K', 107: 'A', 108: 'A', 109: 'L', 110: 'N', 111: 'A', 112: 'A', 113: 'V', 114: 'G', 115: 'K', 116: 'P', 117: 'V', 118: 'I', 119: 'E', 120: 'K', 121: 'V', 122: 'L', 123: 'F', 124: 'T', 125: 'D', 126: 'F', 127: 'V', 128: 'I', 129: 'Q'}
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6AHQ_T.pdb ! residue not defined for rnum = 21
{23: 'A', 24: 'S', 25: 'P', 26: 'I', 27: 'A', 28: 'Y', 29: 'V', 30: 'N', 31: 'L', 32: 'P', 33: 'Q', 34: 'A', 35: 'F', 36: 'V', 37: 'F', 38: 'N', 39: 'V', 40: 'T', 41: 'G', 42: 'D', 43: 'S', 44: 'R', 45: 'D', 46: 'R', 47: 'L', 48: 'V', 49: 'Q', 50: 'I', 51: 'K', 52: 'A', 53: 'Q', 54: 'L', 55: 'M', 56: 'V', 57: 'R', 58: 'G', 59: 'A', 60: 'E', 61: 'N', 62: 'E', 63: 'E', 64: 'L', 65: 'A', 66: 'R', 67: 'Y', 68: 'H', 69: 'S', 70: 'P', 71: 'L', 72: 'I', 73: 'E', 74: 'S', 75: 'S', 76: 'L', 77: 'L', 78: 'S', 79: 'T', 80: 'F', 81: 'A', 82: 'S', 83: 'A', 84: 'T', 85: 'V', 86: 'D', 87: 'Q', 88: 'L', 89: 'R', 90: 'S', 91: 'P', 92: 'T', 93: 'G', 94: 'R', 95: 'V', 96: 'E', 97: 'L', 98: 'R', 99: 'D', 100: 'R', 101: 'A', 102: 'S', 103: 'E', 104: 'D', 105: 'I', 106: 'K', 107: 'A', 108: 'A', 109: 'L', 110: 'N', 111: 'A', 112: 'A', 113: 'V', 114: 'G', 115: 'K', 116: 'P', 117: 'V', 118: 'I', 119: 'E', 120: 'K', 121: 'V', 122: 'L', 123: 'F', 124: 'T', 125: 'D', 126: 'F', 127: 'V', 128: 'I', 129: 'Q'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6AHQ_T.pdb ! residue not defined for rnum = 22
 129
 (129, 129)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.031836
6A9J_B
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6A9J_B.pdb ! residue not defined for rnum = 365
 379
 (379, 379)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.222104
6EDB_B
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6EDB_B.pdb ! residue not defined for rnum = 5
{7: 'K', 8: 'R', 9: 'P', 10: 'M', 11: 'N', 12: 'A', 13: 'F', 14: 'I', 15: 'V', 16: 'W', 17: 'S', 18: 'R', 19: 'D', 20: 'Q', 21: 'R', 22: 'R', 23: 'K', 24: 'M', 25: 'A', 26: 'L', 27: 'E', 28: 'N', 29: 'P', 30: 'R', 31: 'M', 32: 'R', 33: 'N', 34: 'S', 35: 'E', 36: 'I', 37: 'S', 38: 'K', 39: 'Q', 40: 'L', 41: 'G', 42: 'Y', 43: 'Q', 44: 'W', 45: 'K', 46: 'M', 47: 'L', 48: 'T', 49: 'E', 50: 'A', 51: 'E', 52: 'K', 53: 'W', 54: 'P', 55: 'F', 56: 'F', 57: 'Q', 58: 'E', 59: 'A', 60: 'Q', 61: 'K', 62: 'L', 63: 'Q', 64: 'A', 65: 'M', 66: 'H', 67: 'R', 68: 'E', 69: 'K', 70: 'Y', 71: 'P', 72: 'N', 73: 'Y'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6EDB_B.pdb ! residue not defined for rnum = 6
 73
 (73, 73)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.018198
6CMK_A
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CMK_A.pdb ! residue not defined for rnum = 1
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{31: 'E', 32: 'D', 33: 'V', 34: 'T', 35: 'A', 36: 'W', 37: 'R', 38: 'L', 39: 'F', 40: 'I', 41: 'A', 42: 'D', 43: 'H', 44: 'D', 45: 'K', 46: 'P', 47: 'V', 48: 'V', 49: 'N', 50: 'V', 51: 'I', 52: 'D', 53: 'A', 54: 'L', 55: 'D', 56: 'G', 57: 'D', 58: 'K', 59: 'L', 60: 'A', 61: 'T', 62: 'F', 63: 'N', 64: 'V', 65: 'K', 66: 'G', 67: 'P', 68: 'A', 69: 'N', 70: 'L', 71: 'S', 72: 'R', 73: 'S', 74: 'E', 75: 'S', 76: 'G', 77: 'A', 78: 'T', 79: 'I', 80: 'F', 81: 'A', 82: 'I', 83: 'Q', 84: 'G', 85: 'S', 86: 'A', 87: 'G', 88: 'V', 89: 'V', 90: 'S', 91: 'T', 92: 'I', 93: 'A', 94: 'S', 95: 'G', 96: 'I', 97: 'A', 98: 'F', 99: 'H', 100: 'D', 101: 'H', 102: 'G', 103: 'D', 104: 'H', 105: 'A', 106: 'D', 107: 'I', 108: 'D', 109: 'I', 110: 'D', 111: 'A', 112: 'P', 113: 'K', 114: 'L', 115: 'L', 116: 'P', 117: 'L', 118: 'E', 119: 'L', 120: 'T', 121: 'G', 122: 'K', 123: 'K', 124: 'P', 125: 'G', 126: 'H', 127: 'F', 128: 'V', 129: 'E', 130: 'R', 131: 'Q', 132: 'G', 133: 'K', 134: 'I', 135: 'A', 136: 'Q', 137: 'W', 138: 'F', 139: 'D', 140: 'G', 141: 'E', 142: 'D', 143: 'S', 144: 'A', 145: 'Q', 146: 'I', 147: 'L', 148: 'G', 149: 'E', 150: 'S', 151: 'A', 152: 'V', 153: 'L', 154: 'K', 155: 'G', 156: 'Q', 157: 'K', 158: 'N', 159: 'I', 160: 'T', 161: 'K', 162: 'V', 163: 'N', 164: 'V', 165: 'V', 166: 'A', 167: 'P', 168: 'H', 169: 'H', 170: 'G', 171: 'V', 172: 'A', 173: 'V', 174: 'P', 175: 'Y', 176: 'D', 177: 'N', 178: 'Y', 179: 'A', 180: 'V', 181: 'V', 182: 'S', 183: 'I', 184: 'P', 185: 'N', 186: 'P', 187: 'D', 188: 'D', 189: 'A', 190: 'S', 191: 'K', 192: 'R', 193: 'P', 194: 'V', 195: 'G', 196: 'A', 197: 'R', 198: 'V', 199: 'V', 200: 'D', 201: 'L', 202: 'Q', 203: 'G', 204: 'K', 205: 'K', 206: 'V', 207: 'G', 208: 'D', 209: 'D', 210: 'A', 211: 'L', 212: 'C', 213: 'P', 214: 'G', 215: 'L', 216: 'H', 217: 'G', 218: 'S', 219: 'A', 220: 'G', 221: 'S', 222: 'G', 223: 'D', 224: 'T', 225: 'F', 226: 'A', 227: 'L', 228: 'S', 229: 'C', 230: 'E', 231: 'T', 232: 'G', 233: 'L', 234: 'L', 235: 'L', 236: 'I', 237: 'T', 238: 'Q', 239: 'K', 240: 'N', 241: 'A', 242: 'A', 243: 'P', 244: 'V', 245: 'I', 246: 'R', 247: 'H', 248: 'L', 249: 'P', 250: 'Y', 251: 'A', 252: 'K', 253: 'T', 254: 'L', 255: 'P', 256: 'E', 257: 'G', 258: 'S', 259: 'T', 260: 'S', 261: 'T', 262: 'L', 263: 'I', 264: 'G', 265: 'G', 266: 'K', 267: 'G', 268: 'M', 269: 'Q', 270: 'Y', 271: 'F', 272: 'I', 273: 'G', 274: 'N', 275: 'Y', 276: 'G', 277: 'P', 278: 'D', 279: 'R', 280: 'I', 281: 'I', 282: 'L', 283: 'V', 284: 'D', 285: 'P', 286: 'T', 287: 'E', 288: 'S', 289: 'D', 290: 'S', 291: 'F', 292: 'R', 293: 'L', 294: 'I', 295: 'Q', 296: 'L', 297: 'P', 298: 'T', 299: 'R', 300: 'R', 301: 'V', 302: 'H', 303: 'F', 304: 'V', 305: 'V', 306: 'D', 307: 'P', 308: 'V', 309: 'R', 310: 'A', 311: 'K', 312: 'F', 313: 'A', 314: 'Y', 315: 'V', 316: 'F', 317: 'T', 318: 'E', 319: 'D', 320: 'G', 321: 'K', 322: 'L', 323: 'N', 324: 'Q', 325: 'I', 326: 'D', 327: 'V', 328: 'L', 329: 'K', 330: 'G', 331: 'E', 332: 'I', 333: 'S', 334: 'Q', 335: 'S', 336: 'V', 337: 'R', 338: 'V', 339: 'T', 340: 'D', 341: 'P', 342: 'Y', 343: 'S', 344: 'M', 345: 'D', 346: 'G', 347: 'H', 348: 'W', 349: 'N', 350: 'D', 351: 'P', 352: 'R', 353: 'P', 354: 'R', 355: 'I', 356: 'A', 357: 'V', 358: 'A', 359: 'D', 360: 'N', 361: 'K', 362: 'I', 363: 'Y', 364: 'V', 365: 'T', 366: 'D', 367: 'P', 368: 'L', 369: 'K', 370: 'S', 371: 'K', 372: 'I', 373: 'I', 374: 'V', 375: 'L', 376: 'D', 377: 'A', 378: 'T', 379: 'S', 380: 'F', 381: 'K', 382: 'K', 383: 'T', 384: 'S', 385: 'E', 386: 'I', 387: 'S', 388: 'V', 389: 'E', 390: 'G', 391: 'Q', 392: 'P', 393: 'F', 394: 'N', 395: 'I', 396: 'V', 397: 'A', 398: 'V', 399: 'G', 400: 'G', 401: 'S', 402: 'G', 403: 'K', 404: 'V', 405: 'H'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CMK_A.pdb ! residue not defined for rnum = 30
 405
 (405, 405)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.263105
6NU4_A
running..
 Extract distance maps..
 56
 (56, 56)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.015647
6AE8_D
running..
 Extract distance maps..
{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6AE8_D.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6AE8_D.pdb ! residue not defined for rnum = 98
{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
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{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6AE8_D.pdb ! residue not defined for rnum = 105
{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6AE8_D.pdb ! residue not defined for rnum = 106
{108: 'E', 109: 'D', 110: 'D', 111: 'E', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'E', 115: 'D', 116: 'D', 117: 'D', 118: 'F', 119: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6AE8_D.pdb ! residue not defined for rnum = 107
 119
 (119, 119)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.011358
6HC2_X
running..
 Extract distance maps..
{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6HC2_X.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6HC2_X.pdb ! residue not defined for rnum = 2
{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6HC2_X.pdb ! residue not defined for rnum = 3
{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6HC2_X.pdb ! residue not defined for rnum = 4
{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6HC2_X.pdb ! residue not defined for rnum = 5
{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6HC2_X.pdb ! residue not defined for rnum = 6
{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6HC2_X.pdb ! residue not defined for rnum = 7
{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
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{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
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{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
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{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
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{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
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{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
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{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
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{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
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{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
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{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
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{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
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{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
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{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
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{9: 'G', 10: 'N', 11: 'S', 12: 'A', 13: 'L', 14: 'L', 15: 'S', 16: 'L', 17: 'P', 18: 'G', 19: 'Y', 20: 'R', 21: 'P', 22: 'T', 23: 'T', 24: 'R', 45: 'F', 46: 'Y', 47: 'M', 48: 'G', 49: 'T', 50: 'C', 51: 'Q', 52: 'D', 53: 'E', 54: 'P', 55: 'E', 56: 'Q', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'D', 60: 'W', 61: 'N', 62: 'R', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'Q', 68: 'Q'}
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6HC2_X.pdb ! residue not defined for rnum = 43
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6HC2_X.pdb ! residue not defined for rnum = 44
 68
 (68, 68)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.012764
5Z2I_D
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5Z2I_D.pdb ! residue not defined for rnum = 1
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 99
 (99, 99)
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 96
 (96, 96)
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6HPV_A
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6HPV_A.pdb ! residue not defined for rnum = 307
 370
 (370, 370)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.178524
6DKA_I
running..
 Extract distance maps..
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 233
 (233, 233)
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6D2S_A
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 284
 (284, 284)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.144963
6DGN_B
running..
 Extract distance maps..
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 95
 (95, 95)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.024564
5ZT7_B
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT7_B.pdb ! residue not defined for rnum = 10
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZT7_B.pdb ! residue not defined for rnum = 11
 263
 (263, 263)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.123802
6AE1_B
running..
 Extract distance maps..
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{21: 'M', 22: 'T', 23: 'F', 24: 'A', 25: 'H', 26: 'E', 27: 'V', 28: 'V', 29: 'K', 30: 'S', 31: 'N', 32: 'V', 33: 'K', 45: 'V', 46: 'L', 47: 'F', 48: 'N', 49: 'G', 50: 'L', 51: 'T', 52: 'T', 53: 'S', 54: 'K', 55: 'L', 56: 'R', 57: 'N', 58: 'L', 59: 'M', 60: 'E', 61: 'Q', 62: 'V', 63: 'N', 64: 'R', 65: 'L', 66: 'Y', 67: 'T', 68: 'I', 69: 'A', 70: 'F', 71: 'N', 72: 'S', 73: 'N', 74: 'E', 75: 'D', 76: 'Q', 77: 'L', 78: 'N', 79: 'E', 80: 'E', 81: 'F', 82: 'I', 83: 'D', 84: 'E', 85: 'L', 86: 'E', 87: 'Y', 88: 'L', 89: 'K', 90: 'I', 91: 'K', 92: 'F', 93: 'Y', 94: 'Y', 95: 'E', 96: 'A', 97: 'G', 98: 'R', 99: 'E', 100: 'K', 101: 'S', 102: 'V', 103: 'D', 104: 'E', 105: 'F', 106: 'L', 107: 'K', 108: 'K', 109: 'T', 110: 'L', 111: 'M', 112: 'F', 113: 'P', 114: 'I', 115: 'I', 116: 'D', 117: 'R', 118: 'V', 119: 'I', 120: 'K', 121: 'K', 122: 'E', 123: 'S', 124: 'K', 125: 'K', 126: 'F', 127: 'F', 128: 'L', 129: 'D', 130: 'Y', 131: 'C', 132: 'K', 133: 'Y', 134: 'F', 135: 'E', 136: 'A', 137: 'L', 138: 'V', 139: 'A', 140: 'Y', 141: 'A', 142: 'K', 143: 'Y', 144: 'Y', 145: 'Q'}
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{21: 'M', 22: 'T', 23: 'F', 24: 'A', 25: 'H', 26: 'E', 27: 'V', 28: 'V', 29: 'K', 30: 'S', 31: 'N', 32: 'V', 33: 'K', 45: 'V', 46: 'L', 47: 'F', 48: 'N', 49: 'G', 50: 'L', 51: 'T', 52: 'T', 53: 'S', 54: 'K', 55: 'L', 56: 'R', 57: 'N', 58: 'L', 59: 'M', 60: 'E', 61: 'Q', 62: 'V', 63: 'N', 64: 'R', 65: 'L', 66: 'Y', 67: 'T', 68: 'I', 69: 'A', 70: 'F', 71: 'N', 72: 'S', 73: 'N', 74: 'E', 75: 'D', 76: 'Q', 77: 'L', 78: 'N', 79: 'E', 80: 'E', 81: 'F', 82: 'I', 83: 'D', 84: 'E', 85: 'L', 86: 'E', 87: 'Y', 88: 'L', 89: 'K', 90: 'I', 91: 'K', 92: 'F', 93: 'Y', 94: 'Y', 95: 'E', 96: 'A', 97: 'G', 98: 'R', 99: 'E', 100: 'K', 101: 'S', 102: 'V', 103: 'D', 104: 'E', 105: 'F', 106: 'L', 107: 'K', 108: 'K', 109: 'T', 110: 'L', 111: 'M', 112: 'F', 113: 'P', 114: 'I', 115: 'I', 116: 'D', 117: 'R', 118: 'V', 119: 'I', 120: 'K', 121: 'K', 122: 'E', 123: 'S', 124: 'K', 125: 'K', 126: 'F', 127: 'F', 128: 'L', 129: 'D', 130: 'Y', 131: 'C', 132: 'K', 133: 'Y', 134: 'F', 135: 'E', 136: 'A', 137: 'L', 138: 'V', 139: 'A', 140: 'Y', 141: 'A', 142: 'K', 143: 'Y', 144: 'Y', 145: 'Q'}
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{21: 'M', 22: 'T', 23: 'F', 24: 'A', 25: 'H', 26: 'E', 27: 'V', 28: 'V', 29: 'K', 30: 'S', 31: 'N', 32: 'V', 33: 'K', 45: 'V', 46: 'L', 47: 'F', 48: 'N', 49: 'G', 50: 'L', 51: 'T', 52: 'T', 53: 'S', 54: 'K', 55: 'L', 56: 'R', 57: 'N', 58: 'L', 59: 'M', 60: 'E', 61: 'Q', 62: 'V', 63: 'N', 64: 'R', 65: 'L', 66: 'Y', 67: 'T', 68: 'I', 69: 'A', 70: 'F', 71: 'N', 72: 'S', 73: 'N', 74: 'E', 75: 'D', 76: 'Q', 77: 'L', 78: 'N', 79: 'E', 80: 'E', 81: 'F', 82: 'I', 83: 'D', 84: 'E', 85: 'L', 86: 'E', 87: 'Y', 88: 'L', 89: 'K', 90: 'I', 91: 'K', 92: 'F', 93: 'Y', 94: 'Y', 95: 'E', 96: 'A', 97: 'G', 98: 'R', 99: 'E', 100: 'K', 101: 'S', 102: 'V', 103: 'D', 104: 'E', 105: 'F', 106: 'L', 107: 'K', 108: 'K', 109: 'T', 110: 'L', 111: 'M', 112: 'F', 113: 'P', 114: 'I', 115: 'I', 116: 'D', 117: 'R', 118: 'V', 119: 'I', 120: 'K', 121: 'K', 122: 'E', 123: 'S', 124: 'K', 125: 'K', 126: 'F', 127: 'F', 128: 'L', 129: 'D', 130: 'Y', 131: 'C', 132: 'K', 133: 'Y', 134: 'F', 135: 'E', 136: 'A', 137: 'L', 138: 'V', 139: 'A', 140: 'Y', 141: 'A', 142: 'K', 143: 'Y', 144: 'Y', 145: 'Q'}
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{21: 'M', 22: 'T', 23: 'F', 24: 'A', 25: 'H', 26: 'E', 27: 'V', 28: 'V', 29: 'K', 30: 'S', 31: 'N', 32: 'V', 33: 'K', 45: 'V', 46: 'L', 47: 'F', 48: 'N', 49: 'G', 50: 'L', 51: 'T', 52: 'T', 53: 'S', 54: 'K', 55: 'L', 56: 'R', 57: 'N', 58: 'L', 59: 'M', 60: 'E', 61: 'Q', 62: 'V', 63: 'N', 64: 'R', 65: 'L', 66: 'Y', 67: 'T', 68: 'I', 69: 'A', 70: 'F', 71: 'N', 72: 'S', 73: 'N', 74: 'E', 75: 'D', 76: 'Q', 77: 'L', 78: 'N', 79: 'E', 80: 'E', 81: 'F', 82: 'I', 83: 'D', 84: 'E', 85: 'L', 86: 'E', 87: 'Y', 88: 'L', 89: 'K', 90: 'I', 91: 'K', 92: 'F', 93: 'Y', 94: 'Y', 95: 'E', 96: 'A', 97: 'G', 98: 'R', 99: 'E', 100: 'K', 101: 'S', 102: 'V', 103: 'D', 104: 'E', 105: 'F', 106: 'L', 107: 'K', 108: 'K', 109: 'T', 110: 'L', 111: 'M', 112: 'F', 113: 'P', 114: 'I', 115: 'I', 116: 'D', 117: 'R', 118: 'V', 119: 'I', 120: 'K', 121: 'K', 122: 'E', 123: 'S', 124: 'K', 125: 'K', 126: 'F', 127: 'F', 128: 'L', 129: 'D', 130: 'Y', 131: 'C', 132: 'K', 133: 'Y', 134: 'F', 135: 'E', 136: 'A', 137: 'L', 138: 'V', 139: 'A', 140: 'Y', 141: 'A', 142: 'K', 143: 'Y', 144: 'Y', 145: 'Q'}
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{21: 'M', 22: 'T', 23: 'F', 24: 'A', 25: 'H', 26: 'E', 27: 'V', 28: 'V', 29: 'K', 30: 'S', 31: 'N', 32: 'V', 33: 'K', 45: 'V', 46: 'L', 47: 'F', 48: 'N', 49: 'G', 50: 'L', 51: 'T', 52: 'T', 53: 'S', 54: 'K', 55: 'L', 56: 'R', 57: 'N', 58: 'L', 59: 'M', 60: 'E', 61: 'Q', 62: 'V', 63: 'N', 64: 'R', 65: 'L', 66: 'Y', 67: 'T', 68: 'I', 69: 'A', 70: 'F', 71: 'N', 72: 'S', 73: 'N', 74: 'E', 75: 'D', 76: 'Q', 77: 'L', 78: 'N', 79: 'E', 80: 'E', 81: 'F', 82: 'I', 83: 'D', 84: 'E', 85: 'L', 86: 'E', 87: 'Y', 88: 'L', 89: 'K', 90: 'I', 91: 'K', 92: 'F', 93: 'Y', 94: 'Y', 95: 'E', 96: 'A', 97: 'G', 98: 'R', 99: 'E', 100: 'K', 101: 'S', 102: 'V', 103: 'D', 104: 'E', 105: 'F', 106: 'L', 107: 'K', 108: 'K', 109: 'T', 110: 'L', 111: 'M', 112: 'F', 113: 'P', 114: 'I', 115: 'I', 116: 'D', 117: 'R', 118: 'V', 119: 'I', 120: 'K', 121: 'K', 122: 'E', 123: 'S', 124: 'K', 125: 'K', 126: 'F', 127: 'F', 128: 'L', 129: 'D', 130: 'Y', 131: 'C', 132: 'K', 133: 'Y', 134: 'F', 135: 'E', 136: 'A', 137: 'L', 138: 'V', 139: 'A', 140: 'Y', 141: 'A', 142: 'K', 143: 'Y', 144: 'Y', 145: 'Q'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6AE1_B.pdb ! residue not defined for rnum = 44
 145
 (145, 145)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.035271
5Z34_A
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5Z34_A.pdb ! residue not defined for rnum = 4
 365
 (365, 365)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.251203
6D9F_B
running..
 Extract distance maps..
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 325
 (325, 325)
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6G8Y_A
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 92
 (92, 92)
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6DTD_A
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 1125
 (1125, 1125)
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 Writing distance map file.. 
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 97
 (97, 97)
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 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.038901
5ZNS_A
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZNS_A.pdb ! residue not defined for rnum = 1
 382
 (382, 382)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.270975
6GMS_A
running..
 Extract distance maps..
 132
 (132, 132)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.041083
6CZT_A
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CZT_A.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{9: 'Q', 10: 'A', 11: 'P', 12: 'K', 13: 'G', 14: 'S', 15: 'A', 16: 'F', 17: 'V', 18: 'R', 19: 'A', 20: 'Y', 21: 'N', 22: 'A', 23: 'G', 24: 'N', 25: 'S', 26: 'E', 27: 'L', 28: 'D', 29: 'V', 30: 'S', 31: 'V', 32: 'G', 33: 'S', 34: 'T', 35: 'S', 36: 'L', 37: 'N', 38: 'D', 39: 'V', 40: 'A', 41: 'P', 42: 'L', 43: 'G', 44: 'S', 45: 'S', 46: 'D', 47: 'F', 48: 'K', 49: 'F', 50: 'L', 51: 'P', 52: 'P', 53: 'G', 54: 'S', 55: 'Y', 56: 'T', 57: 'A', 58: 'Q', 59: 'V', 60: 'G', 61: 'Q', 62: 'Q', 63: 'S', 64: 'L', 65: 'P', 66: 'V', 67: 'K', 68: 'L', 69: 'D', 70: 'P', 71: 'D', 72: 'S', 73: 'Y', 74: 'Y', 75: 'T', 76: 'L', 77: 'V', 78: 'S', 79: 'Q', 80: 'P', 81: 'G', 82: 'G', 83: 'K', 84: 'P', 85: 'Q', 86: 'L', 87: 'V', 88: 'A', 89: 'E', 90: 'P'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CZT_A.pdb ! residue not defined for rnum = 2
{9: 'Q', 10: 'A', 11: 'P', 12: 'K', 13: 'G', 14: 'S', 15: 'A', 16: 'F', 17: 'V', 18: 'R', 19: 'A', 20: 'Y', 21: 'N', 22: 'A', 23: 'G', 24: 'N', 25: 'S', 26: 'E', 27: 'L', 28: 'D', 29: 'V', 30: 'S', 31: 'V', 32: 'G', 33: 'S', 34: 'T', 35: 'S', 36: 'L', 37: 'N', 38: 'D', 39: 'V', 40: 'A', 41: 'P', 42: 'L', 43: 'G', 44: 'S', 45: 'S', 46: 'D', 47: 'F', 48: 'K', 49: 'F', 50: 'L', 51: 'P', 52: 'P', 53: 'G', 54: 'S', 55: 'Y', 56: 'T', 57: 'A', 58: 'Q', 59: 'V', 60: 'G', 61: 'Q', 62: 'Q', 63: 'S', 64: 'L', 65: 'P', 66: 'V', 67: 'K', 68: 'L', 69: 'D', 70: 'P', 71: 'D', 72: 'S', 73: 'Y', 74: 'Y', 75: 'T', 76: 'L', 77: 'V', 78: 'S', 79: 'Q', 80: 'P', 81: 'G', 82: 'G', 83: 'K', 84: 'P', 85: 'Q', 86: 'L', 87: 'V', 88: 'A', 89: 'E', 90: 'P'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CZT_A.pdb ! residue not defined for rnum = 3
{9: 'Q', 10: 'A', 11: 'P', 12: 'K', 13: 'G', 14: 'S', 15: 'A', 16: 'F', 17: 'V', 18: 'R', 19: 'A', 20: 'Y', 21: 'N', 22: 'A', 23: 'G', 24: 'N', 25: 'S', 26: 'E', 27: 'L', 28: 'D', 29: 'V', 30: 'S', 31: 'V', 32: 'G', 33: 'S', 34: 'T', 35: 'S', 36: 'L', 37: 'N', 38: 'D', 39: 'V', 40: 'A', 41: 'P', 42: 'L', 43: 'G', 44: 'S', 45: 'S', 46: 'D', 47: 'F', 48: 'K', 49: 'F', 50: 'L', 51: 'P', 52: 'P', 53: 'G', 54: 'S', 55: 'Y', 56: 'T', 57: 'A', 58: 'Q', 59: 'V', 60: 'G', 61: 'Q', 62: 'Q', 63: 'S', 64: 'L', 65: 'P', 66: 'V', 67: 'K', 68: 'L', 69: 'D', 70: 'P', 71: 'D', 72: 'S', 73: 'Y', 74: 'Y', 75: 'T', 76: 'L', 77: 'V', 78: 'S', 79: 'Q', 80: 'P', 81: 'G', 82: 'G', 83: 'K', 84: 'P', 85: 'Q', 86: 'L', 87: 'V', 88: 'A', 89: 'E', 90: 'P'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CZT_A.pdb ! residue not defined for rnum = 4
{9: 'Q', 10: 'A', 11: 'P', 12: 'K', 13: 'G', 14: 'S', 15: 'A', 16: 'F', 17: 'V', 18: 'R', 19: 'A', 20: 'Y', 21: 'N', 22: 'A', 23: 'G', 24: 'N', 25: 'S', 26: 'E', 27: 'L', 28: 'D', 29: 'V', 30: 'S', 31: 'V', 32: 'G', 33: 'S', 34: 'T', 35: 'S', 36: 'L', 37: 'N', 38: 'D', 39: 'V', 40: 'A', 41: 'P', 42: 'L', 43: 'G', 44: 'S', 45: 'S', 46: 'D', 47: 'F', 48: 'K', 49: 'F', 50: 'L', 51: 'P', 52: 'P', 53: 'G', 54: 'S', 55: 'Y', 56: 'T', 57: 'A', 58: 'Q', 59: 'V', 60: 'G', 61: 'Q', 62: 'Q', 63: 'S', 64: 'L', 65: 'P', 66: 'V', 67: 'K', 68: 'L', 69: 'D', 70: 'P', 71: 'D', 72: 'S', 73: 'Y', 74: 'Y', 75: 'T', 76: 'L', 77: 'V', 78: 'S', 79: 'Q', 80: 'P', 81: 'G', 82: 'G', 83: 'K', 84: 'P', 85: 'Q', 86: 'L', 87: 'V', 88: 'A', 89: 'E', 90: 'P'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CZT_A.pdb ! residue not defined for rnum = 5
{9: 'Q', 10: 'A', 11: 'P', 12: 'K', 13: 'G', 14: 'S', 15: 'A', 16: 'F', 17: 'V', 18: 'R', 19: 'A', 20: 'Y', 21: 'N', 22: 'A', 23: 'G', 24: 'N', 25: 'S', 26: 'E', 27: 'L', 28: 'D', 29: 'V', 30: 'S', 31: 'V', 32: 'G', 33: 'S', 34: 'T', 35: 'S', 36: 'L', 37: 'N', 38: 'D', 39: 'V', 40: 'A', 41: 'P', 42: 'L', 43: 'G', 44: 'S', 45: 'S', 46: 'D', 47: 'F', 48: 'K', 49: 'F', 50: 'L', 51: 'P', 52: 'P', 53: 'G', 54: 'S', 55: 'Y', 56: 'T', 57: 'A', 58: 'Q', 59: 'V', 60: 'G', 61: 'Q', 62: 'Q', 63: 'S', 64: 'L', 65: 'P', 66: 'V', 67: 'K', 68: 'L', 69: 'D', 70: 'P', 71: 'D', 72: 'S', 73: 'Y', 74: 'Y', 75: 'T', 76: 'L', 77: 'V', 78: 'S', 79: 'Q', 80: 'P', 81: 'G', 82: 'G', 83: 'K', 84: 'P', 85: 'Q', 86: 'L', 87: 'V', 88: 'A', 89: 'E', 90: 'P'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CZT_A.pdb ! residue not defined for rnum = 6
{9: 'Q', 10: 'A', 11: 'P', 12: 'K', 13: 'G', 14: 'S', 15: 'A', 16: 'F', 17: 'V', 18: 'R', 19: 'A', 20: 'Y', 21: 'N', 22: 'A', 23: 'G', 24: 'N', 25: 'S', 26: 'E', 27: 'L', 28: 'D', 29: 'V', 30: 'S', 31: 'V', 32: 'G', 33: 'S', 34: 'T', 35: 'S', 36: 'L', 37: 'N', 38: 'D', 39: 'V', 40: 'A', 41: 'P', 42: 'L', 43: 'G', 44: 'S', 45: 'S', 46: 'D', 47: 'F', 48: 'K', 49: 'F', 50: 'L', 51: 'P', 52: 'P', 53: 'G', 54: 'S', 55: 'Y', 56: 'T', 57: 'A', 58: 'Q', 59: 'V', 60: 'G', 61: 'Q', 62: 'Q', 63: 'S', 64: 'L', 65: 'P', 66: 'V', 67: 'K', 68: 'L', 69: 'D', 70: 'P', 71: 'D', 72: 'S', 73: 'Y', 74: 'Y', 75: 'T', 76: 'L', 77: 'V', 78: 'S', 79: 'Q', 80: 'P', 81: 'G', 82: 'G', 83: 'K', 84: 'P', 85: 'Q', 86: 'L', 87: 'V', 88: 'A', 89: 'E', 90: 'P'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CZT_A.pdb ! residue not defined for rnum = 7
{9: 'Q', 10: 'A', 11: 'P', 12: 'K', 13: 'G', 14: 'S', 15: 'A', 16: 'F', 17: 'V', 18: 'R', 19: 'A', 20: 'Y', 21: 'N', 22: 'A', 23: 'G', 24: 'N', 25: 'S', 26: 'E', 27: 'L', 28: 'D', 29: 'V', 30: 'S', 31: 'V', 32: 'G', 33: 'S', 34: 'T', 35: 'S', 36: 'L', 37: 'N', 38: 'D', 39: 'V', 40: 'A', 41: 'P', 42: 'L', 43: 'G', 44: 'S', 45: 'S', 46: 'D', 47: 'F', 48: 'K', 49: 'F', 50: 'L', 51: 'P', 52: 'P', 53: 'G', 54: 'S', 55: 'Y', 56: 'T', 57: 'A', 58: 'Q', 59: 'V', 60: 'G', 61: 'Q', 62: 'Q', 63: 'S', 64: 'L', 65: 'P', 66: 'V', 67: 'K', 68: 'L', 69: 'D', 70: 'P', 71: 'D', 72: 'S', 73: 'Y', 74: 'Y', 75: 'T', 76: 'L', 77: 'V', 78: 'S', 79: 'Q', 80: 'P', 81: 'G', 82: 'G', 83: 'K', 84: 'P', 85: 'Q', 86: 'L', 87: 'V', 88: 'A', 89: 'E', 90: 'P'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CZT_A.pdb ! residue not defined for rnum = 8
 90
 (90, 90)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.022544
5ZER_B
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 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZER_B.pdb ! residue not defined for rnum = 268
 354
 (354, 354)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.233729
5ZX9_A
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZX9_A.pdb ! residue not defined for rnum = 252
{110: 'P', 111: 'V', 112: 'R', 113: 'I', 114: 'D', 115: 'N', 116: 'P', 117: 'V', 118: 'G', 119: 'G', 120: 'F', 121: 'S', 122: 'F', 123: 'A', 124: 'L', 125: 'P', 126: 'A', 127: 'G', 128: 'W', 129: 'V', 130: 'E', 131: 'S', 132: 'D', 133: 'A', 134: 'A', 135: 'H', 136: 'F', 137: 'D', 138: 'Y', 139: 'G', 140: 'S', 141: 'A', 142: 'L', 143: 'L', 144: 'S', 145: 'K', 146: 'T', 147: 'T', 148: 'G', 149: 'D', 150: 'P', 151: 'P', 152: 'F', 153: 'P', 154: 'G', 155: 'Q', 156: 'P', 157: 'P', 158: 'P', 159: 'V', 160: 'A', 161: 'N', 162: 'D', 163: 'T', 164: 'R', 165: 'I', 166: 'V', 167: 'L', 168: 'G', 169: 'R', 170: 'L', 171: 'D', 172: 'Q', 173: 'K', 174: 'L', 175: 'Y', 180: 'A', 181: 'T', 182: 'D', 183: 'S', 184: 'K', 185: 'A', 186: 'A', 187: 'A', 188: 'R', 189: 'L', 190: 'G', 191: 'S', 192: 'D', 193: 'M', 194: 'G', 195: 'E', 196: 'F', 197: 'Y', 198: 'M', 199: 'P', 200: 'Y', 201: 'P', 202: 'G', 203: 'T', 204: 'R', 205: 'I', 206: 'N', 207: 'Q', 208: 'E', 209: 'T', 210: 'V', 211: 'S', 212: 'L', 213: 'D', 214: 'A', 215: 'N', 216: 'G', 217: 'V', 218: 'S', 219: 'G', 220: 'S', 221: 'A', 222: 'S', 223: 'Y', 224: 'Y', 225: 'E', 226: 'V', 227: 'K', 228: 'F', 229: 'S', 230: 'D', 231: 'P', 232: 'S', 233: 'K', 234: 'P', 235: 'N', 236: 'G', 237: 'Q', 238: 'I', 239: 'W', 240: 'T', 241: 'G', 242: 'V', 243: 'I', 244: 'G', 245: 'S', 246: 'P', 256: 'P', 257: 'Q', 258: 'R', 259: 'W', 260: 'F', 261: 'V', 262: 'V', 263: 'W', 264: 'L', 265: 'G', 266: 'T', 267: 'A', 268: 'N', 269: 'N', 270: 'P', 271: 'V', 272: 'D', 273: 'K', 274: 'G', 275: 'A', 276: 'A', 277: 'K', 278: 'A', 279: 'L', 280: 'A', 281: 'E', 282: 'S', 283: 'I', 284: 'R', 285: 'P', 286: 'L', 287: 'V'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZX9_A.pdb ! residue not defined for rnum = 253
{110: 'P', 111: 'V', 112: 'R', 113: 'I', 114: 'D', 115: 'N', 116: 'P', 117: 'V', 118: 'G', 119: 'G', 120: 'F', 121: 'S', 122: 'F', 123: 'A', 124: 'L', 125: 'P', 126: 'A', 127: 'G', 128: 'W', 129: 'V', 130: 'E', 131: 'S', 132: 'D', 133: 'A', 134: 'A', 135: 'H', 136: 'F', 137: 'D', 138: 'Y', 139: 'G', 140: 'S', 141: 'A', 142: 'L', 143: 'L', 144: 'S', 145: 'K', 146: 'T', 147: 'T', 148: 'G', 149: 'D', 150: 'P', 151: 'P', 152: 'F', 153: 'P', 154: 'G', 155: 'Q', 156: 'P', 157: 'P', 158: 'P', 159: 'V', 160: 'A', 161: 'N', 162: 'D', 163: 'T', 164: 'R', 165: 'I', 166: 'V', 167: 'L', 168: 'G', 169: 'R', 170: 'L', 171: 'D', 172: 'Q', 173: 'K', 174: 'L', 175: 'Y', 180: 'A', 181: 'T', 182: 'D', 183: 'S', 184: 'K', 185: 'A', 186: 'A', 187: 'A', 188: 'R', 189: 'L', 190: 'G', 191: 'S', 192: 'D', 193: 'M', 194: 'G', 195: 'E', 196: 'F', 197: 'Y', 198: 'M', 199: 'P', 200: 'Y', 201: 'P', 202: 'G', 203: 'T', 204: 'R', 205: 'I', 206: 'N', 207: 'Q', 208: 'E', 209: 'T', 210: 'V', 211: 'S', 212: 'L', 213: 'D', 214: 'A', 215: 'N', 216: 'G', 217: 'V', 218: 'S', 219: 'G', 220: 'S', 221: 'A', 222: 'S', 223: 'Y', 224: 'Y', 225: 'E', 226: 'V', 227: 'K', 228: 'F', 229: 'S', 230: 'D', 231: 'P', 232: 'S', 233: 'K', 234: 'P', 235: 'N', 236: 'G', 237: 'Q', 238: 'I', 239: 'W', 240: 'T', 241: 'G', 242: 'V', 243: 'I', 244: 'G', 245: 'S', 246: 'P', 256: 'P', 257: 'Q', 258: 'R', 259: 'W', 260: 'F', 261: 'V', 262: 'V', 263: 'W', 264: 'L', 265: 'G', 266: 'T', 267: 'A', 268: 'N', 269: 'N', 270: 'P', 271: 'V', 272: 'D', 273: 'K', 274: 'G', 275: 'A', 276: 'A', 277: 'K', 278: 'A', 279: 'L', 280: 'A', 281: 'E', 282: 'S', 283: 'I', 284: 'R', 285: 'P', 286: 'L', 287: 'V'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZX9_A.pdb ! residue not defined for rnum = 254
{110: 'P', 111: 'V', 112: 'R', 113: 'I', 114: 'D', 115: 'N', 116: 'P', 117: 'V', 118: 'G', 119: 'G', 120: 'F', 121: 'S', 122: 'F', 123: 'A', 124: 'L', 125: 'P', 126: 'A', 127: 'G', 128: 'W', 129: 'V', 130: 'E', 131: 'S', 132: 'D', 133: 'A', 134: 'A', 135: 'H', 136: 'F', 137: 'D', 138: 'Y', 139: 'G', 140: 'S', 141: 'A', 142: 'L', 143: 'L', 144: 'S', 145: 'K', 146: 'T', 147: 'T', 148: 'G', 149: 'D', 150: 'P', 151: 'P', 152: 'F', 153: 'P', 154: 'G', 155: 'Q', 156: 'P', 157: 'P', 158: 'P', 159: 'V', 160: 'A', 161: 'N', 162: 'D', 163: 'T', 164: 'R', 165: 'I', 166: 'V', 167: 'L', 168: 'G', 169: 'R', 170: 'L', 171: 'D', 172: 'Q', 173: 'K', 174: 'L', 175: 'Y', 180: 'A', 181: 'T', 182: 'D', 183: 'S', 184: 'K', 185: 'A', 186: 'A', 187: 'A', 188: 'R', 189: 'L', 190: 'G', 191: 'S', 192: 'D', 193: 'M', 194: 'G', 195: 'E', 196: 'F', 197: 'Y', 198: 'M', 199: 'P', 200: 'Y', 201: 'P', 202: 'G', 203: 'T', 204: 'R', 205: 'I', 206: 'N', 207: 'Q', 208: 'E', 209: 'T', 210: 'V', 211: 'S', 212: 'L', 213: 'D', 214: 'A', 215: 'N', 216: 'G', 217: 'V', 218: 'S', 219: 'G', 220: 'S', 221: 'A', 222: 'S', 223: 'Y', 224: 'Y', 225: 'E', 226: 'V', 227: 'K', 228: 'F', 229: 'S', 230: 'D', 231: 'P', 232: 'S', 233: 'K', 234: 'P', 235: 'N', 236: 'G', 237: 'Q', 238: 'I', 239: 'W', 240: 'T', 241: 'G', 242: 'V', 243: 'I', 244: 'G', 245: 'S', 246: 'P', 256: 'P', 257: 'Q', 258: 'R', 259: 'W', 260: 'F', 261: 'V', 262: 'V', 263: 'W', 264: 'L', 265: 'G', 266: 'T', 267: 'A', 268: 'N', 269: 'N', 270: 'P', 271: 'V', 272: 'D', 273: 'K', 274: 'G', 275: 'A', 276: 'A', 277: 'K', 278: 'A', 279: 'L', 280: 'A', 281: 'E', 282: 'S', 283: 'I', 284: 'R', 285: 'P', 286: 'L', 287: 'V'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZX9_A.pdb ! residue not defined for rnum = 255
 287
 (287, 287)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.067818
6CSV_D
running..
