T0950
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T0951
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{8: 'S', 9: 'I', 10: 'G', 11: 'L', 12: 'A', 13: 'H', 14: 'N', 15: 'V', 16: 'T', 17: 'I', 18: 'L', 19: 'G', 20: 'S', 21: 'G', 22: 'E', 23: 'T', 24: 'T', 25: 'V', 26: 'V', 27: 'L', 28: 'G', 29: 'H', 30: 'G', 31: 'Y', 32: 'G', 33: 'T', 34: 'D', 35: 'Q', 36: 'S', 37: 'V', 38: 'W', 39: 'K', 40: 'L', 41: 'L', 42: 'V', 43: 'P', 44: 'Y', 45: 'L', 46: 'V', 47: 'D', 48: 'D', 49: 'Y', 50: 'K', 51: 'V', 52: 'L', 53: 'L', 54: 'Y', 55: 'D', 56: 'H', 57: 'M', 58: 'G', 59: 'A', 60: 'G', 61: 'T', 62: 'T', 63: 'N', 64: 'P', 65: 'D', 66: 'Y', 67: 'F', 68: 'D', 69: 'F', 70: 'D', 71: 'R', 72: 'Y', 73: 'S', 74: 'S', 75: 'L', 76: 'E', 77: 'G', 78: 'Y', 79: 'S', 80: 'Y', 81: 'D', 82: 'L', 83: 'I', 84: 'A', 85: 'I', 86: 'L', 87: 'E', 88: 'E', 89: 'F', 90: 'Q', 91: 'V', 92: 'S', 93: 'K', 94: 'C', 95: 'I', 96: 'Y', 97: 'V', 98: 'G', 99: 'H', 100: 'S', 101: 'M', 102: 'S', 103: 'S', 104: 'M', 105: 'A', 106: 'A', 107: 'A', 108: 'V', 109: 'A', 110: 'S', 111: 'I', 112: 'F', 113: 'R', 114: 'P', 115: 'D', 116: 'L', 117: 'F', 118: 'H', 119: 'K', 120: 'L', 121: 'V', 122: 'M', 123: 'I', 124: 'S', 125: 'P', 126: 'T', 127: 'P', 128: 'R', 129: 'L', 130: 'I', 131: 'N', 132: 'T', 133: 'E', 134: 'E', 135: 'Y', 136: 'Y', 137: 'G', 138: 'G', 139: 'F', 140: 'E', 141: 'Q', 142: 'K', 143: 'V', 144: 'M', 145: 'D', 146: 'E', 147: 'T', 148: 'L', 149: 'R', 150: 'S', 151: 'L', 152: 'D', 153: 'E', 154: 'N', 155: 'F', 156: 'K', 157: 'S', 158: 'L', 159: 'S', 160: 'L', 161: 'G', 162: 'T', 163: 'A', 164: 'P', 165: 'L', 166: 'L', 167: 'L', 168: 'A', 169: 'C', 170: 'D', 171: 'L', 172: 'E', 173: 'S', 174: 'A', 175: 'A', 176: 'M', 177: 'Q', 178: 'E', 179: 'Y', 180: 'C', 181: 'R', 182: 'T', 183: 'L', 184: 'F', 185: 'N', 186: 'M', 187: 'R', 188: 'P', 189: 'D', 190: 'I', 191: 'A', 192: 'C', 193: 'C', 194: 'I', 195: 'T', 196: 'R', 197: 'M', 198: 'I', 199: 'C', 200: 'G', 201: 'L', 202: 'D', 203: 'L', 204: 'R', 205: 'P', 206: 'Y', 207: 'L', 208: 'G', 209: 'H', 210: 'V', 211: 'T', 212: 'V', 213: 'P', 214: 'C', 215: 'H', 216: 'I', 217: 'I', 218: 'Q', 219: 'S', 220: 'S', 221: 'N', 222: 'D', 223: 'I', 224: 'M', 225: 'V', 226: 'P', 227: 'V', 228: 'A', 229: 'V', 230: 'G', 231: 'E', 232: 'Y', 233: 'L', 234: 'R', 235: 'K', 236: 'N', 237: 'L', 238: 'G', 239: 'G', 240: 'P', 241: 'S', 242: 'V', 243: 'V', 244: 'E', 245: 'V', 246: 'M', 247: 'P', 248: 'T', 249: 'E', 250: 'G', 251: 'H', 252: 'L', 253: 'P', 254: 'H', 255: 'L', 256: 'S', 257: 'M', 258: 'P', 259: 'E', 260: 'V', 261: 'T', 262: 'I', 263: 'P', 264: 'V', 265: 'V', 266: 'L', 267: 'R', 268: 'H', 269: 'I', 270: 'R', 271: 'Q', 272: 'D', 273: 'I'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/casp13/chains/T0951.pdb ! residue not defined for rnum = 6
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/casp13/chains/T0951.pdb ! residue not defined for rnum = 7
 273
 (273, 273)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.142938
running..
head: cannot open './a3m_from_trRosetta/casp13_a3m/T0951.a3m' for reading: No such file or directory
T0953s1
 Extract distance maps..