 Extract distance maps..
{2: 'H', 3: 'M', 4: 'T', 5: 'R', 6: 'F', 7: 'L', 8: 'E', 9: 'E', 10: 'E', 11: 'E', 12: 'L', 13: 'R', 14: 'S', 15: 'H', 16: 'H', 17: 'I', 18: 'L', 19: 'E', 20: 'R', 21: 'L', 22: 'D', 23: 'A', 24: 'H', 25: 'I', 26: 'E', 27: 'E', 28: 'L', 29: 'K', 30: 'R', 31: 'E', 32: 'S', 33: 'E', 34: 'K', 35: 'T', 36: 'V', 37: 'R', 38: 'Q', 39: 'F', 40: 'T', 47: 'S', 48: 'E', 49: 'G', 50: 'A', 51: 'L', 52: 'E', 53: 'E', 54: 'L', 55: 'R', 56: 'G', 57: 'Q', 58: 'Y', 59: 'I', 60: 'K', 61: 'A', 62: 'V', 63: 'K', 64: 'K', 65: 'I', 66: 'K', 67: 'C', 68: 'D', 69: 'M', 70: 'L', 71: 'R', 72: 'Y', 73: 'I', 74: 'Q', 75: 'E', 76: 'S', 77: 'K', 78: 'E', 79: 'R', 80: 'A', 81: 'A', 82: 'E', 83: 'M', 84: 'V', 85: 'K', 86: 'A', 87: 'E', 88: 'V', 89: 'L', 90: 'R', 91: 'E', 92: 'R', 93: 'Q'}
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CSV_D.pdb ! residue not defined for rnum = 43
{2: 'H', 3: 'M', 4: 'T', 5: 'R', 6: 'F', 7: 'L', 8: 'E', 9: 'E', 10: 'E', 11: 'E', 12: 'L', 13: 'R', 14: 'S', 15: 'H', 16: 'H', 17: 'I', 18: 'L', 19: 'E', 20: 'R', 21: 'L', 22: 'D', 23: 'A', 24: 'H', 25: 'I', 26: 'E', 27: 'E', 28: 'L', 29: 'K', 30: 'R', 31: 'E', 32: 'S', 33: 'E', 34: 'K', 35: 'T', 36: 'V', 37: 'R', 38: 'Q', 39: 'F', 40: 'T', 47: 'S', 48: 'E', 49: 'G', 50: 'A', 51: 'L', 52: 'E', 53: 'E', 54: 'L', 55: 'R', 56: 'G', 57: 'Q', 58: 'Y', 59: 'I', 60: 'K', 61: 'A', 62: 'V', 63: 'K', 64: 'K', 65: 'I', 66: 'K', 67: 'C', 68: 'D', 69: 'M', 70: 'L', 71: 'R', 72: 'Y', 73: 'I', 74: 'Q', 75: 'E', 76: 'S', 77: 'K', 78: 'E', 79: 'R', 80: 'A', 81: 'A', 82: 'E', 83: 'M', 84: 'V', 85: 'K', 86: 'A', 87: 'E', 88: 'V', 89: 'L', 90: 'R', 91: 'E', 92: 'R', 93: 'Q'}
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{2: 'H', 3: 'M', 4: 'T', 5: 'R', 6: 'F', 7: 'L', 8: 'E', 9: 'E', 10: 'E', 11: 'E', 12: 'L', 13: 'R', 14: 'S', 15: 'H', 16: 'H', 17: 'I', 18: 'L', 19: 'E', 20: 'R', 21: 'L', 22: 'D', 23: 'A', 24: 'H', 25: 'I', 26: 'E', 27: 'E', 28: 'L', 29: 'K', 30: 'R', 31: 'E', 32: 'S', 33: 'E', 34: 'K', 35: 'T', 36: 'V', 37: 'R', 38: 'Q', 39: 'F', 40: 'T', 47: 'S', 48: 'E', 49: 'G', 50: 'A', 51: 'L', 52: 'E', 53: 'E', 54: 'L', 55: 'R', 56: 'G', 57: 'Q', 58: 'Y', 59: 'I', 60: 'K', 61: 'A', 62: 'V', 63: 'K', 64: 'K', 65: 'I', 66: 'K', 67: 'C', 68: 'D', 69: 'M', 70: 'L', 71: 'R', 72: 'Y', 73: 'I', 74: 'Q', 75: 'E', 76: 'S', 77: 'K', 78: 'E', 79: 'R', 80: 'A', 81: 'A', 82: 'E', 83: 'M', 84: 'V', 85: 'K', 86: 'A', 87: 'E', 88: 'V', 89: 'L', 90: 'R', 91: 'E', 92: 'R', 93: 'Q'}
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{2: 'H', 3: 'M', 4: 'T', 5: 'R', 6: 'F', 7: 'L', 8: 'E', 9: 'E', 10: 'E', 11: 'E', 12: 'L', 13: 'R', 14: 'S', 15: 'H', 16: 'H', 17: 'I', 18: 'L', 19: 'E', 20: 'R', 21: 'L', 22: 'D', 23: 'A', 24: 'H', 25: 'I', 26: 'E', 27: 'E', 28: 'L', 29: 'K', 30: 'R', 31: 'E', 32: 'S', 33: 'E', 34: 'K', 35: 'T', 36: 'V', 37: 'R', 38: 'Q', 39: 'F', 40: 'T', 47: 'S', 48: 'E', 49: 'G', 50: 'A', 51: 'L', 52: 'E', 53: 'E', 54: 'L', 55: 'R', 56: 'G', 57: 'Q', 58: 'Y', 59: 'I', 60: 'K', 61: 'A', 62: 'V', 63: 'K', 64: 'K', 65: 'I', 66: 'K', 67: 'C', 68: 'D', 69: 'M', 70: 'L', 71: 'R', 72: 'Y', 73: 'I', 74: 'Q', 75: 'E', 76: 'S', 77: 'K', 78: 'E', 79: 'R', 80: 'A', 81: 'A', 82: 'E', 83: 'M', 84: 'V', 85: 'K', 86: 'A', 87: 'E', 88: 'V', 89: 'L', 90: 'R', 91: 'E', 92: 'R', 93: 'Q'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CSV_D.pdb ! residue not defined for rnum = 46
 93
 (93, 93)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.023630
5YVQ_B
running..
 Extract distance maps..
 103
 (103, 103)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.028836
6BXS_C
running..
 Extract distance maps..
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{8: 'P', 9: 'L', 10: 'T', 11: 'L', 12: 'R', 13: 'F', 14: 'T', 15: 'C', 16: 'L', 17: 'G', 18: 'D', 19: 'R', 20: 'N', 21: 'V', 22: 'I', 23: 'F', 24: 'F', 25: 'G', 26: 'P', 27: 'S', 28: 'G', 29: 'R', 30: 'Q', 31: 'D', 32: 'G', 33: 'F', 34: 'T', 35: 'P', 36: 'L', 37: 'Y', 38: 'D', 39: 'P', 40: 'S', 41: 'P', 42: 'S', 43: 'K', 44: 'R', 45: 'V', 46: 'A', 47: 'T', 48: 'V', 49: 'D', 50: 'A', 51: 'G', 52: 'T', 53: 'Y', 54: 'G', 55: 'L', 56: 'F', 57: 'I', 58: 'G', 59: 'G', 60: 'V', 61: 'G', 62: 'M', 63: 'N', 64: 'G', 65: 'E', 66: 'F', 67: 'A', 68: 'D', 69: 'T', 70: 'I', 71: 'I', 72: 'E', 73: 'E', 74: 'A', 75: 'R', 76: 'R', 77: 'N', 78: 'R', 79: 'I', 80: 'P', 81: 'L', 82: 'T', 83: 'A', 84: 'T', 85: 'E', 86: 'L', 87: 'S', 88: 'A', 89: 'E', 90: 'S', 91: 'Q', 92: 'E', 93: 'I', 94: 'Q', 95: 'E', 96: 'R', 97: 'L', 98: 'L', 99: 'H', 100: 'D', 101: 'A', 102: 'E', 103: 'R', 104: 'Q', 105: 'P', 106: 'G', 107: 'T', 108: 'L', 109: 'V', 110: 'E', 111: 'I', 112: 'D', 113: 'S', 114: 'G', 115: 'R', 116: 'F', 117: 'S', 118: 'R', 119: 'V', 120: 'F', 121: 'A', 122: 'R', 123: 'S', 124: 'F', 125: 'A', 126: 'Y', 127: 'V', 128: 'A', 129: 'I', 130: 'V', 131: 'P', 132: 'N', 133: 'T', 134: 'V', 135: 'W', 136: 'D', 137: 'E', 138: 'S', 139: 'E', 140: 'T', 141: 'G', 142: 'K', 143: 'N', 144: 'V', 145: 'G', 146: 'A', 147: 'T', 148: 'F', 149: 'L', 150: 'H', 151: 'I', 152: 'L', 153: 'K', 154: 'P', 155: 'E', 156: 'V', 157: 'T', 158: 'P', 159: 'H', 160: 'G', 161: 'N', 162: 'E', 163: 'M', 164: 'N', 165: 'D', 166: 'V', 167: 'M', 168: 'L', 169: 'Y', 170: 'T', 171: 'V', 172: 'A', 173: 'P', 174: 'F', 175: 'G', 176: 'N', 177: 'A', 178: 'S', 179: 'D', 180: 'S', 181: 'A', 182: 'Y', 183: 'N', 184: 'M', 185: 'A', 186: 'Y', 187: 'K', 188: 'A', 189: 'T', 190: 'M', 191: 'L', 192: 'G', 193: 'I', 194: 'V', 195: 'G', 196: 'A', 197: 'V', 198: 'S', 199: 'E', 200: 'Y', 201: 'N', 202: 'K', 203: 'T', 204: 'P', 205: 'W', 206: 'G', 207: 'E', 208: 'V', 209: 'K', 210: 'P', 211: 'V', 212: 'E', 213: 'A', 214: 'I', 215: 'R', 216: 'L', 217: 'P', 218: 'L', 219: 'L', 220: 'G', 221: 'A', 222: 'G', 223: 'H', 224: 'F', 225: 'R', 226: 'G', 227: 'R', 228: 'R', 229: 'G', 230: 'L', 231: 'H', 232: 'S', 233: 'I', 234: 'G', 235: 'R', 236: 'A', 237: 'N', 238: 'A', 239: 'V', 240: 'A', 241: 'V', 242: 'E', 243: 'A', 244: 'A', 245: 'I', 246: 'T', 247: 'R', 248: 'F', 249: 'D', 250: 'P', 251: 'R', 252: 'V', 253: 'E', 254: 'L', 255: 'Q', 256: 'F', 257: 'M', 258: 'Y', 259: 'E', 260: 'P', 261: 'S', 262: 'D', 263: 'T', 264: 'A', 265: 'L', 266: 'R', 267: 'G', 268: 'L', 269: 'M', 270: 'E', 271: 'S', 272: 'E', 273: 'R', 274: 'K', 275: 'Y', 276: 'K', 277: 'F'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6BXS_C.pdb ! residue not defined for rnum = 7
 277
 (277, 277)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.140063
6CGO_B
running..
 Extract distance maps..
{27: 'Q', 28: 'G', 29: 'I', 30: 'D', 31: 'P', 32: 'F', 33: 'T', 34: 'M', 35: 'T', 36: 'I', 37: 'P', 38: 'A', 39: 'L', 40: 'L', 41: 'S', 42: 'E', 43: 'L', 44: 'Q', 45: 'A', 46: 'R', 47: 'G', 48: 'I', 49: 'T', 50: 'L', 51: 'S', 52: 'L', 53: 'A', 54: 'D', 55: 'G', 56: 'E', 57: 'L', 58: 'S', 59: 'F', 60: 'R', 61: 'A', 62: 'P', 63: 'K', 64: 'G', 65: 'A', 66: 'L', 67: 'T', 68: 'P', 69: 'A', 70: 'D', 71: 'R', 72: 'A', 73: 'T', 74: 'L', 75: 'S', 76: 'A', 77: 'R', 78: 'R', 79: 'E', 80: 'A', 81: 'I', 82: 'V', 83: 'A', 84: 'Y', 85: 'L', 86: 'A', 87: 'A', 88: 'K', 89: 'A', 90: 'A', 91: 'R', 92: 'R', 93: 'T', 94: 'D', 95: 'P', 96: 'V', 97: 'T', 98: 'I', 99: 'T', 100: 'P', 101: 'S', 102: 'A', 103: 'E', 104: 'L', 105: 'R', 106: 'P', 107: 'S', 108: 'L', 109: 'L', 110: 'Q', 111: 'E', 112: 'L', 113: 'W', 114: 'W', 115: 'H', 116: 'W', 117: 'Y', 118: 'G', 119: 'L', 120: 'P', 121: 'P', 122: 'R', 123: 'Q', 124: 'L', 125: 'N', 126: 'Q', 127: 'E', 128: 'R', 129: 'L', 130: 'P', 131: 'L', 132: 'V', 133: 'K', 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{27: 'Q', 28: 'G', 29: 'I', 30: 'D', 31: 'P', 32: 'F', 33: 'T', 34: 'M', 35: 'T', 36: 'I', 37: 'P', 38: 'A', 39: 'L', 40: 'L', 41: 'S', 42: 'E', 43: 'L', 44: 'Q', 45: 'A', 46: 'R', 47: 'G', 48: 'I', 49: 'T', 50: 'L', 51: 'S', 52: 'L', 53: 'A', 54: 'D', 55: 'G', 56: 'E', 57: 'L', 58: 'S', 59: 'F', 60: 'R', 61: 'A', 62: 'P', 63: 'K', 64: 'G', 65: 'A', 66: 'L', 67: 'T', 68: 'P', 69: 'A', 70: 'D', 71: 'R', 72: 'A', 73: 'T', 74: 'L', 75: 'S', 76: 'A', 77: 'R', 78: 'R', 79: 'E', 80: 'A', 81: 'I', 82: 'V', 83: 'A', 84: 'Y', 85: 'L', 86: 'A', 87: 'A', 88: 'K', 89: 'A', 90: 'A', 91: 'R', 92: 'R', 93: 'T', 94: 'D', 95: 'P', 96: 'V', 97: 'T', 98: 'I', 99: 'T', 100: 'P', 101: 'S', 102: 'A', 103: 'E', 104: 'L', 105: 'R', 106: 'P', 107: 'S', 108: 'L', 109: 'L', 110: 'Q', 111: 'E', 112: 'L', 113: 'W', 114: 'W', 115: 'H', 116: 'W', 117: 'Y', 118: 'G', 119: 'L', 120: 'P', 121: 'P', 122: 'R', 123: 'Q', 124: 'L', 125: 'N', 126: 'Q', 127: 'E', 128: 'R', 129: 'L', 130: 'P', 131: 'L', 132: 'V', 133: 'K', 134: 'L', 135: 'F', 136: 'P', 137: 'G', 138: 'V', 139: 'T', 140: 'A', 141: 'G', 142: 'R', 143: 'V', 144: 'A', 145: 'E', 146: 'A', 147: 'L', 148: 'R', 149: 'A', 150: 'I', 151: 'V', 152: 'A', 153: 'R', 154: 'H', 155: 'H', 156: 'T', 157: 'L', 158: 'R', 159: 'S', 160: 'S', 161: 'F', 162: 'H', 163: 'E', 164: 'E', 165: 'D', 166: 'G', 167: 'R', 168: 'L', 169: 'T', 170: 'V', 171: 'T', 172: 'L', 173: 'N', 174: 'E', 175: 'A', 176: 'A', 177: 'A', 178: 'L', 179: 'P', 180: 'I', 181: 'E', 182: 'F', 183: 'V', 184: 'E', 185: 'A', 186: 'D', 187: 'G', 188: 'T', 189: 'L', 190: 'P', 191: 'R', 192: 'E', 193: 'E', 194: 'L', 195: 'E', 196: 'P', 197: 'A', 198: 'L', 199: 'K', 200: 'A', 201: 'Q', 202: 'A', 203: 'A', 204: 'E', 205: 'Y', 206: 'A', 207: 'A', 208: 'R', 209: 'Q', 210: 'L', 211: 'P', 212: 'L', 213: 'D', 214: 'G', 215: 'Q', 216: 'W', 217: 'L', 218: 'L', 219: 'R', 220: 'A', 221: 'R', 222: 'V', 223: 'V', 224: 'S', 225: 'L', 226: 'A', 227: 'P', 228: 'D', 229: 'Q', 230: 'S', 231: 'L', 232: 'L', 233: 'L', 234: 'C', 235: 'V', 236: 'F', 237: 'H', 238: 'H', 239: 'I', 240: 'I', 241: 'V', 242: 'D', 243: 'A', 244: 'A', 245: 'S', 246: 'L', 247: 'L', 248: 'L', 249: 'I', 250: 'L', 251: 'A', 252: 'E', 253: 'L', 254: 'D', 255: 'A', 256: 'R', 257: 'L', 258: 'A', 259: 'D', 260: 'P', 261: 'P', 262: 'R', 263: 'A', 264: 'L', 265: 'P', 266: 'A', 267: 'A', 268: 'A', 269: 'Q', 270: 'F', 271: 'L', 272: 'D', 273: 'Y', 274: 'A', 275: 'A', 276: 'W', 277: 'E', 278: 'R', 279: 'A', 280: 'W', 281: 'M', 282: 'A', 283: 'D', 284: 'P', 285: 'A', 286: 'R', 287: 'Q', 288: 'P', 289: 'L', 290: 'I', 291: 'D', 292: 'Y', 293: 'W', 294: 'A', 295: 'R', 296: 'R', 297: 'F', 298: 'R', 299: 'A', 300: 'L', 301: 'P', 302: 'E', 303: 'L', 304: 'V', 305: 'G', 306: 'P', 307: 'L', 308: 'T', 309: 'G', 310: 'R', 311: 'S', 312: 'L', 313: 'A', 314: 'W', 315: 'Q', 316: 'P', 317: 'G', 318: 'S', 319: 'K', 320: 'V', 321: 'D', 322: 'H', 323: 'R', 324: 'F', 325: 'V', 326: 'I', 327: 'P', 328: 'A', 329: 'A', 330: 'Q', 331: 'L', 332: 'R', 333: 'R', 334: 'M', 335: 'Q', 336: 'A', 337: 'A', 338: 'A', 339: 'T', 340: 'R', 341: 'L', 342: 'Q', 343: 'T', 344: 'S', 345: 'L', 346: 'F', 347: 'S', 348: 'A', 349: 'L', 350: 'L', 351: 'S', 352: 'A', 353: 'F', 354: 'G', 355: 'V', 356: 'A', 357: 'L', 358: 'A', 359: 'R', 360: 'W', 361: 'S', 362: 'G', 363: 'S', 364: 'E', 365: 'R', 366: 'V', 367: 'P', 368: 'V', 369: 'R', 370: 'C', 371: 'V', 372: 'G', 373: 'D', 374: 'L', 375: 'R', 376: 'T', 377: 'S', 378: 'P', 379: 'E', 380: 'L', 381: 'A', 382: 'N', 383: 'L', 384: 'V', 385: 'G', 386: 'Y', 387: 'L', 388: 'V', 389: 'C', 390: 'S', 391: 'D', 392: 'V', 393: 'I', 394: 'E', 395: 'I', 396: 'H', 397: 'A', 398: 'P', 399: 'A', 400: 'K', 401: 'A', 402: 'D', 403: 'F', 404: 'V', 405: 'S', 406: 'I', 407: 'L', 408: 'K', 409: 'A', 410: 'S', 411: 'E', 412: 'I', 413: 'E', 414: 'S', 415: 'H', 416: 'S', 417: 'A', 418: 'M', 419: 'M', 420: 'L', 421: 'R', 422: 'V', 423: 'P', 424: 'T', 425: 'L', 426: 'M', 427: 'R', 428: 'H', 429: 'P', 430: 'L', 431: 'H', 432: 'R', 433: 'G', 434: 'G', 435: 'S', 436: 'G', 437: 'I', 438: 'E', 439: 'D', 440: 'P', 441: 'R', 442: 'G', 443: 'I', 444: 'A', 445: 'A', 446: 'T', 447: 'I', 448: 'N', 449: 'M', 450: 'F', 451: 'S', 452: 'V', 453: 'R', 454: 'I', 455: 'P', 462: 'D', 463: 'E', 464: 'R', 465: 'A', 466: 'D', 467: 'P', 468: 'P', 469: 'W', 470: 'P', 471: 'P', 472: 'Q', 473: 'L', 474: 'T', 475: 'R', 476: 'S', 477: 'A', 478: 'G', 479: 'E', 480: 'P', 481: 'W', 482: 'P', 483: 'I', 484: 'P', 485: 'L', 486: 'P', 487: 'S', 488: 'I', 489: 'Y', 490: 'L', 491: 'R', 492: 'L', 493: 'I', 494: 'D', 495: 'Y', 496: 'G', 497: 'H', 498: 'A', 499: 'L', 500: 'E', 501: 'G', 502: 'S', 503: 'L', 504: 'E', 505: 'L', 506: 'N', 507: 'D', 508: 'T', 509: 'L', 510: 'L', 511: 'T', 512: 'A', 513: 'A', 514: 'E', 515: 'Q', 516: 'A', 517: 'A', 518: 'L', 519: 'I', 520: 'E', 521: 'A', 522: 'L', 523: 'F', 524: 'D', 525: 'A', 526: 'L', 527: 'D', 528: 'R', 529: 'F', 530: 'L', 531: 'L', 532: 'Q', 533: 'A', 539: 'P', 540: 'L', 541: 'T', 542: 'T', 543: 'E', 544: 'V', 545: 'L'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CGO_B.pdb ! residue not defined for rnum = 538
 545
 (545, 545)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.480129
5ZME_A
running..
 Extract distance maps..
{1: 'G', 2: 'V', 3: 'F', 4: 'E', 5: 'E', 6: 'L', 7: 'A', 8: 'A', 9: 'G', 10: 'Q', 11: 'Q', 12: 'R', 13: 'K', 14: 'Y', 15: 'I', 16: 'M', 17: 'I', 18: 'S', 19: 'G', 20: 'K', 21: 'G', 22: 'G', 23: 'V', 24: 'G', 25: 'K', 26: 'T', 27: 'S', 28: 'L', 29: 'S', 30: 'A', 31: 'S', 32: 'L', 33: 'A', 34: 'V', 35: 'K', 36: 'L', 37: 'A', 38: 'A', 39: 'A', 40: 'G', 41: 'H', 42: 'T', 43: 'T', 44: 'L', 45: 'V', 46: 'V', 47: 'S', 48: 'T', 49: 'D', 50: 'P', 51: 'A', 52: 'H', 53: 'S', 54: 'L', 55: 'S', 56: 'D', 57: 'S', 58: 'L', 59: 'A', 60: 'Q', 61: 'D', 62: 'V', 63: 'S', 64: 'G', 65: 'G', 66: 'R', 67: 'P', 68: 'V', 69: 'L', 70: 'L', 71: 'Q', 72: 'G', 73: 'T', 74: 'D', 75: 'L', 76: 'P', 77: 'L', 78: 'W', 79: 'G', 80: 'L', 81: 'E', 82: 'I', 83: 'D', 84: 'P', 85: 'E', 86: 'E', 87: 'A', 88: 'K', 89: 'R', 90: 'E', 91: 'F', 92: 'F', 93: 'E', 111: 'Q', 112: 'V', 113: 'S', 114: 'D', 115: 'F', 116: 'M', 117: 'N', 118: 'R', 119: 'M', 120: 'G', 121: 'M', 122: 'G', 123: 'F', 124: 'V', 125: 'I', 126: 'D', 127: 'Q', 128: 'L', 129: 'K', 130: 'E', 131: 'L', 132: 'K', 133: 'L', 134: 'G', 135: 'E', 136: 'L', 137: 'L', 138: 'N', 139: 'T', 140: 'P', 141: 'P', 142: 'P', 143: 'G', 144: 'L', 145: 'D', 146: 'E', 147: 'A', 148: 'V', 149: 'A', 150: 'I', 151: 'A', 152: 'K', 153: 'V', 154: 'V', 155: 'Q', 156: 'F', 157: 'V', 158: 'Q', 159: 'A', 160: 'A', 161: 'E', 162: 'Y', 163: 'A', 164: 'R', 165: 'F', 166: 'S', 167: 'R', 168: 'I', 169: 'V', 170: 'F', 171: 'D', 172: 'T', 173: 'A', 174: 'P', 175: 'T', 182: 'L', 183: 'A', 184: 'L', 185: 'P', 186: 'D', 187: 'F', 188: 'V', 189: 'D', 190: 'A', 191: 'S', 192: 'L', 193: 'A', 194: 'K', 195: 'V', 196: 'I', 197: 'R', 198: 'L', 199: 'R', 200: 'K', 201: 'K', 202: 'L', 203: 'N', 204: 'G', 205: 'A', 206: 'T', 207: 'S', 208: 'V', 209: 'V', 210: 'R', 211: 'G', 212: 'L', 213: 'F', 214: 'G', 215: 'A', 216: 'G', 217: 'E', 218: 'S', 219: 'Q', 220: 'D', 221: 'E', 222: 'A', 223: 'V', 224: 'E', 225: 'K', 226: 'L', 227: 'E', 228: 'L', 229: 'L', 230: 'Q', 231: 'Q', 232: 'R', 233: 'V', 234: 'R', 235: 'M', 236: 'V', 237: 'K', 238: 'A', 239: 'L', 240: 'F', 241: 'R', 242: 'D', 243: 'K', 244: 'T', 245: 'Q', 246: 'T', 247: 'E', 248: 'F', 249: 'I', 250: 'I', 251: 'A', 252: 'T', 253: 'I', 254: 'P', 255: 'T', 256: 'Y', 257: 'L', 258: 'G', 259: 'V', 260: 'N', 261: 'E', 262: 'S', 263: 'S', 264: 'R', 265: 'L', 266: 'L', 267: 'Q', 268: 'A', 269: 'L', 270: 'R', 271: 'A', 272: 'E', 273: 'Q', 274: 'I', 275: 'P', 276: 'C', 277: 'K', 278: 'R', 279: 'I', 280: 'I', 281: 'V', 282: 'N', 283: 'Q', 284: 'I', 285: 'V', 286: 'G', 287: 'P', 288: 'Q', 289: 'Q', 290: 'G', 291: 'D', 292: 'A', 293: 'Y', 294: 'L', 295: 'R', 296: 'M', 297: 'K', 298: 'M', 299: 'K', 300: 'D', 301: 'Q', 302: 'I', 303: 'A', 304: 'A', 305: 'L', 306: 'E', 307: 'M', 308: 'V', 309: 'A', 310: 'N', 311: 'D', 312: 'P', 313: 'G', 314: 'L', 315: 'R', 316: 'P', 317: 'L', 318: 'R', 319: 'K', 320: 'V', 321: 'I', 322: 'A', 323: 'P', 324: 'M', 325: 'V', 326: 'D', 327: 'V', 328: 'E', 329: 'V', 330: 'R', 331: 'G', 332: 'V', 333: 'P', 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{1: 'G', 2: 'V', 3: 'F', 4: 'E', 5: 'E', 6: 'L', 7: 'A', 8: 'A', 9: 'G', 10: 'Q', 11: 'Q', 12: 'R', 13: 'K', 14: 'Y', 15: 'I', 16: 'M', 17: 'I', 18: 'S', 19: 'G', 20: 'K', 21: 'G', 22: 'G', 23: 'V', 24: 'G', 25: 'K', 26: 'T', 27: 'S', 28: 'L', 29: 'S', 30: 'A', 31: 'S', 32: 'L', 33: 'A', 34: 'V', 35: 'K', 36: 'L', 37: 'A', 38: 'A', 39: 'A', 40: 'G', 41: 'H', 42: 'T', 43: 'T', 44: 'L', 45: 'V', 46: 'V', 47: 'S', 48: 'T', 49: 'D', 50: 'P', 51: 'A', 52: 'H', 53: 'S', 54: 'L', 55: 'S', 56: 'D', 57: 'S', 58: 'L', 59: 'A', 60: 'Q', 61: 'D', 62: 'V', 63: 'S', 64: 'G', 65: 'G', 66: 'R', 67: 'P', 68: 'V', 69: 'L', 70: 'L', 71: 'Q', 72: 'G', 73: 'T', 74: 'D', 75: 'L', 76: 'P', 77: 'L', 78: 'W', 79: 'G', 80: 'L', 81: 'E', 82: 'I', 83: 'D', 84: 'P', 85: 'E', 86: 'E', 87: 'A', 88: 'K', 89: 'R', 90: 'E', 91: 'F', 92: 'F', 93: 'E', 111: 'Q', 112: 'V', 113: 'S', 114: 'D', 115: 'F', 116: 'M', 117: 'N', 118: 'R', 119: 'M', 120: 'G', 121: 'M', 122: 'G', 123: 'F', 124: 'V', 125: 'I', 126: 'D', 127: 'Q', 128: 'L', 129: 'K', 130: 'E', 131: 'L', 132: 'K', 133: 'L', 134: 'G', 135: 'E', 136: 'L', 137: 'L', 138: 'N', 139: 'T', 140: 'P', 141: 'P', 142: 'P', 143: 'G', 144: 'L', 145: 'D', 146: 'E', 147: 'A', 148: 'V', 149: 'A', 150: 'I', 151: 'A', 152: 'K', 153: 'V', 154: 'V', 155: 'Q', 156: 'F', 157: 'V', 158: 'Q', 159: 'A', 160: 'A', 161: 'E', 162: 'Y', 163: 'A', 164: 'R', 165: 'F', 166: 'S', 167: 'R', 168: 'I', 169: 'V', 170: 'F', 171: 'D', 172: 'T', 173: 'A', 174: 'P', 175: 'T', 182: 'L', 183: 'A', 184: 'L', 185: 'P', 186: 'D', 187: 'F', 188: 'V', 189: 'D', 190: 'A', 191: 'S', 192: 'L', 193: 'A', 194: 'K', 195: 'V', 196: 'I', 197: 'R', 198: 'L', 199: 'R', 200: 'K', 201: 'K', 202: 'L', 203: 'N', 204: 'G', 205: 'A', 206: 'T', 207: 'S', 208: 'V', 209: 'V', 210: 'R', 211: 'G', 212: 'L', 213: 'F', 214: 'G', 215: 'A', 216: 'G', 217: 'E', 218: 'S', 219: 'Q', 220: 'D', 221: 'E', 222: 'A', 223: 'V', 224: 'E', 225: 'K', 226: 'L', 227: 'E', 228: 'L', 229: 'L', 230: 'Q', 231: 'Q', 232: 'R', 233: 'V', 234: 'R', 235: 'M', 236: 'V', 237: 'K', 238: 'A', 239: 'L', 240: 'F', 241: 'R', 242: 'D', 243: 'K', 244: 'T', 245: 'Q', 246: 'T', 247: 'E', 248: 'F', 249: 'I', 250: 'I', 251: 'A', 252: 'T', 253: 'I', 254: 'P', 255: 'T', 256: 'Y', 257: 'L', 258: 'G', 259: 'V', 260: 'N', 261: 'E', 262: 'S', 263: 'S', 264: 'R', 265: 'L', 266: 'L', 267: 'Q', 268: 'A', 269: 'L', 270: 'R', 271: 'A', 272: 'E', 273: 'Q', 274: 'I', 275: 'P', 276: 'C', 277: 'K', 278: 'R', 279: 'I', 280: 'I', 281: 'V', 282: 'N', 283: 'Q', 284: 'I', 285: 'V', 286: 'G', 287: 'P', 288: 'Q', 289: 'Q', 290: 'G', 291: 'D', 292: 'A', 293: 'Y', 294: 'L', 295: 'R', 296: 'M', 297: 'K', 298: 'M', 299: 'K', 300: 'D', 301: 'Q', 302: 'I', 303: 'A', 304: 'A', 305: 'L', 306: 'E', 307: 'M', 308: 'V', 309: 'A', 310: 'N', 311: 'D', 312: 'P', 313: 'G', 314: 'L', 315: 'R', 316: 'P', 317: 'L', 318: 'R', 319: 'K', 320: 'V', 321: 'I', 322: 'A', 323: 'P', 324: 'M', 325: 'V', 326: 'D', 327: 'V', 328: 'E', 329: 'V', 330: 'R', 331: 'G', 332: 'V', 333: 'P', 334: 'A', 335: 'L', 336: 'S', 337: 'Y', 338: 'F', 339: 'G', 340: 'N', 341: 'V', 342: 'V', 343: 'W', 344: 'K', 345: 'D', 346: 'V', 347: 'Y', 348: 'D', 349: 'Q', 350: 'M', 351: 'N', 352: 'Q', 353: 'G', 354: 'A', 355: 'D', 356: 'R', 357: 'K', 358: 'F', 359: 'F', 360: 'L', 361: 'L', 362: 'G', 363: 'G', 364: 'K', 365: 'G', 366: 'G', 367: 'V', 368: 'G', 369: 'K', 370: 'T', 371: 'S', 372: 'C', 373: 'S', 374: 'S', 375: 'S', 376: 'L', 377: 'A', 378: 'V', 379: 'H', 380: 'F', 381: 'A', 382: 'N', 383: 'D', 384: 'G', 385: 'L', 386: 'P', 387: 'T', 388: 'L', 389: 'V', 390: 'V', 391: 'S', 392: 'T', 393: 'D', 394: 'P', 395: 'A', 396: 'H', 397: 'S', 398: 'L', 399: 'S', 400: 'D', 401: 'A', 402: 'F', 403: 'D', 404: 'Q', 405: 'D', 406: 'L', 407: 'S', 408: 'G', 409: 'G', 410: 'S', 411: 'P', 412: 'V', 413: 'K', 414: 'I', 415: 'T', 416: 'S', 417: 'P', 418: 'L', 419: 'G', 420: 'D', 421: 'E', 422: 'L', 423: 'P', 424: 'L', 425: 'W', 426: 'G', 427: 'L', 428: 'Q', 429: 'L', 430: 'D', 431: 'P', 432: 'E', 433: 'Q', 434: 'A', 435: 'K', 436: 'A', 437: 'E', 438: 'L', 439: 'R', 440: 'A', 441: 'V', 442: 'L', 443: 'A', 444: 'D', 453: 'T', 454: 'L', 455: 'D', 456: 'G', 457: 'L', 458: 'G', 459: 'L', 460: 'G', 461: 'V', 462: 'I', 463: 'S', 464: 'D', 465: 'Q', 466: 'L', 467: 'K', 468: 'D', 469: 'L', 470: 'Q', 471: 'L', 472: 'G', 473: 'E', 474: 'L', 475: 'L', 476: 'D', 477: 'T', 478: 'P', 479: 'P', 480: 'P', 481: 'G', 482: 'V', 483: 'D', 484: 'E', 485: 'A', 486: 'I', 487: 'A', 488: 'I', 489: 'A', 490: 'K', 491: 'V', 492: 'V', 493: 'Q', 494: 'F', 495: 'L', 496: 'K', 497: 'A', 498: 'P', 499: 'E', 500: 'Y', 501: 'S', 502: 'H', 503: 'F', 504: 'K', 505: 'R', 506: 'I', 507: 'V', 508: 'F', 509: 'D', 510: 'T', 511: 'A', 512: 'P', 513: 'T', 514: 'G', 515: 'H', 516: 'T', 517: 'L', 518: 'R', 519: 'L', 520: 'L', 521: 'S', 522: 'L', 523: 'P', 524: 'D', 525: 'F', 526: 'L', 527: 'D', 528: 'A', 529: 'S', 530: 'I', 531: 'G', 532: 'K', 533: 'L', 534: 'V', 535: 'R', 536: 'L', 537: 'R', 538: 'Q', 539: 'K', 540: 'L', 541: 'S', 542: 'A', 543: 'A', 544: 'T', 562: 'A', 563: 'V', 564: 'K', 565: 'R', 566: 'L', 567: 'E', 568: 'A', 569: 'L', 570: 'Q', 571: 'A', 572: 'S', 573: 'M', 574: 'E', 575: 'D', 576: 'A', 577: 'K', 578: 'A', 579: 'M', 580: 'F', 581: 'R', 582: 'N', 583: 'Q', 584: 'Q', 585: 'T', 586: 'T', 587: 'E', 588: 'F', 589: 'I', 590: 'I', 591: 'V', 592: 'T', 593: 'I', 594: 'P', 595: 'T', 596: 'V', 597: 'M', 598: 'A', 599: 'T', 600: 'A', 601: 'E', 602: 'S', 603: 'C', 604: 'R', 605: 'L', 606: 'A', 607: 'S', 608: 'A', 609: 'L', 610: 'Q', 611: 'H', 612: 'E', 613: 'G', 614: 'I', 615: 'P', 616: 'L', 617: 'K', 618: 'T', 619: 'I', 620: 'I', 621: 'V', 622: 'N', 623: 'Q', 624: 'V', 625: 'V', 626: 'Q', 627: 'A', 628: 'N', 629: 'A', 630: 'T', 631: 'D', 632: 'K', 633: 'F', 634: 'L', 635: 'T', 636: 'A', 637: 'R', 638: 'R', 639: 'A', 640: 'D', 641: 'Q', 642: 'A', 643: 'R', 644: 'A', 645: 'L', 646: 'H', 647: 'H', 648: 'L', 649: 'E', 650: 'E', 651: 'D', 652: 'T', 653: 'G', 654: 'P', 655: 'D', 656: 'G', 657: 'L', 658: 'A', 659: 'S', 660: 'L', 661: 'Q', 662: 'L', 663: 'I', 664: 'K', 665: 'A', 666: 'P', 667: 'L', 668: 'C', 669: 'D', 670: 'L', 671: 'E', 672: 'V', 673: 'R', 674: 'G', 675: 'V', 676: 'P', 677: 'A', 678: 'L', 679: 'S', 680: 'Y', 681: 'F', 682: 'G', 683: 'N', 684: 'V', 685: 'V', 686: 'W'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZME_A.pdb ! residue not defined for rnum = 561
 686
 (686, 686)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.736565
6A2W_A
running..
 Extract distance maps..
 166
 (166, 166)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.058379
6GW7_A
running..
 Extract distance maps..
 59
 (59, 59)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.015897
6D0I_D
running..
 Extract distance maps..
{2: 'L', 3: 'G', 4: 'L', 5: 'A', 6: 'K', 7: 'L', 8: 'V', 9: 'G', 10: 'Q', 11: 'L', 12: 'E', 13: 'D', 14: 'M', 15: 'V', 16: 'E', 17: 'E', 18: 'S', 19: 'G', 20: 'E', 21: 'T', 22: 'D', 23: 'G', 24: 'F', 25: 'D', 26: 'A', 27: 'P', 28: 'E', 29: 'W', 30: 'L', 31: 'S', 32: 'S', 33: 'W', 34: 'L', 35: 'R', 36: 'Q', 37: 'P', 38: 'L', 39: 'P', 40: 'A', 41: 'L', 42: 'G', 43: 'G', 44: 'V', 45: 'N', 46: 'P', 47: 'I', 48: 'D', 49: 'L', 50: 'L', 51: 'D', 52: 'T', 53: 'M', 54: 'E', 55: 'G', 56: 'Q', 57: 'A', 58: 'V', 59: 'V', 60: 'S', 61: 'R', 62: 'A', 63: 'L', 64: 'A', 65: 'Q', 66: 'I', 67: 'Q', 68: 'S', 69: 'G', 70: 'A', 71: 'F', 72: 'A'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6D0I_D.pdb ! residue not defined for rnum = 1
 72
 (72, 72)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.018912
6BEA_A
running..
 Extract distance maps..
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6DLO_A
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 358
 (358, 358)
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6E9B_D
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{33: 'N', 34: 'D', 35: 'D', 36: 'P', 37: 'H', 38: 'I', 39: 'L', 40: 'A', 41: 'P', 42: 'V', 43: 'F', 44: 'P', 45: 'D', 46: 'R', 47: 'T', 48: 'N', 49: 'G', 50: 'Q', 51: 'L', 52: 'A', 53: 'T', 54: 'F', 55: 'A', 56: 'N', 57: 'I', 58: 'S', 59: 'R', 60: 'D', 61: 'A', 62: 'N', 75: 'T', 76: 'T', 77: 'V', 81: 'I', 82: 'D', 83: 'G', 84: 'Q', 85: 'E', 86: 'V', 87: 'E', 88: 'S', 89: 'G', 90: 'T', 91: 'D', 92: 'S', 93: 'D', 94: 'K', 95: 'E', 96: 'I', 97: 'N', 98: 'R', 99: 'S', 100: 'L', 101: 'K', 102: 'A', 103: 'G', 104: 'T', 105: 'Y', 106: 'N', 107: 'L', 108: 'K', 112: 'E', 113: 'T', 114: 'V', 115: 'K', 116: 'G', 117: 'K', 118: 'K', 119: 'T', 120: 'S', 121: 'R', 122: 'E', 123: 'G', 126: 'V', 127: 'V', 128: 'N', 129: 'P', 130: 'L', 131: 'A', 132: 'D', 133: 'D', 134: 'P', 135: 'Q', 136: 'S', 137: 'K', 138: 'E', 139: 'V', 140: 'A', 141: 'F', 142: 'E', 143: 'R', 144: 'I', 145: 'V', 146: 'S', 147: 'P', 148: 'G', 149: 'K', 150: 'T', 151: 'A', 152: 'R', 153: 'L', 154: 'Y', 155: 'G', 156: 'S', 157: 'N', 158: 'L', 159: 'Q', 160: 'N', 161: 'V', 162: 'T', 163: 'A', 164: 'I', 165: 'L', 166: 'L', 167: 'G', 168: 'G', 169: 'N', 170: 'T', 171: 'I', 172: 'T', 173: 'D', 174: 'P', 175: 'T', 176: 'Y', 177: 'V', 178: 'E', 179: 'S', 180: 'A', 181: 'D', 182: 'E', 183: 'N', 184: 'Y', 185: 'L', 186: 'E', 187: 'Y', 188: 'T', 189: 'I', 190: 'P', 191: 'T', 192: 'G', 193: 'V', 194: 'S', 195: 'E', 196: 'G', 197: 'D', 198: 'Y', 199: 'R', 200: 'I', 201: 'V', 202: 'L', 203: 'Q', 204: 'D', 205: 'A', 206: 'D', 207: 'G', 208: 'N', 209: 'Q', 210: 'Y', 211: 'G', 212: 'A', 213: 'D', 214: 'M', 215: 'V', 216: 'K', 217: 'V', 218: 'T', 219: 'N', 220: 'A', 221: 'S', 222: 'L', 223: 'V', 224: 'I', 225: 'S', 226: 'G', 227: 'A', 228: 'N', 229: 'R', 230: 'A', 231: 'T', 232: 'A', 233: 'N', 234: 'V', 235: 'D', 236: 'W', 237: 'T', 238: 'I', 239: 'S', 240: 'G', 241: 'I', 242: 'N', 243: 'L', 244: 'E', 245: 'N', 246: 'I', 247: 'A', 248: 'S', 249: 'L', 250: 'T', 251: 'I', 252: 'G', 253: 'G', 254: 'Q', 255: 'T', 256: 'V', 257: 'S', 258: 'Q', 259: 'F', 260: 'S', 261: 'N', 262: 'Q', 263: 'S', 264: 'S', 265: 'T', 266: 'E', 267: 'I', 268: 'T', 269: 'L', 270: 'T', 271: 'C', 272: 'P', 273: 'D', 274: 'L', 275: 'S', 276: 'D', 277: 'G', 278: 'S', 279: 'Y', 280: 'T', 281: 'M', 282: 'T', 283: 'G', 284: 'K', 285: 'T', 286: 'R', 287: 'S', 288: 'G', 289: 'E', 290: 'A', 291: 'V', 292: 'Q', 293: 'F', 294: 'L', 295: 'N', 296: 'D', 297: 'N', 298: 'I', 299: 'T', 300: 'T', 301: 'T', 302: 'E', 303: 'Q', 304: 'T', 305: 'V', 306: 'T', 307: 'V', 308: 'S', 309: 'T', 310: 'E', 311: 'I', 312: 'T', 313: 'L', 314: 'W', 315: 'S', 316: 'G', 317: 'H', 318: 'H', 319: 'Y', 320: 'V', 321: 'S', 322: 'W', 323: 'D', 324: 'K', 325: 'P', 326: 'D', 327: 'G', 328: 'D', 329: 'P', 330: 'N', 331: 'K', 332: 'T', 333: 'F', 334: 'G', 335: 'L', 336: 'I', 337: 'P', 338: 'M', 339: 'D', 340: 'V', 341: 'F', 342: 'A', 343: 'G', 344: 'I', 345: 'T', 346: 'A', 347: 'G', 348: 'S', 349: 'T', 350: 'L', 351: 'K', 352: 'V', 353: 'V', 354: 'Y', 355: 'S', 356: 'I', 357: 'E', 358: 'P', 359: 'T', 360: 'A', 361: 'E', 362: 'Y', 363: 'H', 364: 'K', 365: 'M', 366: 'Q', 367: 'L', 368: 'A', 369: 'T', 370: 'G', 371: 'Y', 372: 'W', 373: 'T', 374: 'G', 375: 'L', 376: 'A', 377: 'S', 378: 'E', 379: 'M', 380: 'E', 381: 'F', 382: 'T', 383: 'E', 384: 'N', 385: 'G', 386: 'E', 387: 'Y', 388: 'T', 389: 'L', 390: 'I', 391: 'L', 392: 'T', 393: 'Q', 394: 'D', 395: 'M', 396: 'L', 397: 'N', 398: 'K', 399: 'I', 400: 'Q', 401: 'A', 402: 'E', 403: 'A', 404: 'G', 405: 'F', 406: 'L', 407: 'C', 408: 'V', 409: 'G', 410: 'H', 411: 'G', 412: 'Y', 413: 'Y', 414: 'V', 415: 'D', 416: 'L', 417: 'V', 418: 'T', 419: 'V', 420: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6E9B_D.pdb ! residue not defined for rnum = 125
 420
 (420, 420)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.258753
6D97_D
running..
 Extract distance maps..
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233: 'Q', 234: 'M', 235: 'I', 236: 'R', 237: 'L', 238: 'L', 239: 'H', 240: 'D', 241: 'C', 242: 'G', 243: 'L', 244: 'P', 245: 'A', 246: 'E', 247: 'D', 248: 'M', 249: 'D', 250: 'F', 251: 'I', 252: 'N', 253: 'S', 254: 'D', 255: 'G', 256: 'A', 257: 'V', 258: 'M', 259: 'N', 260: 'K', 261: 'L', 262: 'L', 263: 'L', 264: 'E', 265: 'A', 266: 'N', 267: 'P', 268: 'K', 269: 'M', 270: 'T', 271: 'L', 272: 'F', 273: 'T', 274: 'G', 275: 'S', 276: 'S', 277: 'R', 278: 'V', 279: 'A', 280: 'E', 281: 'K', 282: 'L', 283: 'A', 284: 'A', 285: 'D', 286: 'L', 287: 'K', 288: 'G', 289: 'R', 290: 'V', 291: 'K', 292: 'L', 293: 'E', 294: 'D', 295: 'A', 296: 'G', 297: 'F', 298: 'D', 299: 'W', 300: 'K', 301: 'I', 302: 'L', 303: 'G', 304: 'P', 305: 'D', 306: 'V', 307: 'Q', 308: 'E', 309: 'V', 310: 'D', 311: 'Y', 312: 'V', 313: 'A', 314: 'W', 315: 'V', 316: 'C', 317: 'D', 318: 'Q', 319: 'D', 320: 'A', 321: 'Y', 322: 'A', 323: 'C', 324: 'S', 325: 'G', 326: 'Q', 327: 'K', 328: 'C', 329: 'S', 330: 'A', 331: 'Q', 332: 'S', 333: 'V', 334: 'L', 335: 'F', 336: 'M', 337: 'H', 338: 'K', 339: 'N', 340: 'W', 341: 'S', 342: 'S', 343: 'S', 344: 'G', 345: 'L', 346: 'L', 347: 'E', 348: 'K', 349: 'M', 350: 'K', 351: 'K', 352: 'L', 353: 'S', 354: 'E', 355: 'R', 356: 'R', 357: 'K', 358: 'L', 359: 'E', 360: 'D', 361: 'L', 362: 'T', 363: 'I', 364: 'G', 365: 'P', 366: 'V', 367: 'L', 368: 'T', 369: 'V', 370: 'T', 371: 'T', 372: 'E', 373: 'A', 374: 'M', 375: 'I', 376: 'E', 377: 'H', 378: 'M', 379: 'N', 380: 'N', 381: 'L', 382: 'L', 383: 'K', 384: 'I', 385: 'R', 386: 'G', 387: 'S', 388: 'K', 389: 'V', 390: 'L', 391: 'F', 392: 'G', 393: 'G', 394: 'E', 395: 'P', 396: 'L', 397: 'A', 398: 'N', 399: 'H', 400: 'S', 401: 'I', 402: 'P', 403: 'K', 404: 'I', 405: 'Y', 406: 'G', 407: 'A', 408: 'M', 409: 'K', 410: 'P', 411: 'T', 412: 'A', 413: 'V', 414: 'F', 415: 'V', 416: 'P', 417: 'L', 418: 'E', 419: 'E', 420: 'I', 421: 'L', 422: 'K', 423: 'S', 424: 'G', 425: 'N', 426: 'F', 427: 'E', 428: 'L', 429: 'V', 430: 'T', 431: 'K', 432: 'E', 433: 'I', 434: 'F', 435: 'G', 436: 'P', 437: 'F', 438: 'Q', 439: 'V', 440: 'V', 441: 'T', 442: 'E', 443: 'Y', 444: 'S', 445: 'E', 446: 'D', 447: 'Q', 448: 'L', 449: 'E', 450: 'L', 451: 'V', 452: 'L', 453: 'E', 454: 'A', 455: 'C', 456: 'E', 457: 'R', 458: 'M', 459: 'N', 460: 'A', 461: 'H', 462: 'L', 463: 'T', 464: 'A', 465: 'A', 466: 'I', 467: 'V', 468: 'S', 469: 'N', 470: 'D', 471: 'P', 472: 'L', 473: 'F', 474: 'L', 475: 'Q', 476: 'D', 477: 'V', 478: 'L', 479: 'G', 480: 'R', 481: 'S', 482: 'V', 483: 'N', 484: 'G', 485: 'T', 486: 'T', 487: 'Y', 488: 'A', 489: 'G', 490: 'I', 491: 'R', 492: 'A', 493: 'R', 494: 'T', 495: 'T', 496: 'G', 497: 'A', 498: 'P', 499: 'Q', 500: 'N', 501: 'H', 502: 'W', 503: 'F', 504: 'G', 505: 'P', 506: 'A', 507: 'G', 508: 'D', 509: 'P', 510: 'R', 511: 'G', 512: 'A', 513: 'G', 514: 'I', 515: 'G', 516: 'T', 517: 'P', 518: 'E', 519: 'A', 520: 'I', 521: 'K', 522: 'L', 523: 'V', 524: 'W', 525: 'S', 526: 'C', 527: 'H', 528: 'R', 529: 'E', 530: 'I', 531: 'I', 532: 'Y', 533: 'D', 534: 'V', 535: 'G', 536: 'P', 537: 'V', 538: 'P', 539: 'E', 540: 'S', 541: 'W', 542: 'A', 543: 'L', 544: 'P', 545: 'S', 546: 'A', 547: 'T'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6D97_D.pdb ! residue not defined for rnum = 25
 547
 (547, 547)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.496409
6DRF_A
running..
 Extract distance maps..
 143
 (143, 143)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.045636
6BZK_A
running..
 Extract distance maps..
 57
 (57, 57)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.015309
6AGH_B
running..
 Extract distance maps..
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{25: 'S', 26: 'L', 27: 'R', 28: 'K', 29: 'Q', 30: 'R', 31: 'F', 32: 'M', 33: 'Q', 34: 'F', 35: 'S', 36: 'S', 37: 'L', 38: 'E', 39: 'H', 40: 'E', 41: 'G', 42: 'E', 43: 'Y', 44: 'Y', 45: 'M', 46: 'T', 47: 'P', 48: 'R', 49: 'D', 50: 'F', 51: 'L', 52: 'F', 53: 'S', 54: 'V', 55: 'M', 56: 'F', 57: 'E', 58: 'Q', 59: 'M', 60: 'E', 61: 'R', 62: 'K', 63: 'T', 64: 'S', 65: 'V', 66: 'K', 67: 'K', 68: 'L', 69: 'T', 70: 'K', 71: 'K', 72: 'D', 73: 'I', 74: 'E', 75: 'D', 76: 'T', 77: 'L', 78: 'S', 79: 'G', 80: 'I', 81: 'Q', 82: 'T', 83: 'A', 84: 'G', 85: 'C', 86: 'G', 87: 'S', 88: 'T', 89: 'F', 90: 'F', 91: 'R', 92: 'D', 93: 'L', 94: 'G', 95: 'D', 96: 'K', 97: 'G', 98: 'L', 99: 'I', 100: 'S', 101: 'Y', 102: 'T', 103: 'E', 104: 'Y', 105: 'L', 106: 'F', 107: 'L', 108: 'L', 109: 'T', 110: 'I', 111: 'L', 112: 'T', 113: 'K', 114: 'P', 115: 'H', 116: 'S', 117: 'G', 118: 'F', 119: 'H', 120: 'V', 121: 'A', 122: 'F', 123: 'K', 124: 'M', 125: 'L', 126: 'D', 127: 'T', 130: 'N', 131: 'E', 132: 'M', 133: 'I', 134: 'E', 135: 'K', 136: 'R', 137: 'E', 138: 'F', 139: 'F', 140: 'K', 141: 'L', 142: 'Q', 143: 'K', 144: 'I', 145: 'I', 146: 'S', 147: 'K', 148: 'Q', 170: 'E', 171: 'I', 172: 'N', 173: 'T', 174: 'T', 175: 'L', 176: 'Q', 177: 'M', 178: 'R', 179: 'F', 180: 'F', 181: 'G', 182: 'K', 183: 'R', 184: 'G', 185: 'Q', 186: 'R', 187: 'K', 188: 'L', 189: 'H', 190: 'Y', 191: 'K', 192: 'E', 193: 'F', 194: 'R', 195: 'R', 196: 'F', 197: 'M', 198: 'E', 199: 'N', 200: 'L', 201: 'Q', 202: 'T', 203: 'E', 204: 'I', 205: 'Q', 206: 'E', 207: 'M', 208: 'E', 209: 'F', 210: 'L', 211: 'Q', 212: 'F', 213: 'S', 214: 'K', 215: 'G', 216: 'L', 217: 'S', 218: 'F', 219: 'M', 220: 'R', 221: 'K', 222: 'E', 223: 'D', 224: 'F', 225: 'A', 226: 'E', 227: 'W', 228: 'L', 229: 'L', 230: 'F', 231: 'F', 232: 'T', 236: 'N', 237: 'K', 238: 'D', 239: 'I', 240: 'Y', 241: 'W', 242: 'K', 243: 'N', 244: 'V', 245: 'R', 246: 'E', 247: 'K', 248: 'L', 249: 'S', 250: 'A', 251: 'G', 252: 'E', 253: 'S', 254: 'I', 255: 'S', 256: 'L', 257: 'D', 258: 'E', 259: 'F', 260: 'K', 261: 'S', 262: 'F', 263: 'C', 264: 'H', 265: 'F', 266: 'T', 267: 'T', 268: 'H', 269: 'L', 270: 'E', 271: 'D', 272: 'F', 273: 'A', 274: 'I', 275: 'A', 276: 'M', 277: 'Q', 278: 'M', 279: 'F', 280: 'S', 286: 'V', 287: 'R', 288: 'L', 289: 'A', 290: 'E', 291: 'F', 292: 'K', 293: 'R', 294: 'A', 295: 'V', 296: 'K', 297: 'V', 298: 'A', 299: 'T', 300: 'G', 301: 'Q', 302: 'E', 303: 'L', 304: 'S', 305: 'N', 306: 'N', 307: 'I', 308: 'L', 309: 'D', 310: 'T', 311: 'V', 312: 'F', 313: 'K', 314: 'I', 315: 'F', 316: 'D', 317: 'L', 324: 'S', 325: 'H', 326: 'E', 327: 'E', 328: 'F', 329: 'L', 330: 'G', 331: 'V', 332: 'L', 333: 'K', 334: 'N', 335: 'R'}
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{25: 'S', 26: 'L', 27: 'R', 28: 'K', 29: 'Q', 30: 'R', 31: 'F', 32: 'M', 33: 'Q', 34: 'F', 35: 'S', 36: 'S', 37: 'L', 38: 'E', 39: 'H', 40: 'E', 41: 'G', 42: 'E', 43: 'Y', 44: 'Y', 45: 'M', 46: 'T', 47: 'P', 48: 'R', 49: 'D', 50: 'F', 51: 'L', 52: 'F', 53: 'S', 54: 'V', 55: 'M', 56: 'F', 57: 'E', 58: 'Q', 59: 'M', 60: 'E', 61: 'R', 62: 'K', 63: 'T', 64: 'S', 65: 'V', 66: 'K', 67: 'K', 68: 'L', 69: 'T', 70: 'K', 71: 'K', 72: 'D', 73: 'I', 74: 'E', 75: 'D', 76: 'T', 77: 'L', 78: 'S', 79: 'G', 80: 'I', 81: 'Q', 82: 'T', 83: 'A', 84: 'G', 85: 'C', 86: 'G', 87: 'S', 88: 'T', 89: 'F', 90: 'F', 91: 'R', 92: 'D', 93: 'L', 94: 'G', 95: 'D', 96: 'K', 97: 'G', 98: 'L', 99: 'I', 100: 'S', 101: 'Y', 102: 'T', 103: 'E', 104: 'Y', 105: 'L', 106: 'F', 107: 'L', 108: 'L', 109: 'T', 110: 'I', 111: 'L', 112: 'T', 113: 'K', 114: 'P', 115: 'H', 116: 'S', 117: 'G', 118: 'F', 119: 'H', 120: 'V', 121: 'A', 122: 'F', 123: 'K', 124: 'M', 125: 'L', 126: 'D', 127: 'T', 130: 'N', 131: 'E', 132: 'M', 133: 'I', 134: 'E', 135: 'K', 136: 'R', 137: 'E', 138: 'F', 139: 'F', 140: 'K', 141: 'L', 142: 'Q', 143: 'K', 144: 'I', 145: 'I', 146: 'S', 147: 'K', 148: 'Q', 170: 'E', 171: 'I', 172: 'N', 173: 'T', 174: 'T', 175: 'L', 176: 'Q', 177: 'M', 178: 'R', 179: 'F', 180: 'F', 181: 'G', 182: 'K', 183: 'R', 184: 'G', 185: 'Q', 186: 'R', 187: 'K', 188: 'L', 189: 'H', 190: 'Y', 191: 'K', 192: 'E', 193: 'F', 194: 'R', 195: 'R', 196: 'F', 197: 'M', 198: 'E', 199: 'N', 200: 'L', 201: 'Q', 202: 'T', 203: 'E', 204: 'I', 205: 'Q', 206: 'E', 207: 'M', 208: 'E', 209: 'F', 210: 'L', 211: 'Q', 212: 'F', 213: 'S', 214: 'K', 215: 'G', 216: 'L', 217: 'S', 218: 'F', 219: 'M', 220: 'R', 221: 'K', 222: 'E', 223: 'D', 224: 'F', 225: 'A', 226: 'E', 227: 'W', 228: 'L', 229: 'L', 230: 'F', 231: 'F', 232: 'T', 236: 'N', 237: 'K', 238: 'D', 239: 'I', 240: 'Y', 241: 'W', 242: 'K', 243: 'N', 244: 'V', 245: 'R', 246: 'E', 247: 'K', 248: 'L', 249: 'S', 250: 'A', 251: 'G', 252: 'E', 253: 'S', 254: 'I', 255: 'S', 256: 'L', 257: 'D', 258: 'E', 259: 'F', 260: 'K', 261: 'S', 262: 'F', 263: 'C', 264: 'H', 265: 'F', 266: 'T', 267: 'T', 268: 'H', 269: 'L', 270: 'E', 271: 'D', 272: 'F', 273: 'A', 274: 'I', 275: 'A', 276: 'M', 277: 'Q', 278: 'M', 279: 'F', 280: 'S', 286: 'V', 287: 'R', 288: 'L', 289: 'A', 290: 'E', 291: 'F', 292: 'K', 293: 'R', 294: 'A', 295: 'V', 296: 'K', 297: 'V', 298: 'A', 299: 'T', 300: 'G', 301: 'Q', 302: 'E', 303: 'L', 304: 'S', 305: 'N', 306: 'N', 307: 'I', 308: 'L', 309: 'D', 310: 'T', 311: 'V', 312: 'F', 313: 'K', 314: 'I', 315: 'F', 316: 'D', 317: 'L', 324: 'S', 325: 'H', 326: 'E', 327: 'E', 328: 'F', 329: 'L', 330: 'G', 331: 'V', 332: 'L', 333: 'K', 334: 'N', 335: 'R'}
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6AGH_B.pdb ! residue not defined for rnum = 321
{25: 'S', 26: 'L', 27: 'R', 28: 'K', 29: 'Q', 30: 'R', 31: 'F', 32: 'M', 33: 'Q', 34: 'F', 35: 'S', 36: 'S', 37: 'L', 38: 'E', 39: 'H', 40: 'E', 41: 'G', 42: 'E', 43: 'Y', 44: 'Y', 45: 'M', 46: 'T', 47: 'P', 48: 'R', 49: 'D', 50: 'F', 51: 'L', 52: 'F', 53: 'S', 54: 'V', 55: 'M', 56: 'F', 57: 'E', 58: 'Q', 59: 'M', 60: 'E', 61: 'R', 62: 'K', 63: 'T', 64: 'S', 65: 'V', 66: 'K', 67: 'K', 68: 'L', 69: 'T', 70: 'K', 71: 'K', 72: 'D', 73: 'I', 74: 'E', 75: 'D', 76: 'T', 77: 'L', 78: 'S', 79: 'G', 80: 'I', 81: 'Q', 82: 'T', 83: 'A', 84: 'G', 85: 'C', 86: 'G', 87: 'S', 88: 'T', 89: 'F', 90: 'F', 91: 'R', 92: 'D', 93: 'L', 94: 'G', 95: 'D', 96: 'K', 97: 'G', 98: 'L', 99: 'I', 100: 'S', 101: 'Y', 102: 'T', 103: 'E', 104: 'Y', 105: 'L', 106: 'F', 107: 'L', 108: 'L', 109: 'T', 110: 'I', 111: 'L', 112: 'T', 113: 'K', 114: 'P', 115: 'H', 116: 'S', 117: 'G', 118: 'F', 119: 'H', 120: 'V', 121: 'A', 122: 'F', 123: 'K', 124: 'M', 125: 'L', 126: 'D', 127: 'T', 130: 'N', 131: 'E', 132: 'M', 133: 'I', 134: 'E', 135: 'K', 136: 'R', 137: 'E', 138: 'F', 139: 'F', 140: 'K', 141: 'L', 142: 'Q', 143: 'K', 144: 'I', 145: 'I', 146: 'S', 147: 'K', 148: 'Q', 170: 'E', 171: 'I', 172: 'N', 173: 'T', 174: 'T', 175: 'L', 176: 'Q', 177: 'M', 178: 'R', 179: 'F', 180: 'F', 181: 'G', 182: 'K', 183: 'R', 184: 'G', 185: 'Q', 186: 'R', 187: 'K', 188: 'L', 189: 'H', 190: 'Y', 191: 'K', 192: 'E', 193: 'F', 194: 'R', 195: 'R', 196: 'F', 197: 'M', 198: 'E', 199: 'N', 200: 'L', 201: 'Q', 202: 'T', 203: 'E', 204: 'I', 205: 'Q', 206: 'E', 207: 'M', 208: 'E', 209: 'F', 210: 'L', 211: 'Q', 212: 'F', 213: 'S', 214: 'K', 215: 'G', 216: 'L', 217: 'S', 218: 'F', 219: 'M', 220: 'R', 221: 'K', 222: 'E', 223: 'D', 224: 'F', 225: 'A', 226: 'E', 227: 'W', 228: 'L', 229: 'L', 230: 'F', 231: 'F', 232: 'T', 236: 'N', 237: 'K', 238: 'D', 239: 'I', 240: 'Y', 241: 'W', 242: 'K', 243: 'N', 244: 'V', 245: 'R', 246: 'E', 247: 'K', 248: 'L', 249: 'S', 250: 'A', 251: 'G', 252: 'E', 253: 'S', 254: 'I', 255: 'S', 256: 'L', 257: 'D', 258: 'E', 259: 'F', 260: 'K', 261: 'S', 262: 'F', 263: 'C', 264: 'H', 265: 'F', 266: 'T', 267: 'T', 268: 'H', 269: 'L', 270: 'E', 271: 'D', 272: 'F', 273: 'A', 274: 'I', 275: 'A', 276: 'M', 277: 'Q', 278: 'M', 279: 'F', 280: 'S', 286: 'V', 287: 'R', 288: 'L', 289: 'A', 290: 'E', 291: 'F', 292: 'K', 293: 'R', 294: 'A', 295: 'V', 296: 'K', 297: 'V', 298: 'A', 299: 'T', 300: 'G', 301: 'Q', 302: 'E', 303: 'L', 304: 'S', 305: 'N', 306: 'N', 307: 'I', 308: 'L', 309: 'D', 310: 'T', 311: 'V', 312: 'F', 313: 'K', 314: 'I', 315: 'F', 316: 'D', 317: 'L', 324: 'S', 325: 'H', 326: 'E', 327: 'E', 328: 'F', 329: 'L', 330: 'G', 331: 'V', 332: 'L', 333: 'K', 334: 'N', 335: 'R'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6AGH_B.pdb ! residue not defined for rnum = 322
{25: 'S', 26: 'L', 27: 'R', 28: 'K', 29: 'Q', 30: 'R', 31: 'F', 32: 'M', 33: 'Q', 34: 'F', 35: 'S', 36: 'S', 37: 'L', 38: 'E', 39: 'H', 40: 'E', 41: 'G', 42: 'E', 43: 'Y', 44: 'Y', 45: 'M', 46: 'T', 47: 'P', 48: 'R', 49: 'D', 50: 'F', 51: 'L', 52: 'F', 53: 'S', 54: 'V', 55: 'M', 56: 'F', 57: 'E', 58: 'Q', 59: 'M', 60: 'E', 61: 'R', 62: 'K', 63: 'T', 64: 'S', 65: 'V', 66: 'K', 67: 'K', 68: 'L', 69: 'T', 70: 'K', 71: 'K', 72: 'D', 73: 'I', 74: 'E', 75: 'D', 76: 'T', 77: 'L', 78: 'S', 79: 'G', 80: 'I', 81: 'Q', 82: 'T', 83: 'A', 84: 'G', 85: 'C', 86: 'G', 87: 'S', 88: 'T', 89: 'F', 90: 'F', 91: 'R', 92: 'D', 93: 'L', 94: 'G', 95: 'D', 96: 'K', 97: 'G', 98: 'L', 99: 'I', 100: 'S', 101: 'Y', 102: 'T', 103: 'E', 104: 'Y', 105: 'L', 106: 'F', 107: 'L', 108: 'L', 109: 'T', 110: 'I', 111: 'L', 112: 'T', 113: 'K', 114: 'P', 115: 'H', 116: 'S', 117: 'G', 118: 'F', 119: 'H', 120: 'V', 121: 'A', 122: 'F', 123: 'K', 124: 'M', 125: 'L', 126: 'D', 127: 'T', 130: 'N', 131: 'E', 132: 'M', 133: 'I', 134: 'E', 135: 'K', 136: 'R', 137: 'E', 138: 'F', 139: 'F', 140: 'K', 141: 'L', 142: 'Q', 143: 'K', 144: 'I', 145: 'I', 146: 'S', 147: 'K', 148: 'Q', 170: 'E', 171: 'I', 172: 'N', 173: 'T', 174: 'T', 175: 'L', 176: 'Q', 177: 'M', 178: 'R', 179: 'F', 180: 'F', 181: 'G', 182: 'K', 183: 'R', 184: 'G', 185: 'Q', 186: 'R', 187: 'K', 188: 'L', 189: 'H', 190: 'Y', 191: 'K', 192: 'E', 193: 'F', 194: 'R', 195: 'R', 196: 'F', 197: 'M', 198: 'E', 199: 'N', 200: 'L', 201: 'Q', 202: 'T', 203: 'E', 204: 'I', 205: 'Q', 206: 'E', 207: 'M', 208: 'E', 209: 'F', 210: 'L', 211: 'Q', 212: 'F', 213: 'S', 214: 'K', 215: 'G', 216: 'L', 217: 'S', 218: 'F', 219: 'M', 220: 'R', 221: 'K', 222: 'E', 223: 'D', 224: 'F', 225: 'A', 226: 'E', 227: 'W', 228: 'L', 229: 'L', 230: 'F', 231: 'F', 232: 'T', 236: 'N', 237: 'K', 238: 'D', 239: 'I', 240: 'Y', 241: 'W', 242: 'K', 243: 'N', 244: 'V', 245: 'R', 246: 'E', 247: 'K', 248: 'L', 249: 'S', 250: 'A', 251: 'G', 252: 'E', 253: 'S', 254: 'I', 255: 'S', 256: 'L', 257: 'D', 258: 'E', 259: 'F', 260: 'K', 261: 'S', 262: 'F', 263: 'C', 264: 'H', 265: 'F', 266: 'T', 267: 'T', 268: 'H', 269: 'L', 270: 'E', 271: 'D', 272: 'F', 273: 'A', 274: 'I', 275: 'A', 276: 'M', 277: 'Q', 278: 'M', 279: 'F', 280: 'S', 286: 'V', 287: 'R', 288: 'L', 289: 'A', 290: 'E', 291: 'F', 292: 'K', 293: 'R', 294: 'A', 295: 'V', 296: 'K', 297: 'V', 298: 'A', 299: 'T', 300: 'G', 301: 'Q', 302: 'E', 303: 'L', 304: 'S', 305: 'N', 306: 'N', 307: 'I', 308: 'L', 309: 'D', 310: 'T', 311: 'V', 312: 'F', 313: 'K', 314: 'I', 315: 'F', 316: 'D', 317: 'L', 324: 'S', 325: 'H', 326: 'E', 327: 'E', 328: 'F', 329: 'L', 330: 'G', 331: 'V', 332: 'L', 333: 'K', 334: 'N', 335: 'R'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6AGH_B.pdb ! residue not defined for rnum = 323
 335
 (335, 335)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.151533
6A5F_B
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6A5F_B.pdb ! residue not defined for rnum = 1
 152
 (152, 152)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.057013
5Z2H_B
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5Z2H_B.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{9: 'G', 10: 'E', 11: 'L', 12: 'K', 13: 'T', 14: 'I', 15: 'L', 16: 'G', 17: 'Q', 18: 'A', 19: 'K', 20: 'V', 21: 'S', 22: 'K', 23: 'L', 24: 'Q', 25: 'E', 26: 'K', 27: 'L', 28: 'K', 29: 'L', 30: 'D', 31: 'P', 32: 'R', 33: 'S', 34: 'K', 35: 'I', 36: 'T', 37: 'F', 38: 'N', 39: 'D', 40: 'F', 41: 'K', 42: 'G', 43: 'I', 44: 'A', 45: 'K', 46: 'E', 47: 'V', 48: 'G', 49: 'I', 50: 'E', 51: 'E', 52: 'K', 53: 'E', 54: 'I', 55: 'N', 56: 'S', 57: 'V', 58: 'S', 59: 'N', 60: 'A', 61: 'L', 62: 'A', 63: 'Q', 64: 'S', 65: 'G', 66: 'S', 67: 'I', 68: 'I', 69: 'Y', 70: 'L', 71: 'P', 72: 'N', 73: 'S', 74: 'L', 75: 'N', 76: 'E', 77: 'N', 78: 'L', 79: 'K', 80: 'T', 81: 'S', 82: 'V', 83: 'F', 84: 'T', 85: 'K', 86: 'P', 87: 'A', 88: 'H', 89: 'I', 90: 'Y', 91: 'Q', 92: 'S', 93: 'L', 94: 'E', 95: 'H', 96: 'I', 97: 'L', 98: 'D', 99: 'I'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5Z2H_B.pdb ! residue not defined for rnum = 2
{9: 'G', 10: 'E', 11: 'L', 12: 'K', 13: 'T', 14: 'I', 15: 'L', 16: 'G', 17: 'Q', 18: 'A', 19: 'K', 20: 'V', 21: 'S', 22: 'K', 23: 'L', 24: 'Q', 25: 'E', 26: 'K', 27: 'L', 28: 'K', 29: 'L', 30: 'D', 31: 'P', 32: 'R', 33: 'S', 34: 'K', 35: 'I', 36: 'T', 37: 'F', 38: 'N', 39: 'D', 40: 'F', 41: 'K', 42: 'G', 43: 'I', 44: 'A', 45: 'K', 46: 'E', 47: 'V', 48: 'G', 49: 'I', 50: 'E', 51: 'E', 52: 'K', 53: 'E', 54: 'I', 55: 'N', 56: 'S', 57: 'V', 58: 'S', 59: 'N', 60: 'A', 61: 'L', 62: 'A', 63: 'Q', 64: 'S', 65: 'G', 66: 'S', 67: 'I', 68: 'I', 69: 'Y', 70: 'L', 71: 'P', 72: 'N', 73: 'S', 74: 'L', 75: 'N', 76: 'E', 77: 'N', 78: 'L', 79: 'K', 80: 'T', 81: 'S', 82: 'V', 83: 'F', 84: 'T', 85: 'K', 86: 'P', 87: 'A', 88: 'H', 89: 'I', 90: 'Y', 91: 'Q', 92: 'S', 93: 'L', 94: 'E', 95: 'H', 96: 'I', 97: 'L', 98: 'D', 99: 'I'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5Z2H_B.pdb ! residue not defined for rnum = 3
{9: 'G', 10: 'E', 11: 'L', 12: 'K', 13: 'T', 14: 'I', 15: 'L', 16: 'G', 17: 'Q', 18: 'A', 19: 'K', 20: 'V', 21: 'S', 22: 'K', 23: 'L', 24: 'Q', 25: 'E', 26: 'K', 27: 'L', 28: 'K', 29: 'L', 30: 'D', 31: 'P', 32: 'R', 33: 'S', 34: 'K', 35: 'I', 36: 'T', 37: 'F', 38: 'N', 39: 'D', 40: 'F', 41: 'K', 42: 'G', 43: 'I', 44: 'A', 45: 'K', 46: 'E', 47: 'V', 48: 'G', 49: 'I', 50: 'E', 51: 'E', 52: 'K', 53: 'E', 54: 'I', 55: 'N', 56: 'S', 57: 'V', 58: 'S', 59: 'N', 60: 'A', 61: 'L', 62: 'A', 63: 'Q', 64: 'S', 65: 'G', 66: 'S', 67: 'I', 68: 'I', 69: 'Y', 70: 'L', 71: 'P', 72: 'N', 73: 'S', 74: 'L', 75: 'N', 76: 'E', 77: 'N', 78: 'L', 79: 'K', 80: 'T', 81: 'S', 82: 'V', 83: 'F', 84: 'T', 85: 'K', 86: 'P', 87: 'A', 88: 'H', 89: 'I', 90: 'Y', 91: 'Q', 92: 'S', 93: 'L', 94: 'E', 95: 'H', 96: 'I', 97: 'L', 98: 'D', 99: 'I'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5Z2H_B.pdb ! residue not defined for rnum = 4
{9: 'G', 10: 'E', 11: 'L', 12: 'K', 13: 'T', 14: 'I', 15: 'L', 16: 'G', 17: 'Q', 18: 'A', 19: 'K', 20: 'V', 21: 'S', 22: 'K', 23: 'L', 24: 'Q', 25: 'E', 26: 'K', 27: 'L', 28: 'K', 29: 'L', 30: 'D', 31: 'P', 32: 'R', 33: 'S', 34: 'K', 35: 'I', 36: 'T', 37: 'F', 38: 'N', 39: 'D', 40: 'F', 41: 'K', 42: 'G', 43: 'I', 44: 'A', 45: 'K', 46: 'E', 47: 'V', 48: 'G', 49: 'I', 50: 'E', 51: 'E', 52: 'K', 53: 'E', 54: 'I', 55: 'N', 56: 'S', 57: 'V', 58: 'S', 59: 'N', 60: 'A', 61: 'L', 62: 'A', 63: 'Q', 64: 'S', 65: 'G', 66: 'S', 67: 'I', 68: 'I', 69: 'Y', 70: 'L', 71: 'P', 72: 'N', 73: 'S', 74: 'L', 75: 'N', 76: 'E', 77: 'N', 78: 'L', 79: 'K', 80: 'T', 81: 'S', 82: 'V', 83: 'F', 84: 'T', 85: 'K', 86: 'P', 87: 'A', 88: 'H', 89: 'I', 90: 'Y', 91: 'Q', 92: 'S', 93: 'L', 94: 'E', 95: 'H', 96: 'I', 97: 'L', 98: 'D', 99: 'I'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5Z2H_B.pdb ! residue not defined for rnum = 5
{9: 'G', 10: 'E', 11: 'L', 12: 'K', 13: 'T', 14: 'I', 15: 'L', 16: 'G', 17: 'Q', 18: 'A', 19: 'K', 20: 'V', 21: 'S', 22: 'K', 23: 'L', 24: 'Q', 25: 'E', 26: 'K', 27: 'L', 28: 'K', 29: 'L', 30: 'D', 31: 'P', 32: 'R', 33: 'S', 34: 'K', 35: 'I', 36: 'T', 37: 'F', 38: 'N', 39: 'D', 40: 'F', 41: 'K', 42: 'G', 43: 'I', 44: 'A', 45: 'K', 46: 'E', 47: 'V', 48: 'G', 49: 'I', 50: 'E', 51: 'E', 52: 'K', 53: 'E', 54: 'I', 55: 'N', 56: 'S', 57: 'V', 58: 'S', 59: 'N', 60: 'A', 61: 'L', 62: 'A', 63: 'Q', 64: 'S', 65: 'G', 66: 'S', 67: 'I', 68: 'I', 69: 'Y', 70: 'L', 71: 'P', 72: 'N', 73: 'S', 74: 'L', 75: 'N', 76: 'E', 77: 'N', 78: 'L', 79: 'K', 80: 'T', 81: 'S', 82: 'V', 83: 'F', 84: 'T', 85: 'K', 86: 'P', 87: 'A', 88: 'H', 89: 'I', 90: 'Y', 91: 'Q', 92: 'S', 93: 'L', 94: 'E', 95: 'H', 96: 'I', 97: 'L', 98: 'D', 99: 'I'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5Z2H_B.pdb ! residue not defined for rnum = 6
{9: 'G', 10: 'E', 11: 'L', 12: 'K', 13: 'T', 14: 'I', 15: 'L', 16: 'G', 17: 'Q', 18: 'A', 19: 'K', 20: 'V', 21: 'S', 22: 'K', 23: 'L', 24: 'Q', 25: 'E', 26: 'K', 27: 'L', 28: 'K', 29: 'L', 30: 'D', 31: 'P', 32: 'R', 33: 'S', 34: 'K', 35: 'I', 36: 'T', 37: 'F', 38: 'N', 39: 'D', 40: 'F', 41: 'K', 42: 'G', 43: 'I', 44: 'A', 45: 'K', 46: 'E', 47: 'V', 48: 'G', 49: 'I', 50: 'E', 51: 'E', 52: 'K', 53: 'E', 54: 'I', 55: 'N', 56: 'S', 57: 'V', 58: 'S', 59: 'N', 60: 'A', 61: 'L', 62: 'A', 63: 'Q', 64: 'S', 65: 'G', 66: 'S', 67: 'I', 68: 'I', 69: 'Y', 70: 'L', 71: 'P', 72: 'N', 73: 'S', 74: 'L', 75: 'N', 76: 'E', 77: 'N', 78: 'L', 79: 'K', 80: 'T', 81: 'S', 82: 'V', 83: 'F', 84: 'T', 85: 'K', 86: 'P', 87: 'A', 88: 'H', 89: 'I', 90: 'Y', 91: 'Q', 92: 'S', 93: 'L', 94: 'E', 95: 'H', 96: 'I', 97: 'L', 98: 'D', 99: 'I'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5Z2H_B.pdb ! residue not defined for rnum = 7
{9: 'G', 10: 'E', 11: 'L', 12: 'K', 13: 'T', 14: 'I', 15: 'L', 16: 'G', 17: 'Q', 18: 'A', 19: 'K', 20: 'V', 21: 'S', 22: 'K', 23: 'L', 24: 'Q', 25: 'E', 26: 'K', 27: 'L', 28: 'K', 29: 'L', 30: 'D', 31: 'P', 32: 'R', 33: 'S', 34: 'K', 35: 'I', 36: 'T', 37: 'F', 38: 'N', 39: 'D', 40: 'F', 41: 'K', 42: 'G', 43: 'I', 44: 'A', 45: 'K', 46: 'E', 47: 'V', 48: 'G', 49: 'I', 50: 'E', 51: 'E', 52: 'K', 53: 'E', 54: 'I', 55: 'N', 56: 'S', 57: 'V', 58: 'S', 59: 'N', 60: 'A', 61: 'L', 62: 'A', 63: 'Q', 64: 'S', 65: 'G', 66: 'S', 67: 'I', 68: 'I', 69: 'Y', 70: 'L', 71: 'P', 72: 'N', 73: 'S', 74: 'L', 75: 'N', 76: 'E', 77: 'N', 78: 'L', 79: 'K', 80: 'T', 81: 'S', 82: 'V', 83: 'F', 84: 'T', 85: 'K', 86: 'P', 87: 'A', 88: 'H', 89: 'I', 90: 'Y', 91: 'Q', 92: 'S', 93: 'L', 94: 'E', 95: 'H', 96: 'I', 97: 'L', 98: 'D', 99: 'I'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5Z2H_B.pdb ! residue not defined for rnum = 8
 99
 (99, 99)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.026528
5Z8B_B
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5Z8B_B.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{3: 'H', 4: 'M', 5: 'M', 6: 'I', 7: 'V', 8: 'A', 9: 'N', 10: 'M', 11: 'S', 12: 'S', 13: 'Y', 14: 'P', 15: 'P', 16: 'R', 17: 'K', 18: 'K', 19: 'E', 20: 'L', 21: 'V', 22: 'H', 23: 'S', 24: 'I', 25: 'Q', 26: 'S', 27: 'L', 28: 'H', 29: 'A', 30: 'Q', 31: 'V', 32: 'D', 33: 'K', 34: 'I', 35: 'N', 36: 'L', 37: 'C', 38: 'L', 39: 'N', 40: 'E', 41: 'F', 42: 'E', 43: 'E', 44: 'I', 45: 'P', 46: 'E', 47: 'E', 48: 'L', 49: 'D', 50: 'G', 51: 'F', 52: 'S', 53: 'K', 54: 'L', 55: 'N', 56: 'P', 57: 'V', 58: 'I', 59: 'P', 60: 'D', 61: 'K', 62: 'D', 63: 'Y', 64: 'K', 65: 'D', 66: 'V', 67: 'G', 68: 'K', 69: 'F', 70: 'I', 71: 'F', 72: 'P', 73: 'C', 74: 'A', 75: 'K', 76: 'N', 77: 'D', 78: 'M', 79: 'I', 80: 'V', 81: 'L', 82: 'T', 83: 'D', 84: 'D', 85: 'D', 86: 'I', 87: 'I', 88: 'Y', 89: 'P', 90: 'P', 91: 'D', 92: 'Y', 93: 'V', 94: 'E', 95: 'K', 96: 'M', 97: 'L', 98: 'N', 99: 'F', 100: 'Y', 101: 'N', 102: 'S', 103: 'F', 104: 'A', 105: 'I', 106: 'F', 107: 'N', 108: 'C', 109: 'I', 110: 'V', 111: 'G', 112: 'I', 113: 'H', 114: 'G', 115: 'C', 116: 'I', 117: 'Y', 118: 'I', 119: 'D', 120: 'A', 121: 'F', 122: 'D', 123: 'G', 124: 'D', 125: 'Q', 126: 'S', 127: 'K', 128: 'R', 129: 'K', 130: 'V', 131: 'F', 132: 'S', 133: 'F', 134: 'T', 135: 'Q', 136: 'G', 137: 'L', 138: 'L', 139: 'R', 140: 'P', 141: 'R', 142: 'V', 143: 'V', 144: 'N', 145: 'Q', 146: 'L', 147: 'G', 148: 'T', 149: 'G', 150: 'T', 151: 'V', 152: 'F', 153: 'L', 154: 'K', 155: 'A', 156: 'D', 157: 'Q', 158: 'L', 159: 'P', 160: 'S', 161: 'L', 162: 'K', 163: 'Y', 164: 'M', 165: 'D', 166: 'G', 167: 'S', 168: 'Q', 169: 'R', 170: 'F', 171: 'V', 172: 'D', 173: 'V', 174: 'R', 175: 'F', 176: 'S', 177: 'R', 178: 'Y', 179: 'M', 180: 'L', 181: 'E', 182: 'N', 183: 'E', 184: 'I', 185: 'G', 186: 'M', 187: 'I', 188: 'C', 189: 'V', 190: 'P', 191: 'R', 192: 'E', 193: 'K', 194: 'N', 195: 'W', 196: 'L', 197: 'R', 198: 'E', 199: 'V', 200: 'S', 201: 'S', 202: 'G', 203: 'S', 204: 'M', 205: 'E', 206: 'G'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5Z8B_B.pdb ! residue not defined for rnum = 2
 206
 (206, 206)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.086893
6D9M_A
running..