 72
 (72, 72)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.018838
running..
head: cannot open './a3m_from_trRosetta/casp13_a3m/T0953s1.a3m' for reading: No such file or directory
T0953s2
 Extract distance maps..
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 249
 (249, 249)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
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running..
T0954
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 350
 (350, 350)
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T0955
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 41
 (41, 41)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
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running..
head: cannot open './a3m_from_trRosetta/casp13_a3m/T0955.a3m' for reading: No such file or directory
T0957s1
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{2: 'N', 3: 'S', 4: 'F', 5: 'E', 6: 'V', 7: 'S', 8: 'S', 9: 'L', 10: 'P', 11: 'D', 12: 'A', 13: 'N', 14: 'G', 15: 'K', 16: 'N', 17: 'H', 18: 'I', 19: 'T', 20: 'A', 21: 'V', 22: 'K', 23: 'G', 24: 'D', 25: 'A', 26: 'K', 27: 'I', 28: 'P', 29: 'V', 30: 'D', 31: 'K', 32: 'I', 33: 'E', 34: 'L', 35: 'Y', 36: 'M', 37: 'R', 38: 'G', 39: 'K', 40: 'A', 41: 'S', 42: 'G', 43: 'D', 44: 'L', 45: 'D', 46: 'S', 47: 'L', 48: 'Q', 49: 'A', 50: 'E', 51: 'Y', 52: 'N', 53: 'S', 54: 'L', 55: 'K', 56: 'D', 57: 'A', 58: 'R', 59: 'I', 60: 'S', 61: 'S', 62: 'Q', 63: 'K', 64: 'E', 65: 'F', 66: 'A', 67: 'K', 68: 'D', 69: 'P', 70: 'N', 71: 'N', 72: 'A', 73: 'K', 74: 'R', 75: 'M', 76: 'E', 77: 'V', 78: 'L', 79: 'E', 80: 'K', 81: 'Q', 82: 'I', 83: 'H', 84: 'N', 85: 'I', 86: 'E', 87: 'R', 88: 'S', 89: 'Q', 90: 'D', 91: 'M', 92: 'A', 93: 'R', 94: 'V', 95: 'L', 96: 'E', 97: 'Q', 98: 'A', 99: 'G', 100: 'I', 101: 'V', 102: 'N', 103: 'T', 104: 'A', 105: 'S', 106: 'N', 107: 'N', 108: 'S', 109: 'M', 110: 'I', 111: 'M', 112: 'D', 113: 'K', 114: 'L', 115: 'L', 116: 'D', 117: 'S', 118: 'A', 119: 'Q', 120: 'G', 121: 'A', 122: 'T', 123: 'S', 124: 'A', 125: 'N', 126: 'R', 127: 'K', 128: 'T', 129: 'S', 130: 'V', 131: 'V', 132: 'V', 133: 'S', 134: 'G', 135: 'P', 136: 'N', 137: 'G', 138: 'N', 139: 'V', 140: 'R', 141: 'I', 142: 'Y', 143: 'A', 144: 'T', 145: 'W', 146: 'T', 147: 'I', 148: 'L', 149: 'P', 150: 'D', 151: 'G', 152: 'T', 153: 'K', 154: 'R', 155: 'L', 156: 'S', 157: 'T', 158: 'V', 159: 'T', 160: 'G', 161: 'T', 162: 'F', 163: 'K'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/casp13/chains/T0957s1.pdb ! residue not defined for rnum = 1
 163
 (163, 163)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
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running..
T0957s2
 Extract distance maps..
{7: 'V', 8: 'N', 9: 'S', 10: 'T', 11: 'A', 12: 'K', 13: 'D', 14: 'I', 15: 'E', 16: 'G', 17: 'L', 18: 'E', 19: 'S', 20: 'Y', 21: 'L', 22: 'A', 23: 'N', 24: 'G', 25: 'Y', 26: 'V', 27: 'E', 28: 'A', 29: 'N', 30: 'S', 31: 'F', 32: 'N', 33: 'D', 34: 'P', 35: 'E', 36: 'D', 37: 'D', 38: 'A', 39: 'L', 40: 'E', 41: 'C', 42: 'L', 43: 'S', 44: 'N', 45: 'L', 46: 'L', 47: 'V', 48: 'K', 49: 'D', 50: 'S', 51: 'R', 52: 'G', 53: 'G', 54: 'L', 55: 'S', 56: 'F', 57: 'C', 58: 'K', 59: 'K', 60: 'I', 61: 'L', 62: 'N', 63: 'S', 64: 'N', 65: 'N', 66: 'I', 67: 'D', 68: 'G', 69: 'V', 70: 'F', 71: 'I', 72: 'K', 73: 'G', 74: 'S', 75: 'A', 76: 'L', 77: 'N', 78: 'F', 79: 'L', 80: 'L', 81: 'L', 82: 'S', 83: 'E', 84: 'Q', 85: 'W', 86: 'S', 87: 'Y', 88: 'A', 89: 'F', 90: 'E', 91: 'Y', 92: 'L', 93: 'T', 94: 'S', 95: 'N', 96: 'A', 97: 'D', 98: 'N', 99: 'I', 100: 'T', 101: 'L', 102: 'A', 103: 'E', 104: 'L', 105: 'E', 106: 'K', 107: 'A', 108: 'L', 109: 'F', 110: 'Y', 111: 'F', 112: 'Y', 113: 'C', 114: 'A', 115: 'K', 116: 'N', 117: 'E', 118: 'T', 119: 'D', 120: 'P', 121: 'Y', 122: 'P', 123: 'V', 124: 'P', 125: 'E', 126: 'G', 127: 'L', 128: 'F', 129: 'K', 130: 'K', 131: 'L', 132: 'M', 133: 'K', 134: 'R', 135: 'Y', 136: 'E', 137: 'E', 138: 'L', 139: 'K', 140: 'N', 141: 'D', 142: 'P', 143: 'D', 144: 'A', 145: 'K', 146: 'F', 147: 'Y', 148: 'H', 149: 'L', 150: 'H', 151: 'E', 152: 'T', 153: 'Y', 154: 'D', 155: 'D', 156: 'F', 157: 'S', 158: 'K', 159: 'A', 160: 'Y', 161: 'P', 162: 'L', 163: 'N', 164: 'N'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/casp13/chains/T0957s2.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{7: 'V', 8: 'N', 9: 'S', 10: 'T', 11: 'A', 12: 'K', 13: 'D', 14: 'I', 15: 'E', 16: 'G', 17: 'L', 18: 'E', 19: 'S', 20: 'Y', 21: 'L', 22: 'A', 23: 'N', 24: 'G', 25: 'Y', 26: 'V', 27: 'E', 28: 'A', 29: 'N', 30: 'S', 31: 'F', 32: 'N', 33: 'D', 34: 'P', 35: 'E', 36: 'D', 37: 'D', 38: 'A', 39: 'L', 40: 'E', 41: 'C', 42: 'L', 43: 'S', 44: 'N', 45: 'L', 46: 'L', 47: 'V', 48: 'K', 49: 'D', 50: 'S', 51: 'R', 52: 'G', 53: 'G', 54: 'L', 55: 'S', 56: 'F', 57: 'C', 58: 'K', 59: 'K', 60: 'I', 61: 'L', 62: 'N', 63: 'S', 64: 'N', 65: 'N', 66: 'I', 67: 'D', 68: 'G', 69: 'V', 70: 'F', 71: 'I', 72: 'K', 73: 'G', 74: 'S', 75: 'A', 76: 'L', 77: 'N', 78: 'F', 79: 'L', 80: 'L', 81: 'L', 82: 'S', 83: 'E', 84: 'Q', 85: 'W', 86: 'S', 87: 'Y', 88: 'A', 89: 'F', 90: 'E', 91: 'Y', 92: 'L', 93: 'T', 94: 'S', 95: 'N', 96: 'A', 97: 'D', 98: 'N', 99: 'I', 100: 'T', 101: 'L', 102: 'A', 103: 'E', 104: 'L', 105: 'E', 106: 'K', 107: 'A', 108: 'L', 109: 'F', 110: 'Y', 111: 'F', 112: 'Y', 113: 'C', 114: 'A', 115: 'K', 116: 'N', 117: 'E', 118: 'T', 119: 'D', 120: 'P', 121: 'Y', 122: 'P', 123: 'V', 124: 'P', 125: 'E', 126: 'G', 127: 'L', 128: 'F', 129: 'K', 130: 'K', 131: 'L', 132: 'M', 133: 'K', 134: 'R', 135: 'Y', 136: 'E', 137: 'E', 138: 'L', 139: 'K', 140: 'N', 141: 'D', 142: 'P', 143: 'D', 144: 'A', 145: 'K', 146: 'F', 147: 'Y', 148: 'H', 149: 'L', 150: 'H', 151: 'E', 152: 'T', 153: 'Y', 154: 'D', 155: 'D', 156: 'F', 157: 'S', 158: 'K', 159: 'A', 160: 'Y', 161: 'P', 162: 'L', 163: 'N', 164: 'N'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/casp13/chains/T0957s2.pdb ! residue not defined for rnum = 2