 Extract distance maps..
 326
 (326, 326)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.193778
6DFL_A
running..
 Extract distance maps..
{1: 'M', 2: 'R', 3: 'L', 4: 'V', 5: 'L', 6: 'E', 7: 'E', 8: 'P', 9: 'F', 10: 'K', 11: 'R', 12: 'L', 13: 'W', 14: 'N', 15: 'G', 16: 'R', 17: 'D', 18: 'P', 19: 'F', 20: 'E', 21: 'A', 22: 'V', 23: 'E', 24: 'A', 25: 'L', 26: 'Q', 27: 'G', 28: 'K', 29: 'V', 30: 'Y', 31: 'R', 32: 'E', 33: 'L', 34: 'E', 35: 'G', 36: 'R', 37: 'R', 38: 'T', 39: 'L', 40: 'R', 41: 'T', 42: 'E', 43: 'V', 44: 'D', 45: 'G', 46: 'R', 47: 'G', 48: 'Y', 49: 'F', 50: 'V', 51: 'K', 52: 'I', 53: 'H', 54: 'R', 73: 'L', 74: 'G', 75: 'A', 76: 'R', 77: 'Q', 78: 'E', 79: 'W', 80: 'Q', 81: 'A', 82: 'I', 83: 'R', 84: 'R', 85: 'L', 86: 'H', 87: 'E', 88: 'A', 89: 'G', 90: 'V', 91: 'A', 92: 'T', 93: 'M', 94: 'T', 95: 'A', 96: 'V', 97: 'A', 98: 'Y', 99: 'G', 100: 'E', 101: 'R', 102: 'G', 103: 'S', 104: 'D', 105: 'P', 106: 'A', 107: 'R', 108: 'Q', 109: 'H', 110: 'S', 111: 'F', 112: 'I', 113: 'V', 114: 'T', 115: 'E', 116: 'E', 117: 'L', 118: 'A', 119: 'P', 120: 'T', 121: 'V', 122: 'D', 123: 'L', 124: 'E', 125: 'V', 126: 'F', 127: 'S', 128: 'Q', 129: 'D', 130: 'W', 131: 'R', 132: 'E', 133: 'R', 134: 'P', 135: 'P', 136: 'P', 137: 'P', 138: 'R', 139: 'L', 140: 'K', 141: 'R', 142: 'A', 143: 'L', 144: 'V', 145: 'E', 146: 'A', 147: 'V', 148: 'A', 149: 'R', 150: 'M', 151: 'V', 152: 'G', 153: 'D', 154: 'M', 155: 'H', 156: 'R', 157: 'A', 158: 'G', 159: 'V', 160: 'N', 161: 'H', 162: 'R', 163: 'D', 164: 'C', 165: 'Y', 166: 'I', 167: 'C', 168: 'H', 169: 'F', 170: 'L', 171: 'L', 172: 'H', 173: 'T', 174: 'D', 175: 'K', 176: 'P', 177: 'V', 178: 'S', 179: 'A', 180: 'D', 181: 'D', 182: 'F', 183: 'R', 184: 'L', 185: 'S', 186: 'V', 187: 'I', 188: 'D', 189: 'L', 190: 'H', 191: 'R', 192: 'A', 193: 'Q', 194: 'T', 195: 'R', 196: 'D', 197: 'A', 198: 'T', 199: 'P', 200: 'K', 201: 'R', 202: 'W', 203: 'R', 204: 'N', 205: 'K', 206: 'D', 207: 'L', 208: 'A', 209: 'A', 210: 'L', 211: 'Y', 212: 'F', 213: 'S', 214: 'A', 215: 'L', 216: 'D', 217: 'I', 218: 'G', 219: 'L', 220: 'T', 221: 'R', 222: 'R', 223: 'D', 224: 'K', 225: 'L', 226: 'R', 227: 'F', 228: 'L', 229: 'R', 230: 'T', 231: 'Y', 232: 'F', 233: 'R', 234: 'R', 235: 'P', 236: 'L', 237: 'R', 238: 'E', 239: 'I', 240: 'L', 241: 'R', 242: 'D', 243: 'E', 244: 'A', 245: 'G', 246: 'L', 247: 'L', 248: 'A', 249: 'W', 250: 'M', 251: 'E', 252: 'R', 253: 'K', 254: 'A', 255: 'E', 256: 'K', 257: 'L', 258: 'Y', 259: 'E'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6DFL_A.pdb ! residue not defined for rnum = 55
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{1: 'M', 2: 'R', 3: 'L', 4: 'V', 5: 'L', 6: 'E', 7: 'E', 8: 'P', 9: 'F', 10: 'K', 11: 'R', 12: 'L', 13: 'W', 14: 'N', 15: 'G', 16: 'R', 17: 'D', 18: 'P', 19: 'F', 20: 'E', 21: 'A', 22: 'V', 23: 'E', 24: 'A', 25: 'L', 26: 'Q', 27: 'G', 28: 'K', 29: 'V', 30: 'Y', 31: 'R', 32: 'E', 33: 'L', 34: 'E', 35: 'G', 36: 'R', 37: 'R', 38: 'T', 39: 'L', 40: 'R', 41: 'T', 42: 'E', 43: 'V', 44: 'D', 45: 'G', 46: 'R', 47: 'G', 48: 'Y', 49: 'F', 50: 'V', 51: 'K', 52: 'I', 53: 'H', 54: 'R', 73: 'L', 74: 'G', 75: 'A', 76: 'R', 77: 'Q', 78: 'E', 79: 'W', 80: 'Q', 81: 'A', 82: 'I', 83: 'R', 84: 'R', 85: 'L', 86: 'H', 87: 'E', 88: 'A', 89: 'G', 90: 'V', 91: 'A', 92: 'T', 93: 'M', 94: 'T', 95: 'A', 96: 'V', 97: 'A', 98: 'Y', 99: 'G', 100: 'E', 101: 'R', 102: 'G', 103: 'S', 104: 'D', 105: 'P', 106: 'A', 107: 'R', 108: 'Q', 109: 'H', 110: 'S', 111: 'F', 112: 'I', 113: 'V', 114: 'T', 115: 'E', 116: 'E', 117: 'L', 118: 'A', 119: 'P', 120: 'T', 121: 'V', 122: 'D', 123: 'L', 124: 'E', 125: 'V', 126: 'F', 127: 'S', 128: 'Q', 129: 'D', 130: 'W', 131: 'R', 132: 'E', 133: 'R', 134: 'P', 135: 'P', 136: 'P', 137: 'P', 138: 'R', 139: 'L', 140: 'K', 141: 'R', 142: 'A', 143: 'L', 144: 'V', 145: 'E', 146: 'A', 147: 'V', 148: 'A', 149: 'R', 150: 'M', 151: 'V', 152: 'G', 153: 'D', 154: 'M', 155: 'H', 156: 'R', 157: 'A', 158: 'G', 159: 'V', 160: 'N', 161: 'H', 162: 'R', 163: 'D', 164: 'C', 165: 'Y', 166: 'I', 167: 'C', 168: 'H', 169: 'F', 170: 'L', 171: 'L', 172: 'H', 173: 'T', 174: 'D', 175: 'K', 176: 'P', 177: 'V', 178: 'S', 179: 'A', 180: 'D', 181: 'D', 182: 'F', 183: 'R', 184: 'L', 185: 'S', 186: 'V', 187: 'I', 188: 'D', 189: 'L', 190: 'H', 191: 'R', 192: 'A', 193: 'Q', 194: 'T', 195: 'R', 196: 'D', 197: 'A', 198: 'T', 199: 'P', 200: 'K', 201: 'R', 202: 'W', 203: 'R', 204: 'N', 205: 'K', 206: 'D', 207: 'L', 208: 'A', 209: 'A', 210: 'L', 211: 'Y', 212: 'F', 213: 'S', 214: 'A', 215: 'L', 216: 'D', 217: 'I', 218: 'G', 219: 'L', 220: 'T', 221: 'R', 222: 'R', 223: 'D', 224: 'K', 225: 'L', 226: 'R', 227: 'F', 228: 'L', 229: 'R', 230: 'T', 231: 'Y', 232: 'F', 233: 'R', 234: 'R', 235: 'P', 236: 'L', 237: 'R', 238: 'E', 239: 'I', 240: 'L', 241: 'R', 242: 'D', 243: 'E', 244: 'A', 245: 'G', 246: 'L', 247: 'L', 248: 'A', 249: 'W', 250: 'M', 251: 'E', 252: 'R', 253: 'K', 254: 'A', 255: 'E', 256: 'K', 257: 'L', 258: 'Y', 259: 'E'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6DFL_A.pdb ! residue not defined for rnum = 72
 259
 (259, 259)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.116825
5W5P_A
running..
 Extract distance maps..
{14: 'E', 15: 'V', 16: 'K', 17: 'L', 18: 'P', 19: 'A', 20: 'D', 21: 'L', 22: 'I', 23: 'K', 24: 'D', 25: 'S', 26: 'S', 27: 'G', 28: 'K', 29: 'S', 30: 'Q', 31: 'Q', 32: 'E', 33: 'V', 34: 'N', 35: 'N', 36: 'S', 37: 'L', 38: 'K', 39: 'L', 40: 'K', 41: 'T', 42: 'F', 43: 'D', 44: 'D', 45: 'L', 46: 'R', 47: 'N', 48: 'F', 49: 'K', 50: 'P', 51: 'I', 52: 'V', 53: 'N', 54: 'G', 55: 'Q', 56: 'T', 57: 'V', 58: 'Y', 59: 'V', 60: 'G', 61: 'Q', 62: 'R', 63: 'S', 64: 'N', 65: 'T', 66: 'Y', 67: 'L', 68: 'Q', 69: 'G', 70: 'G', 71: 'G', 72: 'L', 73: 'F', 74: 'Y', 75: 'A', 76: 'D', 77: 'T', 78: 'S', 79: 'D', 80: 'T', 81: 'T', 82: 'S', 83: 'L', 84: 'D', 85: 'N', 86: 'D', 87: 'G', 88: 'T', 89: 'I', 90: 'L', 91: 'V', 92: 'G', 93: 'I', 94: 'D', 95: 'G', 96: 'T', 97: 'R', 98: 'W', 99: 'K', 100: 'R', 101: 'K', 102: 'W', 103: 'N', 104: 'T', 105: 'H', 106: 'A', 107: 'D', 108: 'P', 109: 'C', 110: 'W', 111: 'F', 112: 'G', 113: 'A', 114: 'D', 115: 'Y', 116: 'T', 117: 'G', 118: 'T', 119: 'E', 120: 'D', 121: 'C', 122: 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'P', 623: 'T'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5W5P_A.pdb ! residue not defined for rnum = 13
 623
 (623, 623)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.678683
6CUL_H
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CUL_H.pdb ! residue not defined for rnum = 1
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CUL_H.pdb ! residue not defined for rnum = 28
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CUL_H.pdb ! residue not defined for rnum = 226
{2: 'T', 3: 'K', 4: 'R', 5: 'K', 6: 'L', 7: 'A', 8: 'Y', 9: 'I', 10: 'W', 11: 'S', 12: 'L', 13: 'R', 14: 'N', 15: 'A', 16: 'A', 17: 'A', 18: 'D', 19: 'K', 20: 'A', 21: 'G', 22: 'Q', 23: 'Y', 24: 'V', 25: 'P', 26: 'Y', 27: 'K', 32: 'Y', 33: 'M', 34: 'K', 35: 'S', 36: 'V', 37: 'L', 38: 'E', 39: 'S', 40: 'L', 41: 'V', 42: 'E', 43: 'A', 44: 'L', 45: 'N', 46: 'Q', 47: 'T', 48: 'A', 49: 'L', 50: 'G', 51: 'D', 52: 'A', 53: 'Y', 54: 'E', 55: 'L', 56: 'V', 57: 'G', 58: 'V', 59: 'I', 60: 'Y', 61: 'D', 62: 'D', 63: 'D', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'P', 68: 'R', 69: 'D', 70: 'Q', 71: 'G', 72: 'K', 73: 'I', 74: 'K', 75: 'D', 76: 'Y', 77: 'G', 78: 'F', 79: 'A', 80: 'Y', 81: 'R', 82: 'P', 83: 'G', 84: 'Q', 85: 'Q', 86: 'W', 87: 'F', 88: 'Y', 89: 'P', 90: 'A', 91: 'D', 92: 'L', 93: 'Q', 94: 'V', 95: 'Q', 96: 'G', 97: 'K', 98: 'T', 99: 'L', 100: 'N', 101: 'D', 102: 'L', 103: 'L', 104: 'L', 105: 'S', 106: 'V', 107: 'P', 108: 'S', 109: 'T', 110: 'Y', 111: 'R', 112: 'R', 113: 'Y', 114: 'P', 115: 'R', 116: 'G', 117: 'T', 118: 'P', 119: 'E', 120: 'H', 121: 'V', 122: 'A', 123: 'G', 124: 'K', 125: 'S', 126: 'D', 127: 'F', 128: 'E', 129: 'R', 130: 'R', 131: 'L', 132: 'H', 133: 'D', 134: 'T', 135: 'L', 136: 'V', 137: 'E', 138: 'L', 139: 'G', 140: 'A', 141: 'D', 142: 'V', 143: 'V', 144: 'V', 145: 'L', 146: 'D', 147: 'G', 148: 'L', 149: 'L', 150: 'V', 151: 'I', 152: 'L', 153: 'D', 154: 'E', 155: 'L', 156: 'V', 157: 'R', 158: 'P', 159: 'G', 160: 'A', 161: 'P', 162: 'F', 163: 'A', 164: 'R', 165: 'R', 166: 'I', 167: 'M', 168: 'N', 169: 'I', 170: 'H', 171: 'P', 172: 'G', 173: 'V', 174: 'T', 175: 'R', 176: 'E', 177: 'D', 178: 'S', 179: 'P', 180: 'Y', 181: 'E', 182: 'R', 183: 'R', 184: 'G', 185: 'A', 186: 'Y', 187: 'A', 188: 'T', 189: 'L', 190: 'D', 191: 'A', 192: 'L', 193: 'Y', 194: 'G', 195: 'A', 196: 'R', 197: 'G', 198: 'E', 199: 'K', 200: 'V', 201: 'V', 202: 'D', 203: 'W', 204: 'A', 205: 'T', 206: 'M', 207: 'E', 208: 'K', 209: 'V', 210: 'A', 211: 'V', 212: 'E', 213: 'P', 214: 'L', 215: 'Y', 216: 'W', 217: 'T', 218: 'G', 219: 'A', 220: 'S', 221: 'F', 222: 'H', 223: 'Y', 224: 'V', 225: 'D', 229: 'D', 230: 'S', 231: 'G', 232: 'E', 233: 'V', 234: 'F', 235: 'H', 236: 'D', 237: 'V', 238: 'L', 239: 'K', 240: 'T', 241: 'E', 242: 'I', 243: 'S', 244: 'P', 245: 'D', 246: 'D', 247: 'T', 248: 'I', 249: 'L', 250: 'E', 251: 'L', 252: 'R', 253: 'W', 254: 'N', 255: 'N', 256: 'F', 257: 'N', 258: 'N', 259: 'S', 260: 'L', 261: 'F', 262: 'P', 263: 'A', 264: 'L', 265: 'H', 266: 'E', 267: 'G', 268: 'L', 269: 'A', 270: 'L', 271: 'L', 272: 'A', 273: 'E', 274: 'K', 275: 'L'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CUL_H.pdb ! residue not defined for rnum = 227
{2: 'T', 3: 'K', 4: 'R', 5: 'K', 6: 'L', 7: 'A', 8: 'Y', 9: 'I', 10: 'W', 11: 'S', 12: 'L', 13: 'R', 14: 'N', 15: 'A', 16: 'A', 17: 'A', 18: 'D', 19: 'K', 20: 'A', 21: 'G', 22: 'Q', 23: 'Y', 24: 'V', 25: 'P', 26: 'Y', 27: 'K', 32: 'Y', 33: 'M', 34: 'K', 35: 'S', 36: 'V', 37: 'L', 38: 'E', 39: 'S', 40: 'L', 41: 'V', 42: 'E', 43: 'A', 44: 'L', 45: 'N', 46: 'Q', 47: 'T', 48: 'A', 49: 'L', 50: 'G', 51: 'D', 52: 'A', 53: 'Y', 54: 'E', 55: 'L', 56: 'V', 57: 'G', 58: 'V', 59: 'I', 60: 'Y', 61: 'D', 62: 'D', 63: 'D', 64: 'A', 65: 'E', 66: 'L', 67: 'P', 68: 'R', 69: 'D', 70: 'Q', 71: 'G', 72: 'K', 73: 'I', 74: 'K', 75: 'D', 76: 'Y', 77: 'G', 78: 'F', 79: 'A', 80: 'Y', 81: 'R', 82: 'P', 83: 'G', 84: 'Q', 85: 'Q', 86: 'W', 87: 'F', 88: 'Y', 89: 'P', 90: 'A', 91: 'D', 92: 'L', 93: 'Q', 94: 'V', 95: 'Q', 96: 'G', 97: 'K', 98: 'T', 99: 'L', 100: 'N', 101: 'D', 102: 'L', 103: 'L', 104: 'L', 105: 'S', 106: 'V', 107: 'P', 108: 'S', 109: 'T', 110: 'Y', 111: 'R', 112: 'R', 113: 'Y', 114: 'P', 115: 'R', 116: 'G', 117: 'T', 118: 'P', 119: 'E', 120: 'H', 121: 'V', 122: 'A', 123: 'G', 124: 'K', 125: 'S', 126: 'D', 127: 'F', 128: 'E', 129: 'R', 130: 'R', 131: 'L', 132: 'H', 133: 'D', 134: 'T', 135: 'L', 136: 'V', 137: 'E', 138: 'L', 139: 'G', 140: 'A', 141: 'D', 142: 'V', 143: 'V', 144: 'V', 145: 'L', 146: 'D', 147: 'G', 148: 'L', 149: 'L', 150: 'V', 151: 'I', 152: 'L', 153: 'D', 154: 'E', 155: 'L', 156: 'V', 157: 'R', 158: 'P', 159: 'G', 160: 'A', 161: 'P', 162: 'F', 163: 'A', 164: 'R', 165: 'R', 166: 'I', 167: 'M', 168: 'N', 169: 'I', 170: 'H', 171: 'P', 172: 'G', 173: 'V', 174: 'T', 175: 'R', 176: 'E', 177: 'D', 178: 'S', 179: 'P', 180: 'Y', 181: 'E', 182: 'R', 183: 'R', 184: 'G', 185: 'A', 186: 'Y', 187: 'A', 188: 'T', 189: 'L', 190: 'D', 191: 'A', 192: 'L', 193: 'Y', 194: 'G', 195: 'A', 196: 'R', 197: 'G', 198: 'E', 199: 'K', 200: 'V', 201: 'V', 202: 'D', 203: 'W', 204: 'A', 205: 'T', 206: 'M', 207: 'E', 208: 'K', 209: 'V', 210: 'A', 211: 'V', 212: 'E', 213: 'P', 214: 'L', 215: 'Y', 216: 'W', 217: 'T', 218: 'G', 219: 'A', 220: 'S', 221: 'F', 222: 'H', 223: 'Y', 224: 'V', 225: 'D', 229: 'D', 230: 'S', 231: 'G', 232: 'E', 233: 'V', 234: 'F', 235: 'H', 236: 'D', 237: 'V', 238: 'L', 239: 'K', 240: 'T', 241: 'E', 242: 'I', 243: 'S', 244: 'P', 245: 'D', 246: 'D', 247: 'T', 248: 'I', 249: 'L', 250: 'E', 251: 'L', 252: 'R', 253: 'W', 254: 'N', 255: 'N', 256: 'F', 257: 'N', 258: 'N', 259: 'S', 260: 'L', 261: 'F', 262: 'P', 263: 'A', 264: 'L', 265: 'H', 266: 'E', 267: 'G', 268: 'L', 269: 'A', 270: 'L', 271: 'L', 272: 'A', 273: 'E', 274: 'K', 275: 'L'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CUL_H.pdb ! residue not defined for rnum = 228
 275
 (275, 275)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
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5OD1_A
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5OD1_A.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{3: 'G', 4: 'S', 5: 'P', 6: 'L', 7: 'A', 8: 'Q', 9: 'Q', 10: 'I', 11: 'K', 12: 'N', 13: 'T', 14: 'L', 15: 'T', 16: 'F', 17: 'I', 18: 'G', 19: 'Q', 20: 'A', 21: 'N', 22: 'A', 23: 'A', 24: 'G', 25: 'R', 26: 'M', 27: 'D', 28: 'E', 29: 'V', 30: 'R', 31: 'T', 32: 'L', 33: 'Q', 34: 'Q', 35: 'N', 36: 'L', 37: 'H', 38: 'P', 39: 'L', 40: 'W', 41: 'A', 42: 'E', 43: 'Y', 44: 'F', 45: 'Q', 46: 'Q', 47: 'T', 48: 'E', 49: 'G', 50: 'S', 51: 'G', 52: 'G', 53: 'S', 54: 'P', 55: 'L', 56: 'A', 57: 'Q', 58: 'Q', 59: 'I', 60: 'Q', 61: 'Y', 62: 'G', 63: 'H', 64: 'V', 65: 'L', 66: 'I', 67: 'H', 68: 'Q', 69: 'A', 70: 'R', 71: 'A', 72: 'A', 73: 'G', 74: 'R', 75: 'M', 76: 'D', 77: 'E', 78: 'V', 79: 'R', 80: 'R', 81: 'L', 82: 'S', 83: 'E', 84: 'N', 85: 'T', 86: 'L', 87: 'Q', 88: 'L', 89: 'M', 90: 'K', 91: 'E', 92: 'Y', 93: 'F', 94: 'Q', 95: 'Q', 96: 'S'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5OD1_A.pdb ! residue not defined for rnum = 2
 96
 (96, 96)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
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6GCJ_A
running..
 Extract distance maps..
 121
 (121, 121)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.036214
6AE9_B
running..
 Extract distance maps..
 253
 (253, 253)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.120406
5ZKT_B
running..
 Extract distance maps..
 55
 (55, 55)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
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6AKJ_B
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6AKJ_B.pdb ! residue not defined for rnum = 1
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6AKJ_B.pdb ! residue not defined for rnum = 3
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6AKJ_B.pdb ! residue not defined for rnum = 5
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{15: 'E', 16: 'S', 17: 'H', 18: 'I', 19: 'I', 20: 'L', 21: 'L', 22: 'I', 23: 'Q', 24: 'Q', 25: 'G', 26: 'S', 27: 'D', 28: 'P', 29: 'K', 30: 'T', 31: 'R', 32: 'I', 33: 'W', 34: 'S', 35: 'D', 36: 'H', 37: 'C', 38: 'S', 39: 'L', 40: 'R', 41: 'S', 42: 'A', 43: 'I', 44: 'E', 45: 'Y', 46: 'I', 47: 'V', 48: 'G', 49: 'V', 50: 'Y', 51: 'Q', 52: 'T', 53: 'N', 63: 'D', 64: 'V', 65: 'S', 66: 'R', 67: 'F', 68: 'F', 69: 'N', 70: 'F', 71: 'F', 72: 'D', 73: 'E', 74: 'I', 75: 'Y', 76: 'D', 77: 'C', 78: 'V', 79: 'P', 80: 'L', 81: 'V', 82: 'Y', 83: 'D', 84: 'R', 85: 'H', 86: 'F', 87: 'R', 88: 'A', 89: 'Y', 90: 'I', 91: 'P', 92: 'H', 93: 'E', 94: 'K', 95: 'Q', 96: 'W', 97: 'L', 98: 'L', 99: 'H', 100: 'H', 101: 'A', 102: 'Q', 103: 'E', 104: 'Y', 105: 'L', 106: 'T', 107: 'A', 108: 'A', 109: 'R', 129: 'K', 130: 'Y', 131: 'D', 132: 'F', 133: 'S', 134: 'R', 135: 'H', 136: 'C', 137: 'T', 138: 'D', 139: 'Y', 140: 'G', 141: 'H', 142: 'S', 143: 'Y', 144: 'E', 145: 'W', 146: 'P', 147: 'Y', 148: 'F', 149: 'R', 150: 'S', 151: 'L', 152: 'R'}
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{15: 'E', 16: 'S', 17: 'H', 18: 'I', 19: 'I', 20: 'L', 21: 'L', 22: 'I', 23: 'Q', 24: 'Q', 25: 'G', 26: 'S', 27: 'D', 28: 'P', 29: 'K', 30: 'T', 31: 'R', 32: 'I', 33: 'W', 34: 'S', 35: 'D', 36: 'H', 37: 'C', 38: 'S', 39: 'L', 40: 'R', 41: 'S', 42: 'A', 43: 'I', 44: 'E', 45: 'Y', 46: 'I', 47: 'V', 48: 'G', 49: 'V', 50: 'Y', 51: 'Q', 52: 'T', 53: 'N', 63: 'D', 64: 'V', 65: 'S', 66: 'R', 67: 'F', 68: 'F', 69: 'N', 70: 'F', 71: 'F', 72: 'D', 73: 'E', 74: 'I', 75: 'Y', 76: 'D', 77: 'C', 78: 'V', 79: 'P', 80: 'L', 81: 'V', 82: 'Y', 83: 'D', 84: 'R', 85: 'H', 86: 'F', 87: 'R', 88: 'A', 89: 'Y', 90: 'I', 91: 'P', 92: 'H', 93: 'E', 94: 'K', 95: 'Q', 96: 'W', 97: 'L', 98: 'L', 99: 'H', 100: 'H', 101: 'A', 102: 'Q', 103: 'E', 104: 'Y', 105: 'L', 106: 'T', 107: 'A', 108: 'A', 109: 'R', 129: 'K', 130: 'Y', 131: 'D', 132: 'F', 133: 'S', 134: 'R', 135: 'H', 136: 'C', 137: 'T', 138: 'D', 139: 'Y', 140: 'G', 141: 'H', 142: 'S', 143: 'Y', 144: 'E', 145: 'W', 146: 'P', 147: 'Y', 148: 'F', 149: 'R', 150: 'S', 151: 'L', 152: 'R'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6AKJ_B.pdb ! residue not defined for rnum = 128
 152
 (152, 152)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.033767
6DKM_G
running..
 Extract distance maps..
{3: 'D', 4: 'E', 5: 'S', 6: 'D', 7: 'R', 8: 'I', 9: 'R', 10: 'K', 11: 'I', 12: 'V', 13: 'E', 14: 'E', 15: 'S', 16: 'D', 17: 'E', 18: 'I', 19: 'V', 20: 'K', 21: 'E', 22: 'S', 23: 'R', 24: 'K', 25: 'L', 26: 'A', 27: 'E', 28: 'R', 29: 'A', 30: 'R', 31: 'E', 32: 'L', 33: 'I', 34: 'K', 35: 'E', 36: 'S', 37: 'E', 38: 'D', 39: 'K', 40: 'R', 41: 'V', 42: 'S', 43: 'E', 44: 'E', 45: 'R', 46: 'N', 47: 'E', 48: 'R', 49: 'L', 50: 'L', 51: 'E', 52: 'E', 53: 'L', 54: 'L', 55: 'R', 56: 'I', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'E', 60: 'N', 61: 'A', 62: 'E', 63: 'L', 64: 'L', 65: 'K', 66: 'R', 67: 'N', 68: 'L', 69: 'E', 70: 'L', 71: 'L', 72: 'K', 73: 'E', 74: 'V', 75: 'L', 76: 'Y', 77: 'R', 78: 'T'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6DKM_G.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{3: 'D', 4: 'E', 5: 'S', 6: 'D', 7: 'R', 8: 'I', 9: 'R', 10: 'K', 11: 'I', 12: 'V', 13: 'E', 14: 'E', 15: 'S', 16: 'D', 17: 'E', 18: 'I', 19: 'V', 20: 'K', 21: 'E', 22: 'S', 23: 'R', 24: 'K', 25: 'L', 26: 'A', 27: 'E', 28: 'R', 29: 'A', 30: 'R', 31: 'E', 32: 'L', 33: 'I', 34: 'K', 35: 'E', 36: 'S', 37: 'E', 38: 'D', 39: 'K', 40: 'R', 41: 'V', 42: 'S', 43: 'E', 44: 'E', 45: 'R', 46: 'N', 47: 'E', 48: 'R', 49: 'L', 50: 'L', 51: 'E', 52: 'E', 53: 'L', 54: 'L', 55: 'R', 56: 'I', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'E', 60: 'N', 61: 'A', 62: 'E', 63: 'L', 64: 'L', 65: 'K', 66: 'R', 67: 'N', 68: 'L', 69: 'E', 70: 'L', 71: 'L', 72: 'K', 73: 'E', 74: 'V', 75: 'L', 76: 'Y', 77: 'R', 78: 'T'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6DKM_G.pdb ! residue not defined for rnum = 2
 78
 (78, 78)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.020659
6FCG_F
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6FCG_F.pdb ! residue not defined for rnum = 1
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 430
 (430, 430)
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 Writing distance map file.. 
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6OHZ_A
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6OHZ_A.pdb ! residue not defined for rnum = 144
 230
 (230, 230)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.090367
6AEF_A
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6AEF_A.pdb ! residue not defined for rnum = 1
 459
 (459, 459)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.380196
5OVM_A
running..
 Extract distance maps..
{8: 'H', 9: 'L', 10: 'P', 11: 'T', 12: 'S', 13: 'F', 14: 'R', 15: 'G', 16: 'T', 17: 'S', 18: 'V', 19: 'D', 20: 'G', 21: 'S', 22: 'F', 23: 'S', 24: 'V', 25: 'D', 26: 'A', 27: 'S', 28: 'G', 29: 'N', 30: 'L', 31: 'L', 32: 'I', 33: 'T', 34: 'R', 35: 'D', 36: 'I', 37: 'R', 38: 'N', 39: 'L', 40: 'F', 41: 'D', 42: 'Y', 43: 'F', 44: 'L', 45: 'S', 46: 'A', 47: 'V', 48: 'G', 49: 'E', 50: 'E', 51: 'P', 52: 'L', 53: 'Q', 54: 'Q', 55: 'S', 56: 'L', 57: 'D', 58: 'R', 59: 'L', 60: 'R', 61: 'A', 62: 'Y', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'A', 66: 'E', 67: 'L', 68: 'Q', 69: 'E', 70: 'P', 71: 'A', 72: 'R', 73: 'G', 74: 'Q', 75: 'A', 76: 'L', 77: 'A', 78: 'L', 79: 'M', 80: 'Q', 81: 'Q', 82: 'Y', 83: 'I', 84: 'D', 85: 'Y', 86: 'K', 87: 'K', 88: 'E', 89: 'L'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5OVM_A.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{8: 'H', 9: 'L', 10: 'P', 11: 'T', 12: 'S', 13: 'F', 14: 'R', 15: 'G', 16: 'T', 17: 'S', 18: 'V', 19: 'D', 20: 'G', 21: 'S', 22: 'F', 23: 'S', 24: 'V', 25: 'D', 26: 'A', 27: 'S', 28: 'G', 29: 'N', 30: 'L', 31: 'L', 32: 'I', 33: 'T', 34: 'R', 35: 'D', 36: 'I', 37: 'R', 38: 'N', 39: 'L', 40: 'F', 41: 'D', 42: 'Y', 43: 'F', 44: 'L', 45: 'S', 46: 'A', 47: 'V', 48: 'G', 49: 'E', 50: 'E', 51: 'P', 52: 'L', 53: 'Q', 54: 'Q', 55: 'S', 56: 'L', 57: 'D', 58: 'R', 59: 'L', 60: 'R', 61: 'A', 62: 'Y', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'A', 66: 'E', 67: 'L', 68: 'Q', 69: 'E', 70: 'P', 71: 'A', 72: 'R', 73: 'G', 74: 'Q', 75: 'A', 76: 'L', 77: 'A', 78: 'L', 79: 'M', 80: 'Q', 81: 'Q', 82: 'Y', 83: 'I', 84: 'D', 85: 'Y', 86: 'K', 87: 'K', 88: 'E', 89: 'L'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5OVM_A.pdb ! residue not defined for rnum = 2
{8: 'H', 9: 'L', 10: 'P', 11: 'T', 12: 'S', 13: 'F', 14: 'R', 15: 'G', 16: 'T', 17: 'S', 18: 'V', 19: 'D', 20: 'G', 21: 'S', 22: 'F', 23: 'S', 24: 'V', 25: 'D', 26: 'A', 27: 'S', 28: 'G', 29: 'N', 30: 'L', 31: 'L', 32: 'I', 33: 'T', 34: 'R', 35: 'D', 36: 'I', 37: 'R', 38: 'N', 39: 'L', 40: 'F', 41: 'D', 42: 'Y', 43: 'F', 44: 'L', 45: 'S', 46: 'A', 47: 'V', 48: 'G', 49: 'E', 50: 'E', 51: 'P', 52: 'L', 53: 'Q', 54: 'Q', 55: 'S', 56: 'L', 57: 'D', 58: 'R', 59: 'L', 60: 'R', 61: 'A', 62: 'Y', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'A', 66: 'E', 67: 'L', 68: 'Q', 69: 'E', 70: 'P', 71: 'A', 72: 'R', 73: 'G', 74: 'Q', 75: 'A', 76: 'L', 77: 'A', 78: 'L', 79: 'M', 80: 'Q', 81: 'Q', 82: 'Y', 83: 'I', 84: 'D', 85: 'Y', 86: 'K', 87: 'K', 88: 'E', 89: 'L'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5OVM_A.pdb ! residue not defined for rnum = 3
{8: 'H', 9: 'L', 10: 'P', 11: 'T', 12: 'S', 13: 'F', 14: 'R', 15: 'G', 16: 'T', 17: 'S', 18: 'V', 19: 'D', 20: 'G', 21: 'S', 22: 'F', 23: 'S', 24: 'V', 25: 'D', 26: 'A', 27: 'S', 28: 'G', 29: 'N', 30: 'L', 31: 'L', 32: 'I', 33: 'T', 34: 'R', 35: 'D', 36: 'I', 37: 'R', 38: 'N', 39: 'L', 40: 'F', 41: 'D', 42: 'Y', 43: 'F', 44: 'L', 45: 'S', 46: 'A', 47: 'V', 48: 'G', 49: 'E', 50: 'E', 51: 'P', 52: 'L', 53: 'Q', 54: 'Q', 55: 'S', 56: 'L', 57: 'D', 58: 'R', 59: 'L', 60: 'R', 61: 'A', 62: 'Y', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'A', 66: 'E', 67: 'L', 68: 'Q', 69: 'E', 70: 'P', 71: 'A', 72: 'R', 73: 'G', 74: 'Q', 75: 'A', 76: 'L', 77: 'A', 78: 'L', 79: 'M', 80: 'Q', 81: 'Q', 82: 'Y', 83: 'I', 84: 'D', 85: 'Y', 86: 'K', 87: 'K', 88: 'E', 89: 'L'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5OVM_A.pdb ! residue not defined for rnum = 4
{8: 'H', 9: 'L', 10: 'P', 11: 'T', 12: 'S', 13: 'F', 14: 'R', 15: 'G', 16: 'T', 17: 'S', 18: 'V', 19: 'D', 20: 'G', 21: 'S', 22: 'F', 23: 'S', 24: 'V', 25: 'D', 26: 'A', 27: 'S', 28: 'G', 29: 'N', 30: 'L', 31: 'L', 32: 'I', 33: 'T', 34: 'R', 35: 'D', 36: 'I', 37: 'R', 38: 'N', 39: 'L', 40: 'F', 41: 'D', 42: 'Y', 43: 'F', 44: 'L', 45: 'S', 46: 'A', 47: 'V', 48: 'G', 49: 'E', 50: 'E', 51: 'P', 52: 'L', 53: 'Q', 54: 'Q', 55: 'S', 56: 'L', 57: 'D', 58: 'R', 59: 'L', 60: 'R', 61: 'A', 62: 'Y', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'A', 66: 'E', 67: 'L', 68: 'Q', 69: 'E', 70: 'P', 71: 'A', 72: 'R', 73: 'G', 74: 'Q', 75: 'A', 76: 'L', 77: 'A', 78: 'L', 79: 'M', 80: 'Q', 81: 'Q', 82: 'Y', 83: 'I', 84: 'D', 85: 'Y', 86: 'K', 87: 'K', 88: 'E', 89: 'L'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5OVM_A.pdb ! residue not defined for rnum = 5
{8: 'H', 9: 'L', 10: 'P', 11: 'T', 12: 'S', 13: 'F', 14: 'R', 15: 'G', 16: 'T', 17: 'S', 18: 'V', 19: 'D', 20: 'G', 21: 'S', 22: 'F', 23: 'S', 24: 'V', 25: 'D', 26: 'A', 27: 'S', 28: 'G', 29: 'N', 30: 'L', 31: 'L', 32: 'I', 33: 'T', 34: 'R', 35: 'D', 36: 'I', 37: 'R', 38: 'N', 39: 'L', 40: 'F', 41: 'D', 42: 'Y', 43: 'F', 44: 'L', 45: 'S', 46: 'A', 47: 'V', 48: 'G', 49: 'E', 50: 'E', 51: 'P', 52: 'L', 53: 'Q', 54: 'Q', 55: 'S', 56: 'L', 57: 'D', 58: 'R', 59: 'L', 60: 'R', 61: 'A', 62: 'Y', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'A', 66: 'E', 67: 'L', 68: 'Q', 69: 'E', 70: 'P', 71: 'A', 72: 'R', 73: 'G', 74: 'Q', 75: 'A', 76: 'L', 77: 'A', 78: 'L', 79: 'M', 80: 'Q', 81: 'Q', 82: 'Y', 83: 'I', 84: 'D', 85: 'Y', 86: 'K', 87: 'K', 88: 'E', 89: 'L'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5OVM_A.pdb ! residue not defined for rnum = 6
{8: 'H', 9: 'L', 10: 'P', 11: 'T', 12: 'S', 13: 'F', 14: 'R', 15: 'G', 16: 'T', 17: 'S', 18: 'V', 19: 'D', 20: 'G', 21: 'S', 22: 'F', 23: 'S', 24: 'V', 25: 'D', 26: 'A', 27: 'S', 28: 'G', 29: 'N', 30: 'L', 31: 'L', 32: 'I', 33: 'T', 34: 'R', 35: 'D', 36: 'I', 37: 'R', 38: 'N', 39: 'L', 40: 'F', 41: 'D', 42: 'Y', 43: 'F', 44: 'L', 45: 'S', 46: 'A', 47: 'V', 48: 'G', 49: 'E', 50: 'E', 51: 'P', 52: 'L', 53: 'Q', 54: 'Q', 55: 'S', 56: 'L', 57: 'D', 58: 'R', 59: 'L', 60: 'R', 61: 'A', 62: 'Y', 63: 'I', 64: 'A', 65: 'A', 66: 'E', 67: 'L', 68: 'Q', 69: 'E', 70: 'P', 71: 'A', 72: 'R', 73: 'G', 74: 'Q', 75: 'A', 76: 'L', 77: 'A', 78: 'L', 79: 'M', 80: 'Q', 81: 'Q', 82: 'Y', 83: 'I', 84: 'D', 85: 'Y', 86: 'K', 87: 'K', 88: 'E', 89: 'L'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5OVM_A.pdb ! residue not defined for rnum = 7
 89
 (89, 89)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.024026
6A68_A
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6A68_A.pdb ! residue not defined for rnum = 137
{1: 'G', 2: 'P', 3: 'L', 4: 'G', 5: 'S', 6: 'M', 7: 'E', 8: 'N', 9: 'V', 10: 'G', 11: 'R', 12: 'L', 13: 'I', 14: 'T', 15: 'P', 16: 'A', 17: 'K', 18: 'K', 19: 'L', 20: 'E', 21: 'D', 22: 'T', 23: 'I', 24: 'R', 25: 'L', 26: 'A', 27: 'E', 28: 'L', 29: 'V', 30: 'I', 31: 'E', 32: 'V', 33: 'L', 34: 'Q', 35: 'Q', 36: 'N', 37: 'E', 38: 'E', 39: 'H', 40: 'H', 41: 'A', 42: 'E', 43: 'A', 44: 'F', 45: 'A', 46: 'W', 47: 'W', 48: 'S', 49: 'D', 50: 'L', 51: 'M', 52: 'V', 53: 'E', 54: 'H', 55: 'A', 56: 'E', 57: 'T', 58: 'F', 59: 'L', 60: 'S', 61: 'L', 62: 'F', 63: 'A', 64: 'V', 65: 'D', 66: 'M', 67: 'D', 68: 'A', 69: 'A', 70: 'L', 71: 'E', 72: 'V', 73: 'Q', 74: 'P', 75: 'P', 76: 'D', 77: 'T', 78: 'W', 79: 'D', 80: 'S', 81: 'F', 82: 'P', 83: 'L', 84: 'F', 85: 'Q', 86: 'L', 87: 'L', 88: 'N', 89: 'D', 90: 'F', 91: 'L', 92: 'R', 93: 'T', 94: 'D', 95: 'Y', 96: 'N', 97: 'L', 98: 'C', 99: 'N', 100: 'G', 101: 'K', 102: 'F', 103: 'H', 104: 'K', 105: 'H', 106: 'L', 107: 'Q', 108: 'D', 109: 'L', 110: 'F', 111: 'A', 112: 'P', 113: 'L', 114: 'V', 115: 'V', 116: 'R', 117: 'Y', 118: 'V', 119: 'D', 120: 'L', 121: 'M', 122: 'E', 123: 'S', 124: 'S', 125: 'I', 126: 'A', 127: 'Q', 128: 'S', 129: 'I', 130: 'H', 131: 'R', 132: 'G', 133: 'F', 134: 'E', 135: 'R', 136: 'E', 148: 'S', 149: 'E', 150: 'D', 151: 'L', 152: 'F', 153: 'W', 154: 'K', 155: 'L', 156: 'D', 157: 'A', 158: 'L', 159: 'Q', 160: 'T', 161: 'F', 162: 'I', 163: 'R', 164: 'D', 165: 'L', 166: 'H', 167: 'W', 168: 'P', 169: 'E', 170: 'E', 171: 'E', 172: 'F', 173: 'G'}
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6A68_A.pdb ! residue not defined for rnum = 139
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6A68_A.pdb ! residue not defined for rnum = 146
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6A68_A.pdb ! residue not defined for rnum = 147
 173
 (173, 173)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.058258
6G3B_B
running..