{7: 'V', 8: 'N', 9: 'S', 10: 'T', 11: 'A', 12: 'K', 13: 'D', 14: 'I', 15: 'E', 16: 'G', 17: 'L', 18: 'E', 19: 'S', 20: 'Y', 21: 'L', 22: 'A', 23: 'N', 24: 'G', 25: 'Y', 26: 'V', 27: 'E', 28: 'A', 29: 'N', 30: 'S', 31: 'F', 32: 'N', 33: 'D', 34: 'P', 35: 'E', 36: 'D', 37: 'D', 38: 'A', 39: 'L', 40: 'E', 41: 'C', 42: 'L', 43: 'S', 44: 'N', 45: 'L', 46: 'L', 47: 'V', 48: 'K', 49: 'D', 50: 'S', 51: 'R', 52: 'G', 53: 'G', 54: 'L', 55: 'S', 56: 'F', 57: 'C', 58: 'K', 59: 'K', 60: 'I', 61: 'L', 62: 'N', 63: 'S', 64: 'N', 65: 'N', 66: 'I', 67: 'D', 68: 'G', 69: 'V', 70: 'F', 71: 'I', 72: 'K', 73: 'G', 74: 'S', 75: 'A', 76: 'L', 77: 'N', 78: 'F', 79: 'L', 80: 'L', 81: 'L', 82: 'S', 83: 'E', 84: 'Q', 85: 'W', 86: 'S', 87: 'Y', 88: 'A', 89: 'F', 90: 'E', 91: 'Y', 92: 'L', 93: 'T', 94: 'S', 95: 'N', 96: 'A', 97: 'D', 98: 'N', 99: 'I', 100: 'T', 101: 'L', 102: 'A', 103: 'E', 104: 'L', 105: 'E', 106: 'K', 107: 'A', 108: 'L', 109: 'F', 110: 'Y', 111: 'F', 112: 'Y', 113: 'C', 114: 'A', 115: 'K', 116: 'N', 117: 'E', 118: 'T', 119: 'D', 120: 'P', 121: 'Y', 122: 'P', 123: 'V', 124: 'P', 125: 'E', 126: 'G', 127: 'L', 128: 'F', 129: 'K', 130: 'K', 131: 'L', 132: 'M', 133: 'K', 134: 'R', 135: 'Y', 136: 'E', 137: 'E', 138: 'L', 139: 'K', 140: 'N', 141: 'D', 142: 'P', 143: 'D', 144: 'A', 145: 'K', 146: 'F', 147: 'Y', 148: 'H', 149: 'L', 150: 'H', 151: 'E', 152: 'T', 153: 'Y', 154: 'D', 155: 'D', 156: 'F', 157: 'S', 158: 'K', 159: 'A', 160: 'Y', 161: 'P', 162: 'L', 163: 'N', 164: 'N'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/casp13/chains/T0957s2.pdb ! residue not defined for rnum = 3
{7: 'V', 8: 'N', 9: 'S', 10: 'T', 11: 'A', 12: 'K', 13: 'D', 14: 'I', 15: 'E', 16: 'G', 17: 'L', 18: 'E', 19: 'S', 20: 'Y', 21: 'L', 22: 'A', 23: 'N', 24: 'G', 25: 'Y', 26: 'V', 27: 'E', 28: 'A', 29: 'N', 30: 'S', 31: 'F', 32: 'N', 33: 'D', 34: 'P', 35: 'E', 36: 'D', 37: 'D', 38: 'A', 39: 'L', 40: 'E', 41: 'C', 42: 'L', 43: 'S', 44: 'N', 45: 'L', 46: 'L', 47: 'V', 48: 'K', 49: 'D', 50: 'S', 51: 'R', 52: 'G', 53: 'G', 54: 'L', 55: 'S', 56: 'F', 57: 'C', 58: 'K', 59: 'K', 60: 'I', 61: 'L', 62: 'N', 63: 'S', 64: 'N', 65: 'N', 66: 'I', 67: 'D', 68: 'G', 69: 'V', 70: 'F', 71: 'I', 72: 'K', 73: 'G', 74: 'S', 75: 'A', 76: 'L', 77: 'N', 78: 'F', 79: 'L', 80: 'L', 81: 'L', 82: 'S', 83: 'E', 84: 'Q', 85: 'W', 86: 'S', 87: 'Y', 88: 'A', 89: 'F', 90: 'E', 91: 'Y', 92: 'L', 93: 'T', 94: 'S', 95: 'N', 96: 'A', 97: 'D', 98: 'N', 99: 'I', 100: 'T', 101: 'L', 102: 'A', 103: 'E', 104: 'L', 105: 'E', 106: 'K', 107: 'A', 108: 'L', 109: 'F', 110: 'Y', 111: 'F', 112: 'Y', 113: 'C', 114: 'A', 115: 'K', 116: 'N', 117: 'E', 118: 'T', 119: 'D', 120: 'P', 121: 'Y', 122: 'P', 123: 'V', 124: 'P', 125: 'E', 126: 'G', 127: 'L', 128: 'F', 129: 'K', 130: 'K', 131: 'L', 132: 'M', 133: 'K', 134: 'R', 135: 'Y', 136: 'E', 137: 'E', 138: 'L', 139: 'K', 140: 'N', 141: 'D', 142: 'P', 143: 'D', 144: 'A', 145: 'K', 146: 'F', 147: 'Y', 148: 'H', 149: 'L', 150: 'H', 151: 'E', 152: 'T', 153: 'Y', 154: 'D', 155: 'D', 156: 'F', 157: 'S', 158: 'K', 159: 'A', 160: 'Y', 161: 'P', 162: 'L', 163: 'N', 164: 'N'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/casp13/chains/T0957s2.pdb ! residue not defined for rnum = 4
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/casp13/chains/T0957s2.pdb ! residue not defined for rnum = 5
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/casp13/chains/T0957s2.pdb ! residue not defined for rnum = 6
 164
 (164, 164)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.055349
running..
T0958
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Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/casp13/chains/T0958.pdb ! residue not defined for rnum = 2
{5: 'S', 6: 'K', 7: 'Q', 8: 'Q', 9: 'E', 10: 'K', 11: 'L', 12: 'Y', 13: 'N', 14: 'F', 15: 'I', 16: 'I', 17: 'A', 18: 'K', 19: 'S', 20: 'F', 21: 'Q', 22: 'Q', 23: 'P', 24: 'V', 25: 'G', 26: 'S', 27: 'T', 28: 'F', 29: 'T', 30: 'Y', 31: 'G', 32: 'E', 33: 'L', 34: 'R', 35: 'K', 36: 'K', 37: 'Y', 38: 'N', 39: 'V', 40: 'V', 41: 'C', 42: 'S', 43: 'T', 44: 'N', 45: 'D', 46: 'Q', 47: 'R', 48: 'E', 49: 'V', 50: 'G', 51: 'R', 52: 'R', 53: 'F', 54: 'A', 55: 'Y', 56: 'W', 57: 'I', 58: 'K', 59: 'Y', 60: 'T', 61: 'P', 62: 'G', 63: 'L', 64: 'P', 65: 'F', 66: 'K', 67: 'I', 68: 'V', 69: 'G', 70: 'T', 71: 'K', 72: 'N', 73: 'G', 74: 'S', 75: 'L', 76: 'L', 77: 'Y', 78: 'Q', 79: 'K', 80: 'I', 81: 'G'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/casp13/chains/T0958.pdb ! residue not defined for rnum = 3
{5: 'S', 6: 'K', 7: 'Q', 8: 'Q', 9: 'E', 10: 'K', 11: 'L', 12: 'Y', 13: 'N', 14: 'F', 15: 'I', 16: 'I', 17: 'A', 18: 'K', 19: 'S', 20: 'F', 21: 'Q', 22: 'Q', 23: 'P', 24: 'V', 25: 'G', 26: 'S', 27: 'T', 28: 'F', 29: 'T', 30: 'Y', 31: 'G', 32: 'E', 33: 'L', 34: 'R', 35: 'K', 36: 'K', 37: 'Y', 38: 'N', 39: 'V', 40: 'V', 41: 'C', 42: 'S', 43: 'T', 44: 'N', 45: 'D', 46: 'Q', 47: 'R', 48: 'E', 49: 'V', 50: 'G', 51: 'R', 52: 'R', 53: 'F', 54: 'A', 55: 'Y', 56: 'W', 57: 'I', 58: 'K', 59: 'Y', 60: 'T', 61: 'P', 62: 'G', 63: 'L', 64: 'P', 65: 'F', 66: 'K', 67: 'I', 68: 'V', 69: 'G', 70: 'T', 71: 'K', 72: 'N', 73: 'G', 74: 'S', 75: 'L', 76: 'L', 77: 'Y', 78: 'Q', 79: 'K', 80: 'I', 81: 'G'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/casp13/chains/T0958.pdb ! residue not defined for rnum = 4
 81
 (81, 81)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.023145
running..
head: cannot open './a3m_from_trRosetta/casp13_a3m/T0958.a3m' for reading: No such file or directory
T0960
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 384
 (384, 384)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.266851
running..
T0963
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 372
 (372, 372)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.256202
running..
T0966
 Extract distance maps..
 492
 (492, 492)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.428598
running..
head: cannot open './a3m_from_trRosetta/casp13_a3m/T0966.a3m' for reading: No such file or directory
T0968s1
 Extract distance maps..