 Extract distance maps..
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{3: 'S', 4: 'K', 5: 'F', 6: 'I', 7: 'Q', 8: 'N', 9: 'A', 10: 'A', 11: 'E', 12: 'I', 13: 'A', 14: 'K', 15: 'K', 16: 'A', 17: 'M', 18: 'D', 19: 'S', 20: 'V', 21: 'D', 22: 'P', 23: 'S', 24: 'L', 25: 'S', 26: 'E', 27: 'K', 28: 'F', 29: 'T', 30: 'I', 31: 'V', 32: 'I', 33: 'R', 34: 'F', 35: 'L', 36: 'T', 37: 'D', 38: 'N', 39: 'P', 40: 'D', 41: 'A', 42: 'A', 43: 'S', 44: 'A', 45: 'L', 50: 'R', 51: 'S', 52: 'I', 53: 'V', 54: 'G', 55: 'T', 56: 'E', 57: 'E', 58: 'Y', 59: 'I', 60: 'I', 61: 'A', 62: 'S', 63: 'A', 64: 'T', 65: 'N', 66: 'F', 67: 'K', 68: 'K', 69: 'G', 70: 'R', 71: 'D', 72: 'P', 73: 'R', 74: 'T', 75: 'P', 76: 'L', 77: 'P', 78: 'P', 79: 'S', 80: 'T', 81: 'I', 82: 'P', 83: 'D', 84: 'E', 85: 'M', 86: 'V', 87: 'S', 88: 'V', 89: 'I', 90: 'L', 91: 'N', 92: 'K', 93: 'Y', 94: 'F', 95: 'E', 96: 'V', 97: 'P', 98: 'S', 99: 'E', 100: 'E', 101: 'L', 102: 'E', 103: 'K', 104: 'A', 105: 'E', 106: 'E', 107: 'W', 108: 'H', 109: 'R', 110: 'L', 111: 'S', 112: 'M', 113: 'G', 114: 'A', 115: 'E', 116: 'N', 117: 'I', 118: 'V', 119: 'G', 120: 'D', 121: 'L', 122: 'L', 123: 'E', 124: 'R', 125: 'Y', 126: 'I', 127: 'A', 128: 'E', 129: 'V', 130: 'I', 131: 'E', 132: 'P', 133: 'H', 134: 'G', 135: 'W', 136: 'I', 137: 'W', 138: 'C', 139: 'S', 140: 'G', 141: 'S', 142: 'M', 143: 'V', 144: 'R', 145: 'A', 146: 'V', 147: 'D', 148: 'F', 149: 'I', 150: 'Y', 151: 'C', 152: 'D', 153: 'S', 154: 'E', 155: 'N', 156: 'V', 157: 'W', 158: 'Q', 159: 'S', 160: 'L', 161: 'Q', 162: 'V', 163: 'K', 164: 'N', 165: 'R', 166: 'D', 167: 'N', 168: 'T', 169: 'E', 170: 'N', 171: 'S', 172: 'S', 173: 'S', 174: 'A', 175: 'A', 176: 'I', 177: 'R', 178: 'H', 179: 'G', 180: 'T', 181: 'P', 182: 'I', 183: 'K', 184: 'K', 185: 'W', 186: 'F', 187: 'R', 188: 'T', 189: 'F', 190: 'S', 191: 'K', 192: 'K', 193: 'R', 194: 'G', 195: 'D', 196: 'N', 197: 'W', 198: 'D', 199: 'K', 200: 'F', 201: 'P', 202: 'S', 203: 'L', 204: 'E', 205: 'G', 206: 'K', 207: 'E', 208: 'N', 209: 'L', 210: 'S', 211: 'E', 212: 'K', 213: 'G', 214: 'F', 215: 'K', 216: 'L', 217: 'Y', 218: 'V', 219: 'E', 220: 'K', 221: 'Y', 222: 'L', 223: 'S', 224: 'A', 225: 'L', 226: 'R', 227: 'A', 228: 'I', 229: 'K', 230: 'A', 231: 'L'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6G3B_B.pdb ! residue not defined for rnum = 49
 231
 (231, 231)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.105304
6G7O_A
running..
 Extract distance maps..
 350
 (350, 350)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.235306
6CP9_G
running..
 Extract distance maps..
{13: 'S', 14: 'V', 15: 'V', 16: 'D', 17: 'A', 18: 'K', 19: 'K', 20: 'F', 21: 'D', 22: 'Y', 23: 'L', 24: 'F', 25: 'G', 26: 'K', 27: 'A', 28: 'T', 29: 'G', 30: 'N', 31: 'S', 32: 'H', 33: 'T', 34: 'L', 35: 'D', 36: 'R', 37: 'T', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'L', 41: 'A', 42: 'L', 43: 'E', 44: 'M', 45: 'K', 46: 'R', 47: 'L', 48: 'G', 49: 'V', 50: 'A', 51: 'D', 52: 'D', 53: 'I', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'H', 57: 'A', 58: 'V', 59: 'L', 60: 'A', 61: 'E', 62: 'H', 63: 'F', 64: 'T', 65: 'Q', 66: 'A', 67: 'T', 68: 'K', 69: 'D', 70: 'S', 71: 'N', 72: 'N', 73: 'I', 74: 'V', 75: 'K', 76: 'K', 77: 'Y', 78: 'T', 79: 'D', 80: 'Q', 81: 'Y', 82: 'G', 83: 'S', 84: 'F', 85: 'E', 86: 'I', 87: 'R', 88: 'E', 89: 'S', 90: 'F', 91: 'F', 92: 'I', 93: 'G', 94: 'P', 95: 'S', 96: 'G', 97: 'K', 98: 'A', 99: 'T', 100: 'V', 101: 'F', 102: 'E', 103: 'S', 104: 'T', 105: 'F', 106: 'E', 107: 'V', 108: 'M', 109: 'K', 110: 'D', 111: 'G', 112: 'S', 113: 'H', 114: 'R', 115: 'F', 116: 'I', 117: 'T', 118: 'T', 119: 'I', 120: 'P', 121: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CP9_G.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{13: 'S', 14: 'V', 15: 'V', 16: 'D', 17: 'A', 18: 'K', 19: 'K', 20: 'F', 21: 'D', 22: 'Y', 23: 'L', 24: 'F', 25: 'G', 26: 'K', 27: 'A', 28: 'T', 29: 'G', 30: 'N', 31: 'S', 32: 'H', 33: 'T', 34: 'L', 35: 'D', 36: 'R', 37: 'T', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'L', 41: 'A', 42: 'L', 43: 'E', 44: 'M', 45: 'K', 46: 'R', 47: 'L', 48: 'G', 49: 'V', 50: 'A', 51: 'D', 52: 'D', 53: 'I', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'H', 57: 'A', 58: 'V', 59: 'L', 60: 'A', 61: 'E', 62: 'H', 63: 'F', 64: 'T', 65: 'Q', 66: 'A', 67: 'T', 68: 'K', 69: 'D', 70: 'S', 71: 'N', 72: 'N', 73: 'I', 74: 'V', 75: 'K', 76: 'K', 77: 'Y', 78: 'T', 79: 'D', 80: 'Q', 81: 'Y', 82: 'G', 83: 'S', 84: 'F', 85: 'E', 86: 'I', 87: 'R', 88: 'E', 89: 'S', 90: 'F', 91: 'F', 92: 'I', 93: 'G', 94: 'P', 95: 'S', 96: 'G', 97: 'K', 98: 'A', 99: 'T', 100: 'V', 101: 'F', 102: 'E', 103: 'S', 104: 'T', 105: 'F', 106: 'E', 107: 'V', 108: 'M', 109: 'K', 110: 'D', 111: 'G', 112: 'S', 113: 'H', 114: 'R', 115: 'F', 116: 'I', 117: 'T', 118: 'T', 119: 'I', 120: 'P', 121: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CP9_G.pdb ! residue not defined for rnum = 2
{13: 'S', 14: 'V', 15: 'V', 16: 'D', 17: 'A', 18: 'K', 19: 'K', 20: 'F', 21: 'D', 22: 'Y', 23: 'L', 24: 'F', 25: 'G', 26: 'K', 27: 'A', 28: 'T', 29: 'G', 30: 'N', 31: 'S', 32: 'H', 33: 'T', 34: 'L', 35: 'D', 36: 'R', 37: 'T', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'L', 41: 'A', 42: 'L', 43: 'E', 44: 'M', 45: 'K', 46: 'R', 47: 'L', 48: 'G', 49: 'V', 50: 'A', 51: 'D', 52: 'D', 53: 'I', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'H', 57: 'A', 58: 'V', 59: 'L', 60: 'A', 61: 'E', 62: 'H', 63: 'F', 64: 'T', 65: 'Q', 66: 'A', 67: 'T', 68: 'K', 69: 'D', 70: 'S', 71: 'N', 72: 'N', 73: 'I', 74: 'V', 75: 'K', 76: 'K', 77: 'Y', 78: 'T', 79: 'D', 80: 'Q', 81: 'Y', 82: 'G', 83: 'S', 84: 'F', 85: 'E', 86: 'I', 87: 'R', 88: 'E', 89: 'S', 90: 'F', 91: 'F', 92: 'I', 93: 'G', 94: 'P', 95: 'S', 96: 'G', 97: 'K', 98: 'A', 99: 'T', 100: 'V', 101: 'F', 102: 'E', 103: 'S', 104: 'T', 105: 'F', 106: 'E', 107: 'V', 108: 'M', 109: 'K', 110: 'D', 111: 'G', 112: 'S', 113: 'H', 114: 'R', 115: 'F', 116: 'I', 117: 'T', 118: 'T', 119: 'I', 120: 'P', 121: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CP9_G.pdb ! residue not defined for rnum = 3
{13: 'S', 14: 'V', 15: 'V', 16: 'D', 17: 'A', 18: 'K', 19: 'K', 20: 'F', 21: 'D', 22: 'Y', 23: 'L', 24: 'F', 25: 'G', 26: 'K', 27: 'A', 28: 'T', 29: 'G', 30: 'N', 31: 'S', 32: 'H', 33: 'T', 34: 'L', 35: 'D', 36: 'R', 37: 'T', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'L', 41: 'A', 42: 'L', 43: 'E', 44: 'M', 45: 'K', 46: 'R', 47: 'L', 48: 'G', 49: 'V', 50: 'A', 51: 'D', 52: 'D', 53: 'I', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'H', 57: 'A', 58: 'V', 59: 'L', 60: 'A', 61: 'E', 62: 'H', 63: 'F', 64: 'T', 65: 'Q', 66: 'A', 67: 'T', 68: 'K', 69: 'D', 70: 'S', 71: 'N', 72: 'N', 73: 'I', 74: 'V', 75: 'K', 76: 'K', 77: 'Y', 78: 'T', 79: 'D', 80: 'Q', 81: 'Y', 82: 'G', 83: 'S', 84: 'F', 85: 'E', 86: 'I', 87: 'R', 88: 'E', 89: 'S', 90: 'F', 91: 'F', 92: 'I', 93: 'G', 94: 'P', 95: 'S', 96: 'G', 97: 'K', 98: 'A', 99: 'T', 100: 'V', 101: 'F', 102: 'E', 103: 'S', 104: 'T', 105: 'F', 106: 'E', 107: 'V', 108: 'M', 109: 'K', 110: 'D', 111: 'G', 112: 'S', 113: 'H', 114: 'R', 115: 'F', 116: 'I', 117: 'T', 118: 'T', 119: 'I', 120: 'P', 121: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CP9_G.pdb ! residue not defined for rnum = 4
{13: 'S', 14: 'V', 15: 'V', 16: 'D', 17: 'A', 18: 'K', 19: 'K', 20: 'F', 21: 'D', 22: 'Y', 23: 'L', 24: 'F', 25: 'G', 26: 'K', 27: 'A', 28: 'T', 29: 'G', 30: 'N', 31: 'S', 32: 'H', 33: 'T', 34: 'L', 35: 'D', 36: 'R', 37: 'T', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'L', 41: 'A', 42: 'L', 43: 'E', 44: 'M', 45: 'K', 46: 'R', 47: 'L', 48: 'G', 49: 'V', 50: 'A', 51: 'D', 52: 'D', 53: 'I', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'H', 57: 'A', 58: 'V', 59: 'L', 60: 'A', 61: 'E', 62: 'H', 63: 'F', 64: 'T', 65: 'Q', 66: 'A', 67: 'T', 68: 'K', 69: 'D', 70: 'S', 71: 'N', 72: 'N', 73: 'I', 74: 'V', 75: 'K', 76: 'K', 77: 'Y', 78: 'T', 79: 'D', 80: 'Q', 81: 'Y', 82: 'G', 83: 'S', 84: 'F', 85: 'E', 86: 'I', 87: 'R', 88: 'E', 89: 'S', 90: 'F', 91: 'F', 92: 'I', 93: 'G', 94: 'P', 95: 'S', 96: 'G', 97: 'K', 98: 'A', 99: 'T', 100: 'V', 101: 'F', 102: 'E', 103: 'S', 104: 'T', 105: 'F', 106: 'E', 107: 'V', 108: 'M', 109: 'K', 110: 'D', 111: 'G', 112: 'S', 113: 'H', 114: 'R', 115: 'F', 116: 'I', 117: 'T', 118: 'T', 119: 'I', 120: 'P', 121: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CP9_G.pdb ! residue not defined for rnum = 5
{13: 'S', 14: 'V', 15: 'V', 16: 'D', 17: 'A', 18: 'K', 19: 'K', 20: 'F', 21: 'D', 22: 'Y', 23: 'L', 24: 'F', 25: 'G', 26: 'K', 27: 'A', 28: 'T', 29: 'G', 30: 'N', 31: 'S', 32: 'H', 33: 'T', 34: 'L', 35: 'D', 36: 'R', 37: 'T', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'L', 41: 'A', 42: 'L', 43: 'E', 44: 'M', 45: 'K', 46: 'R', 47: 'L', 48: 'G', 49: 'V', 50: 'A', 51: 'D', 52: 'D', 53: 'I', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'H', 57: 'A', 58: 'V', 59: 'L', 60: 'A', 61: 'E', 62: 'H', 63: 'F', 64: 'T', 65: 'Q', 66: 'A', 67: 'T', 68: 'K', 69: 'D', 70: 'S', 71: 'N', 72: 'N', 73: 'I', 74: 'V', 75: 'K', 76: 'K', 77: 'Y', 78: 'T', 79: 'D', 80: 'Q', 81: 'Y', 82: 'G', 83: 'S', 84: 'F', 85: 'E', 86: 'I', 87: 'R', 88: 'E', 89: 'S', 90: 'F', 91: 'F', 92: 'I', 93: 'G', 94: 'P', 95: 'S', 96: 'G', 97: 'K', 98: 'A', 99: 'T', 100: 'V', 101: 'F', 102: 'E', 103: 'S', 104: 'T', 105: 'F', 106: 'E', 107: 'V', 108: 'M', 109: 'K', 110: 'D', 111: 'G', 112: 'S', 113: 'H', 114: 'R', 115: 'F', 116: 'I', 117: 'T', 118: 'T', 119: 'I', 120: 'P', 121: 'K'}
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{13: 'S', 14: 'V', 15: 'V', 16: 'D', 17: 'A', 18: 'K', 19: 'K', 20: 'F', 21: 'D', 22: 'Y', 23: 'L', 24: 'F', 25: 'G', 26: 'K', 27: 'A', 28: 'T', 29: 'G', 30: 'N', 31: 'S', 32: 'H', 33: 'T', 34: 'L', 35: 'D', 36: 'R', 37: 'T', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'L', 41: 'A', 42: 'L', 43: 'E', 44: 'M', 45: 'K', 46: 'R', 47: 'L', 48: 'G', 49: 'V', 50: 'A', 51: 'D', 52: 'D', 53: 'I', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'H', 57: 'A', 58: 'V', 59: 'L', 60: 'A', 61: 'E', 62: 'H', 63: 'F', 64: 'T', 65: 'Q', 66: 'A', 67: 'T', 68: 'K', 69: 'D', 70: 'S', 71: 'N', 72: 'N', 73: 'I', 74: 'V', 75: 'K', 76: 'K', 77: 'Y', 78: 'T', 79: 'D', 80: 'Q', 81: 'Y', 82: 'G', 83: 'S', 84: 'F', 85: 'E', 86: 'I', 87: 'R', 88: 'E', 89: 'S', 90: 'F', 91: 'F', 92: 'I', 93: 'G', 94: 'P', 95: 'S', 96: 'G', 97: 'K', 98: 'A', 99: 'T', 100: 'V', 101: 'F', 102: 'E', 103: 'S', 104: 'T', 105: 'F', 106: 'E', 107: 'V', 108: 'M', 109: 'K', 110: 'D', 111: 'G', 112: 'S', 113: 'H', 114: 'R', 115: 'F', 116: 'I', 117: 'T', 118: 'T', 119: 'I', 120: 'P', 121: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CP9_G.pdb ! residue not defined for rnum = 7
{13: 'S', 14: 'V', 15: 'V', 16: 'D', 17: 'A', 18: 'K', 19: 'K', 20: 'F', 21: 'D', 22: 'Y', 23: 'L', 24: 'F', 25: 'G', 26: 'K', 27: 'A', 28: 'T', 29: 'G', 30: 'N', 31: 'S', 32: 'H', 33: 'T', 34: 'L', 35: 'D', 36: 'R', 37: 'T', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'L', 41: 'A', 42: 'L', 43: 'E', 44: 'M', 45: 'K', 46: 'R', 47: 'L', 48: 'G', 49: 'V', 50: 'A', 51: 'D', 52: 'D', 53: 'I', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'H', 57: 'A', 58: 'V', 59: 'L', 60: 'A', 61: 'E', 62: 'H', 63: 'F', 64: 'T', 65: 'Q', 66: 'A', 67: 'T', 68: 'K', 69: 'D', 70: 'S', 71: 'N', 72: 'N', 73: 'I', 74: 'V', 75: 'K', 76: 'K', 77: 'Y', 78: 'T', 79: 'D', 80: 'Q', 81: 'Y', 82: 'G', 83: 'S', 84: 'F', 85: 'E', 86: 'I', 87: 'R', 88: 'E', 89: 'S', 90: 'F', 91: 'F', 92: 'I', 93: 'G', 94: 'P', 95: 'S', 96: 'G', 97: 'K', 98: 'A', 99: 'T', 100: 'V', 101: 'F', 102: 'E', 103: 'S', 104: 'T', 105: 'F', 106: 'E', 107: 'V', 108: 'M', 109: 'K', 110: 'D', 111: 'G', 112: 'S', 113: 'H', 114: 'R', 115: 'F', 116: 'I', 117: 'T', 118: 'T', 119: 'I', 120: 'P', 121: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CP9_G.pdb ! residue not defined for rnum = 8
{13: 'S', 14: 'V', 15: 'V', 16: 'D', 17: 'A', 18: 'K', 19: 'K', 20: 'F', 21: 'D', 22: 'Y', 23: 'L', 24: 'F', 25: 'G', 26: 'K', 27: 'A', 28: 'T', 29: 'G', 30: 'N', 31: 'S', 32: 'H', 33: 'T', 34: 'L', 35: 'D', 36: 'R', 37: 'T', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'L', 41: 'A', 42: 'L', 43: 'E', 44: 'M', 45: 'K', 46: 'R', 47: 'L', 48: 'G', 49: 'V', 50: 'A', 51: 'D', 52: 'D', 53: 'I', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'H', 57: 'A', 58: 'V', 59: 'L', 60: 'A', 61: 'E', 62: 'H', 63: 'F', 64: 'T', 65: 'Q', 66: 'A', 67: 'T', 68: 'K', 69: 'D', 70: 'S', 71: 'N', 72: 'N', 73: 'I', 74: 'V', 75: 'K', 76: 'K', 77: 'Y', 78: 'T', 79: 'D', 80: 'Q', 81: 'Y', 82: 'G', 83: 'S', 84: 'F', 85: 'E', 86: 'I', 87: 'R', 88: 'E', 89: 'S', 90: 'F', 91: 'F', 92: 'I', 93: 'G', 94: 'P', 95: 'S', 96: 'G', 97: 'K', 98: 'A', 99: 'T', 100: 'V', 101: 'F', 102: 'E', 103: 'S', 104: 'T', 105: 'F', 106: 'E', 107: 'V', 108: 'M', 109: 'K', 110: 'D', 111: 'G', 112: 'S', 113: 'H', 114: 'R', 115: 'F', 116: 'I', 117: 'T', 118: 'T', 119: 'I', 120: 'P', 121: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CP9_G.pdb ! residue not defined for rnum = 9
{13: 'S', 14: 'V', 15: 'V', 16: 'D', 17: 'A', 18: 'K', 19: 'K', 20: 'F', 21: 'D', 22: 'Y', 23: 'L', 24: 'F', 25: 'G', 26: 'K', 27: 'A', 28: 'T', 29: 'G', 30: 'N', 31: 'S', 32: 'H', 33: 'T', 34: 'L', 35: 'D', 36: 'R', 37: 'T', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'L', 41: 'A', 42: 'L', 43: 'E', 44: 'M', 45: 'K', 46: 'R', 47: 'L', 48: 'G', 49: 'V', 50: 'A', 51: 'D', 52: 'D', 53: 'I', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'H', 57: 'A', 58: 'V', 59: 'L', 60: 'A', 61: 'E', 62: 'H', 63: 'F', 64: 'T', 65: 'Q', 66: 'A', 67: 'T', 68: 'K', 69: 'D', 70: 'S', 71: 'N', 72: 'N', 73: 'I', 74: 'V', 75: 'K', 76: 'K', 77: 'Y', 78: 'T', 79: 'D', 80: 'Q', 81: 'Y', 82: 'G', 83: 'S', 84: 'F', 85: 'E', 86: 'I', 87: 'R', 88: 'E', 89: 'S', 90: 'F', 91: 'F', 92: 'I', 93: 'G', 94: 'P', 95: 'S', 96: 'G', 97: 'K', 98: 'A', 99: 'T', 100: 'V', 101: 'F', 102: 'E', 103: 'S', 104: 'T', 105: 'F', 106: 'E', 107: 'V', 108: 'M', 109: 'K', 110: 'D', 111: 'G', 112: 'S', 113: 'H', 114: 'R', 115: 'F', 116: 'I', 117: 'T', 118: 'T', 119: 'I', 120: 'P', 121: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CP9_G.pdb ! residue not defined for rnum = 10
{13: 'S', 14: 'V', 15: 'V', 16: 'D', 17: 'A', 18: 'K', 19: 'K', 20: 'F', 21: 'D', 22: 'Y', 23: 'L', 24: 'F', 25: 'G', 26: 'K', 27: 'A', 28: 'T', 29: 'G', 30: 'N', 31: 'S', 32: 'H', 33: 'T', 34: 'L', 35: 'D', 36: 'R', 37: 'T', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'L', 41: 'A', 42: 'L', 43: 'E', 44: 'M', 45: 'K', 46: 'R', 47: 'L', 48: 'G', 49: 'V', 50: 'A', 51: 'D', 52: 'D', 53: 'I', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'H', 57: 'A', 58: 'V', 59: 'L', 60: 'A', 61: 'E', 62: 'H', 63: 'F', 64: 'T', 65: 'Q', 66: 'A', 67: 'T', 68: 'K', 69: 'D', 70: 'S', 71: 'N', 72: 'N', 73: 'I', 74: 'V', 75: 'K', 76: 'K', 77: 'Y', 78: 'T', 79: 'D', 80: 'Q', 81: 'Y', 82: 'G', 83: 'S', 84: 'F', 85: 'E', 86: 'I', 87: 'R', 88: 'E', 89: 'S', 90: 'F', 91: 'F', 92: 'I', 93: 'G', 94: 'P', 95: 'S', 96: 'G', 97: 'K', 98: 'A', 99: 'T', 100: 'V', 101: 'F', 102: 'E', 103: 'S', 104: 'T', 105: 'F', 106: 'E', 107: 'V', 108: 'M', 109: 'K', 110: 'D', 111: 'G', 112: 'S', 113: 'H', 114: 'R', 115: 'F', 116: 'I', 117: 'T', 118: 'T', 119: 'I', 120: 'P', 121: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CP9_G.pdb ! residue not defined for rnum = 11
{13: 'S', 14: 'V', 15: 'V', 16: 'D', 17: 'A', 18: 'K', 19: 'K', 20: 'F', 21: 'D', 22: 'Y', 23: 'L', 24: 'F', 25: 'G', 26: 'K', 27: 'A', 28: 'T', 29: 'G', 30: 'N', 31: 'S', 32: 'H', 33: 'T', 34: 'L', 35: 'D', 36: 'R', 37: 'T', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'L', 41: 'A', 42: 'L', 43: 'E', 44: 'M', 45: 'K', 46: 'R', 47: 'L', 48: 'G', 49: 'V', 50: 'A', 51: 'D', 52: 'D', 53: 'I', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'H', 57: 'A', 58: 'V', 59: 'L', 60: 'A', 61: 'E', 62: 'H', 63: 'F', 64: 'T', 65: 'Q', 66: 'A', 67: 'T', 68: 'K', 69: 'D', 70: 'S', 71: 'N', 72: 'N', 73: 'I', 74: 'V', 75: 'K', 76: 'K', 77: 'Y', 78: 'T', 79: 'D', 80: 'Q', 81: 'Y', 82: 'G', 83: 'S', 84: 'F', 85: 'E', 86: 'I', 87: 'R', 88: 'E', 89: 'S', 90: 'F', 91: 'F', 92: 'I', 93: 'G', 94: 'P', 95: 'S', 96: 'G', 97: 'K', 98: 'A', 99: 'T', 100: 'V', 101: 'F', 102: 'E', 103: 'S', 104: 'T', 105: 'F', 106: 'E', 107: 'V', 108: 'M', 109: 'K', 110: 'D', 111: 'G', 112: 'S', 113: 'H', 114: 'R', 115: 'F', 116: 'I', 117: 'T', 118: 'T', 119: 'I', 120: 'P', 121: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CP9_G.pdb ! residue not defined for rnum = 12
 121
 (121, 121)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.032181
6CP9_H
running..
 Extract distance maps..
 114
 (114, 114)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.032893
6N8P_A
running..
 Extract distance maps..
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'A', 531: 'V', 532: 'E', 533: 'Q', 534: 'V', 535: 'E', 536: 'A', 537: 'D', 538: 'L', 539: 'L', 540: 'Q', 541: 'D', 542: 'Q', 543: 'E', 544: 'G', 545: 'Y', 546: 'R', 547: 'W', 548: 'K', 549: 'G', 550: 'H', 551: 'E', 552: 'R', 553: 'L', 554: 'A', 555: 'A', 556: 'R', 557: 'S', 558: 'G', 559: 'P', 560: 'V', 561: 'R', 562: 'F', 563: 'E', 564: 'P', 565: 'G', 566: 'F', 567: 'Q', 568: 'P', 569: 'F', 570: 'V', 571: 'L', 572: 'V', 573: 'Q', 574: 'C', 575: 'Q', 576: 'P', 577: 'P', 578: 'A', 579: 'V', 580: 'V', 581: 'T', 582: 'S', 583: 'L', 584: 'A', 585: 'L', 586: 'H', 587: 'S', 588: 'E', 589: 'W', 590: 'R', 591: 'L', 592: 'V', 593: 'A', 594: 'F', 595: 'G', 596: 'T', 597: 'S', 598: 'H', 599: 'G', 600: 'F', 601: 'G', 602: 'L', 603: 'F', 604: 'D', 605: 'H', 606: 'Q', 607: 'Q', 608: 'R', 609: 'R', 610: 'Q', 611: 'V', 612: 'F', 613: 'V', 614: 'K', 615: 'C', 616: 'T', 617: 'L', 618: 'H', 619: 'P', 620: 'S', 621: 'D', 622: 'Q', 623: 'L', 697: 'S', 698: 'F', 699: 'T', 700: 'G', 701: 'F', 702: 'V', 703: 'R', 704: 'T', 705: 'L', 706: 'Y', 707: 'F', 708: 'A', 709: 'D', 710: 'T', 711: 'Y', 712: 'L', 713: 'K', 714: 'D', 715: 'S', 716: 'S', 717: 'R', 718: 'H', 719: 'C', 720: 'P', 721: 'S', 722: 'L', 723: 'W', 724: 'A', 725: 'G', 726: 'T', 727: 'N', 728: 'G', 729: 'G', 730: 'T', 731: 'I', 732: 'Y', 733: 'A', 734: 'F', 735: 'S', 736: 'L', 737: 'R', 738: 'V', 739: 'P', 740: 'P', 741: 'A', 742: 'E', 743: 'R', 744: 'R', 745: 'M', 746: 'D', 747: 'E', 748: 'P', 749: 'V', 750: 'R', 751: 'A', 752: 'E', 753: 'Q', 754: 'A', 755: 'K', 756: 'E', 757: 'I', 758: 'Q', 759: 'L', 760: 'M', 761: 'H', 762: 'R', 763: 'A', 764: 'P', 765: 'V', 766: 'V', 767: 'G', 768: 'I', 769: 'L', 770: 'V', 771: 'L', 772: 'D', 773: 'G', 774: 'H', 775: 'S', 776: 'V', 777: 'P', 778: 'L', 779: 'P', 780: 'E', 781: 'P', 782: 'L', 783: 'E', 784: 'V', 785: 'A', 786: 'H', 787: 'D', 788: 'L', 789: 'S', 790: 'K', 791: 'S', 792: 'P', 793: 'D', 794: 'M', 795: 'Q', 796: 'G', 797: 'S', 798: 'H', 799: 'Q', 800: 'L', 801: 'L', 802: 'V', 803: 'V', 804: 'S', 805: 'E', 806: 'E', 807: 'Q', 808: 'F', 809: 'K', 810: 'V', 811: 'F', 812: 'T', 813: 'L', 814: 'P', 815: 'K', 816: 'V', 817: 'S', 818: 'A', 819: 'K', 820: 'L', 821: 'K', 822: 'L', 823: 'K', 824: 'L', 825: 'T', 826: 'A', 827: 'L', 828: 'E', 829: 'G', 830: 'S', 831: 'R', 832: 'V', 833: 'R', 834: 'R', 835: 'V', 836: 'S', 837: 'V', 838: 'A', 839: 'H', 840: 'F', 841: 'G', 848: 'Y', 849: 'G', 850: 'E', 851: 'H', 852: 'H', 853: 'L', 854: 'A', 855: 'V', 856: 'L', 857: 'T', 858: 'N', 859: 'L', 860: 'G', 861: 'D', 862: 'I', 863: 'Q', 864: 'V', 865: 'V', 866: 'S', 867: 'L', 868: 'P', 869: 'L', 870: 'L', 871: 'K', 872: 'P', 873: 'Q', 874: 'V', 875: 'R', 876: 'Y', 877: 'S', 878: 'C', 879: 'I', 880: 'R', 881: 'R', 882: 'E', 883: 'D', 884: 'V', 885: 'S', 886: 'G', 887: 'I', 888: 'A', 889: 'S', 890: 'C', 891: 'V', 892: 'F', 893: 'T', 894: 'K', 895: 'Y', 896: 'G', 897: 'Q', 898: 'G', 899: 'F', 900: 'Y', 901: 'L', 902: 'I', 903: 'S', 904: 'P', 905: 'S', 906: 'E', 907: 'F', 908: 'E', 909: 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 926
 (926, 926)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
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6G7G_A
running..
 Extract distance maps..
 115
 (115, 115)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.033459
6NX4_A
running..
 Extract distance maps..
 167
 (167, 167)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.058738
5ZKH_B
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZKH_B.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{2: 'C', 3: 'V', 4: 'L', 5: 'T', 6: 'L', 7: 'V', 8: 'K', 9: 'D', 10: 'D', 11: 'I', 12: 'K', 13: 'S', 14: 'D', 15: 'I', 16: 'L', 17: 'K', 18: 'L', 19: 'V', 20: 'L', 21: 'D', 22: 'Y', 23: 'I', 24: 'K', 25: 'V', 26: 'T', 27: 'V', 30: 'D', 31: 'N', 32: 'E', 33: 'N', 34: 'V', 35: 'K', 36: 'L', 37: 'P', 38: 'E', 39: 'I', 40: 'C', 41: 'Y', 42: 'D', 43: 'K', 44: 'K', 45: 'I', 46: 'T', 47: 'L', 48: 'Q', 49: 'Y', 50: 'K', 51: 'N', 52: 'K', 53: 'T', 54: 'Y', 55: 'K', 56: 'D', 57: 'L', 58: 'F', 59: 'C', 60: 'T', 61: 'L', 62: 'Y', 63: 'A', 64: 'L', 65: 'I', 66: 'D', 67: 'I', 68: 'Y', 69: 'D', 70: 'C', 71: 'Y', 72: 'S', 73: 'E', 74: 'L', 75: 'F', 76: 'N', 77: 'E', 78: 'D', 79: 'E', 80: 'G', 81: 'K', 82: 'V', 83: 'S', 84: 'E', 85: 'N', 86: 'E', 87: 'E', 88: 'F', 89: 'I', 90: 'F', 91: 'H', 92: 'L', 93: 'A', 94: 'S', 95: 'D', 96: 'K', 97: 'Y', 98: 'I', 99: 'L', 100: 'K', 101: 'Q', 102: 'S', 103: 'D', 104: 'M', 105: 'K', 106: 'H', 107: 'L', 108: 'N', 109: 'D', 110: 'L', 111: 'L', 112: 'C', 113: 'E', 114: 'K', 115: 'S', 116: 'Y', 117: 'I', 118: 'I', 119: 'S', 120: 'N', 121: 'K', 122: 'H', 123: 'A', 124: 'S', 125: 'I', 126: 'V', 127: 'D', 128: 'I', 129: 'F', 130: 'Y', 131: 'F', 132: 'C', 133: 'A', 134: 'I', 135: 'H', 136: 'K', 137: 'L', 138: 'L', 139: 'D', 140: 'E', 141: 'M', 142: 'A', 143: 'V', 144: 'K', 145: 'E', 146: 'R', 147: 'I', 148: 'E', 149: 'F', 150: 'S', 151: 'Y', 152: 'I', 153: 'Y', 154: 'R', 155: 'W', 156: 'Y', 157: 'L', 158: 'H', 159: 'I', 160: 'Q', 161: 'E', 162: 'T', 163: 'L', 164: 'L', 165: 'A', 166: 'N', 167: 'F', 168: 'S', 169: 'T', 170: 'L', 171: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZKH_B.pdb ! residue not defined for rnum = 28
{2: 'C', 3: 'V', 4: 'L', 5: 'T', 6: 'L', 7: 'V', 8: 'K', 9: 'D', 10: 'D', 11: 'I', 12: 'K', 13: 'S', 14: 'D', 15: 'I', 16: 'L', 17: 'K', 18: 'L', 19: 'V', 20: 'L', 21: 'D', 22: 'Y', 23: 'I', 24: 'K', 25: 'V', 26: 'T', 27: 'V', 30: 'D', 31: 'N', 32: 'E', 33: 'N', 34: 'V', 35: 'K', 36: 'L', 37: 'P', 38: 'E', 39: 'I', 40: 'C', 41: 'Y', 42: 'D', 43: 'K', 44: 'K', 45: 'I', 46: 'T', 47: 'L', 48: 'Q', 49: 'Y', 50: 'K', 51: 'N', 52: 'K', 53: 'T', 54: 'Y', 55: 'K', 56: 'D', 57: 'L', 58: 'F', 59: 'C', 60: 'T', 61: 'L', 62: 'Y', 63: 'A', 64: 'L', 65: 'I', 66: 'D', 67: 'I', 68: 'Y', 69: 'D', 70: 'C', 71: 'Y', 72: 'S', 73: 'E', 74: 'L', 75: 'F', 76: 'N', 77: 'E', 78: 'D', 79: 'E', 80: 'G', 81: 'K', 82: 'V', 83: 'S', 84: 'E', 85: 'N', 86: 'E', 87: 'E', 88: 'F', 89: 'I', 90: 'F', 91: 'H', 92: 'L', 93: 'A', 94: 'S', 95: 'D', 96: 'K', 97: 'Y', 98: 'I', 99: 'L', 100: 'K', 101: 'Q', 102: 'S', 103: 'D', 104: 'M', 105: 'K', 106: 'H', 107: 'L', 108: 'N', 109: 'D', 110: 'L', 111: 'L', 112: 'C', 113: 'E', 114: 'K', 115: 'S', 116: 'Y', 117: 'I', 118: 'I', 119: 'S', 120: 'N', 121: 'K', 122: 'H', 123: 'A', 124: 'S', 125: 'I', 126: 'V', 127: 'D', 128: 'I', 129: 'F', 130: 'Y', 131: 'F', 132: 'C', 133: 'A', 134: 'I', 135: 'H', 136: 'K', 137: 'L', 138: 'L', 139: 'D', 140: 'E', 141: 'M', 142: 'A', 143: 'V', 144: 'K', 145: 'E', 146: 'R', 147: 'I', 148: 'E', 149: 'F', 150: 'S', 151: 'Y', 152: 'I', 153: 'Y', 154: 'R', 155: 'W', 156: 'Y', 157: 'L', 158: 'H', 159: 'I', 160: 'Q', 161: 'E', 162: 'T', 163: 'L', 164: 'L', 165: 'A', 166: 'N', 167: 'F', 168: 'S', 169: 'T', 170: 'L', 171: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZKH_B.pdb ! residue not defined for rnum = 29
 171
 (171, 171)
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 Writing distance map file.. 
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5Y08_A
running..
 Extract distance maps..
 205
 (205, 205)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
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6CB6_A
running..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CB6_A.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{4: 'K', 5: 'L', 6: 'R', 7: 'V', 8: 'L', 9: 'Y', 10: 'D', 11: 'E', 12: 'F', 13: 'V', 14: 'T', 15: 'I', 16: 'S', 17: 'K', 18: 'D', 19: 'N', 20: 'L', 21: 'E', 22: 'R', 23: 'E', 24: 'T', 25: 'G', 26: 'L', 27: 'S', 28: 'A', 29: 'S', 30: 'D', 31: 'V', 32: 'D', 33: 'M', 34: 'D', 35: 'F', 36: 'D', 37: 'L', 38: 'N', 39: 'I', 40: 'F', 41: 'M', 42: 'T', 43: 'L', 44: 'V', 45: 'P', 46: 'V', 47: 'L', 48: 'A', 49: 'A', 50: 'A', 51: 'V', 52: 'C', 53: 'A', 54: 'I', 55: 'T', 56: 'P', 57: 'T', 58: 'I', 59: 'E', 60: 'D', 61: 'D', 62: 'K', 63: 'I', 64: 'V', 65: 'T', 66: 'M', 67: 'M', 68: 'K', 69: 'Y', 70: 'C', 71: 'S', 72: 'Y', 73: 'Q', 74: 'S', 75: 'F', 76: 'S', 77: 'F', 78: 'W', 79: 'F', 80: 'L', 81: 'K', 82: 'S', 83: 'G', 84: 'A', 85: 'V', 86: 'V', 87: 'K', 88: 'S', 89: 'V', 90: 'Y', 91: 'N', 92: 'K', 93: 'L', 94: 'D', 95: 'Y', 96: 'V', 97: 'K', 98: 'K', 99: 'E', 100: 'K', 101: 'F', 102: 'V', 103: 'A', 104: 'T', 105: 'F', 106: 'R', 107: 'D', 108: 'M', 109: 'L', 110: 'L', 111: 'N', 112: 'V', 113: 'Q', 114: 'T', 115: 'L', 116: 'I', 117: 'S', 118: 'L', 119: 'N', 120: 'S', 121: 'M'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CB6_A.pdb ! residue not defined for rnum = 2
{4: 'K', 5: 'L', 6: 'R', 7: 'V', 8: 'L', 9: 'Y', 10: 'D', 11: 'E', 12: 'F', 13: 'V', 14: 'T', 15: 'I', 16: 'S', 17: 'K', 18: 'D', 19: 'N', 20: 'L', 21: 'E', 22: 'R', 23: 'E', 24: 'T', 25: 'G', 26: 'L', 27: 'S', 28: 'A', 29: 'S', 30: 'D', 31: 'V', 32: 'D', 33: 'M', 34: 'D', 35: 'F', 36: 'D', 37: 'L', 38: 'N', 39: 'I', 40: 'F', 41: 'M', 42: 'T', 43: 'L', 44: 'V', 45: 'P', 46: 'V', 47: 'L', 48: 'A', 49: 'A', 50: 'A', 51: 'V', 52: 'C', 53: 'A', 54: 'I', 55: 'T', 56: 'P', 57: 'T', 58: 'I', 59: 'E', 60: 'D', 61: 'D', 62: 'K', 63: 'I', 64: 'V', 65: 'T', 66: 'M', 67: 'M', 68: 'K', 69: 'Y', 70: 'C', 71: 'S', 72: 'Y', 73: 'Q', 74: 'S', 75: 'F', 76: 'S', 77: 'F', 78: 'W', 79: 'F', 80: 'L', 81: 'K', 82: 'S', 83: 'G', 84: 'A', 85: 'V', 86: 'V', 87: 'K', 88: 'S', 89: 'V', 90: 'Y', 91: 'N', 92: 'K', 93: 'L', 94: 'D', 95: 'Y', 96: 'V', 97: 'K', 98: 'K', 99: 'E', 100: 'K', 101: 'F', 102: 'V', 103: 'A', 104: 'T', 105: 'F', 106: 'R', 107: 'D', 108: 'M', 109: 'L', 110: 'L', 111: 'N', 112: 'V', 113: 'Q', 114: 'T', 115: 'L', 116: 'I', 117: 'S', 118: 'L', 119: 'N', 120: 'S', 121: 'M'}
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 121
 (121, 121)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.035960
6N0T_A
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{48: 'S', 49: 'R', 50: 'Y', 51: 'K', 52: 'A', 53: 'S', 54: 'T', 55: 'D', 56: 'Y', 57: 'A', 58: 'K', 59: 'D', 60: 'A', 61: 'E', 62: 'G', 63: 'L', 64: 'T', 65: 'A', 66: 'P', 67: 'Y', 68: 'V', 69: 'S', 70: 'Q', 71: 'D', 72: 'P', 73: 'Q', 74: 'E', 75: 'T', 76: 'A', 77: 'A', 78: 'L', 79: 'V', 80: 'R', 81: 'A', 82: 'L', 83: 'D', 84: 'D', 85: 'A', 86: 'A', 87: 'K', 88: 'K', 89: 'G', 95: 'F', 96: 'S', 97: 'V', 98: 'K', 99: 'K', 100: 'T', 101: 'R', 102: 'Y', 103: 'A', 104: 'V', 105: 'A', 106: 'S', 107: 'S', 108: 'P', 109: 'T', 110: 'G', 111: 'A', 112: 'E', 113: 'V', 114: 'D', 115: 'S', 116: 'W', 117: 'R', 118: 'F', 119: 'N', 120: 'D', 121: 'W', 122: 'D', 123: 'Y', 124: 'K', 125: 'K', 126: 'P', 127: 'D', 128: 'L', 129: 'P', 130: 'T', 131: 'Y', 132: 'A', 133: 'R', 134: 'G', 135: 'L', 136: 'F', 137: 'T', 138: 'T', 139: 'R', 140: 'T', 141: 'Q', 142: 'H', 143: 'G', 144: 'V', 145: 'P', 146: 'E', 147: 'I', 148: 'A', 149: 'V', 150: 'R', 151: 'G', 152: 'Y', 153: 'D', 154: 'K', 155: 'F', 156: 'F', 157: 'N', 158: 'I', 159: 'D', 160: 'E', 161: 'T', 162: 'R', 163: 'D', 164: 'T', 165: 'A', 166: 'W', 167: 'S', 168: 'A', 169: 'I', 170: 'R', 171: 'E', 172: 'R', 173: 'T', 174: 'K', 175: 'G', 176: 'P', 177: 'Y', 178: 'E', 179: 'L', 180: 'T', 181: 'L', 182: 'M', 183: 'E', 184: 'N', 185: 'G', 186: 'C', 187: 'I', 188: 'I', 189: 'F', 190: 'I', 191: 'S', 192: 'G', 193: 'L', 194: 'E', 195: 'D', 196: 'G', 197: 'T', 198: 'L', 199: 'L', 200: 'V', 201: 'C', 202: 'S', 203: 'K', 204: 'H', 205: 'S', 206: 'T', 207: 'G', 208: 'D', 214: 'L', 215: 'S', 216: 'H', 217: 'S', 218: 'S', 219: 'A', 220: 'G', 221: 'E', 222: 'K', 223: 'H', 224: 'L', 225: 'E', 226: 'A', 227: 'Q', 228: 'L', 229: 'E', 230: 'R', 231: 'I', 232: 'G', 233: 'K', 234: 'T', 235: 'K', 236: 'E', 237: 'E', 238: 'L', 239: 'A', 240: 'R', 241: 'E', 242: 'L', 243: 'R', 244: 'K', 245: 'R', 246: 'N', 247: 'A', 248: 'T', 249: 'A', 250: 'V', 251: 'A', 252: 'E', 253: 'L', 254: 'C', 255: 'D', 256: 'D', 257: 'S', 258: 'F', 259: 'E', 260: 'E', 261: 'H', 262: 'I', 263: 'L', 264: 'A', 265: 'Y', 266: 'G', 267: 'P', 268: 'D', 269: 'K', 270: 'A', 271: 'G', 272: 'L', 273: 'Y', 274: 'L', 275: 'H', 276: 'G', 277: 'I', 278: 'N', 279: 'L', 280: 'N', 281: 'I', 282: 'P', 283: 'E', 284: 'F', 285: 'I', 286: 'T', 287: 'Y', 288: 'P', 289: 'S', 290: 'P', 291: 'L', 292: 'V', 293: 'Q', 294: 'K', 295: 'F', 296: 'A', 297: 'E', 298: 'D', 299: 'W', 300: 'G', 301: 'F', 302: 'R', 303: 'K', 304: 'T', 305: 'G', 306: 'L', 307: 'I', 308: 'I', 309: 'I', 310: 'D', 311: 'N', 312: 'I', 313: 'D', 314: 'D', 315: 'V', 316: 'K', 317: 'A', 318: 'F', 319: 'L', 320: 'E', 321: 'E', 322: 'V', 323: 'A', 324: 'E', 325: 'T', 326: 'G', 327: 'A', 328: 'H', 329: 'D', 330: 'G', 331: 'R', 332: 'D', 333: 'V', 334: 'E', 335: 'G', 336: 'F', 337: 'V', 338: 'I', 339: 'R', 340: 'C', 341: 'K', 342: 'K', 343: 'S', 344: 'T', 345: 'N', 346: 'P', 347: 'G', 348: 'V', 349: 'G', 350: 'P', 351: 'Y', 352: 'H', 353: 'D', 354: 'W', 355: 'F', 356: 'F', 357: 'K', 358: 'Y', 359: 'K', 360: 'F', 361: 'E', 362: 'E', 363: 'P', 364: 'Y', 365: 'L', 366: 'M', 367: 'Y', 368: 'R', 369: 'Q', 370: 'W', 371: 'R', 372: 'E', 373: 'C', 374: 'T', 375: 'K', 376: 'A', 377: 'L', 378: 'I', 379: 'S', 380: 'G', 381: 'K', 382: 'Q', 383: 'P', 384: 'K', 385: 'I', 386: 'K', 387: 'K', 388: 'H', 389: 'V', 390: 'K', 391: 'I', 392: 'T', 393: 'E', 394: 'E', 395: 'Y', 396: 'L', 397: 'L', 398: 'Y', 399: 'A', 400: 'R', 401: 'K', 402: 'R', 403: 'L', 404: 'A', 405: 'A', 406: 'D', 407: 'P', 408: 'K', 409: 'L', 410: 'A', 411: 'K', 412: 'L', 413: 'Y', 414: 'N', 415: 'Q', 416: 'N', 417: 'H', 418: 'G', 419: 'I', 420: 'I', 421: 'K', 422: 'L', 423: 'R', 424: 'N', 425: 'D', 426: 'F', 427: 'L', 428: 'E', 429: 'Y', 430: 'K', 431: 'N', 432: 'M', 433: 'K', 434: 'G', 435: 'T', 436: 'D', 437: 'A', 438: 'A', 439: 'N', 440: 'L'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6N0T_A.pdb ! residue not defined for rnum = 213
 440
 (440, 440)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.284128
6D7Y_B
running..
 Extract distance maps..
 155
 (155, 155)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.052729
6A5G_B
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6A5G_B.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{3: 'E', 4: 'I', 5: 'T', 6: 'Q', 7: 'E', 8: 'L', 9: 'V', 10: 'A', 11: 'A', 12: 'A', 13: 'Y', 14: 'E', 15: 'A', 16: 'V', 17: 'T', 18: 'C', 19: 'G', 20: 'D', 21: 'R', 22: 'E', 23: 'K', 24: 'T', 25: 'A', 26: 'L', 27: 'Y', 28: 'W', 29: 'S', 30: 'E', 31: 'D', 32: 'L', 33: 'R', 34: 'F', 35: 'F', 36: 'A', 37: 'P', 38: 'G', 39: 'S', 40: 'H', 41: 'A', 42: 'G', 43: 'S', 44: 'G', 45: 'W', 46: 'R', 47: 'V', 48: 'G', 49: 'I', 50: 'D', 51: 'D', 52: 'F', 53: 'L', 54: 'S', 55: 'Y', 56: 'V', 57: 'Q', 58: 'D', 59: 'M', 60: 'L', 61: 'A', 62: 'A', 63: 'S', 64: 'G', 65: 'G', 66: 'S', 67: 'W', 68: 'S', 69: 'M', 70: 'Q', 71: 'P', 72: 'I', 73: 'T', 74: 'L', 75: 'L', 76: 'I', 77: 'N', 78: 'N', 79: 'E', 80: 'D', 81: 'G', 82: 'Y', 83: 'S', 84: 'V', 85: 'D', 86: 'A', 87: 'N', 88: 'R', 89: 'I', 90: 'H', 91: 'A', 92: 'V', 93: 'R', 94: 'E', 95: 'G', 96: 'A', 97: 'P', 98: 'K', 99: 'D', 100: 'S', 101: 'T', 102: 'S', 103: 'P', 104: 'F', 105: 'D', 106: 'V', 107: 'L', 108: 'D', 109: 'I', 110: 'S', 111: 'G', 112: 'V', 113: 'Q', 114: 'M', 115: 'L', 116: 'K', 117: 'W', 118: 'E', 119: 'N', 120: 'G', 121: 'K', 122: 'V', 123: 'V', 124: 'E', 125: 'G', 126: 'Y', 127: 'G', 128: 'G', 129: 'I', 130: 'F', 131: 'G', 132: 'D', 133: 'G', 134: 'G', 135: 'T', 136: 'N', 137: 'Y', 138: 'T', 139: 'Q', 140: 'W', 141: 'W', 142: 'S', 143: 'P', 144: 'V', 145: 'D', 146: 'G', 147: 'A', 148: 'G', 149: 'E', 150: 'R', 151: 'R', 152: 'Y', 153: 'Q', 154: 'L', 155: 'A', 156: 'A', 157: 'A', 158: 'L', 159: 'E'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6A5G_B.pdb ! residue not defined for rnum = 2
 159
 (159, 159)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.061007
5YVQ_A
running..
 Extract distance maps..
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{138: 'K', 139: 'A', 140: 'V', 141: 'K', 142: 'I', 143: 'A', 144: 'M', 145: 'D', 146: 'N', 147: 'A', 148: 'N', 149: 'A', 150: 'R', 151: 'L', 152: 'A', 153: 'K', 154: 'D', 155: 'R', 156: 'N', 157: 'G', 158: 'A', 159: 'D', 160: 'I', 161: 'P', 162: 'N', 163: 'K', 164: 'P', 165: 'L', 166: 'F', 167: 'I', 168: 'Q', 169: 'N', 170: 'L', 171: 'G', 172: 'L', 173: 'Q', 174: 'E', 175: 'T', 176: 'V', 177: 'N', 178: 'R', 179: 'A', 180: 'R', 181: 'N', 182: 'A', 183: 'V', 184: 'Q', 185: 'K', 186: 'N', 187: 'G', 188: 'D', 189: 'T', 190: 'L', 191: 'S', 192: 'G', 193: 'G', 194: 'L', 195: 'T', 196: 'F', 197: 'E', 198: 'N', 199: 'D', 200: 'S', 201: 'I', 202: 'L', 203: 'A', 204: 'W', 205: 'I', 206: 'R', 207: 'N', 208: 'T', 209: 'D', 210: 'W', 211: 'A', 212: 'K', 213: 'I', 214: 'G', 215: 'F', 216: 'K', 217: 'N', 218: 'D', 219: 'A', 220: 'D', 221: 'S', 222: 'D', 223: 'T', 224: 'D', 225: 'S', 226: 'Y', 227: 'M', 228: 'W', 229: 'F', 230: 'E', 231: 'T', 232: 'G', 233: 'D', 234: 'N', 235: 'G', 236: 'N', 237: 'E', 238: 'Y', 239: 'F', 240: 'K', 241: 'W', 242: 'R', 243: 'S', 244: 'K', 245: 'Q', 246: 'S', 247: 'T', 248: 'T', 249: 'T', 250: 'K', 251: 'D', 252: 'L', 253: 'M', 254: 'N', 255: 'L', 256: 'K', 257: 'W', 258: 'D', 259: 'A', 260: 'L', 261: 'S', 262: 'V', 263: 'L', 264: 'V', 265: 'N', 266: 'A', 267: 'I', 268: 'V', 269: 'N', 270: 'G', 271: 'E', 272: 'V', 273: 'I', 274: 'S', 275: 'K', 276: 'S', 277: 'A', 278: 'N', 279: 'G', 280: 'L', 281: 'R', 282: 'I', 283: 'A', 284: 'Y', 285: 'G', 286: 'N', 287: 'Y', 288: 'G', 289: 'F', 290: 'F', 291: 'I', 292: 'R', 293: 'N', 294: 'D', 295: 'G', 296: 'S', 297: 'N', 298: 'T', 299: 'Y', 300: 'F', 301: 'M', 302: 'L', 303: 'T', 304: 'N', 305: 'S', 306: 'G', 307: 'D', 308: 'N', 309: 'M', 310: 'G', 311: 'T', 312: 'Y', 313: 'N', 314: 'G', 315: 'L', 316: 'R', 317: 'P', 318: 'L', 319: 'W', 320: 'I', 321: 'N', 322: 'N', 323: 'A', 324: 'T', 325: 'G', 326: 'A', 327: 'V', 328: 'S', 329: 'M', 330: 'G', 331: 'R', 332: 'G', 333: 'L', 334: 'N', 335: 'V', 336: 'S', 337: 'G', 338: 'D', 339: 'T', 340: 'L', 341: 'S', 342: 'D', 343: 'R', 344: 'F', 345: 'A', 346: 'I', 347: 'N', 348: 'S', 349: 'S', 350: 'N', 351: 'G', 352: 'M', 353: 'W', 354: 'I', 355: 'Q', 356: 'M', 357: 'R', 358: 'D', 359: 'N', 360: 'N', 361: 'A', 362: 'I', 363: 'F', 364: 'G', 365: 'K', 366: 'N', 367: 'I', 368: 'V', 369: 'N', 370: 'T', 371: 'D', 372: 'S', 373: 'A', 374: 'Q', 375: 'A', 376: 'L', 377: 'L', 378: 'R', 379: 'Q', 380: 'N', 381: 'H', 382: 'A', 383: 'D', 384: 'R', 385: 'K', 386: 'F', 387: 'M', 388: 'I', 389: 'G', 390: 'G', 391: 'L', 392: 'G', 393: 'N', 394: 'K', 395: 'Q', 396: 'F', 397: 'G', 398: 'I', 399: 'Y', 400: 'M', 401: 'I', 402: 'N', 403: 'N', 404: 'S', 405: 'R', 406: 'T', 407: 'A', 408: 'N', 409: 'G', 410: 'T', 411: 'D', 412: 'G', 413: 'Q', 414: 'A', 415: 'Y', 416: 'M', 417: 'D', 418: 'N', 419: 'N', 420: 'G', 421: 'N', 422: 'W', 423: 'L', 424: 'C', 425: 'G', 426: 'A', 427: 'Q', 428: 'V', 429: 'I', 430: 'P', 431: 'G', 432: 'N', 433: 'Y', 434: 'A', 435: 'N', 436: 'F', 437: 'D', 438: 'S', 439: 'R', 440: 'Y', 441: 'V', 442: 'R', 443: 'D', 444: 'V', 445: 'R', 446: 'L', 447: 'G', 448: 'T', 449: 'Q', 450: 'S', 451: 'L', 452: 'T', 453: 'G', 454: 'G', 455: 'L', 456: 'S', 457: 'R', 458: 'D', 459: 'Y', 460: 'K', 461: 'A', 462: 'P', 463: 'S', 464: 'G', 465: 'H', 466: 'V', 467: 'I', 468: 'T', 469: 'G', 470: 'F', 471: 'H', 472: 'T', 482: 'D', 483: 'D', 484: 'K', 485: 'V', 486: 'Y', 487: 'I', 488: 'R', 489: 'P', 490: 'V', 491: 'Q', 492: 'K', 493: 'N', 494: 'I', 495: 'N', 496: 'G', 497: 'T', 498: 'W', 499: 'Y', 500: 'N', 501: 'V', 502: 'A', 503: 'S', 504: 'A'}
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 504
 (504, 504)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.263473
6H6N_B
running..
 Extract distance maps..
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{12: 'M', 13: 'P', 14: 'F', 15: 'K', 16: 'P', 17: 'L', 18: 'V', 19: 'T', 20: 'A', 21: 'G', 22: 'I', 23: 'E', 24: 'S', 25: 'L', 26: 'L', 27: 'N', 28: 'T', 29: 'F', 30: 'L', 31: 'Y', 32: 'R', 33: 'S', 34: 'P', 35: 'A', 36: 'L', 37: 'K', 38: 'T', 39: 'A', 40: 'R', 41: 'S', 42: 'R', 43: 'L', 44: 'L', 45: 'G', 46: 'K', 47: 'V', 48: 'L', 49: 'R', 50: 'V', 51: 'E', 52: 'V', 53: 'K', 54: 'G', 55: 'F', 56: 'S', 57: 'T', 58: 'S', 59: 'L', 60: 'I', 61: 'L', 62: 'V', 63: 'F', 64: 'S', 65: 'E', 66: 'R', 67: 'Q', 68: 'V', 69: 'D', 70: 'V', 71: 'L', 72: 'G', 73: 'E', 74: 'W', 75: 'A', 76: 'G', 77: 'D', 78: 'A', 79: 'D', 80: 'C', 81: 'T', 82: 'V', 83: 'I', 84: 'A', 85: 'Y', 86: 'A', 87: 'S', 88: 'V', 89: 'L', 90: 'P', 91: 'K', 92: 'L', 93: 'R', 94: 'D', 95: 'R', 96: 'Q', 97: 'Q', 98: 'L', 99: 'T', 100: 'A', 101: 'L', 102: 'I', 103: 'R', 104: 'S', 105: 'G', 106: 'E', 107: 'L', 108: 'E', 109: 'V', 110: 'Q', 111: 'G', 112: 'D', 113: 'I', 114: 'Q', 115: 'V', 116: 'V', 117: 'Q', 118: 'N', 119: 'F', 120: 'V', 121: 'A', 122: 'L', 123: 'A', 124: 'D', 125: 'L', 126: 'A', 127: 'E', 128: 'F', 129: 'D'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6H6N_B.pdb ! residue not defined for rnum = 11
 129
 (129, 129)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
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6E3C_C
running..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6E3C_C.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{4: 'M', 5: 'A', 6: 'N', 7: 'P', 8: 'N', 9: 'F', 10: 'T', 11: 'P', 12: 'S', 13: 'W', 14: 'P', 15: 'L', 16: 'Y', 17: 'K', 18: 'D', 19: 'A', 20: 'D', 21: 'G', 22: 'V', 23: 'Y', 24: 'V', 25: 'S', 26: 'A', 27: 'L', 28: 'P', 29: 'I', 30: 'K', 31: 'A', 32: 'I', 33: 'K', 34: 'Y', 35: 'A', 36: 'N', 37: 'D', 38: 'G', 39: 'S', 40: 'A', 41: 'N', 42: 'A', 43: 'E', 44: 'F', 45: 'D', 46: 'G', 47: 'P', 48: 'Y', 49: 'A', 50: 'D', 51: 'Q', 52: 'Y', 53: 'M', 54: 'S', 55: 'A', 56: 'Q', 57: 'T', 58: 'V', 59: 'A', 60: 'V', 61: 'F', 62: 'K', 63: 'P', 64: 'E', 65: 'V', 66: 'G', 67: 'G', 68: 'Y', 69: 'L', 70: 'F', 71: 'R', 72: 'S', 73: 'Q', 74: 'Y', 75: 'G', 76: 'E', 77: 'L', 78: 'L', 79: 'Y', 80: 'M', 81: 'S', 82: 'K', 83: 'T', 84: 'A', 85: 'F', 86: 'E', 87: 'A', 88: 'N', 89: 'Y', 90: 'T', 91: 'S', 92: 'A', 93: 'S', 94: 'G', 95: 'S', 96: 'V', 97: 'A', 98: 'N', 99: 'A', 100: 'E', 101: 'T', 102: 'A', 103: 'D', 104: 'K', 105: 'L', 106: 'S', 107: 'T', 108: 'A', 109: 'R', 110: 'T', 111: 'I', 112: 'T', 113: 'L', 114: 'T', 115: 'G', 116: 'A', 117: 'V', 118: 'T', 119: 'G', 120: 'S', 121: 'A', 122: 'S', 123: 'F', 124: 'D', 125: 'G', 126: 'S', 127: 'A', 128: 'N', 129: 'V', 130: 'T', 131: 'I', 132: 'E', 133: 'T', 134: 'T', 135: 'S', 136: 'G', 137: 'S'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6E3C_C.pdb ! residue not defined for rnum = 2
{4: 'M', 5: 'A', 6: 'N', 7: 'P', 8: 'N', 9: 'F', 10: 'T', 11: 'P', 12: 'S', 13: 'W', 14: 'P', 15: 'L', 16: 'Y', 17: 'K', 18: 'D', 19: 'A', 20: 'D', 21: 'G', 22: 'V', 23: 'Y', 24: 'V', 25: 'S', 26: 'A', 27: 'L', 28: 'P', 29: 'I', 30: 'K', 31: 'A', 32: 'I', 33: 'K', 34: 'Y', 35: 'A', 36: 'N', 37: 'D', 38: 'G', 39: 'S', 40: 'A', 41: 'N', 42: 'A', 43: 'E', 44: 'F', 45: 'D', 46: 'G', 47: 'P', 48: 'Y', 49: 'A', 50: 'D', 51: 'Q', 52: 'Y', 53: 'M', 54: 'S', 55: 'A', 56: 'Q', 57: 'T', 58: 'V', 59: 'A', 60: 'V', 61: 'F', 62: 'K', 63: 'P', 64: 'E', 65: 'V', 66: 'G', 67: 'G', 68: 'Y', 69: 'L', 70: 'F', 71: 'R', 72: 'S', 73: 'Q', 74: 'Y', 75: 'G', 76: 'E', 77: 'L', 78: 'L', 79: 'Y', 80: 'M', 81: 'S', 82: 'K', 83: 'T', 84: 'A', 85: 'F', 86: 'E', 87: 'A', 88: 'N', 89: 'Y', 90: 'T', 91: 'S', 92: 'A', 93: 'S', 94: 'G', 95: 'S', 96: 'V', 97: 'A', 98: 'N', 99: 'A', 100: 'E', 101: 'T', 102: 'A', 103: 'D', 104: 'K', 105: 'L', 106: 'S', 107: 'T', 108: 'A', 109: 'R', 110: 'T', 111: 'I', 112: 'T', 113: 'L', 114: 'T', 115: 'G', 116: 'A', 117: 'V', 118: 'T', 119: 'G', 120: 'S', 121: 'A', 122: 'S', 123: 'F', 124: 'D', 125: 'G', 126: 'S', 127: 'A', 128: 'N', 129: 'V', 130: 'T', 131: 'I', 132: 'E', 133: 'T', 134: 'T', 135: 'S', 136: 'G', 137: 'S'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6E3C_C.pdb ! residue not defined for rnum = 3
 137
 (137, 137)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.043050
6IAI_D
running..
 Extract distance maps..
{8: 'H', 9: 'H', 10: 'H', 11: 'S', 12: 'S', 13: 'G', 14: 'L', 15: 'V', 16: 'P', 17: 'R', 18: 'G', 19: 'S', 20: 'H', 21: 'M', 22: 'F', 23: 'L', 24: 'T', 25: 'F', 26: 'P', 27: 'N', 28: 'V', 29: 'A', 30: 'I', 31: 'T', 32: 'R', 33: 'D', 34: 'N', 35: 'R', 36: 'I', 37: 'D', 38: 'K', 39: 'L', 40: 'S', 41: 'E', 42: 'N', 43: 'D', 44: 'L', 45: 'E', 46: 'L', 47: 'I', 48: 'R', 49: 'D', 50: 'T', 51: 'A', 52: 'I', 53: 'Q', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'G', 57: 'R', 58: 'K', 59: 'I', 60: 'Q', 61: 'V', 62: 'Q', 63: 'L', 64: 'R', 65: 'D', 66: 'L', 67: 'L', 68: 'Y', 69: 'E', 70: 'V', 71: 'S', 72: 'N', 73: 'R', 74: 'A', 75: 'V', 76: 'E', 77: 'G', 78: 'D', 79: 'N', 80: 'N', 81: 'T', 82: 'F', 83: 'K', 84: 'V', 85: 'S', 86: 'F', 87: 'S', 88: 'T', 89: 'T', 90: 'D', 91: 'R', 92: 'A', 93: 'M', 94: 'F', 95: 'R', 97: 'R', 98: 'H', 99: 'I', 100: 'E', 101: 'W', 102: 'Q', 103: 'G', 104: 'N', 105: 'A', 106: 'I', 107: 'R', 108: 'L', 109: 'E', 110: 'R', 111: 'Q', 112: 'L', 113: 'N', 114: 'T'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6IAI_D.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{8: 'H', 9: 'H', 10: 'H', 11: 'S', 12: 'S', 13: 'G', 14: 'L', 15: 'V', 16: 'P', 17: 'R', 18: 'G', 19: 'S', 20: 'H', 21: 'M', 22: 'F', 23: 'L', 24: 'T', 25: 'F', 26: 'P', 27: 'N', 28: 'V', 29: 'A', 30: 'I', 31: 'T', 32: 'R', 33: 'D', 34: 'N', 35: 'R', 36: 'I', 37: 'D', 38: 'K', 39: 'L', 40: 'S', 41: 'E', 42: 'N', 43: 'D', 44: 'L', 45: 'E', 46: 'L', 47: 'I', 48: 'R', 49: 'D', 50: 'T', 51: 'A', 52: 'I', 53: 'Q', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'G', 57: 'R', 58: 'K', 59: 'I', 60: 'Q', 61: 'V', 62: 'Q', 63: 'L', 64: 'R', 65: 'D', 66: 'L', 67: 'L', 68: 'Y', 69: 'E', 70: 'V', 71: 'S', 72: 'N', 73: 'R', 74: 'A', 75: 'V', 76: 'E', 77: 'G', 78: 'D', 79: 'N', 80: 'N', 81: 'T', 82: 'F', 83: 'K', 84: 'V', 85: 'S', 86: 'F', 87: 'S', 88: 'T', 89: 'T', 90: 'D', 91: 'R', 92: 'A', 93: 'M', 94: 'F', 95: 'R', 97: 'R', 98: 'H', 99: 'I', 100: 'E', 101: 'W', 102: 'Q', 103: 'G', 104: 'N', 105: 'A', 106: 'I', 107: 'R', 108: 'L', 109: 'E', 110: 'R', 111: 'Q', 112: 'L', 113: 'N', 114: 'T'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6IAI_D.pdb ! residue not defined for rnum = 2
{8: 'H', 9: 'H', 10: 'H', 11: 'S', 12: 'S', 13: 'G', 14: 'L', 15: 'V', 16: 'P', 17: 'R', 18: 'G', 19: 'S', 20: 'H', 21: 'M', 22: 'F', 23: 'L', 24: 'T', 25: 'F', 26: 'P', 27: 'N', 28: 'V', 29: 'A', 30: 'I', 31: 'T', 32: 'R', 33: 'D', 34: 'N', 35: 'R', 36: 'I', 37: 'D', 38: 'K', 39: 'L', 40: 'S', 41: 'E', 42: 'N', 43: 'D', 44: 'L', 45: 'E', 46: 'L', 47: 'I', 48: 'R', 49: 'D', 50: 'T', 51: 'A', 52: 'I', 53: 'Q', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'G', 57: 'R', 58: 'K', 59: 'I', 60: 'Q', 61: 'V', 62: 'Q', 63: 'L', 64: 'R', 65: 'D', 66: 'L', 67: 'L', 68: 'Y', 69: 'E', 70: 'V', 71: 'S', 72: 'N', 73: 'R', 74: 'A', 75: 'V', 76: 'E', 77: 'G', 78: 'D', 79: 'N', 80: 'N', 81: 'T', 82: 'F', 83: 'K', 84: 'V', 85: 'S', 86: 'F', 87: 'S', 88: 'T', 89: 'T', 90: 'D', 91: 'R', 92: 'A', 93: 'M', 94: 'F', 95: 'R', 97: 'R', 98: 'H', 99: 'I', 100: 'E', 101: 'W', 102: 'Q', 103: 'G', 104: 'N', 105: 'A', 106: 'I', 107: 'R', 108: 'L', 109: 'E', 110: 'R', 111: 'Q', 112: 'L', 113: 'N', 114: 'T'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6IAI_D.pdb ! residue not defined for rnum = 3
{8: 'H', 9: 'H', 10: 'H', 11: 'S', 12: 'S', 13: 'G', 14: 'L', 15: 'V', 16: 'P', 17: 'R', 18: 'G', 19: 'S', 20: 'H', 21: 'M', 22: 'F', 23: 'L', 24: 'T', 25: 'F', 26: 'P', 27: 'N', 28: 'V', 29: 'A', 30: 'I', 31: 'T', 32: 'R', 33: 'D', 34: 'N', 35: 'R', 36: 'I', 37: 'D', 38: 'K', 39: 'L', 40: 'S', 41: 'E', 42: 'N', 43: 'D', 44: 'L', 45: 'E', 46: 'L', 47: 'I', 48: 'R', 49: 'D', 50: 'T', 51: 'A', 52: 'I', 53: 'Q', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'G', 57: 'R', 58: 'K', 59: 'I', 60: 'Q', 61: 'V', 62: 'Q', 63: 'L', 64: 'R', 65: 'D', 66: 'L', 67: 'L', 68: 'Y', 69: 'E', 70: 'V', 71: 'S', 72: 'N', 73: 'R', 74: 'A', 75: 'V', 76: 'E', 77: 'G', 78: 'D', 79: 'N', 80: 'N', 81: 'T', 82: 'F', 83: 'K', 84: 'V', 85: 'S', 86: 'F', 87: 'S', 88: 'T', 89: 'T', 90: 'D', 91: 'R', 92: 'A', 93: 'M', 94: 'F', 95: 'R', 97: 'R', 98: 'H', 99: 'I', 100: 'E', 101: 'W', 102: 'Q', 103: 'G', 104: 'N', 105: 'A', 106: 'I', 107: 'R', 108: 'L', 109: 'E', 110: 'R', 111: 'Q', 112: 'L', 113: 'N', 114: 'T'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6IAI_D.pdb ! residue not defined for rnum = 4
{8: 'H', 9: 'H', 10: 'H', 11: 'S', 12: 'S', 13: 'G', 14: 'L', 15: 'V', 16: 'P', 17: 'R', 18: 'G', 19: 'S', 20: 'H', 21: 'M', 22: 'F', 23: 'L', 24: 'T', 25: 'F', 26: 'P', 27: 'N', 28: 'V', 29: 'A', 30: 'I', 31: 'T', 32: 'R', 33: 'D', 34: 'N', 35: 'R', 36: 'I', 37: 'D', 38: 'K', 39: 'L', 40: 'S', 41: 'E', 42: 'N', 43: 'D', 44: 'L', 45: 'E', 46: 'L', 47: 'I', 48: 'R', 49: 'D', 50: 'T', 51: 'A', 52: 'I', 53: 'Q', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'G', 57: 'R', 58: 'K', 59: 'I', 60: 'Q', 61: 'V', 62: 'Q', 63: 'L', 64: 'R', 65: 'D', 66: 'L', 67: 'L', 68: 'Y', 69: 'E', 70: 'V', 71: 'S', 72: 'N', 73: 'R', 74: 'A', 75: 'V', 76: 'E', 77: 'G', 78: 'D', 79: 'N', 80: 'N', 81: 'T', 82: 'F', 83: 'K', 84: 'V', 85: 'S', 86: 'F', 87: 'S', 88: 'T', 89: 'T', 90: 'D', 91: 'R', 92: 'A', 93: 'M', 94: 'F', 95: 'R', 97: 'R', 98: 'H', 99: 'I', 100: 'E', 101: 'W', 102: 'Q', 103: 'G', 104: 'N', 105: 'A', 106: 'I', 107: 'R', 108: 'L', 109: 'E', 110: 'R', 111: 'Q', 112: 'L', 113: 'N', 114: 'T'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6IAI_D.pdb ! residue not defined for rnum = 5
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6IAI_D.pdb ! residue not defined for rnum = 6
{8: 'H', 9: 'H', 10: 'H', 11: 'S', 12: 'S', 13: 'G', 14: 'L', 15: 'V', 16: 'P', 17: 'R', 18: 'G', 19: 'S', 20: 'H', 21: 'M', 22: 'F', 23: 'L', 24: 'T', 25: 'F', 26: 'P', 27: 'N', 28: 'V', 29: 'A', 30: 'I', 31: 'T', 32: 'R', 33: 'D', 34: 'N', 35: 'R', 36: 'I', 37: 'D', 38: 'K', 39: 'L', 40: 'S', 41: 'E', 42: 'N', 43: 'D', 44: 'L', 45: 'E', 46: 'L', 47: 'I', 48: 'R', 49: 'D', 50: 'T', 51: 'A', 52: 'I', 53: 'Q', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'G', 57: 'R', 58: 'K', 59: 'I', 60: 'Q', 61: 'V', 62: 'Q', 63: 'L', 64: 'R', 65: 'D', 66: 'L', 67: 'L', 68: 'Y', 69: 'E', 70: 'V', 71: 'S', 72: 'N', 73: 'R', 74: 'A', 75: 'V', 76: 'E', 77: 'G', 78: 'D', 79: 'N', 80: 'N', 81: 'T', 82: 'F', 83: 'K', 84: 'V', 85: 'S', 86: 'F', 87: 'S', 88: 'T', 89: 'T', 90: 'D', 91: 'R', 92: 'A', 93: 'M', 94: 'F', 95: 'R', 97: 'R', 98: 'H', 99: 'I', 100: 'E', 101: 'W', 102: 'Q', 103: 'G', 104: 'N', 105: 'A', 106: 'I', 107: 'R', 108: 'L', 109: 'E', 110: 'R', 111: 'Q', 112: 'L', 113: 'N', 114: 'T'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6IAI_D.pdb ! residue not defined for rnum = 7
{8: 'H', 9: 'H', 10: 'H', 11: 'S', 12: 'S', 13: 'G', 14: 'L', 15: 'V', 16: 'P', 17: 'R', 18: 'G', 19: 'S', 20: 'H', 21: 'M', 22: 'F', 23: 'L', 24: 'T', 25: 'F', 26: 'P', 27: 'N', 28: 'V', 29: 'A', 30: 'I', 31: 'T', 32: 'R', 33: 'D', 34: 'N', 35: 'R', 36: 'I', 37: 'D', 38: 'K', 39: 'L', 40: 'S', 41: 'E', 42: 'N', 43: 'D', 44: 'L', 45: 'E', 46: 'L', 47: 'I', 48: 'R', 49: 'D', 50: 'T', 51: 'A', 52: 'I', 53: 'Q', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'G', 57: 'R', 58: 'K', 59: 'I', 60: 'Q', 61: 'V', 62: 'Q', 63: 'L', 64: 'R', 65: 'D', 66: 'L', 67: 'L', 68: 'Y', 69: 'E', 70: 'V', 71: 'S', 72: 'N', 73: 'R', 74: 'A', 75: 'V', 76: 'E', 77: 'G', 78: 'D', 79: 'N', 80: 'N', 81: 'T', 82: 'F', 83: 'K', 84: 'V', 85: 'S', 86: 'F', 87: 'S', 88: 'T', 89: 'T', 90: 'D', 91: 'R', 92: 'A', 93: 'M', 94: 'F', 95: 'R', 97: 'R', 98: 'H', 99: 'I', 100: 'E', 101: 'W', 102: 'Q', 103: 'G', 104: 'N', 105: 'A', 106: 'I', 107: 'R', 108: 'L', 109: 'E', 110: 'R', 111: 'Q', 112: 'L', 113: 'N', 114: 'T'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6IAI_D.pdb ! residue not defined for rnum = 96
 114
 (114, 114)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.031315
5ZKE_A
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZKE_A.pdb ! residue not defined for rnum = 1
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZKE_A.pdb ! residue not defined for rnum = 2
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZKE_A.pdb ! residue not defined for rnum = 3
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5ZKE_A.pdb ! residue not defined for rnum = 4
 178
 (178, 178)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.065350
6CP8_D
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CP8_D.pdb ! residue not defined for rnum = 1
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CP8_D.pdb ! residue not defined for rnum = 4
{8: 'N', 9: 'S', 10: 'T', 11: 'A', 12: 'K', 13: 'D', 14: 'I', 15: 'E', 16: 'G', 17: 'L', 18: 'E', 19: 'S', 20: 'Y', 21: 'L', 22: 'A', 23: 'N', 24: 'G', 25: 'Y', 26: 'V', 27: 'E', 28: 'A', 29: 'N', 30: 'S', 31: 'F', 32: 'N', 33: 'D', 34: 'P', 35: 'E', 36: 'D', 37: 'D', 38: 'A', 39: 'L', 40: 'E', 41: 'C', 42: 'L', 43: 'S', 44: 'N', 45: 'L', 46: 'L', 47: 'V', 48: 'K', 49: 'D', 50: 'S', 51: 'R', 52: 'G', 53: 'G', 54: 'L', 55: 'S', 56: 'F', 57: 'C', 58: 'K', 59: 'K', 60: 'I', 61: 'L', 62: 'N', 63: 'S', 64: 'N', 65: 'N', 66: 'I', 67: 'D', 68: 'G', 69: 'V', 70: 'F', 71: 'I', 72: 'K', 73: 'G', 74: 'S', 75: 'A', 76: 'L', 77: 'N', 78: 'F', 79: 'L', 80: 'L', 81: 'L', 82: 'S', 83: 'E', 84: 'Q', 85: 'W', 86: 'S', 87: 'Y', 88: 'A', 89: 'F', 90: 'E', 91: 'Y', 92: 'L', 93: 'T', 94: 'S', 95: 'N', 96: 'A', 97: 'D', 98: 'N', 99: 'I', 100: 'T', 101: 'L', 102: 'A', 103: 'E', 104: 'L', 105: 'E', 106: 'K', 107: 'A', 108: 'L', 109: 'F', 110: 'Y', 111: 'F', 112: 'Y', 113: 'C', 114: 'A', 115: 'K', 116: 'N', 117: 'E', 118: 'T', 119: 'D', 120: 'P', 121: 'Y', 122: 'P', 123: 'V', 124: 'P', 125: 'E', 126: 'G', 127: 'L', 128: 'F', 129: 'K', 130: 'K', 131: 'L', 132: 'M', 133: 'K', 134: 'R', 135: 'Y', 136: 'E', 137: 'E', 138: 'L', 139: 'K', 140: 'N', 141: 'D', 142: 'P', 143: 'D', 144: 'A', 145: 'K', 146: 'F', 147: 'Y', 148: 'H', 149: 'L', 150: 'H', 151: 'E', 152: 'T', 153: 'Y', 154: 'D', 155: 'D', 156: 'F', 157: 'S', 158: 'K', 159: 'A', 160: 'Y', 161: 'P', 162: 'L', 163: 'N', 164: 'N'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CP8_D.pdb ! residue not defined for rnum = 5
{8: 'N', 9: 'S', 10: 'T', 11: 'A', 12: 'K', 13: 'D', 14: 'I', 15: 'E', 16: 'G', 17: 'L', 18: 'E', 19: 'S', 20: 'Y', 21: 'L', 22: 'A', 23: 'N', 24: 'G', 25: 'Y', 26: 'V', 27: 'E', 28: 'A', 29: 'N', 30: 'S', 31: 'F', 32: 'N', 33: 'D', 34: 'P', 35: 'E', 36: 'D', 37: 'D', 38: 'A', 39: 'L', 40: 'E', 41: 'C', 42: 'L', 43: 'S', 44: 'N', 45: 'L', 46: 'L', 47: 'V', 48: 'K', 49: 'D', 50: 'S', 51: 'R', 52: 'G', 53: 'G', 54: 'L', 55: 'S', 56: 'F', 57: 'C', 58: 'K', 59: 'K', 60: 'I', 61: 'L', 62: 'N', 63: 'S', 64: 'N', 65: 'N', 66: 'I', 67: 'D', 68: 'G', 69: 'V', 70: 'F', 71: 'I', 72: 'K', 73: 'G', 74: 'S', 75: 'A', 76: 'L', 77: 'N', 78: 'F', 79: 'L', 80: 'L', 81: 'L', 82: 'S', 83: 'E', 84: 'Q', 85: 'W', 86: 'S', 87: 'Y', 88: 'A', 89: 'F', 90: 'E', 91: 'Y', 92: 'L', 93: 'T', 94: 'S', 95: 'N', 96: 'A', 97: 'D', 98: 'N', 99: 'I', 100: 'T', 101: 'L', 102: 'A', 103: 'E', 104: 'L', 105: 'E', 106: 'K', 107: 'A', 108: 'L', 109: 'F', 110: 'Y', 111: 'F', 112: 'Y', 113: 'C', 114: 'A', 115: 'K', 116: 'N', 117: 'E', 118: 'T', 119: 'D', 120: 'P', 121: 'Y', 122: 'P', 123: 'V', 124: 'P', 125: 'E', 126: 'G', 127: 'L', 128: 'F', 129: 'K', 130: 'K', 131: 'L', 132: 'M', 133: 'K', 134: 'R', 135: 'Y', 136: 'E', 137: 'E', 138: 'L', 139: 'K', 140: 'N', 141: 'D', 142: 'P', 143: 'D', 144: 'A', 145: 'K', 146: 'F', 147: 'Y', 148: 'H', 149: 'L', 150: 'H', 151: 'E', 152: 'T', 153: 'Y', 154: 'D', 155: 'D', 156: 'F', 157: 'S', 158: 'K', 159: 'A', 160: 'Y', 161: 'P', 162: 'L', 163: 'N', 164: 'N'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CP8_D.pdb ! residue not defined for rnum = 6
{8: 'N', 9: 'S', 10: 'T', 11: 'A', 12: 'K', 13: 'D', 14: 'I', 15: 'E', 16: 'G', 17: 'L', 18: 'E', 19: 'S', 20: 'Y', 21: 'L', 22: 'A', 23: 'N', 24: 'G', 25: 'Y', 26: 'V', 27: 'E', 28: 'A', 29: 'N', 30: 'S', 31: 'F', 32: 'N', 33: 'D', 34: 'P', 35: 'E', 36: 'D', 37: 'D', 38: 'A', 39: 'L', 40: 'E', 41: 'C', 42: 'L', 43: 'S', 44: 'N', 45: 'L', 46: 'L', 47: 'V', 48: 'K', 49: 'D', 50: 'S', 51: 'R', 52: 'G', 53: 'G', 54: 'L', 55: 'S', 56: 'F', 57: 'C', 58: 'K', 59: 'K', 60: 'I', 61: 'L', 62: 'N', 63: 'S', 64: 'N', 65: 'N', 66: 'I', 67: 'D', 68: 'G', 69: 'V', 70: 'F', 71: 'I', 72: 'K', 73: 'G', 74: 'S', 75: 'A', 76: 'L', 77: 'N', 78: 'F', 79: 'L', 80: 'L', 81: 'L', 82: 'S', 83: 'E', 84: 'Q', 85: 'W', 86: 'S', 87: 'Y', 88: 'A', 89: 'F', 90: 'E', 91: 'Y', 92: 'L', 93: 'T', 94: 'S', 95: 'N', 96: 'A', 97: 'D', 98: 'N', 99: 'I', 100: 'T', 101: 'L', 102: 'A', 103: 'E', 104: 'L', 105: 'E', 106: 'K', 107: 'A', 108: 'L', 109: 'F', 110: 'Y', 111: 'F', 112: 'Y', 113: 'C', 114: 'A', 115: 'K', 116: 'N', 117: 'E', 118: 'T', 119: 'D', 120: 'P', 121: 'Y', 122: 'P', 123: 'V', 124: 'P', 125: 'E', 126: 'G', 127: 'L', 128: 'F', 129: 'K', 130: 'K', 131: 'L', 132: 'M', 133: 'K', 134: 'R', 135: 'Y', 136: 'E', 137: 'E', 138: 'L', 139: 'K', 140: 'N', 141: 'D', 142: 'P', 143: 'D', 144: 'A', 145: 'K', 146: 'F', 147: 'Y', 148: 'H', 149: 'L', 150: 'H', 151: 'E', 152: 'T', 153: 'Y', 154: 'D', 155: 'D', 156: 'F', 157: 'S', 158: 'K', 159: 'A', 160: 'Y', 161: 'P', 162: 'L', 163: 'N', 164: 'N'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CP8_D.pdb ! residue not defined for rnum = 7
 164
 (164, 164)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.054832
6D0I_C
running..