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{6: 'T', 7: 'A', 8: 'Q', 9: 'T', 10: 'I', 11: 'A', 12: 'N', 13: 'S', 14: 'V', 15: 'V', 16: 'D', 17: 'A', 18: 'K', 19: 'K', 20: 'F', 21: 'D', 22: 'Y', 23: 'L', 24: 'F', 25: 'G', 26: 'K', 27: 'A', 28: 'T', 29: 'G', 30: 'N', 31: 'S', 32: 'H', 33: 'T', 34: 'L', 35: 'D', 36: 'R', 37: 'T', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'L', 41: 'A', 42: 'L', 43: 'E', 44: 'M', 45: 'K', 46: 'R', 47: 'L', 48: 'G', 49: 'V', 50: 'A', 51: 'D', 52: 'D', 53: 'I', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'H', 57: 'A', 58: 'V', 59: 'L', 60: 'A', 61: 'E', 62: 'H', 63: 'F', 64: 'T', 65: 'Q', 66: 'A', 67: 'T', 68: 'K', 69: 'D', 70: 'S', 71: 'N', 72: 'N', 73: 'I', 74: 'V', 75: 'K', 76: 'K', 77: 'Y', 78: 'T', 79: 'D', 80: 'Q', 81: 'Y', 82: 'G', 83: 'S', 84: 'F', 85: 'E', 86: 'I', 87: 'R', 88: 'E', 89: 'S', 90: 'F', 91: 'F', 92: 'I', 93: 'G', 94: 'P', 95: 'S', 96: 'G', 97: 'K', 98: 'A', 99: 'T', 100: 'V', 101: 'F', 102: 'E', 103: 'S', 104: 'T', 105: 'F', 106: 'E', 107: 'V', 108: 'M', 109: 'K', 110: 'D', 111: 'G', 112: 'S', 113: 'H', 114: 'R', 115: 'F', 116: 'I', 117: 'T', 118: 'T', 119: 'I', 120: 'P', 121: 'K', 122: 'N', 123: 'G'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/casp13/chains/T0968s1.pdb ! residue not defined for rnum = 3
{6: 'T', 7: 'A', 8: 'Q', 9: 'T', 10: 'I', 11: 'A', 12: 'N', 13: 'S', 14: 'V', 15: 'V', 16: 'D', 17: 'A', 18: 'K', 19: 'K', 20: 'F', 21: 'D', 22: 'Y', 23: 'L', 24: 'F', 25: 'G', 26: 'K', 27: 'A', 28: 'T', 29: 'G', 30: 'N', 31: 'S', 32: 'H', 33: 'T', 34: 'L', 35: 'D', 36: 'R', 37: 'T', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'L', 41: 'A', 42: 'L', 43: 'E', 44: 'M', 45: 'K', 46: 'R', 47: 'L', 48: 'G', 49: 'V', 50: 'A', 51: 'D', 52: 'D', 53: 'I', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'H', 57: 'A', 58: 'V', 59: 'L', 60: 'A', 61: 'E', 62: 'H', 63: 'F', 64: 'T', 65: 'Q', 66: 'A', 67: 'T', 68: 'K', 69: 'D', 70: 'S', 71: 'N', 72: 'N', 73: 'I', 74: 'V', 75: 'K', 76: 'K', 77: 'Y', 78: 'T', 79: 'D', 80: 'Q', 81: 'Y', 82: 'G', 83: 'S', 84: 'F', 85: 'E', 86: 'I', 87: 'R', 88: 'E', 89: 'S', 90: 'F', 91: 'F', 92: 'I', 93: 'G', 94: 'P', 95: 'S', 96: 'G', 97: 'K', 98: 'A', 99: 'T', 100: 'V', 101: 'F', 102: 'E', 103: 'S', 104: 'T', 105: 'F', 106: 'E', 107: 'V', 108: 'M', 109: 'K', 110: 'D', 111: 'G', 112: 'S', 113: 'H', 114: 'R', 115: 'F', 116: 'I', 117: 'T', 118: 'T', 119: 'I', 120: 'P', 121: 'K', 122: 'N', 123: 'G'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/casp13/chains/T0968s1.pdb ! residue not defined for rnum = 4
{6: 'T', 7: 'A', 8: 'Q', 9: 'T', 10: 'I', 11: 'A', 12: 'N', 13: 'S', 14: 'V', 15: 'V', 16: 'D', 17: 'A', 18: 'K', 19: 'K', 20: 'F', 21: 'D', 22: 'Y', 23: 'L', 24: 'F', 25: 'G', 26: 'K', 27: 'A', 28: 'T', 29: 'G', 30: 'N', 31: 'S', 32: 'H', 33: 'T', 34: 'L', 35: 'D', 36: 'R', 37: 'T', 38: 'N', 39: 'Q', 40: 'L', 41: 'A', 42: 'L', 43: 'E', 44: 'M', 45: 'K', 46: 'R', 47: 'L', 48: 'G', 49: 'V', 50: 'A', 51: 'D', 52: 'D', 53: 'I', 54: 'N', 55: 'G', 56: 'H', 57: 'A', 58: 'V', 59: 'L', 60: 'A', 61: 'E', 62: 'H', 63: 'F', 64: 'T', 65: 'Q', 66: 'A', 67: 'T', 68: 'K', 69: 'D', 70: 'S', 71: 'N', 72: 'N', 73: 'I', 74: 'V', 75: 'K', 76: 'K', 77: 'Y', 78: 'T', 79: 'D', 80: 'Q', 81: 'Y', 82: 'G', 83: 'S', 84: 'F', 85: 'E', 86: 'I', 87: 'R', 88: 'E', 89: 'S', 90: 'F', 91: 'F', 92: 'I', 93: 'G', 94: 'P', 95: 'S', 96: 'G', 97: 'K', 98: 'A', 99: 'T', 100: 'V', 101: 'F', 102: 'E', 103: 'S', 104: 'T', 105: 'F', 106: 'E', 107: 'V', 108: 'M', 109: 'K', 110: 'D', 111: 'G', 112: 'S', 113: 'H', 114: 'R', 115: 'F', 116: 'I', 117: 'T', 118: 'T', 119: 'I', 120: 'P', 121: 'K', 122: 'N', 123: 'G'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/casp13/chains/T0968s1.pdb ! residue not defined for rnum = 5
 123
 (123, 123)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.046454
running..
T0968s2
 Extract distance maps..
 115
 (115, 115)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.033906
running..
T1003
 Extract distance maps..
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 465
 (465, 465)
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T1005
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{39: 'L', 40: 'I', 41: 'P', 42: 'L', 43: 'I', 44: 'E', 45: 'A', 46: 'Q', 47: 'T', 48: 'E', 49: 'E', 50: 'D', 51: 'L', 52: 'T', 53: 'P', 54: 'T', 55: 'M', 56: 'R', 57: 'E', 58: 'Y', 59: 'F', 60: 'A', 61: 'Q', 62: 'I', 63: 'R', 64: 'E', 65: 'Y', 66: 'R', 67: 'K', 68: 'T', 69: 'P', 70: 'H', 71: 'V', 72: 'K', 73: 'G', 74: 'F', 75: 'G', 76: 'W', 77: 'F', 78: 'G', 79: 'N', 80: 'W', 81: 'T', 82: 'G', 83: 'K', 84: 'G', 85: 'N', 86: 'N', 87: 'A', 88: 'Q', 89: 'N', 90: 'Y', 91: 'L', 92: 'K', 93: 'M', 94: 'L', 95: 'P', 96: 'D', 97: 'S', 98: 'V', 99: 'D', 100: 'F', 101: 'V', 102: 'S', 103: 'L', 104: 'W', 105: 'G', 106: 'T', 107: 'R', 108: 'G', 109: 'Y', 110: 'L', 111: 'S', 112: 'D', 113: 'E', 114: 'Q', 115: 'K', 116: 'A', 117: 'D', 118: 'L', 119: 'K', 120: 'F', 121: 'F', 122: 'Q', 123: 'E', 124: 'V', 125: 'K', 126: 'G', 127: 'G', 128: 'K', 129: 'A', 130: 'L', 131: 'L', 132: 'C', 133: 'W', 134: 'I', 135: 'I', 136: 'Q', 137: 'D', 138: 'L', 139: 'G', 140: 'D', 141: 'Q', 142: 'L', 143: 'T', 144: 'P', 145: 'K', 146: 'G', 147: 'L', 148: 'N', 149: 'A', 150: 'T', 151: 'Q', 152: 'Y', 153: 'W', 154: 'V', 155: 'E', 156: 'E', 157: 'K', 158: 'G', 159: 'Q', 160: 'G', 161: 'N', 162: 'F', 163: 'I', 164: 'E', 165: 'G', 166: 'V', 167: 'K', 168: 'A', 169: 'Y', 170: 'A', 171: 'N', 172: 'A', 173: 'I', 174: 'C', 175: 'D', 176: 'S', 177: 'I', 178: 'E', 179: 'K', 180: 'Y', 181: 'N', 182: 'L', 183: 'D', 184: 'G', 185: 'F', 186: 'D', 187: 'I', 188: 'D', 189: 'Y', 190: 'E', 191: 'P', 192: 'G', 193: 'Y', 194: 'G', 195: 'H', 196: 'S', 197: 'G', 198: 'T', 199: 'L', 200: 'A', 201: 'N', 202: 'Y', 203: 'Q', 204: 'T', 205: 'I', 206: 'S', 207: 'P', 208: 'S', 209: 'G', 210: 'N', 211: 'N', 212: 'K', 213: 'M', 214: 'Q', 215: 'V', 216: 'F', 217: 'I', 218: 'E', 219: 'T', 220: 'L', 221: 'S', 222: 'A', 223: 'R', 224: 'L', 225: 'R', 226: 'P', 227: 'A', 228: 'G', 229: 'R', 230: 'M', 231: 'L', 232: 'V', 233: 'M', 234: 'D', 235: 'G', 236: 'Q', 237: 'P', 238: 'D', 239: 'L', 240: 'L', 241: 'S', 242: 'T', 243: 'E', 244: 'T', 245: 'S', 246: 'K', 247: 'L', 248: 'V', 249: 'D', 250: 'H', 251: 'Y', 252: 'I', 253: 'Y', 254: 'Q', 255: 'A', 256: 'Y', 257: 'W', 258: 'E', 259: 'S', 260: 'S', 261: 'T', 262: 'S', 263: 'S', 264: 'V', 265: 'I', 266: 'Y', 267: 'K', 268: 'I', 269: 'N', 270: 'K', 271: 'P', 272: 'N', 273: 'L', 274: 'D', 275: 'D', 276: 'W', 277: 'E', 278: 'R', 279: 'K', 280: 'T', 281: 'I', 282: 'I', 283: 'T', 284: 'V', 285: 'E', 286: 'F', 287: 'E', 288: 'Q', 289: 'G', 290: 'W', 291: 'K', 292: 'T', 293: 'G', 294: 'G', 295: 'I', 296: 'T', 297: 'Y', 298: 'Y', 299: 'T', 300: 'S', 301: 'V', 302: 'R', 303: 'P', 304: 'E', 305: 'L', 306: 'N', 307: 'S', 308: 'M', 309: 'E', 310: 'G', 311: 'N', 312: 'Q', 313: 'I', 314: 'L', 315: 'D', 316: 'Y', 317: 'A', 318: 'T', 319: 'L', 320: 'D', 321: 'L', 322: 'P', 323: 'S', 324: 'G', 325: 'K', 326: 'R', 327: 'I', 328: 'G', 329: 'G', 330: 'I', 331: 'G', 332: 'T', 333: 'Y', 334: 'H', 335: 'M', 336: 'E', 337: 'Y', 338: 'D', 339: 'Y', 340: 'P', 341: 'N', 342: 'D', 343: 'P', 344: 'P', 345: 'Y', 346: 'K', 347: 'W', 348: 'L', 349: 'R', 350: 'K', 351: 'A', 352: 'L', 353: 'Y', 354: 'F', 355: 'G', 356: 'N', 357: 'Q', 358: 'V', 359: 'Y', 360: 'P', 361: 'G', 362: 'K', 363: 'F', 364: 'D'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/casp13/chains/T1005.pdb ! residue not defined for rnum = 38
 364
 (364, 364)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.206106
running..