 Extract distance maps..
 159
 (159, 159)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.054476
6CCI_A
running..
 Extract distance maps..
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{133: 'V', 134: 'E', 135: 'L', 136: 'P', 137: 'P', 138: 'E', 139: 'E', 140: 'C', 141: 'D', 142: 'L', 143: 'F', 144: 'T', 145: 'G', 146: 'E', 147: 'W', 148: 'V', 149: 'F', 150: 'D', 151: 'N', 152: 'E', 153: 'T', 154: 'H', 155: 'P', 156: 'L', 157: 'Y', 158: 'K', 159: 'E', 160: 'D', 161: 'Q', 162: 'C', 163: 'E', 164: 'F', 165: 'L', 166: 'T', 167: 'A', 168: 'Q', 169: 'V', 170: 'T', 171: 'C', 172: 'M', 173: 'R', 174: 'N', 175: 'G', 176: 'R', 177: 'R', 178: 'D', 179: 'S', 180: 'L', 181: 'Y', 182: 'Q', 183: 'N', 184: 'W', 185: 'R', 186: 'W', 187: 'Q', 188: 'P', 189: 'R', 190: 'D', 191: 'C', 192: 'S', 193: 'L', 194: 'P', 195: 'K', 196: 'F', 197: 'K', 198: 'A', 199: 'K', 200: 'L', 201: 'L', 202: 'L', 203: 'E', 204: 'K', 205: 'L', 206: 'R', 207: 'N', 208: 'K', 209: 'R', 210: 'M', 211: 'M', 212: 'F', 213: 'V', 214: 'G', 215: 'D', 216: 'S', 217: 'L', 218: 'N', 219: 'R', 220: 'N', 221: 'Q', 222: 'W', 223: 'E', 224: 'S', 225: 'M', 226: 'V', 227: 'C', 228: 'L', 229: 'V', 230: 'Q', 231: 'S', 232: 'V', 233: 'V', 234: 'P', 235: 'P', 236: 'G', 237: 'R', 238: 'K', 239: 'S', 240: 'L', 241: 'N', 242: 'K', 243: 'T', 244: 'G', 245: 'S', 246: 'L', 247: 'S', 248: 'V', 249: 'F', 250: 'R', 251: 'V', 252: 'E', 253: 'D', 254: 'Y', 255: 'N', 256: 'A', 257: 'T', 258: 'V', 259: 'E', 260: 'F', 261: 'Y', 262: 'W', 263: 'A', 264: 'P', 265: 'F', 266: 'L', 267: 'V', 268: 'E', 269: 'S', 270: 'N', 271: 'S', 272: 'D', 273: 'D', 274: 'P', 275: 'N', 276: 'M', 277: 'H', 278: 'S', 279: 'I', 280: 'L', 281: 'N', 282: 'R', 283: 'I', 284: 'I', 285: 'M', 286: 'P', 287: 'E', 288: 'S', 289: 'I', 290: 'E', 291: 'K', 292: 'H', 293: 'G', 294: 'V', 295: 'N', 296: 'W', 297: 'K', 298: 'G', 299: 'V', 300: 'D', 301: 'F', 302: 'L', 303: 'V', 304: 'F', 305: 'N', 306: 'T', 307: 'Y', 308: 'I', 309: 'W', 310: 'W', 311: 'M', 312: 'N', 313: 'T', 314: 'F', 315: 'A', 316: 'M', 317: 'K', 318: 'V', 319: 'L', 320: 'R', 321: 'G', 322: 'S', 323: 'F', 324: 'D', 325: 'K', 326: 'G', 327: 'D', 328: 'T', 329: 'E', 330: 'Y', 331: 'E', 332: 'E', 333: 'I', 334: 'E', 335: 'R', 336: 'P', 337: 'V', 338: 'A', 339: 'Y', 340: 'R', 341: 'R', 342: 'V', 343: 'M', 344: 'R', 345: 'T', 346: 'W', 347: 'G', 348: 'D', 349: 'W', 350: 'V', 351: 'E', 352: 'R', 353: 'N', 354: 'I', 355: 'D', 356: 'P', 357: 'L', 358: 'R', 359: 'T', 360: 'T', 361: 'V', 362: 'F', 363: 'F', 364: 'A', 365: 'S', 366: 'M', 367: 'S', 368: 'P', 369: 'L', 370: 'H', 371: 'I', 372: 'K', 373: 'S', 374: 'L', 375: 'D', 376: 'W', 377: 'E', 378: 'N', 379: 'P', 380: 'D', 381: 'G', 382: 'I', 383: 'K', 384: 'C', 385: 'A', 386: 'L', 387: 'E', 388: 'T', 389: 'T', 390: 'P', 391: 'I', 392: 'L', 393: 'N', 394: 'M', 395: 'S', 396: 'M', 397: 'P', 398: 'F', 399: 'S', 400: 'V', 401: 'G', 402: 'T', 403: 'D', 404: 'Y', 405: 'R', 406: 'L', 407: 'F', 408: 'S', 409: 'V', 410: 'A', 411: 'E', 412: 'N', 413: 'V', 414: 'T', 415: 'H', 416: 'S', 417: 'L', 418: 'N', 419: 'V', 420: 'P', 421: 'V', 422: 'Y', 423: 'F', 424: 'L', 425: 'N', 426: 'I', 427: 'T', 428: 'K', 429: 'L', 430: 'S', 431: 'E', 432: 'Y', 433: 'R', 434: 'K', 435: 'D', 436: 'A', 437: 'H', 438: 'T', 439: 'S', 440: 'V', 441: 'H', 442: 'T', 443: 'I', 444: 'R', 445: 'Q', 446: 'G', 447: 'K', 448: 'M', 449: 'L', 450: 'T', 451: 'P', 452: 'E', 453: 'Q', 454: 'Q', 455: 'A', 456: 'D', 457: 'P', 458: 'N', 459: 'T', 460: 'Y', 461: 'A', 462: 'D', 463: 'C', 464: 'I', 465: 'H', 466: 'W', 467: 'C', 468: 'L', 469: 'P', 470: 'G', 471: 'L', 472: 'P', 473: 'D', 474: 'T', 475: 'W', 476: 'N', 477: 'E', 478: 'F', 479: 'L', 480: 'Y', 481: 'T', 482: 'R', 483: 'I', 484: 'I', 485: 'S', 486: 'R'}
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 486
 (486, 486)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.254036
5XKN_F
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5XKN_F.pdb ! residue not defined for rnum = 17
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{1: 'P', 2: 'G', 3: 'S', 4: 'S', 5: 'P', 6: 'P', 7: 'T', 8: 'C', 19: 'K', 20: 'P', 21: 'V', 22: 'H', 23: 'V', 24: 'P', 25: 'I', 26: 'Q', 27: 'P', 34: 'E', 35: 'Y', 36: 'Y', 37: 'P', 38: 'E', 39: 'A', 40: 'W', 41: 'R', 42: 'C', 43: 'K', 44: 'C', 45: 'G', 46: 'N', 47: 'K', 48: 'L', 49: 'F', 50: 'M'}
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{1: 'P', 2: 'G', 3: 'S', 4: 'S', 5: 'P', 6: 'P', 7: 'T', 8: 'C', 19: 'K', 20: 'P', 21: 'V', 22: 'H', 23: 'V', 24: 'P', 25: 'I', 26: 'Q', 27: 'P', 34: 'E', 35: 'Y', 36: 'Y', 37: 'P', 38: 'E', 39: 'A', 40: 'W', 41: 'R', 42: 'C', 43: 'K', 44: 'C', 45: 'G', 46: 'N', 47: 'K', 48: 'L', 49: 'F', 50: 'M'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5XKN_F.pdb ! residue not defined for rnum = 29
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5XKN_F.pdb ! residue not defined for rnum = 30
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5XKN_F.pdb ! residue not defined for rnum = 31
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5XKN_F.pdb ! residue not defined for rnum = 32
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 50
 (50, 50)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.011974
6DLC_A
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6DLC_A.pdb ! residue not defined for rnum = 2
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6DLC_A.pdb ! residue not defined for rnum = 77
{7: 'L', 8: 'Y', 9: 'K', 10: 'L', 11: 'K', 12: 'T', 13: 'F', 14: 'L', 15: 'E', 16: 'N', 17: 'L', 18: 'R', 19: 'R', 20: 'H', 21: 'L', 22: 'D', 23: 'R', 24: 'L', 25: 'D', 26: 'K', 27: 'H', 28: 'I', 29: 'K', 30: 'Q', 31: 'L', 32: 'R', 33: 'D', 34: 'I', 35: 'L', 36: 'S', 37: 'E', 38: 'N', 39: 'P', 40: 'E', 41: 'D', 42: 'E', 43: 'R', 44: 'V', 45: 'K', 46: 'D', 47: 'A', 48: 'I', 49: 'D', 50: 'L', 51: 'S', 52: 'E', 53: 'R', 54: 'S', 55: 'V', 56: 'R', 57: 'I', 58: 'V', 59: 'K', 60: 'T', 61: 'V', 62: 'I', 63: 'K', 64: 'I', 65: 'F', 66: 'E', 67: 'D', 68: 'S', 69: 'V', 70: 'R', 71: 'K', 72: 'K', 73: 'E', 74: 'K', 75: 'R', 76: 'P', 81: 'D', 82: 'D', 83: 'K', 84: 'E', 85: 'L', 86: 'D', 87: 'K', 88: 'L', 89: 'L', 90: 'D', 91: 'T', 92: 'L', 93: 'E', 94: 'K', 95: 'I', 96: 'L', 97: 'Q', 98: 'T', 99: 'A', 100: 'T', 101: 'K', 102: 'I', 103: 'I', 104: 'D', 105: 'D', 106: 'A', 107: 'N', 108: 'K', 109: 'L', 110: 'L', 111: 'E', 112: 'Y', 113: 'L', 114: 'R', 115: 'R'}
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{7: 'L', 8: 'Y', 9: 'K', 10: 'L', 11: 'K', 12: 'T', 13: 'F', 14: 'L', 15: 'E', 16: 'N', 17: 'L', 18: 'R', 19: 'R', 20: 'H', 21: 'L', 22: 'D', 23: 'R', 24: 'L', 25: 'D', 26: 'K', 27: 'H', 28: 'I', 29: 'K', 30: 'Q', 31: 'L', 32: 'R', 33: 'D', 34: 'I', 35: 'L', 36: 'S', 37: 'E', 38: 'N', 39: 'P', 40: 'E', 41: 'D', 42: 'E', 43: 'R', 44: 'V', 45: 'K', 46: 'D', 47: 'A', 48: 'I', 49: 'D', 50: 'L', 51: 'S', 52: 'E', 53: 'R', 54: 'S', 55: 'V', 56: 'R', 57: 'I', 58: 'V', 59: 'K', 60: 'T', 61: 'V', 62: 'I', 63: 'K', 64: 'I', 65: 'F', 66: 'E', 67: 'D', 68: 'S', 69: 'V', 70: 'R', 71: 'K', 72: 'K', 73: 'E', 74: 'K', 75: 'R', 76: 'P', 81: 'D', 82: 'D', 83: 'K', 84: 'E', 85: 'L', 86: 'D', 87: 'K', 88: 'L', 89: 'L', 90: 'D', 91: 'T', 92: 'L', 93: 'E', 94: 'K', 95: 'I', 96: 'L', 97: 'Q', 98: 'T', 99: 'A', 100: 'T', 101: 'K', 102: 'I', 103: 'I', 104: 'D', 105: 'D', 106: 'A', 107: 'N', 108: 'K', 109: 'L', 110: 'L', 111: 'E', 112: 'Y', 113: 'L', 114: 'R', 115: 'R'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6DLC_A.pdb ! residue not defined for rnum = 79
{7: 'L', 8: 'Y', 9: 'K', 10: 'L', 11: 'K', 12: 'T', 13: 'F', 14: 'L', 15: 'E', 16: 'N', 17: 'L', 18: 'R', 19: 'R', 20: 'H', 21: 'L', 22: 'D', 23: 'R', 24: 'L', 25: 'D', 26: 'K', 27: 'H', 28: 'I', 29: 'K', 30: 'Q', 31: 'L', 32: 'R', 33: 'D', 34: 'I', 35: 'L', 36: 'S', 37: 'E', 38: 'N', 39: 'P', 40: 'E', 41: 'D', 42: 'E', 43: 'R', 44: 'V', 45: 'K', 46: 'D', 47: 'A', 48: 'I', 49: 'D', 50: 'L', 51: 'S', 52: 'E', 53: 'R', 54: 'S', 55: 'V', 56: 'R', 57: 'I', 58: 'V', 59: 'K', 60: 'T', 61: 'V', 62: 'I', 63: 'K', 64: 'I', 65: 'F', 66: 'E', 67: 'D', 68: 'S', 69: 'V', 70: 'R', 71: 'K', 72: 'K', 73: 'E', 74: 'K', 75: 'R', 76: 'P', 81: 'D', 82: 'D', 83: 'K', 84: 'E', 85: 'L', 86: 'D', 87: 'K', 88: 'L', 89: 'L', 90: 'D', 91: 'T', 92: 'L', 93: 'E', 94: 'K', 95: 'I', 96: 'L', 97: 'Q', 98: 'T', 99: 'A', 100: 'T', 101: 'K', 102: 'I', 103: 'I', 104: 'D', 105: 'D', 106: 'A', 107: 'N', 108: 'K', 109: 'L', 110: 'L', 111: 'E', 112: 'Y', 113: 'L', 114: 'R', 115: 'R'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6DLC_A.pdb ! residue not defined for rnum = 80
 115
 (115, 115)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.029771
6DII_L
running..
 Extract distance maps..
 616
 (616, 616)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.669039
6DAN_D
running..
 Extract distance maps..
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 329
 (329, 329)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.195758
6H2X_A
running..
 Extract distance maps..
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{3: 'D', 4: 'H', 5: 'L', 6: 'N', 7: 'L', 8: 'V', 9: 'Q', 10: 'T', 11: 'A', 12: 'L', 13: 'R', 14: 'Q', 15: 'Q', 16: 'E', 17: 'K', 18: 'I', 19: 'E', 20: 'R', 21: 'Y', 22: 'E', 23: 'A', 24: 'D', 25: 'L', 26: 'D', 27: 'E', 28: 'L', 29: 'Q', 30: 'I', 31: 'R', 32: 'L', 33: 'E', 34: 'E', 35: 'Q', 36: 'N', 37: 'E', 38: 'V', 39: 'V', 40: 'A', 41: 'E', 42: 'A', 43: 'I', 44: 'E', 45: 'R', 46: 'Q', 47: 'Q', 48: 'E', 49: 'N', 50: 'E', 51: 'A', 52: 'R', 53: 'A', 54: 'E', 55: 'A', 56: 'A', 57: 'E', 58: 'L', 59: 'E', 60: 'V', 61: 'D', 62: 'E', 63: 'L', 64: 'K', 65: 'S', 66: 'Q', 67: 'L', 68: 'A', 69: 'D', 70: 'Y', 71: 'Q', 72: 'Q', 73: 'A', 74: 'L', 75: 'D', 76: 'V', 77: 'Q', 78: 'Q', 79: 'T', 80: 'R', 81: 'A', 82: 'I', 83: 'Q', 84: 'Y', 85: 'N', 86: 'Q', 87: 'A', 88: 'I', 89: 'A', 90: 'A', 91: 'L', 92: 'N', 93: 'R', 94: 'A', 95: 'K', 96: 'E', 97: 'L', 98: 'C', 99: 'H', 100: 'L', 101: 'P', 102: 'D', 103: 'L', 104: 'T', 105: 'A', 106: 'D', 107: 'C', 108: 'A', 109: 'A', 110: 'E', 111: 'W', 112: 'L', 113: 'E', 114: 'T', 115: 'F', 116: 'Q', 117: 'A', 118: 'K', 119: 'E', 120: 'L', 121: 'E', 122: 'A', 123: 'T', 124: 'E', 125: 'K', 126: 'M', 127: 'L', 128: 'S', 129: 'L', 130: 'E', 131: 'Q', 132: 'K', 133: 'M', 134: 'S', 135: 'M', 136: 'A', 137: 'Q', 138: 'T', 139: 'A', 140: 'H', 141: 'S', 142: 'Q', 143: 'F', 144: 'E', 145: 'Q', 146: 'A', 147: 'Y', 148: 'Q', 149: 'L', 150: 'V', 151: 'V', 152: 'A', 153: 'I', 154: 'N', 155: 'G', 156: 'P', 157: 'L', 158: 'A', 159: 'R', 160: 'N', 161: 'E', 162: 'A', 163: 'W', 164: 'D', 165: 'V', 166: 'A', 167: 'R', 168: 'E', 169: 'L', 170: 'L', 171: 'R', 172: 'E', 173: 'G', 174: 'V', 175: 'D', 176: 'Q', 177: 'R', 178: 'H', 179: 'L', 180: 'A', 181: 'E', 182: 'Q', 183: 'V', 184: 'Q', 185: 'P', 186: 'L', 187: 'R', 188: 'M', 189: 'R', 190: 'L', 191: 'S', 192: 'E', 193: 'L', 194: 'E', 195: 'S', 196: 'G', 197: 'G', 198: 'S', 199: 'D', 200: 'R', 201: 'V', 202: 'D', 203: 'E', 204: 'I', 205: 'R', 206: 'E', 207: 'R', 208: 'L', 209: 'D', 210: 'E', 211: 'A', 212: 'Q', 213: 'E', 214: 'A', 215: 'A', 216: 'R', 217: 'F', 218: 'V', 219: 'Q', 220: 'Q', 221: 'F', 222: 'G', 223: 'N', 224: 'Q', 225: 'L', 226: 'A', 227: 'K', 228: 'L', 229: 'E', 230: 'P', 231: 'I', 232: 'V', 233: 'S', 234: 'V', 235: 'L', 236: 'Q', 237: 'S', 238: 'D', 239: 'P', 240: 'E', 241: 'Q', 242: 'F', 243: 'E', 244: 'Q', 245: 'L', 246: 'K', 247: 'E', 248: 'D', 249: 'Y', 250: 'A', 251: 'Y', 252: 'S', 253: 'Q', 254: 'Q', 255: 'M', 256: 'Q', 257: 'R', 258: 'D', 259: 'A', 260: 'R', 261: 'Q', 262: 'Q', 263: 'A', 264: 'F', 265: 'A', 266: 'L', 267: 'T', 268: 'E', 269: 'V', 270: 'V', 271: 'Q', 272: 'R', 273: 'R', 274: 'A', 275: 'H', 276: 'F', 277: 'S', 278: 'Y', 279: 'S', 280: 'D', 281: 'S', 282: 'A', 283: 'E', 284: 'M', 285: 'L', 286: 'S', 287: 'G', 288: 'N', 289: 'S', 290: 'D', 291: 'L', 292: 'N', 293: 'E', 294: 'K', 295: 'L', 296: 'R', 297: 'E', 298: 'R', 299: 'L', 300: 'E', 301: 'Q', 302: 'A', 303: 'E', 304: 'A', 305: 'E', 306: 'R', 307: 'T', 308: 'R', 309: 'A', 310: 'R', 311: 'E', 312: 'A', 313: 'L', 314: 'R', 315: 'G', 316: 'H', 317: 'A', 318: 'A', 319: 'Q', 320: 'L', 321: 'S', 322: 'Q', 323: 'Y', 324: 'N', 325: 'Q', 326: 'V', 327: 'L', 328: 'A', 329: 'S', 330: 'L', 331: 'K', 332: 'S', 333: 'S', 334: 'Y', 335: 'D', 336: 'T', 337: 'K', 338: 'K', 339: 'E', 340: 'L', 341: 'L', 342: 'N', 343: 'D', 344: 'L', 345: 'Q', 346: 'R', 347: 'E', 348: 'L', 349: 'Q', 350: 'D', 351: 'I', 352: 'G', 353: 'V', 354: 'R'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6H2X_A.pdb ! residue not defined for rnum = 2
 354
 (354, 354)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.227126
6A83_A
running..
 Extract distance maps..
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{38: 'A', 39: 'L', 40: 'P', 41: 'P', 42: 'L', 43: 'A', 44: 'N', 45: 'F', 46: 'K', 47: 'D', 48: 'E', 49: 'S', 50: 'G', 51: 'N', 52: 'E', 53: 'P', 54: 'R', 55: 'T', 56: 'L', 57: 'V', 58: 'L', 59: 'V', 60: 'I', 61: 'G', 62: 'E', 63: 'S', 64: 'T', 65: 'Q', 66: 'R', 67: 'G', 68: 'R', 69: 'M', 70: 'S', 71: 'L', 72: 'Y', 73: 'G', 74: 'Y', 75: 'P', 76: 'R', 77: 'E', 78: 'T', 79: 'T', 80: 'P', 81: 'E', 82: 'L', 83: 'D', 84: 'A', 85: 'L', 86: 'H', 87: 'K', 88: 'T', 89: 'D', 90: 'P', 91: 'N', 92: 'L', 93: 'T', 94: 'V', 95: 'F', 96: 'N', 97: 'N', 98: 'V', 99: 'V', 100: 'T', 101: 'S', 102: 'R', 103: 'P', 104: 'Y', 105: 'T', 106: 'I', 107: 'E', 108: 'I', 109: 'L', 110: 'Q', 111: 'Q', 112: 'A', 113: 'L', 114: 'T', 115: 'F', 116: 'A', 117: 'N', 118: 'E', 119: 'K', 120: 'N', 121: 'P', 122: 'D', 123: 'L', 124: 'Y', 125: 'L', 126: 'T', 127: 'Q', 128: 'P', 129: 'S', 130: 'L', 131: 'M', 132: 'N', 133: 'M', 134: 'M', 135: 'K', 136: 'Q', 137: 'A', 138: 'G', 139: 'Y', 140: 'K', 141: 'T', 142: 'F', 143: 'W', 144: 'I', 145: 'T', 146: 'N', 147: 'Q', 148: 'Q', 149: 'T', 150: 'M', 151: 'T', 152: 'A', 153: 'R', 154: 'N', 155: 'T', 156: 'M', 157: 'L', 158: 'T', 159: 'V', 160: 'F', 161: 'S', 162: 'R', 163: 'Q', 164: 'T', 165: 'D', 166: 'K', 167: 'Q', 168: 'Y', 169: 'Y', 170: 'M', 171: 'N', 172: 'Q', 173: 'Q', 174: 'R', 175: 'T', 176: 'Q', 177: 'S', 178: 'A', 179: 'R', 180: 'E', 181: 'Y', 182: 'D', 183: 'T', 184: 'N', 185: 'V', 186: 'L', 187: 'K', 188: 'P', 189: 'F', 190: 'Q', 191: 'E', 192: 'V', 193: 'L', 194: 'N', 195: 'D', 196: 'P', 197: 'A', 198: 'P', 199: 'K', 200: 'K', 201: 'L', 202: 'I', 203: 'I', 204: 'V', 205: 'H', 206: 'L', 207: 'L', 208: 'G', 209: 'T', 210: 'H', 211: 'I', 212: 'K', 213: 'Y', 214: 'K', 215: 'Y', 216: 'R', 217: 'Y', 218: 'P', 219: 'E', 220: 'N', 221: 'Q', 222: 'G', 223: 'K', 224: 'F', 225: 'D', 226: 'G', 227: 'N', 228: 'T', 229: 'D', 230: 'H', 231: 'V', 232: 'P', 233: 'P', 234: 'G', 235: 'L', 236: 'N', 237: 'A', 238: 'E', 239: 'E', 240: 'L', 241: 'E', 242: 'S', 243: 'Y', 244: 'N', 245: 'D', 246: 'Y', 247: 'D', 248: 'N', 249: 'A', 250: 'N', 251: 'L', 252: 'Y', 253: 'N', 254: 'D', 255: 'H', 256: 'V', 257: 'V', 258: 'A', 259: 'S', 260: 'L', 261: 'I', 262: 'K', 263: 'D', 264: 'F', 265: 'K', 266: 'A', 267: 'A', 268: 'N', 269: 'P', 270: 'N', 271: 'G', 272: 'F', 273: 'L', 274: 'V', 275: 'Y', 276: 'F', 277: 'S', 278: 'D', 279: 'H', 280: 'G', 281: 'E', 282: 'E', 283: 'V', 284: 'Y', 285: 'D', 286: 'T', 287: 'P', 288: 'P', 289: 'H', 290: 'K', 291: 'T', 292: 'Q', 293: 'G', 294: 'R', 295: 'N', 296: 'E', 297: 'D', 298: 'N', 299: 'P', 300: 'T', 301: 'R', 302: 'H', 303: 'M', 304: 'Y', 305: 'T', 306: 'I', 307: 'P', 308: 'F', 309: 'L', 310: 'L', 311: 'W', 312: 'T', 313: 'S', 314: 'E', 315: 'K', 316: 'W', 317: 'Q', 318: 'A', 319: 'T', 320: 'H', 321: 'P', 322: 'R', 323: 'D', 324: 'F', 325: 'S', 326: 'Q', 327: 'D', 328: 'V', 329: 'D', 330: 'R', 331: 'K', 332: 'Y', 333: 'S', 334: 'L', 335: 'A', 336: 'E', 337: 'L', 338: 'I', 339: 'H', 340: 'T', 341: 'W', 342: 'S', 343: 'D', 344: 'L', 345: 'A', 346: 'G', 347: 'L', 348: 'S', 349: 'Y', 350: 'D', 351: 'G', 352: 'Y', 353: 'D', 354: 'P', 355: 'T', 356: 'R', 357: 'S', 358: 'V', 359: 'V', 360: 'N', 361: 'P', 362: 'Q', 363: 'F', 364: 'K', 365: 'E', 366: 'T', 367: 'T', 368: 'R', 369: 'W', 370: 'I', 371: 'G', 372: 'N', 373: 'P', 374: 'Y', 375: 'K', 376: 'K', 377: 'N', 378: 'A', 379: 'L', 380: 'I', 381: 'D', 382: 'Y', 383: 'D', 384: 'T', 385: 'L', 386: 'P', 387: 'Y', 388: 'G', 389: 'D', 390: 'Q', 391: 'V', 392: 'G', 393: 'N', 394: 'Q'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6A83_A.pdb ! residue not defined for rnum = 37
 394
 (394, 394)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.244291
5Z3K_B
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5Z3K_B.pdb ! residue not defined for rnum = 1
 484
 (484, 484)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.427599
5WB4_H
running..
 Extract distance maps..
{2: 'E', 3: 'R', 4: 'L', 5: 'D', 6: 'I', 7: 'F', 8: 'G', 9: 'V', 10: 'P', 11: 'I', 12: 'D', 13: 'R', 14: 'V', 15: 'T', 16: 'M', 17: 'I', 18: 'Q', 19: 'A', 20: 'V', 21: 'D', 22: 'I', 23: 'L', 24: 'N', 25: 'N', 26: 'F', 27: 'L', 28: 'Q', 29: 'E', 30: 'N', 31: 'R', 32: 'L', 33: 'H', 34: 'I', 35: 'V', 36: 'A', 37: 'T', 38: 'P', 39: 'N', 40: 'A', 41: 'E', 42: 'I', 43: 'V', 44: 'M', 45: 'M', 46: 'A', 47: 'Q', 48: 'K', 49: 'D', 50: 'K', 51: 'E', 52: 'Y', 53: 'M', 54: 'E', 55: 'I', 56: 'L', 57: 'N', 58: 'N', 59: 'T', 60: 'D', 61: 'L', 62: 'N', 63: 'V', 64: 'P', 65: 'D', 66: 'G', 67: 'S', 68: 'G', 69: 'I', 70: 'V', 71: 'F', 72: 'A', 73: 'S', 74: 'K', 75: 'V', 76: 'F', 77: 'K', 78: 'K', 79: 'P', 80: 'L', 81: 'P', 82: 'E', 83: 'R', 84: 'V', 85: 'A', 86: 'G', 87: 'F', 88: 'D', 89: 'L', 90: 'M', 91: 'L', 92: 'E', 93: 'F', 94: 'I', 95: 'K', 96: 'G', 97: 'I', 98: 'S', 99: 'S', 100: 'K', 101: 'G', 102: 'V', 103: 'K', 104: 'I', 105: 'Y', 106: 'L', 107: 'L', 108: 'G', 109: 'A', 110: 'A', 111: 'A', 112: 'Q', 113: 'V', 114: 'A', 115: 'E', 116: 'Q', 117: 'A', 118: 'R', 119: 'A', 120: 'N', 121: 'L', 122: 'E', 123: 'K', 124: 'L', 125: 'Y', 126: 'P', 127: 'G', 128: 'V', 129: 'K', 130: 'I', 131: 'V', 132: 'G', 133: 'T', 134: 'H', 135: 'H', 136: 'G', 137: 'Y', 138: 'F', 139: 'T', 140: 'E', 141: 'E', 142: 'E', 143: 'E', 144: 'N', 145: 'K', 146: 'I', 147: 'I', 148: 'E', 149: 'E', 150: 'I', 151: 'N', 152: 'N', 153: 'K', 154: 'G', 155: 'A', 156: 'E', 157: 'V', 158: 'L', 159: 'F', 160: 'V', 161: 'A', 162: 'L', 163: 'G', 164: 'A', 165: 'P', 166: 'K', 167: 'Q', 168: 'E', 169: 'K', 170: 'W', 171: 'I', 172: 'Y', 173: 'K', 174: 'N', 175: 'K', 176: 'D', 177: 'K', 178: 'L', 179: 'K', 180: 'V', 181: 'K', 182: 'I', 183: 'A', 184: 'M', 185: 'G', 186: 'V', 187: 'G', 188: 'G', 189: 'S', 190: 'F', 191: 'D', 192: 'V', 193: 'I', 194: 'A'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5WB4_H.pdb ! residue not defined for rnum = 1
 194
 (194, 194)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.077912
6EGC_A
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6EGC_A.pdb ! residue not defined for rnum = 1
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6EGC_A.pdb ! residue not defined for rnum = 2
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{5: 'T', 6: 'R', 7: 'T', 8: 'E', 9: 'I', 10: 'I', 11: 'R', 12: 'E', 13: 'L', 14: 'E', 15: 'R', 16: 'S', 17: 'L', 18: 'R', 19: 'E', 20: 'Q', 21: 'E', 22: 'E', 23: 'L', 24: 'A', 25: 'K', 26: 'R', 27: 'L', 28: 'K', 29: 'E', 30: 'L', 31: 'L', 32: 'R', 33: 'E', 34: 'L', 35: 'E', 36: 'R', 37: 'L', 38: 'Q', 39: 'R', 40: 'E', 41: 'G', 42: 'S', 43: 'S', 44: 'D', 45: 'E', 46: 'D', 47: 'V', 48: 'R', 49: 'E', 50: 'L', 51: 'L', 52: 'R', 53: 'E', 54: 'I', 55: 'K', 56: 'E', 57: 'L', 58: 'V', 59: 'E', 60: 'E', 61: 'I', 62: 'E', 63: 'K', 64: 'L', 65: 'A', 66: 'R', 67: 'E', 68: 'Q', 69: 'K', 70: 'Y', 71: 'L', 72: 'V', 73: 'E', 74: 'E', 75: 'L', 76: 'K', 77: 'R', 78: 'Q', 83: 'G', 84: 'N', 85: 'E', 86: 'I', 87: 'I', 88: 'R', 89: 'E', 90: 'L', 91: 'E', 92: 'R', 93: 'S', 94: 'L', 95: 'R', 96: 'E', 97: 'Q', 98: 'E', 99: 'E', 100: 'L', 101: 'A', 102: 'K', 103: 'R', 104: 'L', 105: 'K', 106: 'E', 107: 'L', 108: 'L', 109: 'R', 110: 'E', 111: 'L', 112: 'E', 113: 'R', 114: 'L', 115: 'Q', 116: 'R', 117: 'E', 118: 'G', 119: 'S', 120: 'S', 121: 'D', 122: 'E', 123: 'D', 124: 'V', 125: 'R', 126: 'E', 127: 'L', 128: 'L', 129: 'R', 130: 'E', 131: 'I', 132: 'K', 133: 'E', 134: 'L', 135: 'V', 136: 'E', 137: 'E', 138: 'I', 139: 'E', 140: 'K', 141: 'L', 142: 'A', 143: 'R', 144: 'E', 145: 'Q', 146: 'K', 147: 'Y', 148: 'L', 149: 'V', 150: 'E', 151: 'E', 152: 'L', 153: 'K', 154: 'R', 155: 'Q'}
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{5: 'T', 6: 'R', 7: 'T', 8: 'E', 9: 'I', 10: 'I', 11: 'R', 12: 'E', 13: 'L', 14: 'E', 15: 'R', 16: 'S', 17: 'L', 18: 'R', 19: 'E', 20: 'Q', 21: 'E', 22: 'E', 23: 'L', 24: 'A', 25: 'K', 26: 'R', 27: 'L', 28: 'K', 29: 'E', 30: 'L', 31: 'L', 32: 'R', 33: 'E', 34: 'L', 35: 'E', 36: 'R', 37: 'L', 38: 'Q', 39: 'R', 40: 'E', 41: 'G', 42: 'S', 43: 'S', 44: 'D', 45: 'E', 46: 'D', 47: 'V', 48: 'R', 49: 'E', 50: 'L', 51: 'L', 52: 'R', 53: 'E', 54: 'I', 55: 'K', 56: 'E', 57: 'L', 58: 'V', 59: 'E', 60: 'E', 61: 'I', 62: 'E', 63: 'K', 64: 'L', 65: 'A', 66: 'R', 67: 'E', 68: 'Q', 69: 'K', 70: 'Y', 71: 'L', 72: 'V', 73: 'E', 74: 'E', 75: 'L', 76: 'K', 77: 'R', 78: 'Q', 83: 'G', 84: 'N', 85: 'E', 86: 'I', 87: 'I', 88: 'R', 89: 'E', 90: 'L', 91: 'E', 92: 'R', 93: 'S', 94: 'L', 95: 'R', 96: 'E', 97: 'Q', 98: 'E', 99: 'E', 100: 'L', 101: 'A', 102: 'K', 103: 'R', 104: 'L', 105: 'K', 106: 'E', 107: 'L', 108: 'L', 109: 'R', 110: 'E', 111: 'L', 112: 'E', 113: 'R', 114: 'L', 115: 'Q', 116: 'R', 117: 'E', 118: 'G', 119: 'S', 120: 'S', 121: 'D', 122: 'E', 123: 'D', 124: 'V', 125: 'R', 126: 'E', 127: 'L', 128: 'L', 129: 'R', 130: 'E', 131: 'I', 132: 'K', 133: 'E', 134: 'L', 135: 'V', 136: 'E', 137: 'E', 138: 'I', 139: 'E', 140: 'K', 141: 'L', 142: 'A', 143: 'R', 144: 'E', 145: 'Q', 146: 'K', 147: 'Y', 148: 'L', 149: 'V', 150: 'E', 151: 'E', 152: 'L', 153: 'K', 154: 'R', 155: 'Q'}
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6EGC_A.pdb ! residue not defined for rnum = 82
 155
 (155, 155)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.051054
6BWH_C
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6BWH_C.pdb ! residue not defined for rnum = 158
{22: 'G', 23: 'D', 24: 'I', 25: 'G', 26: 'L', 27: 'I', 28: 'I', 29: 'A', 30: 'V', 31: 'K', 32: 'R', 33: 'L', 34: 'A', 35: 'A', 36: 'A', 37: 'K', 38: 'T', 39: 'R', 40: 'L', 41: 'A', 42: 'P', 43: 'V', 44: 'F', 45: 'S', 46: 'A', 47: 'Q', 48: 'T', 49: 'R', 50: 'E', 51: 'N', 52: 'V', 53: 'V', 54: 'L', 55: 'A', 56: 'M', 57: 'L', 58: 'V', 59: 'D', 60: 'T', 61: 'L', 62: 'T', 63: 'A', 64: 'A', 65: 'A', 66: 'G', 67: 'V', 68: 'G', 69: 'S', 70: 'L', 71: 'R', 72: 'S', 73: 'I', 74: 'T', 75: 'V', 76: 'I', 77: 'T', 78: 'P', 79: 'D', 80: 'E', 81: 'A', 82: 'A', 83: 'A', 84: 'A', 85: 'A', 86: 'A', 87: 'A', 88: 'G', 89: 'L', 90: 'G', 91: 'A', 92: 'D', 93: 'V', 94: 'L', 95: 'A', 96: 'D', 97: 'P', 98: 'T', 99: 'P', 103: 'P', 104: 'D', 105: 'P', 106: 'L', 107: 'N', 108: 'T', 109: 'A', 110: 'I', 111: 'T', 112: 'A', 113: 'A', 114: 'E', 115: 'R', 116: 'V', 117: 'V', 118: 'A', 119: 'E', 120: 'G', 121: 'A', 122: 'S', 123: 'N', 124: 'I', 125: 'V', 126: 'V', 127: 'L', 128: 'Q', 129: 'G', 130: 'D', 131: 'L', 132: 'P', 133: 'A', 134: 'L', 135: 'Q', 136: 'T', 137: 'Q', 138: 'E', 139: 'L', 140: 'A', 141: 'E', 142: 'A', 143: 'I', 144: 'S', 145: 'A', 146: 'A', 147: 'R', 148: 'H', 149: 'H', 150: 'R', 151: 'R', 152: 'S', 153: 'F', 154: 'V', 155: 'A', 156: 'D', 159: 'G', 160: 'T', 161: 'G', 162: 'T', 163: 'A', 164: 'V', 165: 'L', 166: 'C', 167: 'A', 168: 'F', 169: 'G', 170: 'T', 171: 'A', 172: 'L', 173: 'H', 174: 'P', 175: 'R', 176: 'F', 177: 'G', 178: 'P', 179: 'D', 180: 'S', 181: 'S', 182: 'A', 183: 'R', 184: 'H', 185: 'R', 186: 'R', 188: 'G', 189: 'A', 190: 'V', 191: 'E', 192: 'L', 193: 'T', 194: 'G', 195: 'A', 196: 'W', 197: 'P', 198: 'G', 199: 'L', 200: 'R', 201: 'C', 202: 'D', 203: 'V', 204: 'D', 205: 'T', 206: 'P', 207: 'A', 208: 'D', 209: 'L', 210: 'T', 211: 'A', 212: 'A', 213: 'R', 214: 'Q', 215: 'L', 216: 'G', 217: 'V', 218: 'G', 219: 'P', 220: 'A', 221: 'T', 222: 'A', 223: 'R', 224: 'A', 225: 'V', 226: 'A', 227: 'H'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6BWH_C.pdb ! residue not defined for rnum = 187
 227
 (227, 227)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
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5Z36_A
running..