head: cannot open './a3m_from_trRosetta/casp13_a3m/T1005.a3m' for reading: No such file or directory
T1008
 Extract distance maps..
{3: 'E', 4: 'L', 5: 'L', 6: 'E', 7: 'R', 8: 'L', 9: 'R', 10: 'Q', 11: 'L', 12: 'F', 13: 'E', 14: 'E', 15: 'L', 16: 'H', 17: 'E', 18: 'R', 19: 'G', 20: 'T', 21: 'E', 22: 'I', 23: 'V', 24: 'V', 25: 'E', 26: 'V', 27: 'H', 28: 'I', 29: 'N', 30: 'G', 31: 'E', 32: 'R', 33: 'D', 34: 'E', 35: 'I', 36: 'R', 37: 'V', 38: 'R', 39: 'N', 40: 'I', 41: 'S', 42: 'K', 43: 'E', 44: 'E', 45: 'L', 46: 'K', 47: 'K', 48: 'L', 49: 'L', 50: 'E', 51: 'R', 52: 'I', 53: 'R', 54: 'E', 55: 'K', 56: 'I', 57: 'E', 58: 'R', 59: 'E', 60: 'G', 61: 'S', 62: 'S', 63: 'E', 64: 'V', 65: 'E', 66: 'V', 67: 'N', 68: 'V', 69: 'H', 70: 'S', 71: 'G', 72: 'G', 73: 'Q', 74: 'T', 75: 'W', 76: 'T', 77: 'F', 78: 'N', 79: 'E'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/casp13/chains/T1008.pdb ! residue not defined for rnum = 1
{3: 'E', 4: 'L', 5: 'L', 6: 'E', 7: 'R', 8: 'L', 9: 'R', 10: 'Q', 11: 'L', 12: 'F', 13: 'E', 14: 'E', 15: 'L', 16: 'H', 17: 'E', 18: 'R', 19: 'G', 20: 'T', 21: 'E', 22: 'I', 23: 'V', 24: 'V', 25: 'E', 26: 'V', 27: 'H', 28: 'I', 29: 'N', 30: 'G', 31: 'E', 32: 'R', 33: 'D', 34: 'E', 35: 'I', 36: 'R', 37: 'V', 38: 'R', 39: 'N', 40: 'I', 41: 'S', 42: 'K', 43: 'E', 44: 'E', 45: 'L', 46: 'K', 47: 'K', 48: 'L', 49: 'L', 50: 'E', 51: 'R', 52: 'I', 53: 'R', 54: 'E', 55: 'K', 56: 'I', 57: 'E', 58: 'R', 59: 'E', 60: 'G', 61: 'S', 62: 'S', 63: 'E', 64: 'V', 65: 'E', 66: 'V', 67: 'N', 68: 'V', 69: 'H', 70: 'S', 71: 'G', 72: 'G', 73: 'Q', 74: 'T', 75: 'W', 76: 'T', 77: 'F', 78: 'N', 79: 'E'}
Warning! /home/badri/PDNET/v4-pssmbugfix/data/casp13/chains/T1008.pdb ! residue not defined for rnum = 2
 79
 (79, 79)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.023006
running..
head: cannot open './a3m_from_trRosetta/casp13_a3m/T1008.a3m' for reading: No such file or directory
T1009
 Extract distance maps..
 718
 (718, 718)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.899926
running..
head: cannot open './a3m_from_trRosetta/casp13_a3m/T1009.a3m' for reading: No such file or directory
T1011
 Extract distance maps..
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 520
 (520, 520)
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 Writing distance map file.. 
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running..
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T1016
 Extract distance maps..
 202
 (202, 202)
 Verify the symmetricity in distance maps..
 Writing distance map file.. 
Runtime = 0:00:00.081607
running..
head: cannot open './a3m_from_trRosetta/casp13_a3m/T1016.a3m' for reading: No such file or directory