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 154
 (154, 154)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
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6E0K_A
running..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6E0K_A.pdb ! residue not defined for rnum = 1
 296
 (296, 296)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
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5Z6D_B
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5Z6D_B.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{3: 'P', 4: 'S', 5: 'V', 6: 'D', 7: 'P', 8: 'T', 9: 'K', 10: 'V', 11: 'I', 12: 'F', 13: 'Y', 14: 'Q', 15: 'K', 16: 'K', 17: 'N', 18: 'F', 19: 'E', 20: 'G', 21: 'S', 22: 'G', 23: 'D', 24: 'T', 25: 'Y', 26: 'A', 27: 'V', 28: 'G', 29: 'Q', 30: 'D', 31: 'V', 32: 'S', 33: 'V', 34: 'P', 35: 'G', 36: 'S', 37: 'L', 38: 'N', 39: 'D', 40: 'K', 41: 'Y', 42: 'F', 43: 'S', 44: 'V', 45: 'A', 46: 'V', 47: 'G', 48: 'A', 49: 'S', 50: 'A', 51: 'K', 52: 'V', 53: 'I', 54: 'A', 55: 'W', 56: 'Q', 57: 'H', 58: 'Y', 59: 'N', 60: 'E', 61: 'T', 62: 'G', 63: 'H', 64: 'Y', 65: 'R', 66: 'E', 67: 'W', 68: 'T', 69: 'T', 70: 'S', 71: 'Q', 72: 'A', 73: 'D', 74: 'I', 75: 'S', 76: 'D', 77: 'I', 78: 'G', 79: 'G', 80: 'L', 81: 'S', 82: 'R', 83: 'F', 84: 'R', 85: 'V', 86: 'V', 87: 'D', 88: 'D', 89: 'D', 90: 'T', 91: 'R', 92: 'A', 93: 'I', 94: 'S', 95: 'F', 96: 'L', 97: 'F', 98: 'K', 99: 'D', 100: 'A', 101: 'T', 102: 'G', 103: 'G', 104: 'A', 105: 'D', 106: 'K', 107: 'Q', 108: 'Y', 109: 'S', 110: 'L', 111: 'K', 112: 'V', 113: 'D', 114: 'A', 115: 'R', 116: 'D', 117: 'V', 118: 'G', 119: 'T', 120: 'V', 121: 'M', 122: 'L', 123: 'Y', 124: 'S', 125: 'N', 126: 'D', 127: 'G', 128: 'D', 129: 'E', 130: 'Y', 131: 'G', 132: 'L', 133: 'V', 134: 'G', 135: 'I', 136: 'M', 137: 'P', 138: 'E', 139: 'G', 140: 'G', 141: 'P', 142: 'P', 143: 'V', 144: 'T', 145: 'T', 146: 'A', 147: 'V', 148: 'Y', 149: 'V', 150: 'R', 151: 'D', 152: 'E', 153: 'H', 154: 'S', 155: 'G', 156: 'V', 157: 'Y', 158: 'I', 159: 'A', 160: 'V', 161: 'G', 162: 'S', 163: 'V', 164: 'Y', 165: 'F', 166: 'E', 167: 'W', 168: 'N', 169: 'K', 170: 'D', 171: 'N', 172: 'G', 173: 'E', 174: 'V', 175: 'D', 176: 'V', 177: 'V', 178: 'E', 179: 'N', 180: 'E', 181: 'H', 182: 'W', 183: 'P', 184: 'K', 185: 'Q', 186: 'L', 187: 'K', 188: 'S', 189: 'K', 190: 'R', 191: 'T', 192: 'G', 193: 'K', 194: 'S', 195: 'S', 196: 'F', 197: 'E', 198: 'V', 199: 'T', 200: 'L', 201: 'V', 202: 'D', 203: 'N', 204: 'K', 205: 'P', 206: 'S'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/5Z6D_B.pdb ! residue not defined for rnum = 2
 206
 (206, 206)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.087378
6BS5_A
running..
 Extract distance maps..
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 340
 (340, 340)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.204141
6AGJ_B
running..
 Extract distance maps..
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 374
 (374, 374)
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5YRQ_E
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 Extract distance maps..
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 148
 (148, 148)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.040073
6BZT_D
running..
 Extract distance maps..
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 522
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6FTO_C.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{7: 'S', 8: 'L', 9: 'C', 10: 'K', 11: 'I', 12: 'V', 13: 'V', 14: 'R', 15: 'R', 16: 'E', 17: 'P', 18: 'L', 19: 'D', 20: 'V', 21: 'L', 22: 'L', 23: 'P', 24: 'Y', 25: 'Y', 26: 'D', 27: 'A', 28: 'S', 29: 'E', 30: 'T', 31: 'T', 32: 'V', 33: 'Q', 34: 'K', 35: 'I', 36: 'L', 37: 'H', 38: 'E', 39: 'N', 40: 'D', 41: 'S', 42: 'T', 43: 'L', 44: 'S', 45: 'V', 46: 'K', 47: 'F', 48: 'L', 49: 'A', 50: 'G', 51: 'V', 52: 'E', 53: 'A', 54: 'L', 55: 'I', 56: 'K', 57: 'K', 58: 'D', 59: 'E', 60: 'L', 61: 'D', 62: 'K', 63: 'Y', 64: 'K', 65: 'N', 66: 'G', 67: 'K', 68: 'A', 69: 'C', 70: 'L', 71: 'R', 72: 'V', 73: 'W', 74: 'L', 75: 'K', 76: 'H', 77: 'K', 78: 'S', 79: 'G', 80: 'K', 81: 'R'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6FTO_C.pdb ! residue not defined for rnum = 2
{7: 'S', 8: 'L', 9: 'C', 10: 'K', 11: 'I', 12: 'V', 13: 'V', 14: 'R', 15: 'R', 16: 'E', 17: 'P', 18: 'L', 19: 'D', 20: 'V', 21: 'L', 22: 'L', 23: 'P', 24: 'Y', 25: 'Y', 26: 'D', 27: 'A', 28: 'S', 29: 'E', 30: 'T', 31: 'T', 32: 'V', 33: 'Q', 34: 'K', 35: 'I', 36: 'L', 37: 'H', 38: 'E', 39: 'N', 40: 'D', 41: 'S', 42: 'T', 43: 'L', 44: 'S', 45: 'V', 46: 'K', 47: 'F', 48: 'L', 49: 'A', 50: 'G', 51: 'V', 52: 'E', 53: 'A', 54: 'L', 55: 'I', 56: 'K', 57: 'K', 58: 'D', 59: 'E', 60: 'L', 61: 'D', 62: 'K', 63: 'Y', 64: 'K', 65: 'N', 66: 'G', 67: 'K', 68: 'A', 69: 'C', 70: 'L', 71: 'R', 72: 'V', 73: 'W', 74: 'L', 75: 'K', 76: 'H', 77: 'K', 78: 'S', 79: 'G', 80: 'K', 81: 'R'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6FTO_C.pdb ! residue not defined for rnum = 3
{7: 'S', 8: 'L', 9: 'C', 10: 'K', 11: 'I', 12: 'V', 13: 'V', 14: 'R', 15: 'R', 16: 'E', 17: 'P', 18: 'L', 19: 'D', 20: 'V', 21: 'L', 22: 'L', 23: 'P', 24: 'Y', 25: 'Y', 26: 'D', 27: 'A', 28: 'S', 29: 'E', 30: 'T', 31: 'T', 32: 'V', 33: 'Q', 34: 'K', 35: 'I', 36: 'L', 37: 'H', 38: 'E', 39: 'N', 40: 'D', 41: 'S', 42: 'T', 43: 'L', 44: 'S', 45: 'V', 46: 'K', 47: 'F', 48: 'L', 49: 'A', 50: 'G', 51: 'V', 52: 'E', 53: 'A', 54: 'L', 55: 'I', 56: 'K', 57: 'K', 58: 'D', 59: 'E', 60: 'L', 61: 'D', 62: 'K', 63: 'Y', 64: 'K', 65: 'N', 66: 'G', 67: 'K', 68: 'A', 69: 'C', 70: 'L', 71: 'R', 72: 'V', 73: 'W', 74: 'L', 75: 'K', 76: 'H', 77: 'K', 78: 'S', 79: 'G', 80: 'K', 81: 'R'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6FTO_C.pdb ! residue not defined for rnum = 4
{7: 'S', 8: 'L', 9: 'C', 10: 'K', 11: 'I', 12: 'V', 13: 'V', 14: 'R', 15: 'R', 16: 'E', 17: 'P', 18: 'L', 19: 'D', 20: 'V', 21: 'L', 22: 'L', 23: 'P', 24: 'Y', 25: 'Y', 26: 'D', 27: 'A', 28: 'S', 29: 'E', 30: 'T', 31: 'T', 32: 'V', 33: 'Q', 34: 'K', 35: 'I', 36: 'L', 37: 'H', 38: 'E', 39: 'N', 40: 'D', 41: 'S', 42: 'T', 43: 'L', 44: 'S', 45: 'V', 46: 'K', 47: 'F', 48: 'L', 49: 'A', 50: 'G', 51: 'V', 52: 'E', 53: 'A', 54: 'L', 55: 'I', 56: 'K', 57: 'K', 58: 'D', 59: 'E', 60: 'L', 61: 'D', 62: 'K', 63: 'Y', 64: 'K', 65: 'N', 66: 'G', 67: 'K', 68: 'A', 69: 'C', 70: 'L', 71: 'R', 72: 'V', 73: 'W', 74: 'L', 75: 'K', 76: 'H', 77: 'K', 78: 'S', 79: 'G', 80: 'K', 81: 'R'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6FTO_C.pdb ! residue not defined for rnum = 5
{7: 'S', 8: 'L', 9: 'C', 10: 'K', 11: 'I', 12: 'V', 13: 'V', 14: 'R', 15: 'R', 16: 'E', 17: 'P', 18: 'L', 19: 'D', 20: 'V', 21: 'L', 22: 'L', 23: 'P', 24: 'Y', 25: 'Y', 26: 'D', 27: 'A', 28: 'S', 29: 'E', 30: 'T', 31: 'T', 32: 'V', 33: 'Q', 34: 'K', 35: 'I', 36: 'L', 37: 'H', 38: 'E', 39: 'N', 40: 'D', 41: 'S', 42: 'T', 43: 'L', 44: 'S', 45: 'V', 46: 'K', 47: 'F', 48: 'L', 49: 'A', 50: 'G', 51: 'V', 52: 'E', 53: 'A', 54: 'L', 55: 'I', 56: 'K', 57: 'K', 58: 'D', 59: 'E', 60: 'L', 61: 'D', 62: 'K', 63: 'Y', 64: 'K', 65: 'N', 66: 'G', 67: 'K', 68: 'A', 69: 'C', 70: 'L', 71: 'R', 72: 'V', 73: 'W', 74: 'L', 75: 'K', 76: 'H', 77: 'K', 78: 'S', 79: 'G', 80: 'K', 81: 'R'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6FTO_C.pdb ! residue not defined for rnum = 6
 81
 (81, 81)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.020488
6CPU_A
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CPU_A.pdb ! residue not defined for rnum = 328
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'T', 136: 'G', 137: 'T', 138: 'T', 139: 'H', 140: 'F', 141: 'R', 142: 'Y', 156: 'S', 157: 'K', 158: 'I', 159: 'A', 160: 'G', 161: 'I', 162: 'I', 163: 'P', 164: 'T', 165: 'M', 166: 'T', 167: 'Y', 168: 'I', 169: 'L', 170: 'N', 171: 'C', 172: 'N', 173: 'A', 174: 'T', 175: 'R', 176: 'S', 177: 'E', 178: 'I', 179: 'A', 180: 'T', 181: 'N', 182: 'Q', 183: 'L', 184: 'I', 185: 'Y', 186: 'L', 187: 'Y', 188: 'R', 189: 'L', 190: 'M', 191: 'I', 192: 'E', 193: 'E', 194: 'I', 195: 'N', 196: 'F', 197: 'I', 198: 'E', 199: 'L', 200: 'L', 201: 'Q', 202: 'D', 203: 'A', 204: 'S', 205: 'T', 206: 'T', 207: 'R', 208: 'L', 209: 'S', 210: 'Q', 211: 'L', 212: 'C', 213: 'Y', 214: 'A', 215: 'V', 216: 'G', 217: 'H', 218: 'W', 219: 'S', 220: 'F', 221: 'P', 222: 'A', 223: 'H', 224: 'N', 225: 'L', 226: 'S', 227: 'N', 228: 'D', 229: 'D', 230: 'L', 231: 'V', 232: 'Y', 233: 'C', 234: 'V', 235: 'Y', 236: 'L', 237: 'M', 238: 'I', 239: 'D', 240: 'Y', 241: 'A', 242: 'I', 243: 'K', 244: 'Q', 245: 'V', 246: 'E', 247: 'G', 248: 'F', 249: 'D', 250: 'N', 251: 'I', 252: 'P', 253: 'L', 254: 'N', 255: 'E', 256: 'L', 257: 'L', 258: 'A', 259: 'F', 260: 'I', 261: 'F', 262: 'I', 263: 'V', 264: 'R', 265: 'D', 266: 'T', 267: 'Y', 268: 'K', 269: 'N', 270: 'G', 271: 'N', 272: 'P', 273: 'F', 274: 'H', 275: 'N', 276: 'F', 277: 'R', 278: 'H', 279: 'A', 280: 'V', 281: 'D', 282: 'V', 283: 'L', 284: 'Q', 285: 'A', 286: 'C', 287: 'F', 288: 'H', 289: 'F', 290: 'L', 291: 'I', 292: 'R', 293: 'L', 294: 'G', 295: 'S', 296: 'L', 297: 'P', 298: 'K', 299: 'F', 300: 'K', 301: 'Q', 302: 'F', 303: 'V', 304: 'E', 305: 'D', 306: 'P', 307: 'K', 308: 'L', 309: 'D', 310: 'Y', 311: 'T', 312: 'E', 313: 'V', 314: 'H', 315: 'D', 316: 'K', 317: 'H', 318: 'T', 319: 'V', 320: 'L', 321: 'I', 322: 'A', 323: 'L', 324: 'Q', 330: 'E', 331: 'K', 332: 'A', 333: 'S', 334: 'L', 335: 'N', 336: 'P', 337: 'I', 338: 'Q', 339: 'T', 340: 'L', 341: 'G', 342: 'L', 343: 'L', 344: 'V', 345: 'A', 346: 'A', 347: 'L', 348: 'G', 349: 'H', 350: 'D', 351: 'V', 352: 'G', 353: 'H', 354: 'P', 355: 'G', 356: 'T', 357: 'T', 358: 'N', 359: 'D', 360: 'F', 361: 'M', 362: 'I', 363: 'K', 364: 'F', 365: 'S', 366: 'A', 367: 'P', 368: 'T', 369: 'A', 370: 'L', 371: 'L', 372: 'Y', 373: 'N', 374: 'D', 375: 'R', 376: 'S', 377: 'V', 378: 'L', 379: 'E', 380: 'S', 381: 'Y', 382: 'H', 383: 'A', 384: 'S', 385: 'L', 386: 'F', 387: 'I', 388: 'N', 389: 'K', 390: 'V', 391: 'L', 392: 'R', 393: 'I', 394: 'C', 395: 'W', 396: 'P', 397: 'D', 398: 'L', 399: 'L', 400: 'T', 401: 'C', 402: 'T', 403: 'I', 404: 'E', 405: 'E', 406: 'K', 407: 'S', 408: 'E', 409: 'L', 410: 'T', 411: 'I', 412: 'R', 413: 'S', 414: 'L', 415: 'I', 416: 'I', 417: 'S', 418: 'S', 419: 'I', 420: 'L', 421: 'A', 422: 'T', 423: 'D', 424: 'M', 425: 'G', 426: 'E', 427: 'H', 428: 'N', 429: 'E', 430: 'Y', 431: 'V', 432: 'N', 433: 'R', 434: 'L', 435: 'K', 436: 'S', 437: 'F', 438: 'K', 439: 'T', 440: 'H', 441: 'N', 442: 'E', 443: 'I', 444: 'L', 445: 'N', 446: 'H', 447: 'D', 448: 'N', 449: 'T', 450: 'V', 451: 'K', 452: 'L', 453: 'I', 454: 'S', 455: 'A', 456: 'L', 457: 'L', 458: 'I', 459: 'K', 460: 'C', 461: 'A', 462: 'D', 463: 'I', 464: 'S', 465: 'N', 466: 'V', 467: 'T', 468: 'R', 469: 'P', 470: 'L', 471: 'R', 472: 'V', 473: 'S', 474: 'A', 475: 'Q', 476: 'W', 477: 'A', 478: 'M', 479: 'V', 480: 'L', 481: 'S', 482: 'R', 483: 'E', 484: 'F', 485: 'A', 486: 'E', 487: 'V', 488: 'E', 489: 'L', 490: 'L', 491: 'K', 492: 'S', 493: 'V', 494: 'I', 495: 'K', 496: 'K', 497: 'D', 498: 'I', 499: 'D', 500: 'L', 501: 'D', 502: 'F', 503: 'T', 504: 'K', 505: 'D', 506: 'L', 507: 'T', 508: 'Y', 509: 'D', 510: 'D', 511: 'V', 512: 'P', 513: 'H', 514: 'E', 515: 'L', 516: 'R', 517: 'E', 518: 'I', 519: 'L', 520: 'E', 521: 'I', 522: 'Q', 523: 'P', 524: 'D', 525: 'I', 526: 'H', 527: 'K', 528: 'G', 529: 'Q', 530: 'I', 531: 'F', 532: 'F', 533: 'I', 534: 'N', 535: 'L', 536: 'F', 537: 'A', 538: 'E', 539: 'N', 540: 'L', 541: 'F', 542: 'N', 543: 'S', 544: 'V', 545: 'S', 546: 'D', 547: 'L', 548: 'L', 549: 'P', 550: 'Q', 551: 'L', 552: 'Q', 553: 'Y', 554: 'T', 555: 'C', 556: 'D', 557: 'I', 558: 'I', 559: 'M', 560: 'E', 561: 'N', 562: 'K', 563: 'L', 564: 'F', 565: 'W', 566: 'L', 567: 'E', 568: 'R', 569: 'A', 570: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CPU_A.pdb ! residue not defined for rnum = 329
 570
 (570, 570)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.509111
6GMA_F
running..
 Extract distance maps..
{2: 'A', 3: 'A', 4: 'R', 5: 'I', 6: 'M', 7: 'L', 8: 'L', 9: 'E', 10: 'R', 11: 'T', 12: 'L', 13: 'Q', 14: 'L', 15: 'K', 16: 'E', 17: 'E', 18: 'E', 19: 'N', 20: 'K', 21: 'R', 22: 'L', 23: 'N', 24: 'Q', 25: 'R', 26: 'L', 27: 'M', 28: 'S', 29: 'Q', 30: 'S', 31: 'M', 40: 'E', 41: 'K', 42: 'I', 43: 'A', 44: 'I', 45: 'R', 46: 'D', 47: 'F', 48: 'Q', 49: 'V', 50: 'G', 51: 'D', 52: 'L', 53: 'V', 54: 'L', 55: 'I', 56: 'I', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'E', 60: 'R', 61: 'H', 62: 'D', 63: 'N', 64: 'Y', 65: 'V', 66: 'L', 67: 'F', 68: 'T', 69: 'V', 70: 'S', 71: 'P', 72: 'T', 73: 'L', 74: 'Y', 75: 'F', 76: 'L', 77: 'H', 78: 'S', 79: 'E', 80: 'S', 81: 'L', 82: 'P', 83: 'A', 84: 'L', 85: 'D', 86: 'L', 87: 'K', 98: 'R', 99: 'P', 100: 'W', 101: 'V', 102: 'L', 103: 'G', 104: 'K', 105: 'V', 106: 'M', 107: 'E', 108: 'K', 109: 'E', 110: 'Y', 111: 'C', 112: 'Q', 113: 'A', 114: 'K', 115: 'K', 116: 'A', 117: 'Q', 118: 'N', 119: 'R', 120: 'F', 121: 'K', 122: 'V', 123: 'P', 124: 'L', 125: 'G', 126: 'T', 127: 'K', 128: 'F', 129: 'Y', 130: 'R', 131: 'V', 132: 'K', 133: 'A', 134: 'V', 135: 'S', 136: 'W', 137: 'N', 138: 'K', 139: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6GMA_F.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{2: 'A', 3: 'A', 4: 'R', 5: 'I', 6: 'M', 7: 'L', 8: 'L', 9: 'E', 10: 'R', 11: 'T', 12: 'L', 13: 'Q', 14: 'L', 15: 'K', 16: 'E', 17: 'E', 18: 'E', 19: 'N', 20: 'K', 21: 'R', 22: 'L', 23: 'N', 24: 'Q', 25: 'R', 26: 'L', 27: 'M', 28: 'S', 29: 'Q', 30: 'S', 31: 'M', 40: 'E', 41: 'K', 42: 'I', 43: 'A', 44: 'I', 45: 'R', 46: 'D', 47: 'F', 48: 'Q', 49: 'V', 50: 'G', 51: 'D', 52: 'L', 53: 'V', 54: 'L', 55: 'I', 56: 'I', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'E', 60: 'R', 61: 'H', 62: 'D', 63: 'N', 64: 'Y', 65: 'V', 66: 'L', 67: 'F', 68: 'T', 69: 'V', 70: 'S', 71: 'P', 72: 'T', 73: 'L', 74: 'Y', 75: 'F', 76: 'L', 77: 'H', 78: 'S', 79: 'E', 80: 'S', 81: 'L', 82: 'P', 83: 'A', 84: 'L', 85: 'D', 86: 'L', 87: 'K', 98: 'R', 99: 'P', 100: 'W', 101: 'V', 102: 'L', 103: 'G', 104: 'K', 105: 'V', 106: 'M', 107: 'E', 108: 'K', 109: 'E', 110: 'Y', 111: 'C', 112: 'Q', 113: 'A', 114: 'K', 115: 'K', 116: 'A', 117: 'Q', 118: 'N', 119: 'R', 120: 'F', 121: 'K', 122: 'V', 123: 'P', 124: 'L', 125: 'G', 126: 'T', 127: 'K', 128: 'F', 129: 'Y', 130: 'R', 131: 'V', 132: 'K', 133: 'A', 134: 'V', 135: 'S', 136: 'W', 137: 'N', 138: 'K', 139: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6GMA_F.pdb ! residue not defined for rnum = 32
{2: 'A', 3: 'A', 4: 'R', 5: 'I', 6: 'M', 7: 'L', 8: 'L', 9: 'E', 10: 'R', 11: 'T', 12: 'L', 13: 'Q', 14: 'L', 15: 'K', 16: 'E', 17: 'E', 18: 'E', 19: 'N', 20: 'K', 21: 'R', 22: 'L', 23: 'N', 24: 'Q', 25: 'R', 26: 'L', 27: 'M', 28: 'S', 29: 'Q', 30: 'S', 31: 'M', 40: 'E', 41: 'K', 42: 'I', 43: 'A', 44: 'I', 45: 'R', 46: 'D', 47: 'F', 48: 'Q', 49: 'V', 50: 'G', 51: 'D', 52: 'L', 53: 'V', 54: 'L', 55: 'I', 56: 'I', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'E', 60: 'R', 61: 'H', 62: 'D', 63: 'N', 64: 'Y', 65: 'V', 66: 'L', 67: 'F', 68: 'T', 69: 'V', 70: 'S', 71: 'P', 72: 'T', 73: 'L', 74: 'Y', 75: 'F', 76: 'L', 77: 'H', 78: 'S', 79: 'E', 80: 'S', 81: 'L', 82: 'P', 83: 'A', 84: 'L', 85: 'D', 86: 'L', 87: 'K', 98: 'R', 99: 'P', 100: 'W', 101: 'V', 102: 'L', 103: 'G', 104: 'K', 105: 'V', 106: 'M', 107: 'E', 108: 'K', 109: 'E', 110: 'Y', 111: 'C', 112: 'Q', 113: 'A', 114: 'K', 115: 'K', 116: 'A', 117: 'Q', 118: 'N', 119: 'R', 120: 'F', 121: 'K', 122: 'V', 123: 'P', 124: 'L', 125: 'G', 126: 'T', 127: 'K', 128: 'F', 129: 'Y', 130: 'R', 131: 'V', 132: 'K', 133: 'A', 134: 'V', 135: 'S', 136: 'W', 137: 'N', 138: 'K', 139: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6GMA_F.pdb ! residue not defined for rnum = 33
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{2: 'A', 3: 'A', 4: 'R', 5: 'I', 6: 'M', 7: 'L', 8: 'L', 9: 'E', 10: 'R', 11: 'T', 12: 'L', 13: 'Q', 14: 'L', 15: 'K', 16: 'E', 17: 'E', 18: 'E', 19: 'N', 20: 'K', 21: 'R', 22: 'L', 23: 'N', 24: 'Q', 25: 'R', 26: 'L', 27: 'M', 28: 'S', 29: 'Q', 30: 'S', 31: 'M', 40: 'E', 41: 'K', 42: 'I', 43: 'A', 44: 'I', 45: 'R', 46: 'D', 47: 'F', 48: 'Q', 49: 'V', 50: 'G', 51: 'D', 52: 'L', 53: 'V', 54: 'L', 55: 'I', 56: 'I', 57: 'L', 58: 'D', 59: 'E', 60: 'R', 61: 'H', 62: 'D', 63: 'N', 64: 'Y', 65: 'V', 66: 'L', 67: 'F', 68: 'T', 69: 'V', 70: 'S', 71: 'P', 72: 'T', 73: 'L', 74: 'Y', 75: 'F', 76: 'L', 77: 'H', 78: 'S', 79: 'E', 80: 'S', 81: 'L', 82: 'P', 83: 'A', 84: 'L', 85: 'D', 86: 'L', 87: 'K', 98: 'R', 99: 'P', 100: 'W', 101: 'V', 102: 'L', 103: 'G', 104: 'K', 105: 'V', 106: 'M', 107: 'E', 108: 'K', 109: 'E', 110: 'Y', 111: 'C', 112: 'Q', 113: 'A', 114: 'K', 115: 'K', 116: 'A', 117: 'Q', 118: 'N', 119: 'R', 120: 'F', 121: 'K', 122: 'V', 123: 'P', 124: 'L', 125: 'G', 126: 'T', 127: 'K', 128: 'F', 129: 'Y', 130: 'R', 131: 'V', 132: 'K', 133: 'A', 134: 'V', 135: 'S', 136: 'W', 137: 'N', 138: 'K', 139: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6GMA_F.pdb ! residue not defined for rnum = 97
 139
 (139, 139)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.037314
6E0M_A
running..
 Extract distance maps..
{1: 'M', 2: 'N', 3: 'F', 4: 'S', 5: 'E', 6: 'Q', 7: 'Q', 8: 'L', 9: 'I', 10: 'N', 11: 'W', 12: 'S', 13: 'R', 14: 'P', 15: 'V', 16: 'S', 17: 'T', 18: 'T', 19: 'E', 20: 'D', 21: 'L', 22: 'K', 23: 'C', 24: 'Q', 25: 'N', 26: 'A', 27: 'I', 28: 'T', 29: 'Q', 30: 'I', 31: 'T', 32: 'A', 33: 'A', 34: 'L', 35: 'R', 36: 'A', 37: 'K', 38: 'F', 39: 'G', 40: 'N', 41: 'R', 42: 'V', 43: 'T', 44: 'I', 45: 'F', 46: 'L', 47: 'Q', 48: 'G', 49: 'S', 50: 'Y', 51: 'R', 52: 'N', 53: 'N', 54: 'T', 55: 'N', 56: 'V', 57: 'R', 58: 'Q', 59: 'N', 60: 'S', 61: 'D', 62: 'V', 63: 'D', 64: 'I', 65: 'V', 66: 'M', 67: 'R', 68: 'Y', 69: 'D', 70: 'D', 71: 'A', 72: 'F', 73: 'Y', 74: 'P', 75: 'D', 76: 'L', 96: 'Y', 97: 'N', 98: 'F', 99: 'D', 100: 'E', 101: 'L', 102: 'K', 103: 'A', 104: 'D', 105: 'T', 106: 'E', 107: 'E', 108: 'A', 109: 'L', 110: 'R', 111: 'N', 112: 'V', 113: 'F', 114: 'T', 115: 'T', 116: 'S', 117: 'V', 118: 'E', 119: 'R', 120: 'K', 121: 'N', 122: 'K', 123: 'C', 124: 'I', 125: 'Q', 126: 'V', 127: 'N', 128: 'G', 129: 'N', 130: 'S', 131: 'N', 132: 'R', 133: 'I', 134: 'T', 135: 'A', 136: 'D', 137: 'V', 138: 'I', 139: 'P', 140: 'C', 141: 'F', 142: 'V', 143: 'L', 144: 'K', 145: 'R', 146: 'F', 147: 'S', 148: 'T', 149: 'L', 150: 'Q', 151: 'S', 152: 'V', 153: 'E', 154: 'A', 155: 'E', 156: 'G', 157: 'I', 158: 'K', 159: 'F', 160: 'Y', 161: 'S', 162: 'D', 163: 'D', 164: 'N', 165: 'K', 166: 'E', 167: 'I', 168: 'I', 169: 'S', 170: 'F', 171: 'P', 172: 'E', 173: 'Q', 174: 'H', 175: 'Y', 176: 'S', 177: 'N', 178: 'G', 179: 'T', 180: 'E', 181: 'K', 182: 'T', 183: 'N', 184: 'Q', 185: 'T', 186: 'Y', 187: 'R', 188: 'L', 189: 'Y', 190: 'K', 191: 'R', 192: 'M', 193: 'V', 194: 'R', 195: 'I', 196: 'L', 197: 'K', 198: 'V', 199: 'V', 200: 'N', 201: 'Y', 202: 'R', 203: 'L', 204: 'I', 205: 'D', 206: 'D', 207: 'G', 208: 'E', 209: 'I', 210: 'A', 211: 'D', 212: 'N', 213: 'L', 214: 'V', 215: 'S', 216: 'S', 217: 'F', 218: 'F', 219: 'I', 220: 'E', 221: 'C', 222: 'L', 223: 'V', 224: 'Y', 225: 'N', 226: 'V', 227: 'P', 228: 'N', 229: 'N', 230: 'Q', 231: 'F', 232: 'I', 233: 'S', 234: 'G', 235: 'N', 236: 'Y', 237: 'T', 238: 'Q', 239: 'T', 240: 'L', 241: 'R', 242: 'N', 243: 'V', 244: 'I', 245: 'V', 246: 'K', 247: 'I', 248: 'Y', 249: 'E', 250: 'D', 251: 'M', 252: 'K', 253: 'N', 254: 'N', 255: 'A', 256: 'D', 257: 'Y', 258: 'T', 259: 'E', 260: 'V', 261: 'N', 262: 'R', 263: 'L', 264: 'F', 265: 'W', 266: 'L', 267: 'F', 268: 'S', 269: 'N', 270: 'R', 271: 'S', 272: 'P', 273: 'R', 274: 'T', 275: 'R', 276: 'Q', 277: 'D', 278: 'A', 279: 'L', 280: 'G', 281: 'F', 282: 'M', 283: 'Q', 284: 'K', 285: 'C', 286: 'W', 287: 'N', 288: 'Y', 289: 'L', 290: 'G', 291: 'Y'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6E0M_A.pdb ! residue not defined for rnum = 77
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{1: 'M', 2: 'N', 3: 'F', 4: 'S', 5: 'E', 6: 'Q', 7: 'Q', 8: 'L', 9: 'I', 10: 'N', 11: 'W', 12: 'S', 13: 'R', 14: 'P', 15: 'V', 16: 'S', 17: 'T', 18: 'T', 19: 'E', 20: 'D', 21: 'L', 22: 'K', 23: 'C', 24: 'Q', 25: 'N', 26: 'A', 27: 'I', 28: 'T', 29: 'Q', 30: 'I', 31: 'T', 32: 'A', 33: 'A', 34: 'L', 35: 'R', 36: 'A', 37: 'K', 38: 'F', 39: 'G', 40: 'N', 41: 'R', 42: 'V', 43: 'T', 44: 'I', 45: 'F', 46: 'L', 47: 'Q', 48: 'G', 49: 'S', 50: 'Y', 51: 'R', 52: 'N', 53: 'N', 54: 'T', 55: 'N', 56: 'V', 57: 'R', 58: 'Q', 59: 'N', 60: 'S', 61: 'D', 62: 'V', 63: 'D', 64: 'I', 65: 'V', 66: 'M', 67: 'R', 68: 'Y', 69: 'D', 70: 'D', 71: 'A', 72: 'F', 73: 'Y', 74: 'P', 75: 'D', 76: 'L', 96: 'Y', 97: 'N', 98: 'F', 99: 'D', 100: 'E', 101: 'L', 102: 'K', 103: 'A', 104: 'D', 105: 'T', 106: 'E', 107: 'E', 108: 'A', 109: 'L', 110: 'R', 111: 'N', 112: 'V', 113: 'F', 114: 'T', 115: 'T', 116: 'S', 117: 'V', 118: 'E', 119: 'R', 120: 'K', 121: 'N', 122: 'K', 123: 'C', 124: 'I', 125: 'Q', 126: 'V', 127: 'N', 128: 'G', 129: 'N', 130: 'S', 131: 'N', 132: 'R', 133: 'I', 134: 'T', 135: 'A', 136: 'D', 137: 'V', 138: 'I', 139: 'P', 140: 'C', 141: 'F', 142: 'V', 143: 'L', 144: 'K', 145: 'R', 146: 'F', 147: 'S', 148: 'T', 149: 'L', 150: 'Q', 151: 'S', 152: 'V', 153: 'E', 154: 'A', 155: 'E', 156: 'G', 157: 'I', 158: 'K', 159: 'F', 160: 'Y', 161: 'S', 162: 'D', 163: 'D', 164: 'N', 165: 'K', 166: 'E', 167: 'I', 168: 'I', 169: 'S', 170: 'F', 171: 'P', 172: 'E', 173: 'Q', 174: 'H', 175: 'Y', 176: 'S', 177: 'N', 178: 'G', 179: 'T', 180: 'E', 181: 'K', 182: 'T', 183: 'N', 184: 'Q', 185: 'T', 186: 'Y', 187: 'R', 188: 'L', 189: 'Y', 190: 'K', 191: 'R', 192: 'M', 193: 'V', 194: 'R', 195: 'I', 196: 'L', 197: 'K', 198: 'V', 199: 'V', 200: 'N', 201: 'Y', 202: 'R', 203: 'L', 204: 'I', 205: 'D', 206: 'D', 207: 'G', 208: 'E', 209: 'I', 210: 'A', 211: 'D', 212: 'N', 213: 'L', 214: 'V', 215: 'S', 216: 'S', 217: 'F', 218: 'F', 219: 'I', 220: 'E', 221: 'C', 222: 'L', 223: 'V', 224: 'Y', 225: 'N', 226: 'V', 227: 'P', 228: 'N', 229: 'N', 230: 'Q', 231: 'F', 232: 'I', 233: 'S', 234: 'G', 235: 'N', 236: 'Y', 237: 'T', 238: 'Q', 239: 'T', 240: 'L', 241: 'R', 242: 'N', 243: 'V', 244: 'I', 245: 'V', 246: 'K', 247: 'I', 248: 'Y', 249: 'E', 250: 'D', 251: 'M', 252: 'K', 253: 'N', 254: 'N', 255: 'A', 256: 'D', 257: 'Y', 258: 'T', 259: 'E', 260: 'V', 261: 'N', 262: 'R', 263: 'L', 264: 'F', 265: 'W', 266: 'L', 267: 'F', 268: 'S', 269: 'N', 270: 'R', 271: 'S', 272: 'P', 273: 'R', 274: 'T', 275: 'R', 276: 'Q', 277: 'D', 278: 'A', 279: 'L', 280: 'G', 281: 'F', 282: 'M', 283: 'Q', 284: 'K', 285: 'C', 286: 'W', 287: 'N', 288: 'Y', 289: 'L', 290: 'G', 291: 'Y'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6E0M_A.pdb ! residue not defined for rnum = 95
 291
 (291, 291)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.144109
6AIT_F
running..
 Extract distance maps..
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 438
 (438, 438)
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 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.306785
5Z3F_A
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 Extract distance maps..
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 399
 (399, 399)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.260251
6AJJ_A
running..
 Extract distance maps..
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 941
 (941, 941)
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6E9O_A
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{24: 'K', 25: 'P', 26: 'G', 27: 'R', 28: 'R', 29: 'R', 30: 'Y', 31: 'L', 32: 'T', 33: 'L', 34: 'V', 35: 'M', 36: 'I', 37: 'F', 38: 'I', 39: 'T', 40: 'V', 41: 'V', 42: 'I', 43: 'C', 44: 'Y', 45: 'V', 46: 'D', 47: 'R', 48: 'A', 49: 'N', 50: 'L', 51: 'A', 52: 'V', 53: 'A', 54: 'S', 55: 'A', 56: 'H', 57: 'I', 58: 'Q', 59: 'E', 60: 'E', 61: 'F', 62: 'G', 63: 'I', 64: 'T', 65: 'K', 66: 'A', 67: 'E', 68: 'M', 69: 'G', 70: 'Y', 71: 'V', 72: 'F', 73: 'S', 74: 'A', 75: 'F', 76: 'A', 77: 'W', 78: 'L', 79: 'Y', 80: 'T', 81: 'L', 82: 'C', 83: 'Q', 84: 'I', 85: 'P', 86: 'G', 87: 'G', 88: 'W', 89: 'F', 90: 'L', 91: 'D', 92: 'R', 93: 'V', 94: 'G', 95: 'S', 96: 'R', 97: 'V', 98: 'T', 99: 'Y', 100: 'F', 101: 'I', 102: 'A', 103: 'I', 104: 'F', 105: 'G', 106: 'W', 107: 'S', 108: 'V', 109: 'A', 110: 'T', 111: 'L', 112: 'F', 113: 'Q', 114: 'G', 115: 'F', 116: 'A', 117: 'T', 118: 'G', 119: 'L', 120: 'M', 121: 'S', 122: 'L', 123: 'I', 124: 'G', 125: 'L', 126: 'R', 127: 'A', 128: 'I', 129: 'T', 130: 'G', 131: 'I', 132: 'F', 133: 'Q', 134: 'A', 135: 'P', 136: 'A', 137: 'F', 138: 'P', 139: 'T', 140: 'N', 141: 'N', 142: 'R', 143: 'M', 144: 'V', 145: 'T', 146: 'S', 147: 'W', 148: 'F', 149: 'P', 150: 'E', 151: 'H', 152: 'E', 153: 'R', 154: 'A', 155: 'S', 156: 'A', 157: 'V', 158: 'G', 159: 'F', 160: 'Y', 161: 'T', 162: 'S', 163: 'G', 164: 'Q', 165: 'F', 166: 'V', 167: 'G', 168: 'L', 169: 'A', 170: 'F', 171: 'L', 172: 'T', 173: 'P', 174: 'L', 175: 'L', 176: 'I', 177: 'W', 178: 'I', 179: 'Q', 180: 'E', 181: 'M', 182: 'L', 183: 'S', 184: 'W', 185: 'H', 186: 'W', 187: 'V', 188: 'F', 189: 'I', 190: 'V', 191: 'T', 192: 'G', 193: 'G', 194: 'I', 195: 'G', 196: 'I', 197: 'I', 198: 'W', 199: 'S', 200: 'L', 201: 'I', 202: 'W', 203: 'F', 204: 'K', 205: 'V', 206: 'Y', 207: 'Q', 208: 'P', 209: 'P', 210: 'R', 211: 'L', 212: 'T', 213: 'K', 214: 'G', 215: 'I', 216: 'S', 217: 'K', 218: 'A', 219: 'E', 220: 'L', 221: 'D', 222: 'Y', 223: 'I', 224: 'R', 225: 'D', 226: 'G', 227: 'G', 228: 'G', 229: 'L', 230: 'V', 244: 'L', 245: 'T', 246: 'A', 247: 'K', 248: 'D', 249: 'W', 250: 'K', 251: 'L', 252: 'V', 253: 'F', 254: 'H', 255: 'R', 256: 'K', 257: 'L', 258: 'I', 259: 'G', 260: 'V', 261: 'Y', 262: 'L', 263: 'G', 264: 'Q', 265: 'F', 266: 'A', 267: 'V', 268: 'A', 269: 'S', 270: 'T', 271: 'L', 272: 'W', 273: 'F', 274: 'F', 275: 'L', 276: 'T', 291: 'L', 292: 'K', 293: 'A', 294: 'G', 295: 'F', 296: 'M', 297: 'T', 298: 'T', 299: 'V', 300: 'P', 301: 'F', 302: 'L', 303: 'A', 304: 'A', 305: 'F', 306: 'V', 307: 'G', 308: 'V', 309: 'L', 310: 'L', 311: 'S', 312: 'G', 313: 'W', 314: 'V', 315: 'A', 316: 'D', 317: 'L', 318: 'L', 319: 'V', 320: 'R', 321: 'K', 322: 'G', 323: 'F', 324: 'S', 325: 'L', 326: 'G', 327: 'F', 328: 'A', 329: 'R', 330: 'K', 331: 'T', 332: 'P', 333: 'I', 334: 'I', 335: 'C', 336: 'G', 337: 'L', 338: 'L', 339: 'I', 340: 'S', 341: 'T', 342: 'C', 343: 'I', 344: 'M', 345: 'G', 346: 'A', 347: 'N', 348: 'Y', 349: 'T', 350: 'N', 351: 'D', 352: 'P', 353: 'M', 354: 'M', 355: 'I', 356: 'M', 357: 'C', 358: 'L', 359: 'M', 360: 'A', 361: 'L', 362: 'A', 363: 'F', 364: 'F', 365: 'G', 366: 'N', 367: 'G', 368: 'F', 369: 'A', 370: 'S', 371: 'I', 372: 'T', 373: 'W', 374: 'S', 375: 'L', 376: 'V', 377: 'S', 378: 'S', 379: 'L', 380: 'A', 381: 'P', 382: 'M', 383: 'R', 384: 'L', 385: 'I', 386: 'G', 387: 'L', 388: 'T', 389: 'G', 390: 'G', 391: 'V', 392: 'F', 393: 'N', 394: 'F', 395: 'A', 396: 'G', 397: 'G', 398: 'L', 399: 'G', 400: 'G', 401: 'I', 402: 'T', 403: 'V', 404: 'P', 405: 'L', 406: 'V', 407: 'V', 408: 'G', 409: 'Y', 410: 'L', 411: 'A', 412: 'Q', 413: 'G', 414: 'Y', 415: 'G', 416: 'F', 417: 'A', 418: 'P', 419: 'A', 420: 'L', 421: 'V', 422: 'Y', 423: 'I', 424: 'S', 425: 'A', 426: 'V', 427: 'A', 428: 'L', 429: 'I', 430: 'G', 431: 'A', 432: 'L', 433: 'S', 434: 'Y', 435: 'I', 436: 'L', 437: 'L', 438: 'V', 439: 'G', 440: 'D', 441: 'V', 442: 'K', 443: 'R'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6E9O_A.pdb ! residue not defined for rnum = 290
 443
 (443, 443)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.374664
6CK1_D
running..
 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6CK1_D.pdb ! residue not defined for rnum = 192
 408
 (408, 408)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.268500
6BS5_B
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 Extract distance maps..
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/cameo/chains/6BS5_B.pdb ! residue not defined for rnum = 313
 375
 (375, 375)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.247717
6BXW_A
running..
 Extract distance maps..
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 Writing distance map file.. 
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